FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6466, 614 aa
1>>>pF1KE6466 614 - 614 aa - 614 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0605+/-0.000927; mu= 20.8792+/- 0.056
mean_var=70.3125+/-14.418, 0's: 0 Z-trim(105.4): 41 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.152953
statistics sampled from 8351 (8387) to 8351 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 4250 947.4 0
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 2994 670.2 2.1e-192
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 2831 634.2 1.5e-181
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 2564 575.3 8e-164
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 2564 575.4 9e-164
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 2252 506.5 4.3e-143
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 2226 500.7 1.9e-141
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 2117 476.7 3.8e-134
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1931 435.6 7.8e-122
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1815 410.0 4.5e-114
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1815 410.1 4.6e-114
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 1809 408.7 1.2e-113
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1769 399.9 5.2e-111
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1756 397.0 3.8e-110
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1450 329.4 6.9e-90
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1245 284.3 4e-76
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1179 269.7 8.1e-72
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1179 269.7 8.3e-72
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1179 269.7 8.9e-72
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1119 256.5 8e-68
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 838 194.1 1.5e-49
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 784 182.2 5.8e-46
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 713 166.8 6.6e-41
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 596 141.1 4.3e-33
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 571 135.5 2e-31
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 566 134.4 4.1e-31
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 522 124.8 4e-28
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 503 120.3 3.6e-27
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 482 115.9 1.6e-25
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 482 116.0 1.8e-25
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 327 81.8 3.6e-15
CCDS58198.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 97) 279 70.5 1.2e-12
>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa)
initn: 4250 init1: 4250 opt: 4250 Z-score: 5065.4 bits: 947.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4250; 99.8% identity (99.8% similar) in 614 aa overlap (1-614:1-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 RFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE6 TREGLIAGEKETHL
::::::::::::::
CCDS85 TREGLIAGEKETHL
610
>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (602 aa)
initn: 2990 init1: 2192 opt: 2994 Z-score: 3567.6 bits: 670.2 E(32554): 2.1e-192
Smith-Waterman score: 2994; 71.5% identity (87.4% similar) in 589 aa overlap (25-613:21-601)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
.....:: . .::.:.::::::::::::::::::::
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGL
::::::::::::::::::..:.:.::::::.::.:::::::::.:::::::::.:.:::
CCDS85 RFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTP
:: .: :::::::.::::::::::::: .::: : . :::::: .: . .:. . :
CCDS85 ASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKTNGSLNGTS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
:: ::::.:::::::: :..::. ::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 -ENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
:::::::::::.::::::::::: ::: .:: :.: :: ::::::::::::::::::: :
CCDS85 FTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
::::::.:.::.:.:.: ::.: ::.:...::::::::::: :::: .::.:. .::..:
CCDS85 GLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
::.::: ..:. .:.::...::::::.::::::::.::.::::...:: .:..::::: :
CCDS85 REVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
::::::::::::::::.: ::::::..: ::::::: ::::: ::. :.:: :: ..::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGW
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
.::::::::.: . . : .::::.:.:::. : .::: ..: :: . .:
CCDS85 LLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQ--RNP-----AGPSAPATP
540 550 560 570 580
610
pF1KE6 TREGLIAGEKETHL
: : :.:
CCDS85 RTSLLRLTELESHC
590 600
>>CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 (632 aa)
initn: 2843 init1: 2057 opt: 2831 Z-score: 3372.9 bits: 634.2 E(32554): 1.5e-181
Smith-Waterman score: 2831; 67.8% identity (87.7% similar) in 587 aa overlap (33-614:47-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 GKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
:..::.:.::.:::::::::::::::::::
CCDS26 EARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLAS
::::::::::::.::: .::. :::::::::.::::.::.:..: :::.::::.::: :.
CCDS26 PYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCGIPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEGIGYAT
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDF--LNHSGAGTVTP
:::..::::::::::::.::: . ::.::::.::.. ::::.:..: :: :. . :.
