Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6496, 532 aa
1>>>pF1KE6496 532 - 532 aa - 532 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5421+/-0.000373; mu= 18.6400+/- 0.023
mean_var=90.6554+/-18.483, 0's: 0 Z-trim(115.2): 44 B-trim: 1476 in 1/51
Lambda= 0.134703
statistics sampled from 25413 (25455) to 25413 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 6.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003046 (OMIM: 600336) vesicular acetylcholine t ( 532) 3483 687.2 3.3e-197
NP_003044 (OMIM: 193002) chromaffin granule amine ( 525) 1034 211.2 6.1e-54
NP_001129163 (OMIM: 193002) chromaffin granule ami ( 525) 1034 211.2 6.1e-54
NP_003045 (OMIM: 193001) synaptic vesicular amine ( 514) 1014 207.3 8.9e-53
XP_011542929 (OMIM: 193002) PREDICTED: chromaffin ( 472) 944 193.7 1e-48
NP_001135797 (OMIM: 193002) chromaffin granule ami ( 472) 944 193.7 1e-48
XP_011542927 (OMIM: 193002) PREDICTED: chromaffin ( 497) 843 174.1 8.8e-43
NP_001135796 (OMIM: 193002) chromaffin granule ami ( 493) 580 123.0 2.1e-27
XP_011542928 (OMIM: 193002) PREDICTED: chromaffin ( 493) 580 123.0 2.1e-27
XP_016865725 (OMIM: 613361) PREDICTED: MFS-type tr ( 409) 284 65.4 3.8e-10
NP_439896 (OMIM: 613361) MFS-type transporter SLC1 ( 456) 284 65.4 4.1e-10
>>NP_003046 (OMIM: 600336) vesicular acetylcholine trans (532 aa)
initn: 3483 init1: 3483 opt: 3483 Z-score: 3661.4 bits: 687.2 E(85289): 3.3e-197
Smith-Waterman score: 3483; 99.8% identity (99.8% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
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NP_003 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IAHMRGGGEGPTRTPEVWEPTLPLPTPANASAYTANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IAHMRGGGEGPTRTPEVWEPTLPLPTPANASAYTANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 YAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 ERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_003 ERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPPGPFDACEDDYNYYYTRS
490 500 510 520 530
>>NP_003044 (OMIM: 193002) chromaffin granule amine tran (525 aa)
initn: 1171 init1: 510 opt: 1034 Z-score: 1089.4 bits: 211.2 E(85289): 6.1e-54
Smith-Waterman score: 1134; 38.3% identity (67.9% similar) in 517 aa overlap (25-510:13-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
NP_003 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
NP_003 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
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NP_003 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
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NP_003 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
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NP_003 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
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NP_003 AK---GTPLFMLLKDPYILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
NP_003 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:: ..: ::...:: : .
NP_003 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLL--DEPPQGLYDAVR--LRERPVSGQDG
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NP_003 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
470 480 490 500 510
510 520 530
pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
NP_003 DEEPDHEE
520
>>NP_001129163 (OMIM: 193002) chromaffin granule amine t (525 aa)
initn: 1171 init1: 510 opt: 1034 Z-score: 1089.4 bits: 211.2 E(85289): 6.1e-54
Smith-Waterman score: 1134; 38.3% identity (67.9% similar) in 517 aa overlap (25-510:13-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
NP_001 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
NP_001 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
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NP_001 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
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NP_001 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
NP_001 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.::.. :. .:.::::. :: .:: . .:..:.:.::
NP_001 AK---GTPLFMLLKDPYILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
NP_001 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:: ..: ::...:: : .
