Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6488
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6488, 559 aa
1>>>pF1KE6488 559 - 559 aa - 559 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5333+/-0.000996; mu= 17.1994+/- 0.060
mean_var=65.8383+/-13.466, 0's: 0 Z-trim(103.8): 24 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158065
statistics sampled from 7575 (7593) to 7575 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7958.1 SLC43A1 gene_id:8501|Hs108|chr11 ( 559) 3712 855.8 0
CCDS67108.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 573) 1879 437.8 1.7e-122
CCDS11006.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 569) 1867 435.0 1.1e-121
CCDS67107.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 ( 432) 1328 312.1 9e-85
CCDS7956.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 ( 491) 295 76.5 8.2e-14
CCDS60784.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 ( 504) 295 76.5 8.4e-14
>>CCDS7958.1 SLC43A1 gene_id:8501|Hs108|chr11 (559 aa)
initn: 3712 init1: 3712 opt: 3712 Z-score: 4571.8 bits: 855.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3712; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ
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CCDS79 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSVPLRKSLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSVPLRKSLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFYSSVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFYSSVFG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQKLTNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQKLTNAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNHFGTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNHFGTLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 GLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRARLQQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 GLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRARLQQE
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE6 YAANGMGPLKVLSGSEVTA
:::::::::::::::::::
CCDS79 YAANGMGPLKVLSGSEVTA
550
>>CCDS67108.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (573 aa)
initn: 1960 init1: 1067 opt: 1879 Z-score: 2312.6 bits: 437.8 E(32554): 1.7e-122
Smith-Waterman score: 2143; 59.4% identity (81.1% similar) in 562 aa overlap (1-540:1-549)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPA-ESSTNTT
::::: :.:::::::::::::::.:::::::::::::.::.::::: : :. :: :
CCDS67 MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTNGT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE6 --------QDE---QRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRL
..: . : .:. :::::::.::.:::.::: ::::::.::..::: .::
CCDS67 VGGTAEPGHEEVSWMNGWLSCQAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 VGSACFTASCTLMALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLM
.:::::..:: :.: .. .::: :::.::.::::::.:.::::::::::::.::::..
CCDS67 LGSACFAVSCLLIAYGASKPNALSVLIFIALALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 ALMIGSYASSAITFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEV
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CCDS67 ALMIGSYASSAVTFPGIKLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 NYTKKIKLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQD
.:. :::.: :..:::.:: :: .:::.:.::: .. .:..: .: :
CCDS67 DYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE6 VRGTSENLPERSV-P-LRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQE
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CCDS67 LEVKCQ--PDAAVAPSFMHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSG---
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 HETNEQQQKVAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDAR
.:. : :::.:.:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. ::
CCDS67 -----DQKTVMATVGLYTSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDAN
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 DGVATKSIRPRYCKIQKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGF
.: :. : : .:::.:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.::::::::
CCDS67 QGEKKKKKRDR--QIQKITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGF
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FHSACGSLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLL
.::: :.:::::.::..::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.::::
CCDS67 IHSAVGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KE6 FSLLGFLLPSYLFYYRARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA
.::::: :: ::. :: .:...
CCDS67 LSLLGFCLPLYLICYRRQLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV
530 540 550 560 570
>>CCDS11006.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (569 aa)
initn: 2026 init1: 938 opt: 1867 Z-score: 2297.8 bits: 435.0 E(32554): 1.1e-121
Smith-Waterman score: 2131; 59.3% identity (80.8% similar) in 562 aa overlap (1-540:1-545)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPA-ESSTNTT
::::: :.:::::::::::::::.:::::::::::::.::.::::: : :. :: :
CCDS11 MAPTLATAHRRRWWMACTAVLENLLFSAVLLGWGSLLIMLKSEGFYSYLCTEPENVTNGT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE6 --------QDE---QRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRL
..: . : .:. :::::::.::.:::.::: ::::::.::..::: .::
CCDS11 VGGTAEPGHEEVSWMNGWLSCQAQDEMLNLAFTVGSFLLSAITLPLGIVMDKYGPRKLRL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 VGSACFTASCTLMALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLM
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CCDS11 LGSACFAVSCLLIAYGASKPNALSVLIFIALALNGFGGMCMTFTSLTLPNMFGDLRSTFI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 ALMIGSYASSAITFPGIKLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEV
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CCDS11 ALMIGSYASSAVTFPGIKLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 NYTKKIKLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQD
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CCDS11 DYSVKIKFSWLGFDHKITGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE6 VRGTSENLPERSV-P-LRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQE
.. . :. .: : . .:. :: .: ::.:: .::::.::::.:.:..:..::.: :.
