Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6484
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6484, 621 aa
1>>>pF1KE6484 621 - 621 aa - 621 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5588+/-0.000419; mu= 17.7136+/- 0.026
mean_var=73.1128+/-14.932, 0's: 0 Z-trim(110.9): 45 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.149995
statistics sampled from 19256 (19297) to 19256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 6.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001310502 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 506) 753 172.9 2.5e-42
NP_001310503 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 515) 753 172.9 2.5e-42
XP_011516722 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 871) 702 162.0 8.1e-39
XP_016870038 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 917) 702 162.0 8.5e-39
XP_016870037 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 961) 702 162.0 8.8e-39
XP_016870036 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1064) 702 162.0 9.6e-39
XP_016870035 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1068) 702 162.0 9.6e-39
XP_005251906 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1108) 702 162.0 9.9e-39
XP_016870034 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1142) 702 162.0 1e-38
XP_011516720 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1182) 702 162.0 1e-38
NP_056054 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypeptidas (1186) 702 162.0 1.1e-38
XP_005251905 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1226) 702 162.0 1.1e-38
NP_001317630 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1226) 702 162.0 1.1e-38
XP_016870033 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1226) 702 162.0 1.1e-38
NP_001273646 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1238) 702 162.0 1.1e-38
NP_001273644 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1278) 702 162.0 1.1e-38
XP_016858086 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 464) 627 145.6 3.7e-34
XP_016858085 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 490) 627 145.6 3.9e-34
XP_016858084 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 491) 627 145.6 3.9e-34
NP_001310504 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 494) 627 145.6 3.9e-34
NP_116174 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypeptidas ( 503) 627 145.6 4e-34
XP_011519530 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 795) 494 116.9 2.7e-25
XP_016877409 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 862) 494 116.9 2.9e-25
XP_011519529 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1057) 494 117.0 3.4e-25
XP_016877407 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1110) 494 117.0 3.5e-25
NP_689549 (OMIM: 615496,615523) cytosolic carboxyp (1112) 494 117.0 3.5e-25
XP_011519528 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1121) 494 117.0 3.6e-25
XP_016877408 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1093) 475 112.9 6e-24
XP_011540610 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 531) 393 95.0 7.2e-19
XP_016858087 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 258) 379 91.8 3.2e-18
XP_016877410 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 725) 358 87.5 1.8e-16
XP_011540612 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 270) 299 74.5 5.5e-13
NP_001030584 (OMIM: 615900,617023) cytosolic carbo ( 717) 282 71.0 1.6e-11
XP_005264534 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 805) 282 71.1 1.7e-11
XP_011531313 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11
NP_068603 (OMIM: 615900,617023) cytosolic carboxyp ( 886) 282 71.1 1.9e-11
XP_011531315 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11
XP_011531314 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11
>>NP_001310502 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypeptidase (506 aa)
initn: 620 init1: 342 opt: 753 Z-score: 881.0 bits: 172.9 E(85289): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 827; 34.5% identity (63.9% similar) in 441 aa overlap (151-569:21-449)
130 140 150 160 170
pF1KE6 TQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGNRTP-LKQPVDY----RDNTLMFEARF
.::: . . :. : . . :.:.: :
NP_001 MAEGSQSAPEAGNDMGNDDAIGGNVSKYIVLPTGYCGQPKKGHLIFDACF
10 20 30 40 50
180 190 200 210 220
pF1KE6 ESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTNMRAG----------IVYR--F
::::: .: .:.:.::.: .::: . . :. : : :.. . .: : :
NP_001 ESGNLGRVDQVSEFEYDLFIRPDTCNPRFRVWFNFTVENVKESQVREIVDTFRVVLRVIF
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pF1KE6 TIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNNPGQDGRHYFSLTWT
.::::.: ::: :: :. : .. : :::. . :: : : :. . ....
NP_001 NIVNFSKTKSLYRDGMAPMVKSTSRPK-----WQRLPPKNVYYYRCP--DHRKNYVMSFA
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290 300 310 320 330 340
pF1KE6 FQFPHNKDTCYFAHCYPYTYTNLQEYLSGINNDPVRSKFCKIRVLCHTLARNMVYILTIT
: : ...: ::.::::::: .:.::..... . . : . . : ... . . .::::
NP_001 FCFDREEDIYQFAYCYPYTYTRFQHYLDSLQKRNM-DYFFREQ-LGQSVQQRKLDLLTIT
170 180 190 200 210 220
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 TPLKNSDSRKRKAVILTARVHPGETNSSWIMKGFLDYILGNSSDAQLLRDTFVFKVVPML
.: . .. ..:.:..:.::::::: ::.. .:..:..... : .::. .:::..:::
NP_001 SPDNLREGAEQKVVFITGRVHPGETPSSFVCQGIIDFLVSQHPIACVLREYLVFKIAPML
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pF1KE6 NPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRNYTSLLKESFPSVWYTRNMVHRLME--KREVILYCDLHG
::::: .::::::: : ::::.. . :.. ..... .... : . .: :.:.
