Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6493
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6493, 610 aa
1>>>pF1KE6493 610 - 610 aa - 610 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1916+/-0.000501; mu= 19.9297+/- 0.031
mean_var=68.3956+/-14.194, 0's: 0 Z-trim(107.8): 64 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155082
statistics sampled from 15829 (15890) to 15829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.524), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 7.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_666018 (OMIM: 608044) sodium-coupled monocarbox ( 610) 4020 909.3 0
XP_016874399 (OMIM: 608044) PREDICTED: sodium-coup ( 444) 2897 657.9 2e-188
NP_848593 (OMIM: 612455) sodium-coupled monocarbox ( 618) 2055 469.6 1.4e-131
NP_000444 (OMIM: 274400,601843) sodium/iodide cotr ( 643) 1953 446.8 1e-124
XP_006718219 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 417) 1794 411.1 3.8e-114
XP_011518223 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 413) 1724 395.5 1.9e-109
NP_066918 (OMIM: 604024) sodium-dependent multivit ( 635) 1694 388.9 2.9e-107
XP_006712193 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 1694 388.9 2.9e-107
XP_006712191 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 1694 388.9 2.9e-107
XP_006712192 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 1694 388.9 2.9e-107
XP_016882647 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 554) 1651 379.2 2e-104
XP_006718218 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 507) 1600 367.8 5.1e-101
XP_011526494 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 654) 1271 294.2 9e-79
XP_011518222 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 1169 271.3 4.8e-72
XP_016872733 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 1169 271.3 4.8e-72
XP_011526495 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 565) 969 226.6 1.8e-58
XP_016860705 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 426) 926 216.9 1.1e-55
XP_011531448 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 412) 891 209.1 2.4e-53
XP_011526496 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 532) 849 199.8 2e-50
NP_001291934 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 580) 270 70.2 2.2e-11
NP_068587 (OMIM: 158580,608761,617143) high affini ( 580) 270 70.2 2.2e-11
XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodi ( 432) 254 66.6 2e-10
NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cot ( 664) 254 66.7 2.9e-10
NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotra ( 675) 252 66.3 4e-10
XP_016878390 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 252 66.3 4e-10
XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 252 66.3 4e-10
XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 252 66.3 4e-10
XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 252 66.3 4e-10
XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 252 66.3 4e-10
NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cot ( 672) 251 66.0 4.6e-10
XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodi ( 705) 251 66.1 4.8e-10
XP_016878396 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 243 64.2 1.4e-09
XP_016878397 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 243 64.2 1.4e-09
XP_016878393 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 662) 243 64.2 1.6e-09
NP_008864 (OMIM: 600444) sodium/myo-inositol cotra ( 718) 239 63.4 3.1e-09
NP_001245342 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 611) 223 59.7 3.3e-08
XP_016878395 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 611) 223 59.7 3.3e-08
NP_001245343 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 519) 214 57.7 1.2e-07
XP_016860118 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 475) 206 55.9 3.7e-07
NP_001291935 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 475) 206 55.9 3.7e-07
XP_011509882 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 496) 206 55.9 3.9e-07
XP_016860117 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 542) 206 55.9 4.2e-07
XP_011544030 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 365) 147 42.6 0.0029
>>NP_666018 (OMIM: 608044) sodium-coupled monocarboxylat (610 aa)
initn: 4020 init1: 4020 opt: 4020 Z-score: 4859.6 bits: 909.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4020; 100.0% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNHIELNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_666 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNHIELNSD
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE6 QSGKSNGTRL
::::::::::
NP_666 QSGKSNGTRL
610
>>XP_016874399 (OMIM: 608044) PREDICTED: sodium-coupled (444 aa)
initn: 2897 init1: 2897 opt: 2897 Z-score: 3503.7 bits: 657.9 E(85289): 2e-188
Smith-Waterman score: 2897; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
::::::::::::::::::::
XP_016 GGPLMGLFALGILVPFANSIIFMG
430 440
>>NP_848593 (OMIM: 612455) sodium-coupled monocarboxylat (618 aa)
initn: 2168 init1: 2037 opt: 2055 Z-score: 2483.5 bits: 469.6 E(85289): 1.4e-131
Smith-Waterman score: 2163; 53.9% identity (80.5% similar) in 605 aa overlap (7-609:3-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
. .:.::::::::... ::..::...:. . ::..::.:::.:. ::.::
NP_848 MEVKNFAVWDYVVFAALFFISSGIGVFFAIKERKKATSREFLVGGRQMSFGPVGLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
::::::::::::::::::::::: : .: ..:.::.....:.::::::. :::::::::.