CCDS26 QVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVEFQKLNVSNYSHVS-
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
..: :::::::::.:::.:..::. .:.:::::::::: ::.:::::::::.::::::::
CCDS26 LQNATSPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVY
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
::::::.::.:::::::::::: .:: .:: ::: ::.:::::.:::::::::.::: :
CCDS26 VTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWVDAGTQIFFSYAICLG
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
:::::::::.:.::::.::: :: :::.:::::::..::.::::. ::::::.:::::::
CCDS26 CLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVAESGP
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
::::::.:::::::::: ::. :::.::::::::::::::: :::: .::.:. .:.. :
CCDS26 GLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFFMMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYR
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
::::::...:. :..:: ..:::::::::::: ::.::.::::...:: .::.::::..:
CCDS26 RELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVYGSNR
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
::::::::::::: :.: :...:::.: . :.: : :: ::::::.:.:: :::.:::
CCDS26 FYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGW
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
..:::::.:.::.. ::. ::.: . ..:..: ::...: . . . : .
CCDS26 LMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKLGVSPRMVTVNDCDAK
560 570 580 590 600 610
610
pF1KE6 TR-EGLIAG--EKETHL
. .: ::. :::::.
CCDS26 LKSDGTIAAITEKETHF
620 630
>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (620 aa)
initn: 2571 init1: 1857 opt: 2564 Z-score: 3054.6 bits: 575.3 E(32554): 8e-164
Smith-Waterman score: 2564; 64.0% identity (84.2% similar) in 556 aa overlap (22-575:27-582)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIG
: . ..: : . .: .:..:..::::::: ..:
CCDS33 MATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLF
:::::::::::::::::::.::::::.: :.::::::. .:::::.:..: :.::::::
CCDS33 LGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCT-DFLNHSG
.::: ::::: : ::::::.::::: .:::.:: .::::. ::. ::: :: : . ..
CCDS33 SGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AGTVT-PFENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVK
. .: ::::::.::::: ::... :: :::.:.:::::::.:..:.:::::::.
CCDS33 SVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFF
:::::::::::::. ::..::.::.::::: :: .:: ::. ::.:::::.::::::::
CCDS33 STGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPIS
:.::: : .:.:::::::. : :.::. : :::.::::.::..:::::::.::::: :.
CCDS33 SYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 EVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPR
.::::::::::::.::::::::: .:: ::::::..:::::::: :: .:. .:..:
CCDS33 DVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 QLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCIS
:::. :::..: . . ::.:: .:::::::.::::::::.::.:::....:: :.
CCDS33 FLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 WVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPP
:.::.: .::.::::::::: : .: :: .:: ::.. :.::: ::.:: ::..::::
CCDS33 WIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPN
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 WGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAG
:. ..:: ::::::.:::: .:: : .:.::: :.. :.::
CCDS33 WAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNS
550 560 570 580 590 600
600 610
pF1KE6 RNFGPSPTREGLIAGEKETHL
CCDS33 RTVMNGALVKPTHIIVETMM
610 620
>>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (721 aa)
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Smith-Waterman score: 2564; 64.0% identity (84.2% similar) in 556 aa overlap (22-575:128-683)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAG
: . ..: : . .: .:..:..:::::::
CCDS77 QTKEMATKEKLQCLKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAG
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 EIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKI
..::::::::::::::::::::.::::::.: :.::::::. .:::::.:..: :.::
CCDS77 GFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKI
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CPLFQGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCT-DFL
::::.::: ::::: : ::::::.::::: .:::.:: .::::. ::. ::: :: : .
CCDS77 CPLFSGIGYASVVIVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTM
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220
pF1KE6 NHSGAGTVT-PFENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIW
.. . .: ::::::.::::: ::... :: :::.:.:::::::.:..:.::::
CCDS77 RKNKSVWITISSTNFTSPVIEFWERNVLSLSPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIW
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 KGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGT
:::.:::::::::::::. ::..::.::.::::: :: .:: ::. ::.:::::.::::
CCDS77 KGVRSTGKVVYFTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGT
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 QIFFSFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQG
:::::.::: : .:.:::::::. : :.::. : :::.::::.::..:::::::.::::
CCDS77 QIFFSYAICLGAMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQG
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 VPISEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASID
: :..::::::::::::.::::::::: .:: ::::::..:::::::: :: .:. .:
CCDS77 VDIADVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVD
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 MFPRQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEV
..: :::. :::..: . . ::.:: .:::::::.::::::::.::.:::....::
CCDS77 LYPSFLRKGYRREIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFEC
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 VCISWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVY
:.:.::.: .::.::::::::: : .: :: .:: ::.. :.::: ::.:: ::..:
CCDS77 FVIAWIYGGDNLYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTY
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 VYPPWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLD
::: :. ..:: ::::::.:::: .:: : .:.::: :.. :.::
CCDS77 VYPNWAIGLGWSLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGAT
640 650 660 670 680 690
590 600 610
pF1KE6 GSAGRNFGPSPTREGLIAGEKETHL
CCDS77 PYNSRTVMNGALVKPTHIIVETMM
700 710 720
>>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (635 aa)
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Smith-Waterman score: 2252; 56.8% identity (80.8% similar) in 551 aa overlap (33-575:49-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 GKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRF
: : :: .:.:..: .: .::::::::
CCDS14 KGPLIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLAS
::::::::::.:.::: .. .: :::.::::..:::. . ::...: .:::::.:.: ::
CCDS14 PYLCYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVW-NICPLFKGLGYAS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPFE
.:: : :.:::..:::...:: .:::. :::.::.. ::: :.... : .... .
CCDS14 MVIVFYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANAS-LA
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KE6 NFT--------SPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKS
:.: :::.:::: .:: ...:.. :.: ::..:::: ::. :::.::::::
CCDS14 NLTCDQLADRRSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKS
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFS
:::.:::::::::..::.::.::: :::: .::::::::: .: .::::.:::::::::
CCDS14 TGKIVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISE
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CCDS14 YAIGLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISK
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQ
::::::::::::.:.:::.::.. ::. :::.::..:::::::: :: ..:. .:..: .
CCDS14 VAESGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPAS
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISW
.::. . ..:..: : .::.::::.:::::::..:: ::. ...: : ..:
CCDS14 YYFRFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAW
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 VYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPW
:::::::.:.: :::::: : .: : :.:: .:.. :.:.. : :: :::.:::: :
CCDS14 VYGADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWW
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGR
: ..:: .:::::.:::: .. ::...: . .: ..: :
CCDS14 GEAMGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPIWGLHHLEYRAQDADVRGL
560 570 580 590 600 610
600 610
pF1KE6 NFGPSPTREGLIAGEKETHL
CCDS14 TTLTPVSESSKVVVVESVM
620 630
>>CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (510 aa)
initn: 2449 init1: 2192 opt: 2226 Z-score: 2652.7 bits: 500.7 E(32554): 1.9e-141
Smith-Waterman score: 2303; 59.8% identity (73.5% similar) in 589 aa overlap (25-613:21-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
.....:: . .::.:.::::::::::::::::::::
CCDS53 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGL
:::::::::::
CCDS53 RFPYLCYKNGG-------------------------------------------------
60
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTP
::: .: . .:. . :
CCDS53 -------------------------------------------EHCMEFQKTNGSLNGTS
70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
:: ::::.:::::::: :..::. ::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -ENATSPVIEFWERRVLKISDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG
:::::::::::.::::::::::: ::: .:: :.: :: ::::::::::::::::::: :
CCDS53 FTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLG
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS53 CLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGR
::::::.:.::.:.:.: ::.: ::.:...::::::::::: :::: .::.:. .::..:
CCDS53 GLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNR
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 RELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADR
::.::: ..:. .:.::...::::::.::::::::.::.::::...:: .:..::::: :
CCDS53 REVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKR
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGW
::::::::::::::::.: ::::::..: ::::::: ::::: ::. :.:: :: ..::
CCDS53 FYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGW
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 FLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP
.::::::::.: . . : .::::.:.:::. : .::: ..: :: . .:
CCDS53 LLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQ--RNP-----AGPSAPATP
450 460 470 480 490
610
pF1KE6 TREGLIAGEKETHL
: : :.:
CCDS53 RTSLLRLTELESHC
500 510
>>CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 (599 aa)
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Smith-Waterman score: 2117; 49.9% identity (78.3% similar) in 585 aa overlap (2-586:10-584)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDGKVAVQERGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGE
::..... :... :. :. .. :: : ....:..: .:
CCDS26 MATNGSKVADGQISTEVSEAPVANDKPKTLVVKVQKKAADLPDRDTWKGRFDFLMSCVGY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 IIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKIC
::::::::::::: :::::::.::::. .. :.:.:.:: .:::::: :.. .: :.
