Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6606, 334 aa
1>>>pF1KE6606 334 - 334 aa - 334 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4141+/-0.000864; mu= 12.0098+/- 0.052
mean_var=115.2720+/-22.932, 0's: 0 Z-trim(109.2): 82 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.119457
statistics sampled from 10641 (10727) to 10641 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47390.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 334) 2193 388.7 3.7e-108
CCDS56404.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 330) 2147 380.7 8.9e-106
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 2147 380.9 1.3e-105
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 1761 314.3 1.2e-85
CCDS56401.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 336) 1538 275.8 3.5e-74
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 1534 275.2 8e-74
CCDS56402.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 256) 844 156.1 2.9e-38
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 839 155.5 9.1e-38
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 813 151.0 2.2e-36
CCDS4605.1 BTN3A2 gene_id:11118|Hs108|chr6 ( 334) 775 144.3 1.3e-34
CCDS56399.1 BTN3A2 gene_id:11118|Hs108|chr6 ( 311) 752 140.3 2e-33
CCDS4609.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 352) 750 140.0 2.8e-33
CCDS47389.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 378) 750 140.0 2.9e-33
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 750 140.1 3.7e-33
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 697 130.9 1.7e-30
CCDS56400.1 BTN3A2 gene_id:11118|Hs108|chr6 ( 292) 686 128.9 5e-30
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 679 127.9 1.8e-29
CCDS78126.1 BTNL2 gene_id:56244|Hs108|chr6 ( 482) 672 126.6 3.9e-29
CCDS78104.1 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 344) 660 124.5 1.3e-28
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 660 124.6 1.8e-28
CCDS47358.1 BTNL3 gene_id:10917|Hs108|chr5 ( 466) 586 111.8 1.1e-24
CCDS43413.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 500) 568 108.7 1e-23
CCDS54956.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 340) 561 107.4 1.7e-23
CCDS4459.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 347) 561 107.4 1.8e-23
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 406 80.8 2.4e-15
CCDS34368.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 206) 347 70.3 1.5e-12
CCDS47394.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 208) 347 70.4 1.5e-12
CCDS34367.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 213) 347 70.4 1.5e-12
CCDS34369.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 224) 347 70.4 1.6e-12
CCDS34366.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 229) 347 70.4 1.6e-12
CCDS34370.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 247) 347 70.4 1.7e-12
CCDS4667.1 MOG gene_id:4340|Hs108|chr6 ( 252) 347 70.4 1.7e-12
CCDS32288.1 CD276 gene_id:80381|Hs108|chr15 ( 534) 327 67.2 3.4e-11
>>CCDS47390.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (334 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2055.3 bits: 388.7 E(32554): 3.7e-108
Smith-Waterman score: 2193; 100.0% identity (100.0% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE6 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
310 320 330
>>CCDS56404.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (330 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 2012.5 bits: 380.7 E(32554): 8.9e-106
Smith-Waterman score: 2147; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE6 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAGPV
310 320 330
>>CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (527 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 2009.8 bits: 380.9 E(32554): 1.3e-105
Smith-Waterman score: 2147; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MESAAALHFSRPASLLLLLLSLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE6 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAVDVVLDPDTAHPDLFLSEDRRSVRRCPFRHLGE
310 320 330 340 350 360
>>CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (466 aa)
initn: 1761 init1: 1761 opt: 1761 Z-score: 1651.0 bits: 314.3 E(32554): 1.2e-85
Smith-Waterman score: 1761; 100.0% identity (100.0% similar) in 266 aa overlap (62-327:1-266)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEE
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 YRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLI
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRD
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 KSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWINK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 LQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LQKEKKILSGEKEFERETREIALKELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAVDVV
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FSN
CCDS56 LDPDTAHPDLFLSEDRRSVRRCPFRHLGESVPDNPERFDSQPCVLGRESFASGKHYWEVE
280 290 300 310 320 330
>>CCDS56401.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 (336 aa)
initn: 1520 init1: 1386 opt: 1538 Z-score: 1445.2 bits: 275.8 E(32554): 3.5e-74
Smith-Waterman score: 1591; 73.9% identity (84.2% similar) in 348 aa overlap (1-331:1-330)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLL----SLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPE
:: ::::::: ::::::::: :::::::::: ::::..:::: ::::::::::::::
CCDS56 MEPAAALHFSLPASLLLLLLLLLLSLCALVSAQFTVVGPANPILAMVGENTTLRCHLSPE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::.:
CCDS56 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRITFVSKDINRGSVALVIHNVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLT
::::: ::::::::::::::::.:::::::::::: ....:::.: ::::: ::::.:::
CCDS56 AQENGIYRCYFQEGRSYDEAILRLVVAGLGSKPLIEIKAQEDGSIWLECISGGWYPEPLT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFI
::::::: :.:::::::. ::::::::::::::::: :::.:::.:::::::.::.::::
CCDS56 VWRDPYGEVVPALKEVSIADADGLFMVTTAVIIRDKYVRNVSCSVNNTLLGQEKETVIFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE6 PESFMPSVSPCAVAL-------P------IIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEK
:::::::.:: ::: : .:.....: .:: : :.:::.:::::::::
CCDS56 PESFMPSASPWMVALAVILTASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCIKKLQREKKILSGEK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE6 EFERETREIALKELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
. :.: .::: ..::::::::::::::....
