FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6449, 534 aa
1>>>pF1KE6449 534 - 534 aa - 534 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9438+/-0.00112; mu= 14.3814+/- 0.067
mean_var=66.7333+/-13.174, 0's: 0 Z-trim(102.1): 45 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157001
statistics sampled from 6781 (6818) to 6781 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 1.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33404.1 UGT1A5 gene_id:54579|Hs108|chr2 ( 534) 3577 819.7 0
CCDS2509.1 UGT1A3 gene_id:54659|Hs108|chr2 ( 534) 3404 780.5 0
CCDS33405.1 UGT1A4 gene_id:54657|Hs108|chr2 ( 534) 3357 769.9 0
CCDS2510.1 UGT1A1 gene_id:54658|Hs108|chr2 ( 533) 2635 606.3 2.8e-173
CCDS2505.1 UGT1A9 gene_id:54600|Hs108|chr2 ( 530) 2422 558.1 9.2e-159
CCDS33402.1 UGT1A8 gene_id:54576|Hs108|chr2 ( 530) 2416 556.7 2.4e-158
CCDS33403.1 UGT1A10 gene_id:54575|Hs108|chr2 ( 530) 2369 546.1 3.8e-155
CCDS2507.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 ( 532) 2368 545.9 4.4e-155
CCDS2506.1 UGT1A7 gene_id:54577|Hs108|chr2 ( 530) 2363 544.7 9.7e-155
CCDS2508.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 ( 265) 1751 406.0 2.7e-113
CCDS3523.1 UGT2B17 gene_id:7367|Hs108|chr4 ( 530) 1512 352.0 1e-96
CCDS75136.1 UGT2B10 gene_id:7365|Hs108|chr4 ( 528) 1497 348.6 1.1e-95
CCDS43234.1 UGT2B4 gene_id:7363|Hs108|chr4 ( 528) 1496 348.3 1.3e-95
CCDS56331.1 UGT2A2 gene_id:574537|Hs108|chr4 ( 536) 1482 345.2 1.1e-94
CCDS3524.1 UGT2B15 gene_id:7366|Hs108|chr4 ( 530) 1474 343.4 4e-94
CCDS3526.1 UGT2B7 gene_id:7364|Hs108|chr4 ( 529) 1469 342.2 8.7e-94
CCDS3529.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 527) 1463 340.9 2.2e-93
CCDS3527.1 UGT2B11 gene_id:10720|Hs108|chr4 ( 529) 1461 340.4 3.1e-93
CCDS3528.1 UGT2B28 gene_id:54490|Hs108|chr4 ( 529) 1460 340.2 3.6e-93
CCDS3525.1 UGT2A3 gene_id:79799|Hs108|chr4 ( 527) 1406 328.0 1.7e-89
CCDS75135.1 UGT2B10 gene_id:7365|Hs108|chr4 ( 444) 1161 272.5 7.4e-73
CCDS58901.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 527) 1094 257.3 3.2e-68
CCDS3705.1 UGT8 gene_id:7368|Hs108|chr4 ( 541) 1015 239.4 8.1e-63
CCDS3914.1 UGT3A2 gene_id:167127|Hs108|chr5 ( 523) 876 207.9 2.3e-53
CCDS3913.1 UGT3A1 gene_id:133688|Hs108|chr5 ( 523) 859 204.1 3.4e-52
CCDS77925.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 483) 858 203.8 3.7e-52
CCDS77924.1 UGT2A2 gene_id:574537|Hs108|chr4 ( 492) 858 203.8 3.7e-52
CCDS58902.1 UGT2A1 gene_id:10941|Hs108|chr4 ( 693) 858 203.9 5.2e-52
CCDS54842.1 UGT3A2 gene_id:167127|Hs108|chr5 ( 489) 825 196.4 6.6e-50
CCDS75137.1 UGT2B4 gene_id:7363|Hs108|chr4 ( 369) 787 187.7 2e-47
CCDS82930.1 UGT2B7 gene_id:7364|Hs108|chr4 ( 369) 761 181.8 1.2e-45
CCDS56330.1 UGT2B28 gene_id:54490|Hs108|chr4 ( 335) 666 160.3 3.2e-39
CCDS54841.1 UGT3A1 gene_id:133688|Hs108|chr5 ( 252) 303 78.1 1.4e-14
>>CCDS33404.1 UGT1A5 gene_id:54579|Hs108|chr2 (534 aa)
initn: 3577 init1: 3577 opt: 3577 Z-score: 4377.6 bits: 819.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3577; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 REVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS2509.1 UGT1A3 gene_id:54659|Hs108|chr2 (534 aa)
initn: 3404 init1: 3404 opt: 3404 Z-score: 4165.8 bits: 780.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3404; 94.6% identity (97.8% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
:::::::::: :::::::::::::::::::::::: ::::::::::.::.:::::::.::
CCDS25 MATGLQVPLPWLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPIDGSHWLSMREVLRELHARGHQAVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
:: ::::.::::::::::::::::::::::: .::::: .:::::.: :: : ::..:::
CCDS25 LTPEVNMHIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRHVLGHTQLYFETEHFLKKFFRSMAMLNNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCDL
::. :::::::::::::::::.::::::::::: .:::::::::::::.:::::::::::
