Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6486, 584 aa
1>>>pF1KE6486 584 - 584 aa - 584 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9977+/-0.000989; mu= 20.4765+/- 0.059
mean_var=69.3356+/-14.448, 0's: 0 Z-trim(104.8): 34 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.154027
statistics sampled from 8052 (8071) to 8052 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31909.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 584) 3888 873.6 0
CCDS81744.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 528) 2345 530.7 1.8e-150
CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20 ( 644) 289 73.9 7.2e-13
CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 558) 275 70.7 5.6e-12
CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 603) 275 70.7 5.9e-12
CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 622) 275 70.7 6e-12
>>CCDS31909.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 (584 aa)
initn: 3888 init1: 3888 opt: 3888 Z-score: 4667.3 bits: 873.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3888; 100.0% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRRLNLRWALSVLCVLLMAETVSGTRGSSTGAHISPQFPASGVNQTPVVDCRKVCGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAGRRLNLRWALSVLCVLLMAETVSGTRGSSTGAHISPQFPASGVNQTPVVDCRKVCGLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VSDRCDFIRTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSDRCDFIRTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VTTVVAGGITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VTTVVAGGITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VVTVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYGDEYRPLFFYQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVTVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYGDEYRPLFFYQET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TAQILVRALNPLDYMKWRRKSAYWKALKVFKLPVEFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TAQILVRALNPLDYMKWRRKSAYWKALKVFKLPVEFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLVPVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLVPVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE6 SLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
550 560 570 580
>>CCDS81744.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 2344 init1: 2344 opt: 2345 Z-score: 2814.9 bits: 530.7 E(32554): 1.8e-150
Smith-Waterman score: 3405; 90.4% identity (90.4% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGRRLNLRWALSVLCVLLMAETVSGTRGSSTGAHISPQFPASGVNQTPVVDCRKVCGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAGRRLNLRWALSVLCVLLMAETVSGTRGSSTGAHISPQFPASGVNQTPVVDCRKVCGLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VSDRCDFIRTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VSDRCDFIRTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FFCPNLSAISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFG----
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VTTVVAGGITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFY
::::::::
CCDS81 ----------------------------------------------------YLGLYVFY
180
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VVTVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYGDEYRPLFFYQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VVTVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYGDEYRPLFFYQET
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TAQILVRALNPLDYMKWRRKSAYWKALKVFKLPVEFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TAQILVRALNPLDYMKWRRKSAYWKALKVFKLPVEFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNC
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLVPVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLVPVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWL
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLAR
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 QGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGLGCLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVF
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580
pF1KE6 SLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
490 500 510 520
>>CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20 (644 aa)
initn: 445 init1: 234 opt: 289 Z-score: 344.5 bits: 73.9 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 409; 25.3% identity (54.7% similar) in 534 aa overlap (99-578:109-632)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAKFFCPNLSA
::.:.: .:.: :... :: :.:
CCDS13 AGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVA-FSDPHTAGLALGALFGAGVLVTTVVAG
: :.::..:::.::.: :..::..:..... : .:. :.. :..:. . :
CCDS13 ICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGV--GTIVGSAVFNILCIIG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 --GITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFYVVTVI
:. . .: ..:: ..: ..:. ..... .:. .: . .:..:.: .
CCDS13 VCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMK
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KE6 LCTWIYQ-RQRR----GSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYG--------DE--
. :.: .:: :.. . . :: ..:. : . .. .. ::
CCDS13 YNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKKANFHRKASVIMVDELL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330
pF1KE6 --YRPLFFYQETTAQILVRALNP----LDY-----MKWRRKSAYWKALK------VFKLP
: . ..:. .:.. . : :.. .. :.. .: ..:.:
CCDS13 SAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380
pF1KE6 VEFLLLL-TVPVVDPDK-------DD-----QNWKRPLNCLHLVISPLVVVLTLQSGTYG
.. . : : ::. :: : . : . . : :
CCDS13 IKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYT
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE6 VYEI--GGLVPV-WVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWLFAFL-GFLTSALWINAA
.. : : : :. . :. : .:.. . . :: : :. : .:.::: :
CCDS13 PFDTPSGKLETVKWAFT----WPLSFVLYFTVPNCNKPR--WEKWFMVTFASSTLWIAAF
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 ATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLARQGYPRMAFSACFGGII
. .: .. .: .. . ....:.:.:: :.:. : .... .::::. :: : .:. .
CCDS13 SYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNV
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 FNILVGVGLGCLLQ-ISRSH-TEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVFSLVSVPLQCFQLSR
:.::.:.:: :: .. .. . ..:. ::. : : : :. .. .: :. .::..
