Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6447
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6447, 506 aa
1>>>pF1KE6447 506 - 506 aa - 506 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1527+/-0.00101; mu= 19.2103+/- 0.060
mean_var=62.0316+/-12.198, 0's: 0 Z-trim(103.1): 25 B-trim: 42 in 1/50
Lambda= 0.162842
statistics sampled from 7231 (7243) to 7231 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4238.1 HARS2 gene_id:23438|Hs108|chr5 ( 506) 3359 798.1 0
CCDS64267.1 HARS2 gene_id:23438|Hs108|chr5 ( 481) 2950 702.0 3.9e-202
CCDS4237.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 509) 2466 588.3 6.9e-168
CCDS58976.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 469) 2210 528.1 8.2e-150
CCDS75324.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 435) 1816 435.5 5.6e-122
CCDS75323.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 395) 1815 435.3 6.1e-122
CCDS58977.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 449) 1815 435.3 6.8e-122
CCDS58978.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 ( 489) 1815 435.3 7.3e-122
CCDS42016.1 EIF2AK4 gene_id:440275|Hs108|chr15 (1649) 445 113.7 1.6e-24
>>CCDS4238.1 HARS2 gene_id:23438|Hs108|chr5 (506 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 4261.4 bits: 798.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3359; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLLGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAVLTSQLKAHQEKPNFIIKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MPLLGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAVLTSQLKAHQEKPNFIIKTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KGTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KGTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GQFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GQFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSID
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIR
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 SVASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
490 500
>>CCDS64267.1 HARS2 gene_id:23438|Hs108|chr5 (481 aa)
initn: 2950 init1: 2950 opt: 2950 Z-score: 3742.5 bits: 702.0 E(32554): 3.9e-202
Smith-Waterman score: 3144; 95.1% identity (95.1% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLLGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAVLTSQLKAHQEKPNFIIKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MPLLGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQ------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KGTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 -GTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GQFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GQFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSID
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAA
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 FLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIR
400 410 420 430 440 450
490 500
pF1KE6 SVASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
460 470 480
>>CCDS4237.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (509 aa)
initn: 2489 init1: 2460 opt: 2466 Z-score: 3127.6 bits: 588.3 E(32554): 6.9e-168
Smith-Waterman score: 2466; 76.3% identity (93.9% similar) in 473 aa overlap (34-505:32-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAV-LTSQLKAHQEKPNFIIKTPKG
. .::. . : .:: . : .:..:::::
CCDS42 AERAALEELVKLQGERVRGLKQQKASAELIEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQG
::: ::..:.::::..:..: :::::::. .:::.::::::: :::::: :.:::::::
CCDS42 TRDYSPRQMAVREKVFDVIIRCFKRHGAEVIDTPVFELKETLMGKYGEDSKLIYDLKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQ
::::::::::::::::::::::. ..::::..::.::..:....:::::: ::::::::.
CCDS42 GELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKL
:::::::::::::::::::.::.::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::
CCDS42 FDPMIPDAECLKIMCEILSSLQIGDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGD
::..:..:..::: .:::::::::::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::
CCDS42 DKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGG
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::
CCDS42 LKLLFEYLTLFGIDDKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 RYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFL
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:
CCDS42 RYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 QERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSV
.:::::..::::.:::::.:::.:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::
CCDS42 EERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSV
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 ASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
.::::: ..::..: ::..: ..
CCDS42 TSREEVDVRREDLVEEIKRRTGQPLCIC
490 500
>>CCDS58976.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (469 aa)
initn: 2253 init1: 2210 opt: 2210 Z-score: 2803.1 bits: 528.1 E(32554): 8.2e-150
Smith-Waterman score: 2210; 80.0% identity (95.8% similar) in 405 aa overlap (101-505:60-464)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 MVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQGGELLSLRY
:::: :::::: :.:::::::::::::::
CCDS58 LIEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKETLMGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRY
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 DLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQFDPMIPDA
::::::::::::::. ..::::..::.::..:....:::::: ::::::::.::::::::
CCDS58 DLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAKVYRRDNPAMTRGRYREFYQCDFDIAGNFDPMIPDA
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 ECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKLDKMAWKDV
:::::::::::.::.::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::::..:..:
CCDS58 ECLKIMCEILSSLQIGDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEV
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 RHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGDLKLLFEYL
..::: .:::::::::::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 KNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFEYL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGGRYDGLVGM
::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::
CCDS58 TLFGIDDKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGGRYDGLVGM
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 FDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIA
:::::.::::::::::::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:.:::::..
CCDS58 FDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVS
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 ELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSVASREEVAI
::::.:::::.:::.:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::.::::: .