CCDS25 SLVYHRSCVELLHNEALIRHLNATSFDVVLTDPVNLCAAVLAKYLSIPTVFFLRNIPCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELFQ
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::: :::::::::::::
CCDS25 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFMQRVKNMLYPLALSYICHAFSAPYASLASELFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 REVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS25 REVSVVDILSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANRKPLSQEFEAYINASGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS33405.1 UGT1A4 gene_id:54657|Hs108|chr2 (534 aa)
initn: 3357 init1: 3357 opt: 3357 Z-score: 4108.3 bits: 769.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3357; 93.4% identity (97.4% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
:: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::.::
CCDS33 MARGLQVPLPRLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSPWLSMREALRELHARGHQAVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
:: ::::.::::.:::::.::. ::: ::::. ::.::.:::::::: ..:: ::::::.
CCDS33 LTPEVNMHIKEEKFFTLTAYAVPWTQKEFDRVTLGYTQGFFETEHLLKRYSRSMAIMNNV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCDL
:: .:: ::::::::::::::.::::::::::: .::.:::::::::::::: : :::::
CCDS33 SLALHRCCVELLHNEALIRHLNATSFDVVLTDPVNLCGAVLAKYLSIPAVFFWRYIPCDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELFQ
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::. :::::::::::::
CCDS33 DFKGTQCPNPSSYIPKLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYICHTFSAPYASLASELFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 REVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REVSVVDLVSYASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
490 500 510 520 530
>>CCDS2510.1 UGT1A1 gene_id:54658|Hs108|chr2 (533 aa)
initn: 2633 init1: 2633 opt: 2635 Z-score: 3224.5 bits: 606.3 E(32554): 2.8e-173
Smith-Waterman score: 2635; 72.8% identity (88.6% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
::. : : :. :::: . ...::.:..:.:::::::: :...:. :::..::
CCDS25 MAVESQGGRP-LVLGLLLCVLGPVVSHAGKILLIPVDGSHWLSMLGAIQQLQQRGHEIVV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
:. ....::.. :.:: :: . . ... . ... .. ::.. .:.. . . ...
CCDS25 LAPDASLYIRDGAFYTLKTYPVPFQREDVKESFVSLGHNVFENDSFLQRVIKTYKKIKKD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCDL
: .. .: .::::. :. : .::::.::::: :. ..:.:::.:.::::. .::.:
CCDS25 SAMLLSGCSHLLHNKELMASLAESSFDVMLTDPFLPCSPIVAQYLSLPTVFFLHALPCSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELFQ
.:..:::::: ::.:: :...:::::::::::::: .. ..:: .: .:::.::::..:
CCDS25 EFEATQCPNPFSYVPRPLSSHSDHMTFLQRVKNMLIAFSQNFLCDVVYSPYATLASEFLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 REVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASGE
:::.: ::.: :::::::.::: ::::::::::::.::::: . .:::::::::::::::
CCDS25 REVTVQDLLSSASVWLFRSDFVKDYPRPIMPNMVFVGGINCLHQNPLSQEFEAYINASGE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQND
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEMT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAAH
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE6 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2505.1 UGT1A9 gene_id:54600|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 2403 init1: 2217 opt: 2422 Z-score: 2963.8 bits: 558.1 E(32554): 9.2e-159
Smith-Waterman score: 2422; 69.1% identity (83.3% similar) in 534 aa overlap (3-534:4-530)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVV
:: ::: : . ::: . .::.::.:::: :::::..:: ... : :::.::
CCDS25 MACTGWTSPLP-LCVCLLLTCG---FAEAGKLLVVPMDGSHWFTMRSVVEKLILRGHEVV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VLTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLL--LGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIM
:. ::. . . :. ::. :.: ...:: . ..:.: ... . .: :. .
