Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6456
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6456, 553 aa
1>>>pF1KE6456 553 - 553 aa - 553 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1207+/-0.000735; mu= 16.5091+/- 0.044
mean_var=108.2284+/-21.677, 0's: 0 Z-trim(113.1): 164 B-trim: 132 in 1/49
Lambda= 0.123283
statistics sampled from 13636 (13809) to 13636 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 2.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42153.1 PRSS53 gene_id:339105|Hs108|chr16 ( 553) 3960 714.8 6.6e-206
CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16 ( 343) 613 119.3 7.3e-27
CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 ( 280) 611 118.9 8.1e-27
CCDS10476.1 PRSS27 gene_id:83886|Hs108|chr16 ( 290) 597 116.4 4.6e-26
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 589 115.4 2.7e-25
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 589 115.4 2.7e-25
CCDS58452.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 752) 544 107.3 6.6e-23
CCDS58453.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 850) 544 107.4 7.2e-23
CCDS32436.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 855) 544 107.4 7.2e-23
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 500 99.3 9.5e-21
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 500 99.3 1e-20
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 500 99.3 1e-20
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 495 98.3 1.5e-20
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 495 98.5 1.9e-20
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 492 98.1 4.4e-20
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 490 97.9 6.6e-20
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 479 95.7 1.6e-19
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 475 95.0 2.5e-19
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 472 94.2 2.5e-19
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 475 95.0 2.6e-19
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 463 92.8 9.7e-19
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 457 91.6 1.7e-18
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 452 90.6 2.5e-18
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 453 91.0 3.6e-18
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 453 91.0 3.8e-18
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 446 89.7 7.4e-18
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 437 88.0 1.6e-17
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 437 88.1 2.3e-17
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 434 87.6 3.3e-17
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 434 87.6 3.3e-17
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 436 88.1 3.4e-17
CCDS47145.1 PRSS48 gene_id:345062|Hs108|chr4 ( 328) 429 86.6 5e-17
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 432 87.4 6.3e-17
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 425 86.0 9.9e-17
CCDS46816.1 PRSS42 gene_id:339906|Hs108|chr3 ( 293) 422 85.3 1.1e-16
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 415 84.1 2.6e-16
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 415 84.2 3.3e-16
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 415 84.2 3.5e-16
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 415 84.2 3.5e-16
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 415 84.2 3.5e-16
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 415 84.2 3.5e-16
CCDS74857.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 824) 408 83.2 1.3e-15
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 405 82.7 2e-15
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 387 79.1 7.7e-15
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 389 79.6 8.4e-15
CCDS10432.1 TPSD1 gene_id:23430|Hs108|chr16 ( 242) 383 78.3 1.2e-14
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 382) 372 76.5 6.4e-14
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 444) 372 76.6 7.1e-14
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 466) 372 76.6 7.4e-14
CCDS34302.1 F12 gene_id:2161|Hs108|chr5 ( 615) 372 76.7 9.1e-14
>>CCDS42153.1 PRSS53 gene_id:339105|Hs108|chr16 (553 aa)
initn: 3960 init1: 3960 opt: 3960 Z-score: 3810.2 bits: 714.8 E(32554): 6.6e-206
Smith-Waterman score: 3960; 100.0% identity (100.0% similar) in 553 aa overlap (1-553:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGLQAAQRACGQRGPGPPKPQEGNTVPGEWPWQASVRRQGAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGLQAAQRACGQRGPGPPKPQEGNTVPGEWPWQASVRRQGAH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVAALQLPRAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVAALQLPRAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 NHYSQGSDLALLQLAHPTTHTPLCLPQPAHRFPFGASCWATGWDQDTSDAPGTLRNLRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NHYSQGSDLALLQLAHPTTHTPLCLPQPAHRFPFGASCWATGWDQDTSDAPGTLRNLRLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LISRPTCNCIYNQLHQRHLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPCQGDSGGPVLCLEPDGHWVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LISRPTCNCIYNQLHQRHLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPCQGDSGGPVLCLEPDGHWVQA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GIISFASSCAQEDAPVLLTNTAAHSSWLQARVQGAAFLAQSPETPEMSDEDSCVACGSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GIISFASSCAQEDAPVLLTNTAAHSSWLQARVQGAAFLAQSPETPEMSDEDSCVACGSLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TAGPQAGAPSPWPWEARLMHQGQLACGGALVSEEAVLTAAHCFIGRQAPEEWSVGLGTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAGPQAGAPSPWPWEARLMHQGQLACGGALVSEEAVLTAAHCFIGRQAPEEWSVGLGTRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EEWGLKQLILHGAYTHPEGGYDMALLLLAQPVTLGASLRPLCLPYPDHHLPDGERGWVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEWGLKQLILHGAYTHPEGGYDMALLLLAQPVTLGASLRPLCLPYPDHHLPDGERGWVLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 RARPGAGISSLQTVPVTLLGPRACSRLHAAPGGDGSPILPGMVCTSAVGELPSCEGLSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RARPGAGISSLQTVPVTLLGPRACSRLHAAPGGDGSPILPGMVCTSAVGELPSCEGLSGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 PLVHEVRGTWFLAGLHSFGDACQGPARPAVFTALPAYEDWVSSLDWQVYFAEEPEPEAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PLVHEVRGTWFLAGLHSFGDACQGPARPAVFTALPAYEDWVSSLDWQVYFAEEPEPEAEP
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE6 GSCLANISQPTSC
:::::::::::::
CCDS42 GSCLANISQPTSC
550
>>CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16 (343 aa)
initn: 539 init1: 199 opt: 613 Z-score: 595.7 bits: 119.3 E(32554): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 613; 36.2% identity (61.3% similar) in 326 aa overlap (6-311:8-323)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGL-QAAQRACGQRGPGPPKPQE----GNT-VPGEWPWQA
:: : : : .:. :: ... : : ..: :: :.. : :.::::.