NP_848 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGASFLVFFIAYLFVILLTSELFLPVFYRSGITSTYEYLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
::::: :: .::..:::::::::.:.:::::::::::::::::.: :::.:::::::::
NP_848 LRFNKPVRYAATVIYIVQTILYTGVVVYAPALALNQVTGFDLWGSVFATGIVCTFYCTLG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
:::::.:::.::. .:..:: .:.::. . ::. ..:... .:.::....:. .::.::
NP_848 GLKAVVWTDAFQMVVMIVGFLTVLIQGSTHAGGFHNVLEQSTNGSRLHIFDFDVDPLRRH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
::::: .:::::: .::::::: .:: ::::.. .:::.::.::.::: ::.:.:: ::
NP_848 TFWTITVGGTFTWLGIYGVNQSTIQRCISCKTEKHAKLALYFNLLGLWIILVCAVFSGLI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
.::...::::::. .:::::::::.:..:. .:::::::::::.:::::::.::::::
NP_848 MYSHFKDCDPWTSGIISAPDQLMPYFVMEIFATMPGLPGLFVACAFSGTLSTVASSINAL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
:.:: ::..: : ::.. .:::.:. ...:..: .::. ::.::...::.::. ::
NP_848 ATVTFEDFVKSCFPHLSDKLSTWISKGLCLLFGVMCTSMAVAASVMGGVVQASLSIHGMC
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
:::..:::.:::. ::.: ::: ::..:...:.::.::: ::: .: :: :. . :
NP_848 GGPMLGLFSLGIVFPFVNWKGALGGLLTGITLSFWVAIGAFIYPAPASKTWPLPLSTDQC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
..:. :.: : .: : . :.:::.::::.:.:: : ...:...:
NP_848 I----KSNV-TATGPPVLSS--------RPGIADTWYSISYLYYSAVGCLGCIVAGVIIS
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE6 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNH--IELN
: :: :... : . .: . . :. : .::. .:.::.. ... . .
NP_848 LITG-RQRGEDIQPLLIRP--VCNLFCFWSKKYKTLCWCGVQHDSGTEQENLENGSARKQ
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KE6 SDQSGKSNGTRL
. .: .:: :
NP_848 GAESVLQNGLRRESLVHVPGYDPKDKSYNNMAFETTHF
590 600 610
>>NP_000444 (OMIM: 274400,601843) sodium/iodide cotransp (643 aa)
initn: 1712 init1: 1633 opt: 1953 Z-score: 2359.9 bits: 446.8 E(85289): 1e-124
Smith-Waterman score: 1953; 51.8% identity (81.1% similar) in 550 aa overlap (9-552:11-560)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVA
:: .::: ::: ::..:..::.. ..: :::....::. ::::..:.::.
NP_000 MEAVETGERPTFGAWDYGVFALMLLVSTGIGLWVGLARGGQRSAEDFFTGGRRLAALPVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LSLTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEY
:::.::::::: :::.:::.::.: : . . .. :..: .:.::::.::.::::::
NP_000 LSLSASFMSAVQVLGVPSEAYRYGLKFLWMCLGQLLNSVLTALLFMPVFYRLGLTSTYEY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LELRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCT
::.::.. ::::::. .:: :.:::::::::::: ::::::.:.:.....::..:::: .
NP_000 LEMRFSRAVRLCGTLQYIVATMLYTGIVIYAPALILNQVTGLDIWASLLSTGIICTFYTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQ
.::.:::.::::::: .:..:: :. ..:.. :: .:. : . .:.:. .:::.: .
NP_000 VGGMKAVVWTDVFQVVVMLSGFWVVLARGVMLVGGPRQVLTLAQNHSRINLMDFNPDPRS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RHTFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCG
:.::::...:::..: :.:::::.:::::..:... ::::.: :: :::. :.. .. ::
NP_000 RYTFWTFVVGGTLVWLSMYGVNQAQVQRYVACRTEKQAKLALLINQVGLFLIVSSAACCG
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pF1KE6 LALYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSIN
.... : :::: ..::::: :: :::::..: ::.::::.::::::::::.:.:::
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NP_000 AMAAVTVEDLIKPRLRSLAPRKLVIISKGLSLIYGSACLTVAALSSLLGGGVLQGSFTVM
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: . . : ..:. . .: . : ....: : :..:..::::....:::.:.
