Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6477, 505 aa
1>>>pF1KE6477 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8527+/-0.000918; mu= 15.6332+/- 0.055
mean_var=72.0179+/-14.215, 0's: 0 Z-trim(106.2): 32 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.151131
statistics sampled from 8821 (8842) to 8821 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31714.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 ( 505) 3438 758.9 0
CCDS44757.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 ( 501) 3389 748.2 4.7e-216
CCDS13689.1 SLC37A1 gene_id:54020|Hs108|chr21 ( 533) 976 222.1 1.2e-57
CCDS5859.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 ( 494) 963 219.3 7.9e-57
CCDS75669.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 ( 478) 738 170.2 4.5e-42
CCDS5858.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 ( 443) 668 154.9 1.7e-37
>>CCDS31714.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 (505 aa)
initn: 3438 init1: 3438 opt: 3438 Z-score: 4050.0 bits: 758.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3438; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
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CCDS31 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYYLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYYLSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGKRGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGKRGFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDVDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDVDCAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPGVVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPGVVEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNG
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CCDS31 SLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 RATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 VYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
490 500
>>CCDS44757.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 (501 aa)
initn: 3389 init1: 3389 opt: 3389 Z-score: 3992.3 bits: 748.2 E(32554): 4.7e-216
Smith-Waterman score: 3389; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYYLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYYLSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGKRGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGKRGFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDVDCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDVDCAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 PQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPGVVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPGVVEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 RATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 VYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
:::::::::::::::::
CCDS44 VYKEILAWKVSLSRGSGYKEI
490 500
>>CCDS13689.1 SLC37A1 gene_id:54020|Hs108|chr21 (533 aa)
initn: 2083 init1: 963 opt: 976 Z-score: 1148.5 bits: 222.1 E(32554): 1.2e-57
Smith-Waterman score: 2012; 59.8% identity (80.2% similar) in 515 aa overlap (5-485:4-517)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNC------
: :. :. .::::.:.:..:..::::.:: .:.:::::::::..::. :
CCDS13 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE6 ----SEQIKPINDT--HSLNDTMW-CSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGV
: : . ... :.: :. :.::::::.::..:::..: .:: :::.::..::.
CCDS13 DVRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 FGERLPLRYYLSAGMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTC
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CCDS13 IGERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFGLGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 VGNWFGKGKRGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFL
.:::::::.::.:::.::::::::::::::::: ::. :::::.::: :.:.::.. ::
CCDS13 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE6 FLIEHPEDVDCAPPQ-HHGEPAENQDN---------------PEDPGNSPCSIRESGLET
::::::.:: :. :.. :: : : :: . : . .: .
CCDS13 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDP-EMQCLLLSDGKGS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE6 V--AKCSKGPCEE---PAAISFFGALRIPGVVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVA
. . : . ::::: :::.::::.:::::::::::::::::.::::::.::
CCDS13 IHPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVD
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 HFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDG
:..::.::.::::::::::.:::.::..:: . ::.:: .::.:::: ..... ... :
CCDS13 HLDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMG
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 IASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAAL
. ..:.::.. :.::.:::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS13 LEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAAL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRLVYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
:::::::.::.::.::::::. ::. : :.: ::..::.
CCDS13 GPLLAGLLSPSGWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
480 490 500 510 520 530
>>CCDS5859.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (494 aa)
initn: 748 init1: 281 opt: 963 Z-score: 1133.7 bits: 219.3 E(32554): 7.9e-57
Smith-Waterman score: 963; 36.0% identity (64.0% similar) in 469 aa overlap (24-487:22-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
...::::. :. : ::: .: :: . ::: :
CCDS58 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSI----SEQWTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 --INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKEL-LGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYY
.: . : .: : : . . : :: .:. ::..::.:.::::. :.:: ::.
CCDS58 SAFNTSVELPVEIWSSNHLFPSAEKATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIVGDRLNLRWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LSAGMLLSGLFTSLFGLGYFW-NIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGK
:: :: :.: . .:: : ... : . . . :::.:.:::: ::. .::::::.
