Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6452
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6452, 486 aa
1>>>pF1KE6452 486 - 486 aa - 486 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1774+/-0.00099; mu= 18.8805+/- 0.059
mean_var=73.5130+/-15.494, 0's: 0 Z-trim(104.5): 39 B-trim: 10 in 1/46
Lambda= 0.149586
statistics sampled from 7907 (7941) to 7907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 ( 516) 3250 711.1 6.9e-205
CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 ( 478) 916 207.4 2.8e-53
CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 ( 504) 856 194.5 2.3e-49
CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 ( 426) 629 145.4 1.1e-34
CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 ( 465) 613 142.0 1.3e-33
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 ( 471) 607 140.7 3.3e-33
CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 ( 500) 578 134.5 2.6e-31
CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 ( 510) 554 129.3 9.6e-30
CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 ( 523) 517 121.3 2.5e-27
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 ( 505) 510 119.8 6.9e-27
CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 487) 494 116.3 7.3e-26
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 ( 509) 458 108.6 1.7e-23
CCDS55623.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 439) 431 102.7 8.4e-22
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 319) 425 101.3 1.6e-21
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs108|chr6 ( 515) 357 86.8 6.1e-17
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs108|chrX ( 539) 351 85.5 1.5e-16
CCDS55622.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 425) 342 83.5 4.9e-16
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 (516 aa)
initn: 3250 init1: 3250 opt: 3250 Z-score: 3791.8 bits: 711.1 E(32554): 6.9e-205
Smith-Waterman score: 3250; 100.0% identity (100.0% similar) in 486 aa overlap (1-486:31-516)
10 20 30
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTI
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CCDS74 MPSGSHWTANSSKIITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 CTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIML
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 GGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 FVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 GLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 PYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDP
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CCDS74 PYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDP
430 440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KE6 KLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
490 500 510
>>CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 (478 aa)
initn: 876 init1: 578 opt: 916 Z-score: 1070.1 bits: 207.4 E(32554): 2.8e-53
Smith-Waterman score: 916; 33.3% identity (65.8% similar) in 447 aa overlap (12-450:13-450)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQTAW
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CCDS89 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 IHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLT
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CCDS89 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLI
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CCDS89 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKE--WAQTCL
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CCDS89 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQT-TSKSKNKTGKTEDDS----SPKKIKTKKSTWEKVNK
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGV
..:.. :.. . ..: : ...:.::: . :... .::::.:...
CCDS89 ----YLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAFLLSVMAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFD
.:... . : ... . .. . ::. ..:.:.: :. :. :: .. ::
CCDS89 VDMFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYAVFFGLGF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCG
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CCDS89 GSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYKYMYMSCG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FSMIFSSV--LLGFA---RLIKRMRKTQ-LQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQK
.. .:: :.: : ::. . :: . . ..::.:
CCDS89 AIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKVSNAQSVT
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE6 HGEPVATAVPGYSLT
CCDS89 SERETNI
>>CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 (504 aa)
initn: 864 init1: 836 opt: 856 Z-score: 999.8 bits: 194.5 E(32554): 2.3e-49
Smith-Waterman score: 865; 36.1% identity (63.4% similar) in 435 aa overlap (8-430:8-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQTAWI
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CCDS13 MGAGGPRRGEGPPDGGWGWVVLGACFVVTGFAYGFPKAVSVFFRALMRDFDAGYSDTAWV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTG
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CCDS13 SSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGVLTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLIL
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CCDS13 LGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGFLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 GGFVLNLCVCGALMRPITL-----KEDHTTPEQNHVCRTQKED-----IKRVSPYSSLTK
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CCDS13 GGLLLHCCACGAVMRPPPGPGPRPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREASPRVRPRR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAF
. . : : .. :.: ::. ..:: : . :: :: ..:: .:::
CCDS13 RLLD--LAVCTDRA--------FAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTDAAF
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE6 LMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGM--DGLCYLCLPMLQSLPLLVP
:.::.: .::.. . : :. :. .: :::.... .:: : .: ::
CCDS13 LLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLR--PHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALVA
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 FSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGS
: .:: : .: : ::. . ::::.: ...:. :..:: ::::::. .