NP_001 NPDGVYLGNYRCSLMGFDLNRHWLDPSPWVHPTLHGVKQLIVQMYNDPKTSLEFYIDIHA
290 300 310 320 330 340
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 HSRKENIFMYGCDGSDRSKTLYLQQRIFPLMLSKNCPDKFSFSACKFNVQKSKEGTGRVV
:: : :::: :. . . .: ::: .: .: : ::.:. .:: . : ::::
NP_001 HSTMMNGFMYGNIFEDEER--FQRQAIFPKLLCQNAED-FSYSSTSFNRDAVKAGTGRRF
350 360 370 380 390
530 540 550 560 570
pF1KE6 MWKMGIRNSF--TMEATFCGSTL-GNKRGTHFSTKDLESMGYHFCDSLLDYCDPDRTKYY
. . ..:. :.:..: . . :. .. .. . ..: . ..:::
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pF1KE6 RCLKELEEMERHITLEKVFEDSDTPVIDITLDVESRELTFLLR
NP_001 VAIPMPRLRKEKSPPYKHPLLRGPASNYPNSKGDKKSSVNHKDPSTPF
460 470 480 490 500
>>NP_001310503 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypeptidase (515 aa)
initn: 628 init1: 342 opt: 753 Z-score: 880.9 bits: 172.9 E(85289): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 827; 34.5% identity (63.9% similar) in 441 aa overlap (151-569:21-449)
130 140 150 160 170
pF1KE6 TQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGNRTP-LKQPVDY----RDNTLMFEARF
.::: . . :. : . . :.:.: :
NP_001 MAEGSQSAPEAGNDMGNDDAIGGNVSKYIVLPTGYCGQPKKGHLIFDACF
10 20 30 40 50
180 190 200 210 220
pF1KE6 ESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTNMRAG----------IVYR--F
::::: .: .:.:.::.: .::: . . :. : : :.. . .: : :
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pF1KE6 TIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNNPGQDGRHYFSLTWT
.::::.: ::: :: :. : .. : :::. . :: : : :. . ....
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pF1KE6 FQFPHNKDTCYFAHCYPYTYTNLQEYLSGINNDPVRSKFCKIRVLCHTLARNMVYILTIT
: : ...: ::.::::::: .:.::..... . . : . . : ... . . .::::
NP_001 FCFDREEDIYQFAYCYPYTYTRFQHYLDSLQKRNM-DYFFREQ-LGQSVQQRKLDLLTIT
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pF1KE6 TPLKNSDSRKRKAVILTARVHPGETNSSWIMKGFLDYILGNSSDAQLLRDTFVFKVVPML
.: . .. ..:.:..:.::::::: ::.. .:..:..... : .::. .:::..:::
NP_001 SPDNLREGAEQKVVFITGRVHPGETPSSFVCQGIIDFLVSQHPIACVLREYLVFKIAPML
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pF1KE6 NPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRNYTSLLKESFPSVWYTRNMVHRLME--KREVILYCDLHG
::::: .::::::: : ::::.. . :.. ..... .... : . .: :.:.
NP_001 NPDGVYLGNYRCSLMGFDLNRHWLDPSPWVHPTLHGVKQLIVQMYNDPKTSLEFYIDIHA
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pF1KE6 HSRKENIFMYGCDGSDRSKTLYLQQRIFPLMLSKNCPDKFSFSACKFNVQKSKEGTGRVV
:: : :::: :. . . .: ::: .: .: : ::.:. .:: . : ::::
NP_001 HSTMMNGFMYGNIFEDEER--FQRQAIFPKLLCQNAED-FSYSSTSFNRDAVKAGTGRRF
350 360 370 380 390
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pF1KE6 MWKMGIRNSF--TMEATFCGSTL-GNKRGTHFSTKDLESMGYHFCDSLLDYCDPDRTKYY
. . ..:. :.:..: . . :. .. .. . ..: . ..:::
NP_001 LGGLLDHTSYCYTLEVSFYSYIISGTTAAVPYTEEAYMKLGRNVARTFLDYYRLNPVVEK
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pF1KE6 RCLKELEEMERHITLEKVFEDSDTPVIDITLDVESRELTFLLR
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>>XP_011516722 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (871 aa)
initn: 1034 init1: 386 opt: 702 Z-score: 817.9 bits: 162.0 E(85289): 8.1e-39
Smith-Waterman score: 1219; 39.5% identity (66.9% similar) in 532 aa overlap (67-567:267-780)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CALLTADSFGDPFFPRTTQILLEYQLGRWVPRLREPRDLYGVSSSGPLSPTRWPYHCEVI
: :..: ::: .. : : . ::
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pF1KE6 -DEKVQHIDWTPSCPEPVYI-PTGLETQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGN
. :: : ::. : :.. . : .. ... .. . ::. . :
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pF1KE6 RTPLKQPVDYRDNTLMFEARFESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTN
: . . . : :...::::::.::... . ::.: . :. .:.. ::.::.:..