CCDS11 LEVKCQ--PDAAVAPSFMHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQK
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 HETNEQQQKVAETVGFYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDAR
:::.:.:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. ::
CCDS11 ------------TVGLYTSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDAN
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 DGVATKSIRPRYCKIQKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGF
.: :. : : .:::.:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.::::::::
CCDS11 QGEKKKKKRDR--QIQKITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGF
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FHSACGSLYAAVFPSNHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLL
.::: :.:::::.::..::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.::::
CCDS11 IHSAVGGLYAAVYPSTQFGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KE6 FSLLGFLLPSYLFYYRARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA
.::::: :: ::. :: .:...
CCDS11 LSLLGFCLPLYLICYRRQLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV
530 540 550 560
>>CCDS67107.1 SLC43A2 gene_id:124935|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 1324 init1: 626 opt: 1328 Z-score: 1635.4 bits: 312.1 E(32554): 9e-85
Smith-Waterman score: 1446; 57.2% identity (80.8% similar) in 395 aa overlap (156-540:31-408)
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAITFPGI
::::::.::::..:::::::::::.:::::
CCDS67 MTYGSPQANASPSDAVALDHGEVSRRQQQELPNMFGDLRSTFIALMIGSYASSAVTFPGI
10 20 30 40 50 60
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 KLIYDAGVAFVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKIKLSGLALDHKV
::::::::.:.:.. .:.: . :.:::: .:::.: ::.::...:. :::.: :..:::.
CCDS67 KLIYDAGVSFIVVLVVWAGCSGLVFLNCFFNWPLEPFPGPEDMDYSVKIKFSWLGFDHKI
70 80 90 100 110 120
250 260 270 280 290
pF1KE6 TGDLFYTHVTTMGQRLS--------QKAPSLEDGSDAFMSPQDVRGTSENLPERSV-P-L
:: :: .:::.:.::: .. .:..: .: :.. . :. .: : .
CCDS67 TGKQFYKQVTTVGRRLSVGSSMRSAKEQVALQEGHKLCLSTVDLEVKCQ--PDAAVAPSF
130 140 150 160 170
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVGFY
.:. :: .: ::.:: .::::.::::.:.:..:..::.: :. :::.:
CCDS67 MHSVFSPILLLSLVTMCVTQLRLIFYMGAMNNILKFLVSGDQK------------TVGLY
180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 SSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKIQK
.:.::..::::::: :.::::::::.:.: :: .. :: .: :. : : .:::
CCDS67 TSIFGVLQLLCLLTAPVIGYIMDWRLKECEDA-SEEPEEKDANQGEKKKKKRDR--QIQK
230 240 250 260 270 280
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPSNH
.:::. ::..:::::::::.:::: :: ::...:.::::::::.::: :.:::::.::..
CCDS67 ITNAMRAFAFTNLLLVGFGVTCLIPNLPLQILSFILHTIVRGFIHSAVGGLYAAVYPSTQ
290 300 310 320 330 340
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 FGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYYRA
::.::::::::::.:::::::::.::.:::.:.:.:::.::::.::::: :: ::. ::
CCDS67 FGSLTGLQSLISALFALLQQPLFLAMMGPLQGDPLWVNVGLLLLSLLGFCLPLYLICYRR
350 360 370 380 390 400
540 550
pF1KE6 RLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA
.:...