CCDS26 AIGLGNVWRFPYLCGKNGGGAFLIPYFLTLIFAGVPLFLLECSLGQYTSIGGLGVW-KLA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PLFQGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNH
:.:.:.:::..:. .::.:::.:..::..::..:::. ::: :.: :::..: : :.
CCDS26 PMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQCDNPWNTDRC--FSNY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 SGAGTVTPFENFTSPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGV
: ..:. :.:: :.::::: . .:.:. :..:: ::. : .::.. ::::::::
CCDS26 SMVNTT----NMTSAVVEFWERNMHQMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWKGV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIF
:::::::.::.::.::.::..:::::::: .::..:. :.. .:.: .::.::.::::
CCDS26 GWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTLPGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAATQIF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FSFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPI
::... : : ::::::..::: :.: : .: .:: ::. ::::.:::.:::.. :
CCDS26 FSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIVCCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMAHVTKRSI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 SEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFP
..:: :::::::.:.:.:::..:.: ::. ::: ::..::.:::: :: ..:: .: .:
CCDS26 ADVAASGPGLAFLAYPEAVTQLPISPLWAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCI
: ::. ::::.: .. .. ::::: .:.::.:.:.:::::..::. :::: .:: : :
CCDS26 RLLRN--RRELFIAAVCIISYLIGLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 SWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYP
:: ::..::::::..:.: :: :. : :.:: . ..:.:: ..::: ..: ::.:
CCDS26 SWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKLCWSFFTPIIVAGVFIFSAVQMTPLTMGN-YVFP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 PWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSA
:: ..::..:::::: .: ... .: .: ...:.. .. :. .. .:.. :
CCDS26 KWGQGVGWLMALSSMVLIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAG
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KE6 GRNFGPSPTREGLIAGEKETHL
CCDS26 SSTSKEAYI
>>CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 1923 init1: 1664 opt: 1931 Z-score: 2300.8 bits: 435.6 E(32554): 7.8e-122
Smith-Waterman score: 1931; 56.5% identity (80.7% similar) in 481 aa overlap (103-575:4-482)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 AFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLASVVIESYLNVY
::...: .:::::.:.: ::.:: : :.:
CCDS48 MKAGSINVW-NICPLFKGLGYASMVIVFYCNTY
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KE6 YIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPFENFT-------
::..:::...:: .:::. :::.::.. ::: :.... : .... . :.:
CCDS48 YIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANAS-LANLTCDQLADR
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 -SPVMEFWERRVLGITSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTAT
:::.:::: .:: ...:.. :.: ::..:::: ::. :::.:::::::::.::::::
CCDS48 RSPVIEFWENKVLRLSGGLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGKIVYFTAT
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQGCLTA
:::..::.::.::: :::: .::::::::: .: .::::.:::::::::.:: : :::
CCDS48 FPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAIGLGALTA
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAF
:::::...:::::: : : ..::.::: ::::::::::::. :::: ::.::::::::::
CCDS48 LGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAESGPGLAF
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRKSGRRELL
::.:.:::.::.. ::. :::.::..:::::::: :: ..:. .:..: . .::.
CCDS48 IAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYFRFQREIS
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