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pF1KE6 MRAGIVYRFTIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNN-----
:: :..:::.:.: : : .. ::.::.:: .:: . : :.: .: ::.:.
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pF1KE6 ---PGQDGRHYFSLTWTFQFPHNKDTCYFAHCYPYTYTNLQEYLSGINN--DPVRSKFCK
:: :. :...:.: .:::. :.::::. :::::..:: .:. ... .: . : :
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pF1KE6 IRVLCHTLARNMVYILTITT-PLKN-----SDSRKRKAVILTARVHPGETNSSWIMKGFL
:::.::. : ..:::. : .: :.: :.:.:::::::::.::.::: :
XP_011 -DVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTL
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.:...:. :: ::....::.:::::::::: ::.::::.:.::::.. : . :...
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....... : :: ..::: ::::::.:.:::::. .: . . . .
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pF1KE6 RGTHFSTKDLESMGYHFCDSLLDYCDPDRTKYYRCLKELEEMERHITLEKVFEDSDTPVI
.: ...:..:: :: .:: .::
XP_011 KGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYV
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>>XP_016870038 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (917 aa)
initn: 1034 init1: 386 opt: 702 Z-score: 817.5 bits: 162.0 E(85289): 8.5e-39
Smith-Waterman score: 1219; 39.5% identity (66.9% similar) in 532 aa overlap (67-567:357-870)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CALLTADSFGDPFFPRTTQILLEYQLGRWVPRLREPRDLYGVSSSGPLSPTRWPYHCEVI
: :..: ::: .. : : . ::
XP_016 LCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDP-DLYIEIVKNTKSV---PEYSEVA
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pF1KE6 -DEKVQHIDWTPSCPEPVYI-PTGLETQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGN
. :: : ::. : :.. . : .. ... .. . ::. . :
XP_016 YPDYFGHIP--PPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIER--LIHQSDIIDR---VVYDLDNPN
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pF1KE6 RTPLKQPVDYRDNTLMFEARFESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTN
: . . . : :...::::::.::... . ::.: . :. .:.. ::.::.:..
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pF1KE6 MRAGIVYRFTIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNN-----
:: :..:::.:.: : : .. ::.::.:: .:: . : :.: .: ::.:.
XP_016 MRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRSS
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pF1KE6 ---PGQDGRHYFSLTWTFQFPHNKDTCYFAHCYPYTYTNLQEYLSGINN--DPVRSKFCK
:: :. :...:.: .:::. :.::::. :::::..:: .:. ... .: . : :
XP_016 VAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRK
560 570 580 590 600 610
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pF1KE6 IRVLCHTLARNMVYILTITT-PLKN-----SDSRKRKAVILTARVHPGETNSSWIMKGFL
:::.::. : ..:::. : .: :.: :.:.:::::::::.::.::: :
XP_016 -DVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTL
620 630 640 650 660
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pF1KE6 DYILGNSSDAQLLRDTFVFKVVPMLNPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRNYTSLLKESFPSVW
.:...:. :: ::....::.:::::::::: ::.::::.:.::::.. : . :...
XP_016 EYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIY
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>>XP_016870035 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (1068 aa)
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XP_016 KGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYV
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>>XP_005251906 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (1108 aa)
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pF1KE6 RTPLKQPVDYRDNTLMFEARFESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTN
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XP_005 RTLPKILSHIAP-AFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGKY
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pF1KE6 RGTHFSTKDLESMGYHFCDSLLDYCDPDRTKYYRCLKELEEMERHITLEKVFEDSDTPVI
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XP_005 KGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYV
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>>XP_016870034 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (1142 aa)
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XP_016 YPDYFGHIP--PPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIER--LIHQSDIIDR---VVYDLDNPN
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XP_016 YT-----IPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSG
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XP_016 MRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRSS
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pF1KE6 DYILGNSSDAQLLRDTFVFKVVPMLNPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRNYTSLLKESFPSVW
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XP_016 EYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIY
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pF1KE6 YTRNMVHRLME-KREVILYCDLHGHSRKENIFMYGCD-------GSDRSKTLYLQQ----
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