Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6482
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6482, 538 aa
1>>>pF1KE6482 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2307+/-0.000781; mu= 19.6581+/- 0.047
mean_var=70.7237+/-14.756, 0's: 0 Z-trim(108.4): 40 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.152508
statistics sampled from 10152 (10190) to 10152 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 538) 3521 783.8 0
CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 631) 3112 693.8 1.5e-199
CCDS5707.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 914) 3099 691.1 1.5e-198
CCDS13391.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1116) 618 145.3 3.6e-34
CCDS46610.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1139) 618 145.3 3.7e-34
CCDS42012.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1091) 617 145.0 4.1e-34
CCDS10036.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1099) 617 145.1 4.2e-34
CCDS42010.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1135) 617 145.1 4.3e-34
CCDS42011.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1141) 617 145.1 4.3e-34
CCDS58352.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1150) 617 145.1 4.3e-34
CCDS54031.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1054) 613 144.2 7.4e-34
CCDS54030.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1079) 613 144.2 7.6e-34
CCDS10855.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1085) 613 144.2 7.6e-34
CCDS54032.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1087) 613 144.2 7.6e-34
CCDS34129.1 SLC12A7 gene_id:10723|Hs108|chr5 (1083) 607 142.8 1.9e-33
CCDS58965.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1196) 492 117.6 8.5e-26
CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1212) 492 117.6 8.6e-26
CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 458 110.1 1.4e-23
CCDS53940.1 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 458 110.1 1.4e-23
CCDS58464.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1021) 435 105.0 4.5e-22
CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1029) 435 105.0 4.5e-22
CCDS10770.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1030) 435 105.0 4.5e-22
CCDS43143.1 SLC12A8 gene_id:84561|Hs108|chr3 ( 714) 416 100.7 6.1e-21
>>CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 (538 aa)
initn: 3521 init1: 3521 opt: 3521 Z-score: 4183.4 bits: 783.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3521; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 DATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVSGSLASVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVSGSLASVLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVILAPAKVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVILAPAKVVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYVLGHVTLGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYVLGHVTLGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLESNSHPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLESNSHPLP
490 500 510 520 530
>>CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 (631 aa)
initn: 3488 init1: 3104 opt: 3112 Z-score: 3696.1 bits: 693.8 E(32554): 1.5e-199
Smith-Waterman score: 3112; 93.9% identity (96.5% similar) in 512 aa overlap (28-534:113-623)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIV--
:: ... : .:. : ..:....:
CCDS59 LALTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANVCGCAVSLLGLVES
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ---VFLRIDATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVS
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLDVF-GADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVS
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTT
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSS
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVI
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEW
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 ASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSW
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYV
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LGHVTLGDLDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGHVTLGDLDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLES
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 NSHPLP
..
CCDS59 GTLLPWGFRS
630
>--
initn: 411 init1: 372 opt: 382 Z-score: 449.8 bits: 93.2 E(32554): 9.8e-19
Smith-Waterman score: 382; 73.2% identity (85.6% similar) in 97 aa overlap (1-95:1-93)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 D-ATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGL-VGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVSGSLASV
..: .:: :. . :: . ..:.: : .::..
CCDS59 GFVVGHAGLL---QALAM-LLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNF
CCDS59 GGSIGLMFYLANVCGCAVSLLGLVESVLDVFGADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS5707.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 (914 aa)
initn: 3449 init1: 3091 opt: 3099 Z-score: 3678.3 bits: 691.1 E(32554): 1.5e-198
Smith-Waterman score: 3099; 94.3% identity (96.5% similar) in 508 aa overlap (28-530:113-619)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIV--
:: ... : .:. : ..:....:
CCDS57 LALTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMFYLANVCGCAVSLLGLVES
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ---VFLRIDATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVS
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VLDVF-GADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVS
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTT
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSS
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDLFGVI
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEW
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 ASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSW
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVGNPRGALPLLRLANQLKKGGLYV
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LGHVTLGDLDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGHVTLGDLDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGG
570 580 590 600 610 620
pF1KE6 NSHPLP
CCDS57 MKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQ
630 640 650 660 670 680
>--
initn: 411 init1: 372 opt: 382 Z-score: 447.5 bits: 93.3 E(32554): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 382; 73.2% identity (85.6% similar) in 97 aa overlap (1-95:1-93)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 D-ATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGL-VGGVCTLGAGLYARASFLTFLLVSGSLASV
..: .:: :. . :: . ..:.: : .::..
CCDS57 GFVVGHAGLL---QALAM-LLVAYFILALTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNF
CCDS57 GGSIGLMFYLANVCGCAVSLLGLVESVLDVFGADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS13391.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1116 aa)
initn: 585 init1: 233 opt: 618 Z-score: 726.9 bits: 145.3 E(32554): 3.6e-34
Smith-Waterman score: 618; 31.3% identity (62.4% similar) in 402 aa overlap (151-535:372-768)
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFAS
.:..: : :. . . :. . . .. .
CCDS13 EIQGIPGAASGLIKENLWSSYLTKGVIVERSGMTSVGLADGTPIDMDHPYVFSDMTSYFT
350 360 370 380 390 400
190 200 210 220 230
pF1KE6 VFA-VLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTL
... . : . ::::::.: ::.:.: ...:: :::.:.: : ::. : . . ..
CCDS13 LLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPTGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVV
410 420 430 440 450 460
240 250 260 270 280
pF1KE6 LQEDYGFFRAISL------WP-P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--F
:.. .: .: :: : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:..:: . :
CCDS13 LRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPF
470 480 490 500 510 520
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GVILAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLS
... .:. .:.: :.: . . .. .: ..:. .: ....:.:. : :.:.:
CCDS13 LQVFGHGKA---NGEPTWALLLTACICEIGILIASLDEVAPILSMFFLMCYMFVNLACAV
530 540 550 560 570
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGP
.::.:: : . : .::.. :: .::. : : ..:. ::. . ::.
CCDS13 QTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALVAMLIAGLIYKYIEYRGAE
580 590 600 610 620 630
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 SSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLV---GNPRGALP-LLRLANQL
. :: ..: . .: ::::. :.: ::::::.:: . . : :: :..::
CCDS13 KEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLVRVDQDQNVVHPQLLSLTSQL
640 650 660 670 680 690
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 KKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQH
: : :: ..: : : :.. :. .: . :.. .::.: ....: ..:.:..:
CCDS13 KAGKGLTIVGSVLEGTFLENHPQ--AQRAEESIRRLMEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVSH
700 710 720 730 740 750
530
pF1KE6 LLRISGLESNSHPLP
:.. .:: . .:
CCDS13 LIQSGGLGGLQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFIELVRETTAGHLALLVTKNVSMFPG
760 770 780 790 800 810
>>CCDS46610.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1139 aa)
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CCDS58 QSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNISFFPSNV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]