CCDS45 MAQKGVLGPGQLGAVAILLYLGLLRSGTGAEGAEAPCGVAPQARITGGSSAVAGQWPWQV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SVRRQGAHICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVA
:. .:.:.:.::::.. :::.::::: . : .. : ::. : .. : :.. :.
CCDS45 SITYEGVHVCGGSLVSEQWVLSAAHCFPSEHHKE--AYEVKLGAHQLDSYS---EDAKVS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE6 ALQ----LPRAYNHYSQGSDLALLQLAHPTTHT----PLCLPQPAHRFPFGASCWATGWD
.:. : .. ::: :.:::::..: : . :.::: :: : : .:::
CCDS45 TLKDIIPHPSYLQEGSQG-DIALLQLSRPITFSRYIRPICLPAANASFPNGLHCTVTGWG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QDTSDA----PGTLRNLRLRLISRPTCNCIYNQLHQRHLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPC
. . .. : :..:.. :::: ::::.:: . . . .. :.:.: : . :
CCDS45 HVAPSVSLLTPKPLQQLEVPLISRETCNCLYNIDAKPEEPHFVQEDMVCAGYVEGGKDAC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 QGDSGGPVLCLEPDGHWVQAGIISFASSCAQEDAPVLLTNTAAHSSWLQARVQGAAFLAQ
:::::::. : .: : .::.:....:. .. : . : .....::.:..: .
CCDS45 QGDSGGPLSC-PVEGLWYLTGIVSWGDACGARNRPGVYTLASSYASWIQSKVTELQPRV-
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE6 SPETPEMSDEDSCVACGS--LRTAGPQAGAPSPWPWEARLMHQGQLACGGALVSEEAVLT
:.: : :. :: . ::: ...: : :
CCDS45 VPQTQE-SQPDSNL-CGSHLAFSSAPAQGLLRPILFLPLGLALGLLSPWLSEH
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 AAHCFIGRQAPEEWSVGLGTRPEEWGLKQLILHGAYTHPEGGYDMALLLLAQPVTLGASL
>>CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 (280 aa)
initn: 530 init1: 220 opt: 611 Z-score: 595.0 bits: 118.9 E(32554): 8.1e-27
Smith-Waterman score: 611; 38.2% identity (62.5% similar) in 280 aa overlap (4-272:6-278)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGLQAAQRACGQRGPGPPKPQEG--NTVPGEWPWQASVRR
: .::.. ... .: ..: :::: : . : . ::::::::...