CCDS67 QLERQLQQRQEDDKLFLKINGSSNQEAFV
410 420 430
>>CCDS7956.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 (491 aa)
initn: 513 init1: 271 opt: 295 Z-score: 361.5 bits: 76.5 E(32554): 8.2e-14
Smith-Waterman score: 660; 29.1% identity (58.5% similar) in 530 aa overlap (18-540:15-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESSTNTTQ
:..:: : :..::.:: ::....::: .... : ... .
CCDS79 MAGQGLPLHVATLLTGLLECLGFAGVLFGWPSLVFVFKNEDYFKDLCGPDAGPIGNA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DEQRRWPGCDQQDEMLNLGFTIGSFVLSATTLPLGILMDRFGPRPVRLVGSACFTASCTL
: : ::: ..: ::.:::. . :.: : ..::: .::.. .:.. .
CCDS79 TGQ---ADCKAQDERFSLIFTLGSFMNNFMTFPTGYIFDRFKTTVARLIAIFFYTTATLI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MALASRDVEALSPLIFLALSLNGFGGICLTFTSLTLPNMFGNLRSTLMALMIGSYASSAI
.:..: .: .:::. . .::: . .:.: . :.::. :::...:. :.. ::.
CCDS79 IAFTSAGSAVL---LFLAMPMLTIGGILFLITNLQIGNLFGQHRSTIITLYNGAFDSSSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 TFPGIKLIYDAGVA------FVVIMFTWSGLACLIFLNCTLNWPIEAFPAPEEVNYTKKI
.: :::.:. :.. :. . :: .... : .: : ::.
CCDS79 VFLIIKLLYEKGISLRASFIFISVCSTWHVARTFLLM------PRGHIPYPLPPNYSY--
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KLSGLALDHKVTGDLFYTHVTTMGQRLSQKAPSLEDGSDAFMSPQD-VRGTSENLPERSV
:: :. :: .. . . . : : :.: .. . :.... ::
CCDS79 ---GLC-----PGN-----GTTKEEKETAEHENRELQSKEFLSAKEETPGAGQKQELRS-
230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PLRKSLCSPTFLWSLLTMGMTQLRIIFYMAAVNKMLEYLVTGGQEHETNEQQQKVAETVG
. . : : : :. ... :: ......:..: .. : . . :.
CCDS79 -FWSYAFSRRFAWHLVWLSVIQLWHYLFIGTLNSLLTNMAGGDMAR------------VS
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FYSSVFGAMQLLCLLTCPLIGYIMDWRIKDCVDAPTQGTVLGDARDGVATKSIRPRYCKI
:...:. :. .: : : .:: :.:. . .. : :.. .::
CCDS79 TYTNAFAFTQF-GVLCAPWNGLLMD-RLKQKYQKEARKT--GSSTLAVA-----------
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 QKLTNAISAFTLTNLLLVGFGITCLINNLHLQFVTFVLHTIVRGFFHSACGSLYAAVFPS
: ... ...::.:: .::.. . : ::..::.:..: :.:.... ... . .:::
CCDS79 --LCSTVPSLALTSLLCLGFALCASVPILPLQYLTFILQVISRSFLYGSNAAFLTLAFPS
370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 NHFGTLTGLQSLISAVFALLQQPLFMAMVGPLKGEPFWVNLGLLLFSLLGFLLPSYLFYY
.::: : :: .::: .::: :.: . : :...::.::. ..: :: :. : .: :
CCDS79 EHFGKLFGLVMALSAVVSLLQFPIFTLIKGSLQNDPFYVNVMFMLAILLTFFHP-FLVYR
420 430 440 450 460 470
540 550
pF1KE6 RARLQQEYAANGMGPLKVLSGSEVTA
. : .:
CCDS79 ECRTWKESPSAIA
480 490
>>CCDS60784.1 SLC43A3 gene_id:29015|Hs108|chr11 (504 aa)
initn: 524 init1: 271 opt: 295 Z-score: 361.3 bits: 76.5 E(32554): 8.4e-14
Smith-Waterman score: 660; 29.1% identity (58.1% similar) in 540 aa overlap (18-540:15-498)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAPTLQQAYRRRWWMACTAVLENLFFSAVLLGWGSLLIILKNEGFYSSTCPAESST--NT
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