Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6478, 483 aa
1>>>pF1KE6478 483 - 483 aa - 483 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6891+/-0.00105; mu= 15.7838+/- 0.062
mean_var=67.5166+/-14.072, 0's: 0 Z-trim(102.9): 34 B-trim: 457 in 1/49
Lambda= 0.156088
statistics sampled from 7147 (7170) to 7147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 ( 483) 3131 714.4 6.5e-206
CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 476) 2204 505.7 4.4e-143
CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 470) 1782 410.7 1.8e-114
CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 386) 1764 406.6 2.5e-113
CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 504) 1557 360.0 3.4e-99
CCDS47316.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 ( 511) 1370 317.9 1.6e-86
CCDS66202.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 ( 369) 1223 284.7 1.1e-76
CCDS78073.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 ( 243) 1074 251.1 9.7e-67
>>CCDS4315.1 SLC36A2 gene_id:153201|Hs108|chr5 (483 aa)
initn: 3131 init1: 3131 opt: 3131 Z-score: 3810.3 bits: 714.4 E(32554): 6.5e-206
Smith-Waterman score: 3131; 100.0% identity (100.0% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTKGITVFQAL
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CCDS43 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTKGITVFQAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NSTTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLV
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CCDS43 NSTTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILS
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CCDS43 IIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYV
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CCDS43 LGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALAL
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CCDS43 PAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTT
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CCDS43 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTT
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FVR
:::
CCDS43 FVR
>>CCDS4316.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (476 aa)
initn: 2197 init1: 2197 opt: 2204 Z-score: 2682.2 bits: 505.7 E(32554): 4.4e-143
Smith-Waterman score: 2204; 73.0% identity (89.5% similar) in 459 aa overlap (21-479:19-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTKGITVFQAL
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CCDS43 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLS-----SPGSYQRFGQSNSTTWFQTL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPF
:::.:::.:::.::::::::::::.:::.:::..:..: ::: ::::::..::.:::: :
CCDS43 IHLLKGNIGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAV
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CCDS43 VDYGDTVMYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NSTTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLV
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CCDS43 NGTTNNCHNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILS
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CCDS43 MIYQFIVQRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYV
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CCDS43 LGMVIVTILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALAL
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CCDS43 PAEIIIPFFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLTCILAILIPRLDLVISLVGSVSSSALAL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTT
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CCDS43 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYEALYELIQPSNAPIFINSTC
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FVR
CCDS43 AFI
>>CCDS4314.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 (470 aa)
initn: 1765 init1: 1765 opt: 1782 Z-score: 2168.7 bits: 410.7 E(32554): 1.8e-114
Smith-Waterman score: 1782; 60.0% identity (84.2% similar) in 448 aa overlap (40-479:20-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 PQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTK--------GITVFQALI
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CCDS43 MSLLGRDYNSELNSLDNGPQSPSESSSSITSENVHPAGEAGLSMMQTLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPFM
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CCDS43 HLLKCNIGTGLLGLPLAIKNAGLLVGPVSLLAIGVLTVHCMVILLNCAQHLSQRLQKTFV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAVN
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CCDS43 NYGEATMYGLETCPNTWLRAHAVWGRYTVSFLLVITQLGFCSVYFMFMADNLQQMVEKAH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 STTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLVI
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CCDS43 VTSNICQPREILTLTPILDIRFYMLIILPFLILLVFIQNLKVLSVFSTLANITTLGSMAL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILSL
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CCDS43 IFEYIMEGIPYPSNLPLMANWKTFLLFFGTAIFTFEGVGMVLPLKNQMKHPQQFSFVLYL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYVP
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CCDS43 GMSIVIILYILLGTLGYMKFGSDTQASITLNLPNCWLYQSVKLMYSIGIFFTYALQFHVP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALALI
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CCDS43 AEIIIPFAISQVSESWALFVDLSVRSALVCLTCVSAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALI
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTTF
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CCDS43 IPALLEIVIFYSEDMSCVTIAKDIMISIVGLLGCIFGTYQALYEL-PQPISHSMANSTGV
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 VR
CCDS43 HA
470
>>CCDS83035.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (386 aa)
initn: 1757 init1: 1757 opt: 1764 Z-score: 2148.2 bits: 406.6 E(32554): 2.5e-113
Smith-Waterman score: 1764; 70.5% identity (88.7% similar) in 373 aa overlap (21-393:19-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTKGITVFQAL
.:: :: .. :. : ::. . .... : ::.:
CCDS83 MSTQRLRNEDYHDYSSTDVSPEESPSEGLNNLS-----SPGSYQRFGQSNSTTWFQTL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPF
:::.:::.:::.::::::::::::.:::.:::..:..: ::: ::::::..::.:::: :
CCDS83 IHLLKGNIGTGLLGLPLAVKNAGIVMGPISLLIIGIVAVHCMGILVKCAHHFCRRLNKSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAV
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CCDS83 VDYGDTVMYGLESSPCSWLRNHAHWGRRVVDFFLIVTQLGFCCVYFVFLADNFKQVIEAA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NSTTNNCYSNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLV
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CCDS83 NGTTNNCHNNETVILTPTMDSRLYMLSFLPFLVLLVFIRNLRALSIFSLLANITMLVSLV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILS
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CCDS83 MIYQFIVQRIPDPSHLPLVAPWKTYPLFFGTAIFSFEGIGMVLPLENKMKDPRKFPLILY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYV
::: ::: :::... ::::.:: .:..::.:::::::::::::::: ::. ::::::::
CCDS83 LGMVIVTILYISLGCLGYLQFGANIQGSITLNLPNCWLYQSVKLLYSIGIFFTYALQFYV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVISLVGSVSGTALAL
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CCDS83 PAEIIIPFFVSRAPEHCELVVDLFVRTVLVCLT
360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELLKSEDSHPFSNSTT
>>CCDS8291.1 SLC36A4 gene_id:120103|Hs108|chr11 (504 aa)
initn: 1559 init1: 598 opt: 1557 Z-score: 1894.4 bits: 360.0 E(32554): 3.4e-99
Smith-Waterman score: 1561; 50.9% identity (77.6% similar) in 477 aa overlap (2-467:4-476)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSVTKSTEGPQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKK------TK
..: .. : . .:.: : . .: :.: .: .: ..: .
CCDS82 MEAAATPAAAGAARREELDMDVMRP---LINEQNFDGTSDEEHEQELLPVQKHYQLDDQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GITVFQALIHLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRF
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CCDS82 GISFVQTLMHLLKGNIGTGLLGLPLAIKNAGIVLGPISLVFIGIISVHCMHILVRCSHFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CKRLNKPFMDYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGRHIVSFFLIITQLGFCCVYIVFLADN
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CCDS82 CLRFKKSTLGYSDTVSFAMEVSPWSCLQKQAAWGRSVVDFFLVITQLGFCSVYIVFLAEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 LKQVVEAVNSTTNNCYSNETVILTP----TMDSRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFS
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CCDS82 VKQVHEGF-LESKVFISNSTNSSNPCERRSVDLRIYMLCFLPFIILLVFIRELKNLFVLS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 MLANISMLVSLVIIIQYITQEIPDPSRLPLVASWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENK
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CCDS82 FLANVSMAVSLVIIYQYVVRNMPDPHNLPIVAGWKKYPLFFGTAVFAFEGIGVVLPLENQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 MKNARHFPAILSLGMSIVTSLYIGMAALGYLRFGDDIKASISLNLP-NCWLYQSVKLLYI
::....:: :..::.:::.::. .:.:::. : :.::.::.:::: . :::::::.::
CCDS82 MKESKRFPQALNIGMGIVTTLYVTLATLGYMCFHDEIKGSITLNLPQDVWLYQSVKILYS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 AGILCTYALQFYVPAEIIIPFAISRVSTRWALPLDLSIRLVMVCLTCLLAILIPRLDLVI
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CCDS82 FGIFVTYSIQFYVPAEIIIPGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCAGAILIPRLDIVI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 SLVGSVSGTALALIIPPLLEVTTFYSEGMSPLTIFKDALISILGFVGFVVGTYQALDELL
:.::.::...::::.:::.:. :: .: .. ..:. :.. : :::..::: ...:..