CCDS25 VVMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDLDREFKAFAHAQWKAQVRSI---YSLLMGSY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NNMSLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIP
:.. .. .: :.... :...:. .:::.:. ::: :. ..:::.:.:.: : :.:
CCDS25 NDIFDLFFSNCRSLFKDKKLVEYLKESSFDAVFLDPFDNCGLIVAKYFSLPSVVFARGIL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASE
: .:.::: : ::.::.: :: ::: .::.: .. : ::: .:::
CCDS25 CHYLEEGAQCPAPLSYVPRILLGFSDAMTFKERVRNHIMHLEEHLLCHRFFKNALEIASE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LFQREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINA
..: :. :: ::.:.::.: :::.:::.:.::::.::::::: .:::: .::::::::
CCDS25 ILQTPVTEYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 EMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 AAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33402.1 UGT1A8 gene_id:54576|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 2401 init1: 2219 opt: 2416 Z-score: 2956.4 bits: 556.7 E(32554): 2.4e-158
Smith-Waterman score: 2416; 68.4% identity (83.8% similar) in 532 aa overlap (3-534:4-530)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVV
:: :.: : ..::: . .::.::.:::: :::::..:. ... : :::.::
CCDS33 MARTGWTSPIP-LCVSLLLTCG---FAEAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VLTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNN
:. ::. . . :. ::. :.: ...:: .. ... .... . :: .. :.
CCDS33 VVMPEVSWQLGKSLNCTVKTYSTSYTLEDLDREFMDFADAQWKAQ-VRSLFSLFLSSSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MSLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPCD
. .. : :.... :...:. .:::.:. ::: :. ..:::.:.:.: : :.: :
CCDS33 FFNLFFSHCRSLFNDRKLVEYLKESSFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGIACH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASELF
.:.::: : ::.::.: :: ::: .::.: .. : .:. : .:::..
CCDS33 YLEEGAQCPAPLSYVPRILLGFSDAMTFKERVRNHIMHLEEHLFCQYFSKNALEIASEIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 QREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASG
: :.. :: ::.:.::.: :::.:::.:.::::.::::::: .:::: .::::::::::
CCDS33 QTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINASG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
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480 490 500 510 520 530
pF1KE6 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33403.1 UGT1A10 gene_id:54575|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 2360 init1: 2187 opt: 2369 Z-score: 2898.9 bits: 546.1 E(32554): 3.8e-155
Smith-Waterman score: 2369; 67.9% identity (82.7% similar) in 533 aa overlap (4-534:5-530)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVV
: :.: : . ::: . .::.::.:::: :::::..:. ... : :::.::
CCDS33 MARAGWTSPVP-LCVCLLLTCG---FAEAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGHEVV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VLTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDR--LLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIM
:. ::. ... :. ::. :.: .. .: ....:.: ... . :: :.
CCDS33 VVMPEVSWQLERSLNCTVKTYSTSYTLEDQNREFMVFAHAQWKAQAQSI---FSLLMSSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NNMSLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIP
... .. : :.... :...:. .:::.:. ::: :. ..:::.:.:.: : :.:
CCDS33 SGFLDLFFSHCRSLFNDRKLVEYLKESSFDAVFLDPFDTCGLIVAKYFSLPSVVFTRGIF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASE
: .:.::: : ::.: : :: ::: .:: : . : .:. . .:::
CCDS33 CHHLEEGAQCPAPLSYVPNDLLGFSDAMTFKERVWNHIVHLEDHLFCQYLFRNALEIASE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LFQREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINA
..: :.. :: ::.:.::.: :::.:::.:.::::.::::::: .:::: .::::::::
CCDS33 ILQTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLDYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPLPMEFEAYINA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 QNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 EMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 AAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2507.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 2353 init1: 2353 opt: 2368 Z-score: 2897.7 bits: 545.9 E(32554): 4.4e-155
Smith-Waterman score: 2368; 67.9% identity (83.7% similar) in 526 aa overlap (11-534:9-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLLLLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGHQVVV
: .. ...:.. . . :.:::: ::::::::.. .. : :::..::
CCDS25 MACLLRSFQRISAGVFFLALWGMVVGDKLLVVPQDGSHWLSMKDIVEVLSDRGHEIVV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAIMNNM
.. :::. .:: ...: : . . :.:. . .. : . .: . . :::
CCDS25 VVPEVNLLLKESKYYTRKIYPVPYDQEELKNRYQSFGNNHFAERSFLT--APQTEYRNNM
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pF1KE6 SLI--IHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNIPC
.: .: ::... . .. ..::...::: :...::.::..:.:...:..::
CCDS25 IVIGLYFINCQSLLQDRDTLNFFKESKFDALFTDPALPCGVILAEYLGLPSVYLFRGFPC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLASEL
.:. .. :.: ::::: : :::::: ::: :.: : :: . . . : ::: .
