FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6468, 592 aa
1>>>pF1KE6468 592 - 592 aa - 592 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6548+/-0.000563; mu= 22.7561+/- 0.034
mean_var=70.1251+/-14.881, 0's: 0 Z-trim(106.1): 98 B-trim: 76 in 1/48
Lambda= 0.153157
statistics sampled from 14176 (14275) to 14176 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.489), E-opt: 0.2 (0.167), width: 16
Scan time: 5.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 592) 3938 880.4 0
XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 493) 3267 732.0 1.1e-210
NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 555) 2350 529.5 1.2e-149
XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 321) 2133 481.3 2.1e-135
NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral ( 628) 2046 462.3 2.1e-129
NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) s ( 634) 2016 455.7 2.1e-127
NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 730) 1593 362.3 3.2e-99
XP_006710706 (OMIM: 610299,616269) PREDICTED: sodi ( 727) 1528 347.9 6.6e-95
NP_001010898 (OMIM: 610299,616269) sodium-dependen ( 727) 1528 347.9 6.6e-95
NP_001139807 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutr ( 623) 1351 308.8 3.5e-83
XP_011536827 (OMIM: 607971) PREDICTED: sodium-depe ( 554) 1265 289.7 1.7e-77
NP_054756 (OMIM: 607972) orphan sodium- and chlori ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_005258877 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_006723231 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1264 289.6 2.4e-77
XP_011525162 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 758) 1264 289.6 2.5e-77
XP_016882201 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 818) 1264 289.7 2.6e-77
XP_011525163 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 589) 1144 263.0 2e-69
XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599) 975 225.7 3.5e-58
XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 975 225.7 3.5e-58
NP_060527 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 289) 838 195.1 2.7e-49
XP_011525161 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 781) 623 148.0 1.1e-34
NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635) 580 138.4 6.9e-32
NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520) 578 137.9 8.1e-32
NP_001177926 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-d ( 510) 570 136.1 2.7e-31
XP_006719068 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 570) 566 135.3 5.4e-31
XP_005253805 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 571) 566 135.3 5.4e-31
XP_005253804 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 610) 566 135.3 5.7e-31
NP_001193860 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 566 135.3 5.7e-31
XP_011519312 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 614) 566 135.3 5.7e-31
NP_001116319 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 566 135.3 5.7e-31
NP_001116320 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 566 135.3 5.7e-31
NP_003035 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-depe ( 614) 566 135.3 5.7e-31
XP_016875333 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 394) 556 132.9 1.9e-30
NP_057699 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-depe ( 602) 556 133.1 2.6e-30
XP_011519314 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 483) 552 132.1 4.1e-30
XP_011519315 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 550 131.6 5.2e-30
XP_011519316 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 550 131.6 5.2e-30
XP_016875330 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 426) 544 130.3 1.3e-29
XP_016862562 (OMIM: 607952) PREDICTED: sodium- and ( 458) 537 128.8 3.9e-29
XP_016874034 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 450) 532 127.7 8.4e-29
XP_016874033 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 505) 532 127.7 9.1e-29
XP_016865259 (OMIM: 606205) PREDICTED: sodium-depe ( 555) 532 127.8 9.7e-29
NP_001305298 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chl ( 563) 532 127.8 9.8e-29
NP_055043 (OMIM: 606205) sodium-dependent proline ( 636) 532 127.8 1.1e-28
>>NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and chl (592 aa)
initn: 3938 init1: 3938 opt: 3938 Z-score: 4703.9 bits: 880.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3938; 100.0% identity (100.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE6 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
550 560 570 580 590
>>XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTED: s (493 aa)
initn: 3267 init1: 3267 opt: 3267 Z-score: 3903.6 bits: 732.0 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 3267; 100.0% identity (100.0% similar) in 493 aa overlap (100-592:1-493)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLN
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGT
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIF
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENC
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQ
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLP
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 KEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRF
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 ESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTK
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590
pF1KE6 DYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
460 470 480 490
>>NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and chl (555 aa)
initn: 2338 init1: 2338 opt: 2350 Z-score: 2807.9 bits: 529.5 E(85289): 1.2e-149
Smith-Waterman score: 3610; 93.8% identity (93.8% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
:::::::::::::: :::::::::
NP_071 VYLCILRGTESTGK-------------------------------------IEQLANPKA
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 KATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNLEQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 ESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSVLYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 SKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAGNYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 CYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVSPLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWD
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590
pF1KE6 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 ASQGQLVTKDYPAYALAVIGLLVASSTMCIPLAALGTFVQRRLKRGDADPVA
510 520 530 540 550
>>XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTED: s (321 aa)
initn: 2133 init1: 2133 opt: 2133 Z-score: 2551.8 bits: 481.3 E(85289): 2.1e-135
Smith-Waterman score: 2133; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYLCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVVVSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKTLNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIRGLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKA
190 200 210 220 230 240
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XP_011 WINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQKHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGF
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XP_011 KATFNYENCLKKKEEADGRLW
310 320
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:: :
NP_872 TWRDRDARPDTDMRPDTDTRPDTDMRPDTDMR
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: :. ... . .. ::
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:::..:::: :..:.::..:. ..::: ::..: : ...: .:.::..::.. .:: :::
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.:::.. :.:. .:. .:::::.: . .::.: .::::.::.::::::..:::.:::.
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.:::. :..::.:: :::..:..:.:.. ::::. :.:. . : . . . . .
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: . :: : . .:. .: .: :: ....:..: ::. ::::::::::..
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:::. .. .: .:::..:.::. ::.:::.:. .:.::..:. . :: .. . :
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: : :. :: .:::...::.. . .. :. :.:: .... .::...:.:
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pF1KE6 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPYL
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NP_001 HFDAALVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANIMNEKCVVENAEKILGYLNTNVLSRDLIP
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