CCDS58 LSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAVMGNWFGKAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDV
:: ..:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: . . . :.. :. :. ::..
CCDS58 RGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFFGLLVSPEEI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DCAPPQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPG
. . . . :.. : :. . : . : . ::::. : .::
CCDS58 GLSGIEAEENFEEDSHRPLINGGENEDEYEPNYSIQDDSS---VAQVKAISFYQACCLPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 VVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSD
:. .:: :::.:.:..:::.:..: .. :: :: .:::::::: . :..::
CCDS58 VIPYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNNFGWKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 YTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADL
. :: . . :.::. .. :. .: ....: . : ...:: .:..:.::::
CCDS58 VLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSRSPNDKSINALLMTVT-GFFIGGPSNMISSAISADL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLI-SPTGWNNVFYMLISADVLACL
: .. .. ...::.:::.:.::.::::::.: :..:: . :: :::..: . .
CCDS58 GRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVGQYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIV
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE6 LLCRLVYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
.. :. .::..
CCDS58 FISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
480 490
>>CCDS75669.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (478 aa)
initn: 947 init1: 281 opt: 738 Z-score: 868.8 bits: 170.2 E(32554): 4.5e-42
Smith-Waterman score: 916; 35.4% identity (62.3% similar) in 469 aa overlap (24-487:22-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
...::::. :. : ::: .: :: . ::: :
CCDS75 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSI----SEQWTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 --INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKEL-LGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYY
.: . : .: : : . . : :: .:. ::..::.:.::::. :.:: ::.
CCDS75 SAFNTSVELPVEIWSSNHLFPSAEKATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIVGDRLNLRWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LSAGMLLSGLFTSLFGLGYFW-NIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGK
:: :: :.: . .:: : ... : . . . :::.:.:::: ::. .::::::.
CCDS75 LSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAVMGNWFGKAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDV
:: ..:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: . . . :.. :. :. ::..
CCDS75 RGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFFGLLVSPEEI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DCAPPQHHGEPAENQDNPEDPGNSPCSIRESGLETVAKCSKGPCEEPAAISFFGALRIPG
. . . . :.. : :. . : . : . ::::. : .::
CCDS75 GLSGIEAEENFEEDSHRPLINGGENEDEYEPNYSIQDDSS---VAQVKAISFYQACCLPG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 VVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVAHFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSD
:. .:: :::.:.:..:::.:..: .. :: :: .:::::::: . :..::
CCDS75 VIPYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNNFGWKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 YTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDGIASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADL
. :: . . :.::. .. :. . ...:: .:..:.::::
CCDS75 VLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSRF-----------------FIGGPSNMISSAISADL
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAALGPLLAGLI-SPTGWNNVFYMLISADVLACL
: .. .. ...::.:::.:.::.::::::.: :..:: . :: :::..: . .
CCDS75 GRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVGQYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIV
400 410 420 430 440 450
480 490 500
pF1KE6 LLCRLVYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
.. :. .::..
CCDS75 FISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
460 470
>>CCDS5858.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (443 aa)
initn: 672 init1: 281 opt: 668 Z-score: 786.9 bits: 154.9 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 668; 36.4% identity (61.5% similar) in 327 aa overlap (24-346:22-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNCSEQIKP
...::::. :. : ::: .: :: . ::: :
CCDS58 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSI----SEQWTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 --INDTHSLNDTMWCSWAPFDKDNYKEL-LGGVDNAFLIAYAIGMFISGVFGERLPLRYY
.: . : .: : : . . : :: .:. ::..::.:.::::. :.:: ::.
CCDS58 SAFNTSVELPVEIWSSNHLFPSAEKATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIVGDRLNLRWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LSAGMLLSGLFTSLFGLGYFW-NIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTCVGNWFGKGK
:: :: :.: . .:: : ... : . . . :::.:.:::: ::. .::::::.
CCDS58 LSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAVMGNWFGKAG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFLFLIEHPEDV
:: ..:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: . . . :.. :. :. ::..
CCDS58 RGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFFGLLVSPEEI
180 190 200 210 220 230
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