CCDS13 FDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSV--GLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDK
560 570 580 590 600
560 570 580
pF1KE6 VYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
: ::.: :: ...:::.:
CCDS13 KLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
610 620 630 640
>>CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (558 aa)
initn: 452 init1: 209 opt: 275 Z-score: 328.6 bits: 70.7 E(32554): 5.6e-12
Smith-Waterman score: 436; 24.9% identity (55.4% similar) in 522 aa overlap (99-578:35-545)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAKFFCPNLSA
:: :.. ::.: :... :: :.:
CCDS45 NGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEK
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVLVTTVVAG-
: :.::..:::.::.: :...:..:..... : . ...:.. :..:. . :
CCDS45 ICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITH-GDVGVGTIVGSAVFNILCIIGV
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 -GITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFYVV----
:. . . :: :.: ..:.. ..... ... .: . :::::..
CCDS45 CGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVFIYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKY
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280
pF1KE6 TVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEI-----LSDSEEDRVS-----SNTNSYDYG----
.: . ... .:. :. ::. :. . :. : : . .. .::
CCDS45 NVKMQAFFTVKQK--SIANGNPVNSELEAGNDFYDGSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPV
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330
pF1KE6 ---DEYR----PLFFYQETTAQILVRA-LNPLDYMKW-------RRKSAYWKALKVFKLP
:: : : . :. .:.. ..: .. .:. .: : . :
CCDS45 VMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRIIINERQRLINSANGVSSKP
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380
pF1KE6 V-----EFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNCLHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLV
. : . .::: .:. .:: .. : : . : ..: : :
CCDS45 LQNGRHENIENGNVPVENPEDPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLS-PFSVPEARGDK
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 PVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLG
:: . : . . . . :: . .: .. :.:..::: . . .: .. .:
CCDS45 VKWVFT----WPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFF-MVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIG
370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 VVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLARQGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGL--G
.. . ....:.:.:: :.:. : .... .:::: :: : .:. .:.::::.:. :
CCDS45 YTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWG
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 CLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVFSLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLN
.. . ::.. :: :. .. :: :........ :. ..:.: : .:..:
CCDS45 LQTMVVNYGSTVKINSRGL-VYSVVLLLG-SVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAI
480 490 500 510 520 530
570 580
pF1KE6 FLVVALLTEFGVIHLKSM
:: ... ::.:
CCDS45 FLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
540 550
>>CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (603 aa)
initn: 452 init1: 209 opt: 275 Z-score: 328.1 bits: 70.7 E(32554): 5.9e-12
Smith-Waterman score: 465; 24.9% identity (57.1% similar) in 503 aa overlap (99-578:99-590)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAKFFCPNLSA
:: :.. ::.: :... :: :.:
CCDS45 NGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVLVTTVVAG-
: :.::..:::.::.: :...:..:..... : . ...:.. :..:. . :
CCDS45 ICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITH-GDVGVGTIVGSAVFNILCIIGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 -GITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFYVV----
:. . . :: :.: ..:.. ..... ... .: . :::::..
CCDS45 CGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVFIYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSY--DYGDEYRPLFFYQET
.: . ... .:. :. ::. :. . .:. . ..: . . . : : . :.
CCDS45 NVKMQAFFTVKQK--SIANGNPVNSELEAVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE6 TAQILVRA-LNPLDYMKW-------RRKSAYWKALKVFKLPV-----EFLLLLTVPVVDP
.:.. ..: .. .:. .: : . :. : . .::: .:
CCDS45 GLRIMITNKFGPRTRLRMASRIIINERQRLINSANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 DKDDQNWKRPLNCLHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLVPVWVVVVIAGTALASVTFF
. .:: .. : : . : ..: : : :: . : .
CCDS45 EDPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLS-PFSVPEARGDKVKWVFT----WPLIFLLCV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 ATSDSQPPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGN
. . . :: . .: .. :.:..::: . . .: .. .: .. . ....:.:.:: :.
CCDS45 TIPNCSKPRWEKFF-MVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGT
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 SIGDAFSDFTLARQGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGL--GCLLQISRSHTEVKLEPDGL
:. : .... .:::: :: : .:. .:.::::.:. : .. . ::.. ::
CCDS45 SVPDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 LVWVLAGALGLSLVFSLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM
:. .. :: :........ :. ..:.: : .:..: :: ... ::.:
CCDS45 -VYSVVLLLG-SVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLP
540 550 560 570 580 590
CCDS45 MCREDD
600
>>CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (622 aa)
initn: 452 init1: 209 opt: 275 Z-score: 327.9 bits: 70.7 E(32554): 6e-12
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]