NP_001 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLL--DEPPQGLYDAVR--LRERPVSGQDG
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NP_001 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
470 480 490 500 510
510 520 530
pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
NP_001 DEEPDHEE
520
>>NP_003045 (OMIM: 193001) synaptic vesicular amine tran (514 aa)
initn: 1138 init1: 467 opt: 1014 Z-score: 1068.5 bits: 207.3 E(85289): 8.9e-53
Smith-Waterman score: 1154; 37.7% identity (69.9% similar) in 522 aa overlap (17-513:3-513)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSE-AVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPD
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NP_003 MALSELALVRWLQESRRSRKLILFIVFLALLLDNMLLTVVVPIIPS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE6 Y---IAHMRGGGE----GPTRTPEVWEPTLPLPTPA-NASAYTANTSASPTAAWPA----
: : : ... : :..: . . . . :.. :.:.. . : :
NP_003 YLYSIKHEKNATEIQTARPVHTASISDSFQSIFSYYDNSTMVTGNATRDLTLHQTATQHM
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE6 ---GSALRPRYPTESED-----VKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDVPLLIGL
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NP_003 VTNASAVPSDCPSEDKDLLNENVQVGLLFASKATVQLITNPFIGLLTNRIGYPIPIFAGF
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 GVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRALGVALA
.::.::..:::. .:: :. ::::::.::. ....:..:.:. : .. ::. ..:.::.
NP_003 CIMFVSTIMFAFSSSYAFLLIARSLQGIGSSCSSVAGMGMLASVYTDDEERGNVMGIALG
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARARANLPVG
...: ::.::::..::::.:: .:::::::. :.:. . : : .: .:.. . :
NP_003 GLAMGVLVGPPFGSVLYEFVGKTAPFLVLAALVLLDGAIQLFVLQP----SRVQPESQKG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 TPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLPAFVPHV
::. :. :::: ..::.. :. .:.:::.. :: .:: . .:..:.:.::: . ..
NP_003 TPLTTLLKDPYILIAAGSICFANMGIAMLEPALPIWMMETMCSRKWQLGVAFLPASISYL
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 LGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFGIALVDT
.:. . :: .. .:: . ::. ..:.: .: ... :.. :. :.:..::.
NP_003 IGTNIFGILAHKMG--RWLCALLGMIIVGVSILCIPFAKNIYGLIAPNFGVGFAIGMVDS
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 ALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSLGMGLAN
...: ...:::.::::::::::::::... ..::.:: ..: :....:: : .:. .
NP_003 SMMPIMGYLVDLRHVSVYGSVYAIADVAFCMGYAIGPSAGGAIAKAIGFPWLMTIIGIID
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 LLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSER-DVLLDE--PPQG-LYDAVRLRERPVSGQDGEPRSPP
.:.::. ..::. .. :. .:.:. : . .: .. :. :.: : .:
NP_003 ILFAPLCFFLRS----PPAKEEKMAILMDHNCPIKTKMYTQNNIQSYPI-GEDEESESD
470 480 490 500 510
520 530
pF1KE6 GPFDECEDDYNYYYTRS
>>XP_011542929 (OMIM: 193002) PREDICTED: chromaffin gran (472 aa)
initn: 1081 init1: 510 opt: 944 Z-score: 995.5 bits: 193.7 E(85289): 1e-48
Smith-Waterman score: 1043; 40.0% identity (69.2% similar) in 438 aa overlap (25-435:13-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
XP_011 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
XP_011 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
XP_011 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
:.. :. .:: :::.:::. :. ::.::.:::.::.:....:..:.:. : .. ::.::
XP_011 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
XP_011 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.::.. :. .:.::::. :: .:: . .:..:.:.::
XP_011 AK---GTPLFMLLKDPYILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLP
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
XP_011 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:
XP_011 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGYSESGLPHGDPDVCNPEA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 GMGLANLLYAPVLLLLRNVGLLTRSRSERDVLLDEPPQGLYDAVRLRERPVSGQDGEPRS
XP_011 HEGISSGGGQ
470
>>NP_001135797 (OMIM: 193002) chromaffin granule amine t (472 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
:.: : .:.::::.: :::::::::. :.::::: .