CCDS13 FCVAFGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVDVLKN
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 YTAAFLLCGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVAREL
: : : : . ...:... :
CCDS13 YEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRCAKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDSEPLPV
410 420 430 440 450 460
>>CCDS11085.1 SLC16A13 gene_id:201232|Hs108|chr17 (426 aa)
initn: 864 init1: 629 opt: 629 Z-score: 736.0 bits: 145.4 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 837; 32.3% identity (64.6% similar) in 455 aa overlap (7-458:2-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQTAWI
:: : ::::::::..: . :. . . .: : ...::::: . : .. :...::
CCDS11 MARRTEPPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEEQAARVSWI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGVLTG
:: : .. .:.::..:.... . .: ::.::. :..:.:::::: ::::..:.:.:
CCDS11 ASIGIAVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLSG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLIL
:.:: ..:..: .. :::::..:: :.:..: :...: .:: : :. ...:::.::..
CCDS11 SGWALTFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFFQWLLSHYAWRGSLLLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCC
... :.: .::::.:: .: :: : . .: ..::
CCDS11 SALSLHLVACGALLRPPSLAED---PAVG-------------GPRAQLT-----------
180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDI
:.: . :. .:.. .. : ...:: . .. . ::::.:.... :.
CCDS11 -----SLLHHGPFLRYTVALTLINTGYFIPYLHLVAHLQDLDWDPLPAAFLLSVVAISDL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 IGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAY
.: .. ::: : . . .. . . :. .:. :. :: .. ..:. .::
CCDS11 VGRVVSGWLGD--AVPGPVTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVALAVAYGFTSGAL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KE6 VTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCG-FS
. : : :..:: . .::.. ..... :..::..: : :.::.:::.:.. : :
CCDS11 APLAFSVLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNYTASFVVAGAFL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 MIFSSVLLGFARLIKRMRKTQ--LQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVA
. :..:: . ... :. ..... : :. : .:
CCDS11 LSGSGILLTLPHFFCFSTTTSGPQDLVTEALDTKVPLPKEGLEED
390 400 410 420
480
pF1KE6 TAVPGYSLT
>>CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 (465 aa)
initn: 898 init1: 613 opt: 613 Z-score: 716.8 bits: 142.0 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 853; 35.4% identity (62.5% similar) in 443 aa overlap (13-453:16-430)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDYAQT
::::::: .. :::..: . : . .:.:: :. : :..:
CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKAPDGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKELIQEFGIGYSDT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 AWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFATSLKHLYLTLGV
::: ::. . . .:: :: :...:. ...:::.:: :.. .:: :. ..::: ::
CCDS11 AWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFCRSIIQVYLTTGV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGAL
.::::.:: ..:.. :...:::.:. .: :.: .:: . :.:. ::: ....:::..
CCDS11 ITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQLLQDRYGWRGGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCL
:::::..:: :::.:::::... ..: :. . .. :
CCDS11 LILGGLLLNCCVCAALMRPLVVT---------------------AQPGSGPPRP-SRRLL
190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGV
. .. .:.:.. .:.::. .. :.:: : :: ..:: .::::..:::
CCDS11 DLSVFRDRGFVLYA----VAASVMVLGLFVPPVFV--VSYAKDLGVPDTKAAFLLTILGF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 IDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFD
:::.. . :... .. :. . :.. ..:: : . :: : ::
CCDS11 IDIFARPAAGFVAGLGKVRPYSVYLFSFSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVVFCIFFGISY
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 GAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCG
: .: : :::: ..:::.:.: ...:: ::.:: .:.:.:.: : .:.: :
CCDS11 GMVGALQFEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHVYMYVFILAG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FSMIFSSV--LLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEP
.. ::. ::: :.. : .: . ::.
CCDS11 AEVLTSSLILLLGNFFCIRKKPKEPQPEVAAAEEEKLHKPPADSGVDLREVEHFLKAEPE
400 410 420 430 440 450
480
pF1KE6 VATAVPGYSLT
CCDS11 KNGEVVHTPETSV
460
>>CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 (471 aa)
initn: 795 init1: 607 opt: 607 Z-score: 709.8 bits: 140.7 E(32554): 3.3e-33
Smith-Waterman score: 780; 32.7% identity (66.6% similar) in 428 aa overlap (12-431:32-428)
10 20 30 40
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISI
::::::::...:. : .. . .. : ...