NP_000 ARCVALSVNASGLLDPALLPANDSSRAPSSGMDASRPALADSFYAISYLYYGALGTLTTV
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: : :.: :: :.. : :
NP_000 LCGALISCLTGPTKRSTLAPGLLWWDLARQTASVAPKEEVAILDDNLVKGPEELPTGNKK
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10 20 30 40 50 60
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. .:.::::::::... ::..::...:. . ::..::.:::.:. ::.::
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::::::::::::::::::::::: : .: ..:.::.....:.::::::. :::::::::.
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::::: :: .::..:::::::::.:.:::::::::::::::::.: :::.:::::::::
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:::::.:::.::. .:..:: .:.::. . ::. ..:... .:.::....:. .::.::
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::::: .:::::: .::::::: .:: ::::.. .:::.::.::.::: ::.:.:: ::
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XP_006 N
>>XP_011518223 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coupled (413 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
. .:.::::::::... ::..::...:. . ::..::.:::.:. ::.::
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XP_011 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGASFLVFFIAYLFVILLTSELFLPVFYRSGITSTYEYLQ
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pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
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XP_011 MYSHFKDCDPWTSGIISAPDQLMPYFVMEIFATMPGLPGLFVACAFSGTLSTVASSINAL
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pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGM--SVV------YGALCIGMAALASLMGALLQA
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pF1KE6 ALSVFGMVGGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLP
>>NP_066918 (OMIM: 604024) sodium-dependent multivitamin (635 aa)
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::.: .::.:::::::::: ::.:::: :: : ..: :.:.:::.:::: ::::::: .:
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. . : : : ::.... :.. : . ... .::::.. :.:.:.:. :::::::.:
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: :: .::::.:.::::::::.::: ::.. : :: ::.:::.::.....:.:::. :
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. : . .. . : : .:: ::.:: .. .. .::::::.
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.:. .. ....::..::: :: : ..:.: : . .:: . . .:. : :: .
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.. :
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:. :.: .:::::: :.:.:::..::.:::.::::. . ... ::. ..: :..:.::
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pF1KE6 FYKLGITSTYEYLELRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAV
::.: .::.:::::::::: ::.:::: :: : ..: :.:.:::.:::: ::::::: .:
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: :: .::::.:.::::::::.::: ::.. : :: ::.:::.::.....:.:::. :
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XP_006 TSMGSSMPPSPSNGSSFSLPTNLTVATVTTLMPLTT-------FSKPTGLQRFYSLSYLW
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pF1KE6 FSTVGTLVTLLVGILVSLSTGG-RKQNLDPRYIL-TKEDFLSNFDI-FKKKKHVLSYKSH
.:. .. ....::..::: :: : ..:.: : . .:: . . .:. : :: .
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pF1KE6 PVEDGGTDNPAFNHIELNSDQSGKSNGTRL
.. :
XP_006 HLDTGLFPEKPRNGVLGDSRDKEAMALDGTAYQGSSSTCILQETSL
590 600 610 620 630
>>XP_006712191 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-dependen (635 aa)
initn: 1673 init1: 1595 opt: 1694 Z-score: 2046.8 bits: 388.9 E(85289): 2.9e-107
Smith-Waterman score: 1694; 46.3% identity (73.5% similar) in 589 aa overlap (3-585:17-594)
10 20 30 40
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFL
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pF1KE6 MGGRRMTAVPVALSLTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPV
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XP_006 MADRKMGCLPVALSLLATFQSAVAILGVPSEIYRFGTQYWFLGCCYFLGLLIPAHIFIPV
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XP_006 FYRLHLTSAYEYLELRFNKTVRVCGTVTFIFQMVIYMGVVLYAPSLALNAVTGFDLWLSV
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pF1KE6 VATGVVCTFYCTLGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGR
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XP_006 LALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQHGR
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pF1KE6 LNFWNFNPNPLQRHTFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVG
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XP_006 ISGFELDPDPFVRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYA-VFP
250 260 270 280 290
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pF1KE6 LWAILTCSVFC--GLALYSRYHDCDPWTAKKV-SAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVA
. . : : : ::.... :.. : . ... .::::.. :.:.:.:. :::::::.:
XP_006 FQQVSLC-VGCLIGLVMFAYYQEY-PMSIQQAQAAPDQFVLYFVMDLLKGLPGLPGLFIA
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pF1KE6 CAYSGTLSTVSSSINALAAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALA
: .::.:::.::..:.::.::.::::.:.: .:: .:.:.. :: ::.::: ..
XP_006 CLFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEFSEARAIMLSRGLAFGYGLLCLGMAYIS
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pF1KE6 SLMGALLQAALSVFGMVGGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIY
: :: .::::.:.::::::::.::: ::.. : :: ::.:::.::.....:.:::. :
XP_006 SQMGPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGS-IV
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