CCDS58 ELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVTSREEVDV
390 400 410 420 430 440
500
pF1KE6 KRENFVAEIQKRLSES
.::..: ::..: ..
CCDS58 RREDLVEEIKRRTGQPLCIC
450 460
>>CCDS75324.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (435 aa)
initn: 2064 init1: 1815 opt: 1816 Z-score: 2303.3 bits: 435.5 E(32554): 5.6e-122
Smith-Waterman score: 1919; 64.5% identity (79.3% similar) in 473 aa overlap (34-505:32-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAV-LTSQLKAHQEKPNFIIKTPKG
. .::. . : .:: . : .:..:::::
CCDS75 AERAALEELVKLQGERVRGLKQQKASAELIEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQG
::: ::..:.::::..:..: :::::::. .:::.::::
CCDS75 TRDYSPRQMAVREKVFDVIIRCFKRHGAEVIDTPVFELK---------------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQ
::::::.
CCDS75 -----------------------------------------------------DFDIAGN
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKL
:::::::::::::::::::.::.::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::
CCDS75 FDPMIPDAECLKIMCEILSSLQIGDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKL
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGD
::..:..:..::: .:::::::::::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::
CCDS75 DKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGD
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGG
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::
CCDS75 LKLLFEYLTLFGIDDKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGG
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 RYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFL
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:
CCDS75 RYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLL
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 QERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSV
.:::::..::::.:::::.:::.:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::
CCDS75 EERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSV
350 360 370 380 390 400
490 500
pF1KE6 ASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
.::::: ..::..: ::..: ..
CCDS75 TSREEVDVRREDLVEEIKRRTGQPLCIC
410 420 430
>>CCDS75323.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (395 aa)
initn: 1861 init1: 1815 opt: 1815 Z-score: 2302.7 bits: 435.3 E(32554): 6.1e-122
Smith-Waterman score: 1815; 80.9% identity (96.4% similar) in 330 aa overlap (176-505:61-390)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 KKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQFDPMIPDAECLKIMCEILSGLQL
::::::.:::::::::::::::::::.::.
CCDS75 IEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKDFDIAGNFDPMIPDAECLKIMCEILSSLQI
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 GDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVA
::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::::..:..:..::: .::::::::
CCDS75 GDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVA
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 DRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSL
:::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS75 DRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFEYLTLFGIDDKISFDLSL
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSI
::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS75 ARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSI
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 GVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKN
:::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:.:::::..::::.:::::.:::.
CCDS75 GVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVSELWDAGIKAELLYKK
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 NPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSVASREEVAIKRENFVAEIQKRLSE
:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::.::::: ..::..: ::..: ..
CCDS75 NPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVTSREEVDVRREDLVEEIKRRTGQ
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 S
CCDS75 PLCIC
>>CCDS58977.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (449 aa)
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80 90 100 110 120 130
pF1KE6 MVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQGGELLSLRY
:::: :::::: :.:::::::::::::::
CCDS58 LIEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKETLMGKYGEDSKLIYDLKDQGGELLSLRY
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 DLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQFDPMIPDA
::::::::::::::. ..::::..: ::::::.::::::::
CCDS58 DLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAK--------------------DFDIAGNFDPMIPDA
90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 ECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKLDKMAWKDV
:::::::::::.::.::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::::..:..:
CCDS58 ECLKIMCEILSSLQIGDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKLDKVSWEEV
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 RHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGDLKLLFEYL
..::: .:::::::::::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 KNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGDLKLLFEYL
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGGRYDGLVGM
::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::
CCDS58 TLFGIDDKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGGRYDGLVGM
250 260 270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 FDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIA
:::::.::::::::::::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:.:::::..
CCDS58 FDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLLEERLKLVS
310 320 330 340 350 360
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 ELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSVASREEVAI
::::.:::::.:::.:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::.::::: .
CCDS58 ELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSVTSREEVDV
370 380 390 400 410 420
500
pF1KE6 KRENFVAEIQKRLSES
.::..: ::..: ..
CCDS58 RREDLVEEIKRRTGQPLCIC
430 440
>>CCDS58978.1 HARS gene_id:3035|Hs108|chr5 (489 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAV-LTSQLKAHQEKPNFIIKTPKG
. .::. . : .:: . : .:..:::::
CCDS58 AERAALEELVKLQGERVRGLKQQKASAELIEEEVAKLLKLKAQLGPDESKQKFVLKTPKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQG
::: ::..:.::::..:..: :::::::. .:::.::::::: :::::: :.:::::::
CCDS58 TRDYSPRQMAVREKVFDVIIRCFKRHGAEVIDTPVFELKETLMGKYGEDSKLIYDLKDQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQ
::::::::::::::::::::::. ..::::..: ::::::.