CCDS11 PAPQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGPPDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGLLRSLGL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLIL
: .. .: .. .:::: ... : . .:.::..:.. . . .:.::.::: :...
CCDS11 AFPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASPVGSALSTRWGARPVVMVGGVLASLGFVF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILA
:.::..: :::: ::.:.:.:.:: ..::.. ...:::::..:: :.:..:.: ....::
CCDS11 SAFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGASSLLLA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 PVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKR
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CCDS11 PALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPLVLPGDPPAPPR-------------
190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VSPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMSDFVVLAVSVLFMAYGCSPLFVYLVPYALSV
:: ..: :.. : ..:... ... : .:.:.:.::.
CCDS11 -SPLAALG---------------LSLFTRRAFSIFALGTALVGGGYFVPYVHLAPHALDR
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCL-PML
:.. ::..... .. : . .. :::.:. . . . . :. :: . : :..
CCDS11 GLGGYGAALVVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVPLPRLLAVFGALTGLGLWVVGLVPVV
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE6 QSL-----PLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVS
. :::. . ..: :.:. :. : .::. .. .: :.:..: .. :..
CCDS11 GGEESWGGPLLAA-AVAYGLSAGSYAPLVFGVLPGLVGVGGVVQATGLVMMLMSLGGLLG
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 PPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSS--VLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQ
::..: : : ::..::.::: : :.:.:. . .:. :
CCDS11 PPLSGFLRDETGDFTASFLLSG-SLILSGSFIYIGLPRALPSCGPASPPATPPPETGELL
400 410 420 430 440 450
460 470 480
pF1KE6 LWTNGSVAYSVARELDQKHGEPVATAVPGYSLT
CCDS11 PAPQAVLLSPGGPGSTLDTTC
460 470
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50 60
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CCDS85 ISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGVIG
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pF1KE6 GLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQLLIEQFSWRGALLI
:::.:. .::..:.:::: .:. :: :.::.:: . :::. :... :.:::..::
CCDS85 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSFLI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVC--RTQKEDIKRV--SPYSSLTKEWAQT
:::..:: :: ::::::: : .. ..... .. : .:. . ..: . .
CCDS85 LGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPKQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CLCCCLQQEYSFLLMSDFV----VLAVS-VLFMAYGCSPLFVYLVPYALSVGVSHQQAAF
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CCDS85 EKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSAF
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300 310 320 330 340
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:.:::. .:... ..: ... . .. . :.::... .:.:.. :. . .
CCDS85 LLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIR--PRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCV
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 FSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGS
.. ::. : ... . ..:: .:::.:.: ... : :..::. ::: : :.
CCDS85 YAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 YTAAFLLCGFSMIFSSVLL--GFA---RLIKRMRKTQLQFI-AKESDPKLQLWTNGSVAY
: .. :: .:.:.. : :.. ::. . .:.. : .:: . .... . . .
CCDS85 YKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVT
420 430 440 450 460 470
470 480
pF1KE6 SVARELDQKH--GEPVATAVPGYSLT
..:. ::: : : :
CCDS85 KAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
480 490 500
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10 20 30 40
pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVE
::::.::.: . :.: : . .... ::
CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
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50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLILSSFA
. : :. . :::. :. .:.. .:. .. : .:. ..:::. : : .::..:
CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
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110 120 130 140 150 160
pF1KE6 TSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFILAPVVQ
.....:..:.:: .::: .. : ::..:::.::..:.::: :.. .:.:.:::... ...
CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE6 LLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHV--------------
: ...::.:.:: :. ::::::::::::.. .. . : .. :
CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KE6 ---CRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTC---------LCCC-LQQEYSFLLMS------D
::...: .. .: :: : .: . . :.: : :
CCDS24 GQQGRTEEKD-GGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFED
250 260 270 280 290
260 270 280 290
pF1KE6 F-------VVLAVSVLFMAYGCSPLFVY---LVPYALS------VGVSHQQAAF-LMSIL
. . : .. .:.:. ::.: ..:. ..:.:. .: : ::.
CCDS24 WYSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSII
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 GVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGMDGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGY
... :.:.. .: ..: :.. .. .:.: : . ::.... :. . :..