CCDS82 SFVGAVSSSTLALILPPLVEILTFSKEHYNIWMVLKNISIAFTGVVGFLLGTYITVEEII
420 430 440 450 460 470
470 480
pF1KE6 KSEDSHPFSNSTTFVR
CCDS82 YPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
480 490 500
>>CCDS47316.1 SLC36A3 gene_id:285641|Hs108|chr5 (511 aa)
initn: 1356 init1: 1356 opt: 1370 Z-score: 1666.7 bits: 317.9 E(32554): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 1691; 55.2% identity (77.3% similar) in 489 aa overlap (40-479:20-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 PQGAVAIKLDLMSPPESAKKLENKDSTFLDESPSESAGLKKTK--------GITVFQALI
.:::::.. .. :....:.::
CCDS47 MSLLGRDYNSELNSLDNGPQSPSESSSSITSENVHPAGEAGLSMMQTLI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HLVKGNMGTGILGLPLAVKNAGILMGPLSLLVMGFIACHCMHILVKCAQRFCKRLNKPFM
::.: :.:::.::::::.::::.:.::.:::..: .. ::: ::..:::.. .::.: :.
CCDS47 HLLKCNIGTGLLGLPLAIKNAGLLVGPVSLLAIGVLTVHCMVILLNCAQHLSQRLQKTFV
50 60 70 80 90 100
130 140
pF1KE6 DYGDTVMHGLEANPNAWLQNHAHWGR---------------------HI-----------
.::...:.:::. ::.::. :: ::: :.
CCDS47 NYGEATMYGLETCPNTWLRAHAVWGRWNLALSPRLECSGKISAHCNPHLQGSSNSPAQAS
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 ---------VSFFLIITQLGFCCVYIVFLADNLKQVVEAVNSTTNNCYSNETVILTPTMD
:::.:.::::::: ::..:.::::.:.:: .. :.: : : . ::: .:
CCDS47 RVAGIYRYTVSFLLVITQLGFCSVYFMFMADNLQQMVEKAHVTSNICQPREILTLTPILD
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 SRLYMLSFLPFLVLLVLIRNLRILTIFSMLANISMLVSLVIIIQYITQEIPDPSRLPLVA
:.::: .::::.:::.:.::..:..:: ::::. : :...:..:: . :: :: :::.:
CCDS47 IRFYMLIILPFLILLVFIQNLKVLSVFSTLANITTLGSMALIFEYIMEGIPYPSNLPLMA
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 SWKTYPLFFGTAIFSFESIGVVLPLENKMKNARHFPAILSLGMSIVTSLYIGMAALGYLR
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CCDS47 NWKTFLLFFGTAIFTFEGVGMVLPLKNQMKHPQQFSFVLYLGMSIVIILYILLGTLGYMK
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 FGDDIKASISLNLPNCWLYQSVKLLYIAGILCTYALQFYVPAEIIIPFAISRVSTRWALP
::.: .:::.::::::::::::::.: ::. ::::::.::::::::::::.:: :::
CCDS47 FGSDTQASITLNLPNCWLYQSVKLMYSIGIFFTYALQFHVPAEIIIPFAISQVSESWALF
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390 400 410 420 430 440
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CCDS47 VDLSVRSALVCLTCVSAILIPRLDLVISLVGSVSSSALALIIPALLEIVIFYSEDMSCVT
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450 460 470 480
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: :: .:::.:..: . :::::: :: . :: ..:::
CCDS47 IAKDIMISIVGLLGCIFGTYQALYEL-PQPISHSMANSTGVHA
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.:..: . ::..: ::: .:.:::.:::::
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:.:::::::::.::....:: :..::.:::.::. .:.:::. : :.::.::.:::: .
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CCDS66 VWLYQSVKILYSFGIFVTYSIQFYVPAEIIIPGITSKFHTKWKQICEFGIRSFLVSITCA
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..::: ...:..
CCDS66 LLGTYITVEEIIYPTPKVVAGTPQSPFLNLNSTCLTSGLK
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>>CCDS78073.1 SLC36A1 gene_id:206358|Hs108|chr5 (243 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.:: :: .. :. : ::. . .... : ::.:
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:::.:::.:::.::::::::::::.:::.:::..:..: ::: ::::::..::.:::: :
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.: :.:.:
CCDS78 MIYQFIVQIL
240
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]