Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6432, 557 aa
1>>>pF1KE6432 557 - 557 aa - 557 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9074+/-0.00039; mu= 15.2689+/- 0.024
mean_var=85.7183+/-16.533, 0's: 0 Z-trim(113.6): 162 B-trim: 385 in 2/52
Lambda= 0.138528
statistics sampled from 22805 (22992) to 22805 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 9.300
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005268273 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 is ( 557) 3772 764.3 0
NP_006023 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 2 [Homo ( 557) 3772 764.3 0
NP_001267487 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 1 [Ho ( 612) 3772 764.3 0
XP_005268274 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 is ( 382) 2624 534.8 1.9e-151
NP_705900 (OMIM: 605689) copine-7 isoform a [Homo ( 558) 2428 495.7 1.6e-139
NP_570720 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 2 [Homo ( 557) 2359 481.9 2.3e-135
XP_016861182 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 575) 2359 481.9 2.3e-135
NP_001276041 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Ho ( 575) 2359 481.9 2.3e-135
NP_702907 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Homo ( 575) 2359 481.9 2.3e-135
XP_011521302 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 595) 2277 465.5 2e-130
XP_016878629 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 599) 2262 462.5 1.6e-129
NP_055242 (OMIM: 605689) copine-7 isoform b [Homo ( 633) 2105 431.2 4.8e-120
XP_016878628 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 637) 2105 431.2 4.8e-120
XP_011510708 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 2040 418.1 2.9e-116
XP_011510709 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 2040 418.1 2.9e-116
XP_011510710 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 444) 2040 418.1 2.9e-116
XP_011521303 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 527) 1954 401.0 5e-111
XP_016878627 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 670) 1954 401.0 6.1e-111
XP_005251150 (OMIM: 604207) PREDICTED: copine-3 is ( 537) 1931 396.4 1.2e-109
NP_003900 (OMIM: 604207) copine-3 [Homo sapiens] ( 537) 1931 396.4 1.2e-109
XP_016869434 (OMIM: 604207) PREDICTED: copine-3 is ( 537) 1931 396.4 1.2e-109
NP_689940 (OMIM: 604206) copine-2 [Homo sapiens] ( 548) 1835 377.2 7.5e-104
XP_016861183 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 434) 1825 375.1 2.5e-103
NP_690904 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1823 374.8 3.9e-103
NP_690902 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1823 374.8 3.9e-103
NP_690903 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1823 374.8 3.9e-103
NP_690905 (OMIM: 604205) copine-1 isoform a [Homo ( 537) 1823 374.8 3.9e-103
NP_003906 (OMIM: 604205) copine-1 isoform b [Homo ( 542) 1823 374.8 3.9e-103
NP_001185792 (OMIM: 604205) copine-1 isoform c [Ho ( 536) 1809 372.0 2.7e-102
XP_016861184 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 417) 1556 321.3 3.6e-87
XP_016861185 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 is ( 306) 1433 296.7 7.1e-80
NP_065990 (OMIM: 604209) copine-5 isoform a [Homo ( 593) 1406 291.5 5.1e-78
XP_005249304 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 610) 1383 286.9 1.3e-76
XP_016878630 (OMIM: 605689) PREDICTED: copine-7 is ( 344) 1293 268.7 2.1e-71
XP_011513071 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 653) 1265 263.3 1.7e-69
XP_016866628 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 522) 1242 258.7 3.4e-68
XP_011513072 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 632) 1242 258.7 4e-68
XP_011513073 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 632) 1242 258.7 4e-68
XP_011513070 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 670) 1242 258.7 4.2e-68
XP_011513075 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 473) 1199 250.0 1.2e-65
XP_011513074 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 543) 1088 227.9 6.5e-59
NP_001300947 (OMIM: 604209) copine-5 isoform c [Ho ( 301) 984 206.9 7.2e-53
XP_011513077 (OMIM: 604209) PREDICTED: copine-5 is ( 361) 843 178.8 2.5e-44
NP_001300949 (OMIM: 604209) copine-5 isoform d [Ho ( 243) 760 162.1 1.8e-39
NP_001300948 (OMIM: 604209) copine-5 isoform d [Ho ( 243) 760 162.1 1.8e-39
NP_001300946 (OMIM: 604209) copine-5 isoform b [Ho ( 140) 292 68.4 1.7e-11
NP_995320 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sap ( 425) 155 41.4 0.0072
NP_001257734 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo ( 425) 155 41.4 0.0072
XP_016855860 (OMIM: 607718) PREDICTED: synaptotagm ( 443) 155 41.4 0.0074
>>XP_005268273 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 isofor (557 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4077.5 bits: 764.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE6 PGAPRPCTLATTPSPSP
:::::::::::::::::
XP_005 PGAPRPCTLATTPSPSP
550
>>NP_006023 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 2 [Homo sapi (557 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4077.5 bits: 764.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE6 PGAPRPCTLATTPSPSP
:::::::::::::::::
NP_006 PGAPRPCTLATTPSPSP
550
>>NP_001267487 (OMIM: 605688) copine-6 isoform 1 [Homo s (612 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4076.9 bits: 764.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:56-612)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHG
:::::::::::: :::::::::::::::::
NP_001 GAGASGWSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHG
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFH
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550
pF1KE6 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
570 580 590 600 610
>>XP_005268274 (OMIM: 605688) PREDICTED: copine-6 isofor (382 aa)
initn: 2624 init1: 2624 opt: 2624 Z-score: 2840.0 bits: 534.8 E(85289): 1.9e-151
Smith-Waterman score: 2624; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (176-557:1-382)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 EVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWE
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 PFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCI
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 NPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQS
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 LHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENP
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 ECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGV
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 VSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFV
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510 520 530 540 550
pF1KE6 PFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
340 350 360 370 380
>>NP_705900 (OMIM: 605689) copine-7 isoform a [Homo sapi (558 aa)
initn: 2424 init1: 1440 opt: 2428 Z-score: 2625.9 bits: 495.7 E(85289): 1.6e-139
Smith-Waterman score: 2428; 66.2% identity (86.2% similar) in 542 aa overlap (7-544:14-548)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQ
: .: : ::.::::.::. ::::: ::: : : : .. :
NP_705 MSAGSERGAAATPGGLPAPC-----ASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 WVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTEC
::.: ::::.:: ::::.:....:.::: : ..:.:.:.. .. : ..: :::. ::
NP_705 WVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMEC
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
::::::.: :::.::::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.:::::::
NP_705 TLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKS
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
:::.:.:..:.::. :::.::::::::::: :: :..:: :::::. :::: ::.::::
NP_705 DPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDS
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pF1KE6 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
:::::::::..::.:::.. . :: ::::.::::..:...::.::.::::. ..:
NP_705 RGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRV
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pF1KE6 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
..::::::::::: :::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::
NP_705 YSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYD
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pF1KE6 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
::::: :.::::::::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::
NP_705 SDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNV
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pF1KE6 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
::::..::. : :.:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::
NP_705 APIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVG
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pF1KE6 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
::::.::..:::::: :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::
NP_705 NADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVE
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540 550
pF1KE6 YYASQGISP---GAPRPCTLATTPSPSP
::. .:. : :.:
NP_705 YYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
540 550
>>NP_570720 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 2 [Homo sapi (557 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2551.3 bits: 481.9 E(85289): 2.3e-135
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:3-542)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQW
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.:: :::.::. : ::
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10 20 30 40 50
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pF1KE6 VEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTL
::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : .. .. .. :::. ::::
NP_570 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
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pF1KE6 GQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDP
:::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.: : :::.::.::::::
NP_570 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
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pF1KE6 FMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSG
:.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: : : :: .:.:.::.:
NP_570 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
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pF1KE6 KHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHT
::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.::::.: : ..:.:.
NP_570 KHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHS
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pF1KE6 FLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSD
:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::.:: ::: ::::::::
NP_570 FLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSD
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pF1KE6 KRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAP
: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:. :::..:::::::.::
NP_570 KMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAP
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pF1KE6 IINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNA
::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.::.::::.::::::::
NP_570 IIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNA
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pF1KE6 DFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYY
:::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.:::: :::::: :::.::
NP_570 DFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYY
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE6 ASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
..::.:
NP_570 NGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550
>>XP_016861182 (OMIM: 604208) PREDICTED: copine-4 isofor (575 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2551.1 bits: 481.9 E(85289): 2.3e-135
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:21-560)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLT
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.
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40 50 60 70 80 90
pF1KE6 KPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGA
:: :::.::. : :: ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : ..
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pF1KE6 TSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTF
.. .. :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.:
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160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCD
: :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :
XP_016 NARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGD
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: :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.
XP_016 PDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
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280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYL
::::.: : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::
XP_016 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
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pF1KE6 QALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYR
.:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:.
XP_016 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
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pF1KE6 RCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVR
:::..:::::::.::::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.
XP_016 SCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVH
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pF1KE6 ASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSAL
::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.::
XP_016 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
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520 530 540 550
pF1KE6 AKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:: :::::: :::.:: ..::.:
XP_016 AKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550 560 570
>>NP_001276041 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Homo s (575 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2551.1 bits: 481.9 E(85289): 2.3e-135
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:21-560)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLT
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.
NP_001 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
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40 50 60 70 80 90
pF1KE6 KPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGA
:: :::.::. : :: ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : ..
NP_001 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
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pF1KE6 TSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTF
.. .. :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.:
NP_001 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAF
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160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCD
: :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :
NP_001 NARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGD
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pF1KE6 VHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKS
: :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.
NP_001 PDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
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pF1KE6 SGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYL
::::.: : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::
NP_001 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
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pF1KE6 QALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYR
.:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:.
NP_001 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
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:::..:::::::.::::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.
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pF1KE6 ASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSAL
::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.::
NP_001 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
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pF1KE6 AKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:: :::::: :::.:: ..::.:
NP_001 AKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550 560 570
>>NP_702907 (OMIM: 604208) copine-4 isoform 1 [Homo sapi (575 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2551.1 bits: 481.9 E(85289): 2.3e-135
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:21-560)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLT
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.
NP_702 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 KPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGA
:: :::.::. : :: ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : ..
NP_702 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
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pF1KE6 TSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTF
.. .. :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.:
NP_702 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAF
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pF1KE6 RAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCD
: :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :
NP_702 NARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKS
: :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.
NP_702 PDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
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pF1KE6 SGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYL
::::.: : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::
NP_702 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
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pF1KE6 QALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYR
.:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:.
NP_702 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
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pF1KE6 RCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVR
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NP_702 SCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVH
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pF1KE6 ASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSAL
::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.::
NP_702 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
480 490 500 510 520 530
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pF1KE6 AKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
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