CCDS25 SLEHTFSRSPDPVSYIPRCYTKFSDHMTFSQRVANFLVNLLEPYLFYCLFSKYEELASAV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FQREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINAS
..:.:... : ...::::.: :::..::::.:::::::::::: . : ::::::::::::
CCDS25 LKRDVDIITLYQKVSVWLLRYDFVLEYPRPVMPNMVFIGGINCKKRKDLSQEFEAYINAS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 GEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 NDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 MTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 AHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2506.1 UGT1A7 gene_id:54577|Hs108|chr2 (530 aa)
initn: 2359 init1: 2188 opt: 2363 Z-score: 2891.6 bits: 544.7 E(32554): 9.7e-155
Smith-Waterman score: 2363; 68.6% identity (82.7% similar) in 525 aa overlap (14-534:7-530)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MATGLQVPLPQLATGLL----LLLSVQPWAESGKVLVVPTDGSHWLSMREALRDLHARGH
:::: :: . .:..::.:::: :::::..:. ... : :::
CCDS25 MARAGWTGLLPLYVCLLLTCGFAKAGKLLVVPMDGSHWFTMQSVVEKLILRGH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 QVVVLTLEVNMYIKEENFFTLTTYAISWTQDEFDRLLLGHTQSFFETEHLLMKFSRRMAI
.:::. ::. . . :. ::. :.: .. :: .. ... . : : :: .
CCDS25 EVVVVMPEVSWQLGRSLNCTVKTYSTSYTLEDQDREFMVFADARW-TAPLRSAFSLLTSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MNNMSLIIHRSCVELLHNEALIRHLHATSFDVVLTDPFHLCAAVLAKYLSIPAVFFLRNI
:.. .. .: :.... :...:. . ::.:. ::: :. ..:::.:.:.: : :.:
CCDS25 SNGIFDLFFSNCRSLFNDRKLVEYLKESCFDAVFLDPFDACGLIVAKYFSLPSVVFARGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PCDLDFKGTQCPNPSSYIPRLLTTNSDHMTFLQRVKNMLYPLALSYLCHAVSAPYASLAS
: .:.::: : ::.:::: :: ::: .:: : .. : .: .::
CCDS25 FCHYLEEGAQCPAPLSYVPRLLLGFSDAMTFKERVWNHIMHLEEHLFCPYFFKNVLEIAS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ELFQREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYIN
:..: :.. :: ::.:.::.: :::..::.:.::::.::::::: .:::. .:::::::
CCDS25 EILQTPVTAYDLYSHTSIWLLRTDFVLEYPKPVMPNMIFIGGINCHQGKPVPMEFEAYIN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ASGEHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PQNDLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LEMTSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PAAHDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
480 490 500 510 520 530
>>CCDS2508.1 UGT1A6 gene_id:54578|Hs108|chr2 (265 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1751 Z-score: 2147.4 bits: 406.0 E(32554): 2.7e-113
Smith-Waterman score: 1751; 98.5% identity (98.9% similar) in 265 aa overlap (270-534:1-265)
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 QREVSVVDLVSHASVWLFRGDFVMDYPRPIMPNMVFIGGINCANGKPLSQEFEAYINASG
:::::::::::: . : :::::::::::::
CCDS25 MPNMVFIGGINCKKRKDLSQEFEAYINASG
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EHGIVVFSLGSMVSEIPEKKAMAIADALGKIPQTVLWRYTGTRPSNLANNTILVKWLPQN
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLLGHPMTRAFITHAGSHGVYESICNGVPMVMMPLFGDQMDNAKRMETKGAGVTLNVLEM
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TSEDLENALKAVINDKSYKENIMRLSSLHKDRPVEPLDLAVFWVEFVMRHKGAPHLRPAA
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HDLTWYQYHSLDVIGFLLAVVLTVAFITFKCCAYGYRKCLGKKGRVKKAHKSKTH
220 230 240 250 260
534 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:25:01 2016 done: Tue Nov 8 13:25:02 2016
Total Scan time: 1.760 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]