CCDS56 KVEQEEKEIA------------------QQLQEELRWRRTFLHADVNLTGLRNT
310 320 330
>>CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 (523 aa)
initn: 1491 init1: 1386 opt: 1534 Z-score: 1438.8 bits: 275.2 E(32554): 8e-74
Smith-Waterman score: 1587; 74.7% identity (84.0% similar) in 344 aa overlap (1-327:1-326)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLL----SLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPE
:: ::::::: ::::::::: :::::::::: ::::..:::: ::::::::::::::
CCDS46 MEPAAALHFSLPASLLLLLLLLLLSLCALVSAQFTVVGPANPILAMVGENTTLRCHLSPE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::.:
CCDS46 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRITFVSKDINRGSVALVIHNVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLT
::::: ::::::::::::::::.:::::::::::: ....:::.: ::::: ::::.:::
CCDS46 AQENGIYRCYFQEGRSYDEAILRLVVAGLGSKPLIEIKAQEDGSIWLECISGGWYPEPLT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVIIRDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFI
::::::: :.:::::::. ::::::::::::::::: :::.:::.:::::::.::.::::
CCDS46 VWRDPYGEVVPALKEVSIADADGLFMVTTAVIIRDKYVRNVSCSVNNTLLGQEKETVIFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE6 PESFMPSVSPCAVAL-------P------IIVVILMIPIAVCIYWINKLQKEKKILSGEK
:::::::.:: ::: : .:.....: .:: : :.:::.:::::::::
CCDS46 PESFMPSASPWMVALAVILTASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCIKKLQREKKILSGEK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE6 EFERETREIALKELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHAELQFFSN
. :.: .::: ..::::::::::::::
CCDS46 KVEQEEKEIA------------------QQLQEELRWRRTFLHAADVVLDPDTAHPELFL
310 320 330 340
CCDS46 SEDRRSVRRGPYRQRVPDNPERFDSQPCVLGWESFASGKHYWEVEVENVMVWTVGVCRHS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS56402.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 (256 aa)
initn: 938 init1: 790 opt: 844 Z-score: 800.4 bits: 156.1 E(32554): 2.9e-38
Smith-Waterman score: 913; 54.7% identity (63.1% similar) in 331 aa overlap (1-327:1-232)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESAAALHFSRPASLLLLLL----SLCALVSAQFIVVGPTDPILATVGENTTLRCHLSPE
:: ::::::: ::::::::: :::::::::: ::::..:::: ::::::::::::::
CCDS56 MEPAAALHFSLPASLLLLLLLLLLSLCALVSAQFTVVGPANPILAMVGENTTLRCHLSPE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::.:
CCDS56 KNAEDMEVRWFRSQFSPAVFVYKGGRERTEEQMEEYRGRITFVSKDINRGSVALVIHNVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKPLISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLT
::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS56 AQENGIYRCYFQEGRSYDEAILRLVVA---------------------------------
130 140
180 190 200 210 220 230
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: ::.:. .::. :::.
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..:: :.. .:.....: .:: : :.:::.:::::::::. :.: .:::
CCDS56 ------TASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCIKKLQREKKILSGEKKVEQEEKEIA---
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300 310 320 330
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..::::::::::::::
CCDS56 ---------------QQLQEELRWRRTFLHAGYELPGIRGPSWKRPLHGEPPSAF
220 230 240 250
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: :: :.::.: : :: : :.:: .::::.:::.. : :.:::. .:
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: .:.::::.. ::::.:.. :::. ::: :::::.:.:. :..: ::: :... ...
CCDS46 EHLELRWFRKKVSPAVLVHRDGREQEAEQMPEYRGRATLVQDGIAKGRVALRIRGVRVSD
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: :. .: :: .::: :...::::: :..:.:: :.: ::::.:. : :: :
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:.. ::.: :::.:... :::
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CCDS46 -----AATEQEISLREKLQEELKWRKIQYMARGEKSLAYHEWKMALFKPADVILDPDTAN
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120 130 140 150 160 170
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120 130 140 150 160 170
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]