CCDS42 MRGVSCLQVLLLLVLGAAGTQGRKSA--ACGQ--PRMSSRIVGGRDGRDGEWPWQASIQH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 QGAHICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVAALQL
.:::.:.:::.: ::::::::: . : . : ::.:. . :: . : : . :
CCDS42 RGAHVCGGSLIAPQWVLTAAHCFPRRALPA--EYRVRLGALRLGSTSPRTLSVPVRRVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PRAYNHYSQGSDLALLQLAHPTTHT----PLCLPQPAHRFPFGASCWATGWDQDTSDAP-
: :.. . .::::::: .:. . :.::: :. : : :. : .::: . .:
CCDS42 PPDYSEDGARGDLALLQLRRPVPLSARVQPVCLPVPGARPPPGTPCRVTGWGSLRPGVPL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 ---GTLRNLRLRLISRPTCNCIYN-QLHQRHLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPCQGDSGGP
:...:. :.. ::. .:. . . :: ::.: : . ::::::::
CCDS42 PEWRPLQGVRVPLLDSRTCDGLYHVGADVPQAERIVLPGSLCAGYPQGHKDACQGDSGGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VLCLEPDGHWVQAGIISFASSCAQEDAPVLLTNTAAHSSWLQARVQGAAFLAQSPETPEM
. ::. .: :: .:..:....:: . : . :..:..: :.::::
CCDS42 LTCLQ-SGSWVLVGVVSWGKGCALPNRPGVYTSVATYSPWIQARVSF
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 SDEDSCVACGSLRTAGPQAGAPSPWPWEARLMHQGQLACGGALVSEEAVLTAAHCFIGRQ
>>CCDS10476.1 PRSS27 gene_id:83886|Hs108|chr16 (290 aa)
initn: 549 init1: 221 opt: 597 Z-score: 581.3 bits: 116.4 E(32554): 4.6e-26
Smith-Waterman score: 597; 36.2% identity (64.5% similar) in 276 aa overlap (7-269:8-273)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGLQAAQ--RACGQRGPGPPKPQEG--NTVPGEWPWQASVR
:.::. : : : :. :::. : . . : .: ::::::.:..
CCDS10 MRRPAAVPLLLL-----LCFGSQRAKAATACGR--PRMLNRMVGGQDTQEGEWPWQVSIQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RQGAHICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVAALQ
:.:.:.:.:::.:. :::::::::.... : : ..:.::. : .: : . : ..
CCDS10 RNGSHFCGGSLIAEQWVLTAAHCFRNTSETSL--YQVLLGARQLVQPGPHAMYARVRQVE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE6 LPRAYNHYSQGSDLALLQLAHPTTHT----PLCLPQPAHRFPFGASCWATGW----DQDT
:. ....:.::..: :. : :.:::.:. : : .::.::: ..:
CCDS10 SNPLYQGTASSADVALVELEAPVPFTNYILPVCLPDPSVIFETGMNCWVTGWGSPSEEDL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SDAPGTLRNLRLRLISRPTCNCIYNQLHQR-HLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPCQGDSGG
: :..: . .:. : :: .:.. . . . . :::.: . : . :.:::::
CCDS10 LPEPRILQKLAVPIIDTPKCNLLYSKDTEFGYQPKTIKNDMLCAGFEEGKKDACKGDSGG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 PVLCLEPDGHWVQAGIISFASSCAQEDAPVLLTNTAAHSSWLQARVQGAAFLAQSPETPE
:..:: .. :.:::.::.. .::... : . ..:: .:..
CCDS10 PLVCLVGQS-WLQAGVISWGEGCARQNRPGVYIRVTAHHNWIHRIIPKLQFQPARLGGQK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 MSDEDSCVACGSLRTAGPQAGAPSPWPWEARLMHQGQLACGGALVSEEAVLTAAHCFIGR
>>CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 (802 aa)
initn: 576 init1: 316 opt: 589 Z-score: 567.6 bits: 115.4 E(32554): 2.7e-25
Smith-Waterman score: 589; 36.3% identity (62.2% similar) in 251 aa overlap (28-272:559-801)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKWCWGPVLLIAGATVLMEGLQAAQRACGQRGPGPPKPQEGNTVPGEWPWQASVRRQ
:: .::. . . ::::::::.. .
CCDS74 CEDRSCVKKPNPQCDGRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPSSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVR
530 540 550 560 570 580
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GAHICSGSLVADTWVLTAAHCFEKAAATELNSWSVVLGSLQREGLSPGAEEVGVAALQLP
: :::.:.:.:: ::.::::::.. . . :.: ::.. ... :: :. : :
CCDS74 GRHICGGALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLGKVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLH
590 600 610 620 630 640
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RAYNHYSQGSDLALLQLAHPTTHT----PLCLPQPAHRFPFGASCWATGWDQDTSDAP--
... :. :.::::: ::.... :.::: .: : : :: ::: .:
CCDS74 PYHEEDSHDYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPIS
650 660 670 680 690 700
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GTLRNLRLRLISRPTCNCIYNQLHQRHLSNPARPGMLCGGPQPGVQGPCQGDSGGPVLCL
..:... ..:: . :. .: .: . : :::.: . : . ::::::::..:
CCDS74 NALQKVDVQLIPQDLCSEVYR--YQ------VTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCK
710 720 730 740 750 760
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