NP_001 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
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. :. .: .: .: . : ..: : .:
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: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
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160 170 180 190 200 210
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:.. :. .:: :::.:::. :. ::.::.:::.::.:....:..:.:. : .. ::.::
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300 310 320 330
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: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
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NP_001 HEGISSGGGQ
470
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10 20 30 40 50 60
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70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
XP_011 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
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pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
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XP_011 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
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160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
:.. :. .:: ::: .:: :.:. : .. ::.::
XP_011 PMFAGFVIMFLSTV------------------SLG----------MLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200
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pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
XP_011 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
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pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
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pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
XP_011 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
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pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
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XP_011 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
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pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
XP_011 DEEPDHEE
490
>>NP_001135796 (OMIM: 193002) chromaffin granule amine t (493 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESAEPAGQARAAATKLSEAVGAALQEPRRQRRLVLVIVCVALLLDNMLYMVIVPIVPDY
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NP_001 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
NP_001 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
: :. . . .. :. : : ...::::::::..::::::. ::. .:..: .
NP_001 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
:.. :. .:: :::.:::. :. ::.::.:::.::.:....:..:.:. : .. ::.::
NP_001 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LGVALAFISFGSLVAPPFGGILYEFAGKRVPFLVLAAVSLFDALLLLAVAKPFSAAARAR
.:.::. ...: ::. :::...:::.:: .:::.:: ..:.:. : : . .: : ..
NP_001 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
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280 290 300 310 320 330
pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
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290 300 310
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pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
: : ...:. : :: .. .:: . .:. :.:.: :: ... :. :: ..
NP_001 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
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pF1KE6 IALVDTALLPTLAFLVDVRHVSVYGSVYAIADISYSVAYALGPIVAGHIVHSLGFEQLSL
:..::....: .. :::.::.:::::::::::... ...:.:: ..: ::...:: : .
NP_001 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
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NP_001 ITGVINIVYAPLCYYLRS----PPAKEEKLAILSQDCPMETRMYATQKPTKEFPL-GEDS
440 450 460 470 480
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pF1KE6 EPRSPPGPFDECEDDYNYYYTRS
.
NP_001 DEEPDHEE
490
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XP_011 MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTF
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE6 IA-----------HMRGGGEGP--TRTPE-------------VWEPTLPLPTP-ANASAY
. :. .: .: .: . : ..: : .:
XP_011 LYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGIAWMNDTAS
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TANTSASPTAAWPAGSALRPRYPTESEDVKIGVLFASKAILQLLVNPLSGPFIDRMSYDV
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XP_011 TIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHI
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 PLLIGLGVMFASTVLFAFAEDYATLFAARSLQGLGSAFADTSGIAMIADKYPEEPERSRA
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XP_011 PMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQGIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRA
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220 230 240 250 260 270
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XP_011 MGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQP-SKVSPES
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 ANLPVGTPIHRLMLDPYIAVVAGALTTCNIPLAFLEPTIATWMKHTMAASEWEMGMAWLP
:. :::. :. :::: :.: :.:.::
XP_011 AK---GTPLFMLLKDPYILVAA--------------------------------GLAFLP
290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AFVPHVLGVYLTVRLAARYPHLQWLYGALGLAVIGASSCIVPACRSFAPLVVSLCGLCFG
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XP_011 ASVSYLIGTNLFGVLANKMG--RWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLGLA
320 330 340 350 360 370
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XP_011 IGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMV
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.
XP_011 DEEPDHEE
490
>>XP_016865725 (OMIM: 613361) PREDICTED: MFS-type transp (409 aa)
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..::.. . : .. ... .. :. : . :.::. . : : .: ...
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.. : : :.. ...: .:.. . .:: .: ..: ...:: ::.::. : .:::.
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::. : :. . : . . . . : . .:. : ....: .... . ..
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::.::.. .. . . .:...: . .... : :. . : : .:: .: :
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: ..: . . . . :.. . :: :.... ::. ... :
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.:. : : .. . .:.. .:: ..: . ...::: . .:: :. . .. :.
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. :.::. . .:
XP_016 LEYSRRKRSKSQNILSTEEERTTLLPNET
390 400
532 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:52:54 2016 done: Tue Nov 8 13:52:55 2016
Total Scan time: 6.560 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]