CCDS58 GELLSLRYDLTVPFARYLAMNKLTNIKRYHIAK--------------------DFDIAGN
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FDPMIPDAECLKIMCEILSGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKL
:::::::::::::::::::.::.::::.:::::::.:::::.::: .::::.::::.:::
CCDS58 FDPMIPDAECLKIMCEILSSLQIGDFLVKVNDRRILDGMFAICGVSDSKFRTICSSVDKL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGLGD
::..:..:..::: .:::::::::::::::: :::::::::..:::.:::::::::::::
CCDS58 DKVSWEEVKNEMVGEKGLAPEVADRIGDYVQQHGGVSLVEQLLQDPKLSQNKQALEGLGD
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGG
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::
CCDS58 LKLLFEYLTLFGIDDKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 RYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFL
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::... ::.:::::::.::. ::..:
CCDS58 RYDGLVGMFDPKGRKVPCVGLSIGVERIFSIVEQRLEALEEKIRTTETQVLVASAQKKLL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 QERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSV
.:::::..::::.:::::.:::.:::::.::.::: .:::::.::::::::.::::.:::
CCDS58 EERLKLVSELWDAGIKAELLYKKNPKLLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELKDGVIKLRSV
410 420 430 440 450 460
490 500
pF1KE6 ASREEVAIKRENFVAEIQKRLSES
.::::: ..::..: ::..: ..
CCDS58 TSREEVDVRREDLVEEIKRRTGQPLCIC
470 480
>>CCDS42016.1 EIF2AK4 gene_id:440275|Hs108|chr15 (1649 aa)
initn: 309 init1: 104 opt: 445 Z-score: 553.9 bits: 113.7 E(32554): 1.6e-24
Smith-Waterman score: 445; 26.7% identity (59.1% similar) in 450 aa overlap (61-492:1053-1476)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VRCQSQVAEAVLTSQLKAHQEKPNFIIKTPKGTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGA
::. .. .: .... . .: ::::::
CCDS42 DGKAYRTMMAQIFSQRISPAIDYTYDSDILKGNFSIRTAKM--QQHVCETIIRIFKRHGA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 KGMDTPAFELKETLTEKYGEDSGLMYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKR
. :: . .. ...: . .: :..: :. : .:: .:::::.: :.. ..::
CCDS42 VQLCTPLLLPRNRQIYEHNEAALFM----DHSGMLVMLPFDLRIPFARYVARNNILNLKR
1090 1100 1110 1120 1130
160 170 180 190 200
pF1KE6 YHVGKVWRRESPTIVQGRY--REFCQCDFDIA-GQFDPMIPDAECLKIMCEILS---GLQ
: . .:.: : .. :. .:. .: :::. . . ..: :: . . ::.. .::
CCDS42 YCIERVFR---PRKLD-RFHPKELLECAFDIVTSTTNSFLPTAEIIYTIYEIIQEFPALQ
1140 1150 1160 1170 1180 1190
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKLDKMAWKDVRHEMVVK---KGLA
.. : .: .. ... ::.::.:. . : : .. : .:.:. .: .:.
CCDS42 ERNYSIYLNHTMLLKAILLHCGIPEDKLSQV--YIILYDAVTEKLTRREVEAKFCNLSLS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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. :. ... .: .: . : : ..: .. :: ::. . : .::
CCDS42 SNSLCRLYKFIEQKG--DLQDLMPTINSLIKQKTGIAQLVKYGLKDLEEVVGLLKKLGIK
1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KE6 DKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAV-LLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGGRYDGLVGMF-DPK
.. ..:.:. .. ..:.:.. : ... .: : : ::::::: :. .: :.
CCDS42 LQVLINLGLVYKVQQHNGIIFQFVAFIKRRQRAVPEIL-----AAGGRYDLLIPQFRGPQ
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KE6 G-HKVPC-VGLSIGVERIFYIVEQRMKTKGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIAEL
. :: .:.::....: : :. :.: . ...:.. . ... ..: .:
CCDS42 ALGPVPTAIGVSIAIDKISAAV-LNME---ESVTISSCDLLVVSVGQMSMSRAINLTQKL
1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KE6 WDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSVASREEVAIKR
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CCDS42 WTAGITAEIMYDWSQSQEELQEYCRHHEITYVALVSDKEGSH--VKVKSFE-KERQTEKR
1420 1430 1440 1450 1460 1470
500
pF1KE6 ENFVAEIQKRLSES
CCDS42 VLETELVDHVLQKLRTKVTDERNGREASDNLAVQNLKGSFSNASGLFEIHGATVVPIVSV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]