FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6462, 494 aa
1>>>pF1KE6462 494 - 494 aa - 494 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8449+/-0.000436; mu= 20.5726+/- 0.027
mean_var=71.5525+/-15.182, 0's: 0 Z-trim(109.1): 54 B-trim: 21 in 1/50
Lambda= 0.151622
statistics sampled from 17195 (17237) to 17195 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 6.680
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016883871 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 507) 531 126.1 2.3e-28
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XP_016883869 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28
XP_016883866 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28
XP_016883868 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28
XP_016883867 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 533) 531 126.1 2.4e-28
NP_001307466 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate ex ( 533) 531 126.1 2.4e-28
XP_011527917 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 564) 531 126.2 2.5e-28
XP_011527916 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 577) 513 122.2 3.9e-27
XP_016883870 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 508) 510 121.5 5.6e-27
XP_016883865 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 539) 510 121.6 5.8e-27
XP_016883872 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-p ( 395) 433 104.6 5.4e-22
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NP_001157752 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 429) 217 57.4 9.7e-08
NP_001458 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose-6-p ( 429) 217 57.4 9.7e-08
NP_001157750 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 451) 217 57.4 1e-07
NP_001157751 (OMIM: 232220,232240,602671) glucose- ( 356) 162 45.3 0.00035
NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 149 42.7 0.0043
NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycopro ( 742) 149 42.7 0.0043
NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 149 42.7 0.0043
XP_016865725 (OMIM: 613361) PREDICTED: MFS-type tr ( 409) 141 40.7 0.0094
>>XP_016883871 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (507 aa)
initn: 864 init1: 287 opt: 531 Z-score: 630.2 bits: 126.1 E(85289): 2.3e-28
Smith-Waterman score: 901; 37.2% identity (67.3% similar) in 422 aa overlap (83-480:72-491)
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pF1KE6 EIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SIQDDSSV-
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pF1KE6 KLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSR-SPNDKSINALLM
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pF1KE6 TVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVGQYLVSLI
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450 460 470 480 490
pF1KE6 RDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
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XP_016 SPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
470 480 490 500
>>NP_061837 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate exchanger (533 aa)
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Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : .
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pF1KE6 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV
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NP_061 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
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230 240 250 260
pF1KE6 GLLVSPEEIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SI
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NP_061 EATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALG
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>>XP_016883869 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (533 aa)
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pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
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XP_016 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
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XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
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>>XP_016883866 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (533 aa)
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Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517)
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pF1KE6 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
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360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG
. .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.:
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420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE6 QYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
:..:. . :: :::.... .:...:. :: .:.
XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
480 490 500 510 520 530
>>XP_016883867 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (533 aa)
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Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517)
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... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : .
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: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
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:. :... :. . ...:. ..: : .:.. .:.. ::
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. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..:
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pF1KE6 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG
. .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.:
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XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
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>>NP_001307466 (OMIM: 608094) glucose-6-phosphate exchan (533 aa)
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Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (19-480:20-517)
10 20 30 40 50
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: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
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. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..:
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NP_001 LDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMGL
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pF1KE6 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG
. .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.:
NP_001 EATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALG
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450 460 470 480 490
pF1KE6 QYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
:..:. . :: :::.... .:...:. :: .:.
NP_001 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
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>>XP_011527917 (OMIM: 608094) PREDICTED: glucose-6-phosp (564 aa)
initn: 926 init1: 287 opt: 531 Z-score: 629.6 bits: 126.2 E(85289): 2.5e-28
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220 230 240 250 260
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. : ::: :. :. :... :. . ...:. ..: : .:.. .:..
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::. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.:
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380 390 400 410 420 430
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.: : . .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.
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440 450 460 470 480 490
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::.::.:::.: :..:. . :: :::.... .:...:. :: .:.
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560
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. : . : . .. : .:. : . .::.:: :: .
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::::...:::.:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.
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220 230 240 250 260
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::. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.:
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320 330 340 350 360 370
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:::.:..: .: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .:
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380 390 400 410 420 430
pF1KE6 IGYSR-SPNDKSINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIV
.: : . .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.
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440 450 460 470 480 490
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pF1KE6 ILRE
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560 570
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pF1KE6 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV
: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
XP_016 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII
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:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::.
XP_016 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
130 140 150 160 170
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pF1KE6 MGNWFGKAGRGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFF
.::::::. ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :.
XP_016 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KE6 GLLVSPEEIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SI
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XP_016 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQCLLLSDGKGSI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 QDDSSV-------AQVKAISFYQACCLPGVIPYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNNFG
. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..:
XP_016 HPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDH
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 WKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSR-SPNDK
.: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .: .: :
XP_016 LDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMGL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG
. .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.:
XP_016 EATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALG
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE6 QYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
:..:. . :: :::.... .:...
XP_016 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLI
480 490 500
494 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:31:50 2016 done: Tue Nov 8 13:31:51 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]