CCDS24 AIVHIFGKVILGVIADLPCISVWNV--FLLANFTLVLSIFILPLMHTYAGLAVI-CALIG
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLL
:...: .:.:::: ..:: :..: :.. ... :..::.:: . : : .: .: .
CCDS24 FSSGYFSLMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYI
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 CGFSMIFSSVLLGFARLIKRMRKTQLQFIAKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQKHGEP
::. .... ..: . :. ..... ...
CCDS24 CGLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
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pF1KE6 MAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCISIFFVEFQTYFTQDY
: ::::::: .... :.: . : .. . ...:: ... :...
CCDS11 MTQNKLKLCSKANVYTEVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKTFGVFFNDLMDSFNESN
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.. .:: :: : . :::..:.::... .. .::::::.:::.. .::. ..:.:..
CCDS11 SRISWIISICVFVLTFSAPLATVLSNRFGHRLVVMLGGLLVSTGMVAASFSQEVSHMYVA
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.:...:::. . . :.......::..:.... ..: .: ...: .::... : :...::
CCDS11 IGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFGKRRSIVTAVASTGECFAVFAFAPAIMALKERIGWR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KE6 GALLILGGFVLNLCVCGALMRPI----------TLKEDHTTPE---QNHVCRTQKEDI--
.::..: . ::. . :::.::: ...:.. . .:. ::. ..:
CCDS11 YSLLFVGLLQLNIVIFGALLRPIFIRGPASPKIVIQENRKEAQYMLENEKTRTSIDSIDS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KE6 --------KRVSPYSSLT---KEWAQTCLCCCLQQ---------EYSFLLMSDFVVLAVS
: : ...: : : : . ..:.: ..:. :.
CCDS11 GVELTTSPKNVPTHTNLELEPKADMQQVLVKTSPRPSEKKAPLLDFSILKEKSFICYALF
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260 270 280 290 300 310
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:: . : .:..: ..:.:.....::::.: ... ...: : :.. .:. ...
CCDS11 GLFATLGFFAPSLYIIPLGISLGIDQDRAAFLLSTMAIAEVFGRIGAGFVLNREPIRKI-
310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
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:. :. : . . . . . . :. : ::.. :. : ::... . .:: ..
CCDS11 YI-ELICVILLTVSLFAFTFATEFWGLMSCSIFFGFMVGTIGGTHIPLLAEDDVVGIEKM
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380 390 400 410 420 430
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::: :: :.... :..::.:: ::: . :. :: :. .: ...: :...:
CCDS11 SSAAGVYIFIQSIAGLAGPPLAGLLVDQSKIYSRAFYSCAAGMALAAVCLALVRPCKMGL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
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CCDS11 CQHHHSGETKVVSHRGKTLQDIPEDFLEMDLAKNEHRVHVQMEPV
480 490 500 510 520
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::.:.:... . ... : . ::.:::.:.: : . ..:.:.
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTELQWEFQASNSETSWF
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CCDS11 PSILTAVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFSHNLSQLYFTAGFITG
60 70 80 90 100 110
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CCDS11 LGMCFSFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGITLWPLLSRYLLENLGWRGTFLVF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 GGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVCRTQKEDIKRVSPYSSLTKEWAQTCLCCC
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CCDS11 GGIFLHCCICGAIIRPVATS---VAPET-----------KECPPPPPETP--ALGCLAAC
180 190 200 210
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pF1KE6 ---LQQEYSFLLM---SDFVVLAVSVLFMAYGCSPLF-VYLVPYALSVGVSHQQAAFLMS
.:.. .: .. . . : ..:.. . : :: :.:::::. .:..::::.:.:
CCDS11 GRTIQRHLAFDILRHNTGYCVYILGVMWSVLGF-PLPQVFLVPYAMWHSVDEQQAALLIS
220 230 240 250 260 270
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CCDS11 IIGFSNIFLRPLAGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVGYCLAY
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pF1KE6 GYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHAVPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAF
. .. .:: : .:: .. :::. : .. .:.:::.:: :.:.:.... .:
CCDS11 SVSMSGIGALIFQVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDATNNFSYVF
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. .: .: .....: : : :. . :
CCDS11 YMSSFFLISAALFMGGSFYALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPGKQRSPEIMCQS
400 410 420 430 440 450
486 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]