FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6432, 557 aa
1>>>pF1KE6432 557 - 557 aa - 557 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6606+/-0.000896; mu= 16.7961+/- 0.054
mean_var=80.1544+/-15.626, 0's: 0 Z-trim(106.7): 63 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.143255
statistics sampled from 9069 (9132) to 9069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 3772 789.6 0
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 3772 789.6 0
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 2428 511.8 8.4e-145
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 2359 497.6 1.6e-140
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 2359 497.6 1.7e-140
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 2105 445.1 1.2e-124
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 1931 409.1 6.8e-114
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 1835 389.3 6.5e-108
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 1823 386.8 3.6e-107
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 1823 386.8 3.6e-107
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 1676 356.4 5.2e-98
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 1575 335.6 9.8e-92
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 1439 307.4 2.6e-83
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 1406 300.6 3.4e-81
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 984 213.2 3.5e-55
>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (557 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4214.3 bits: 789.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 TKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 TNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 EPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 LLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGIS
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE6 PGAPRPCTLATTPSPSP
:::::::::::::::::
CCDS96 PGAPRPCTLATTPSPSP
550
>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (612 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 4213.7 bits: 789.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3772; 99.6% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:56-612)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHG
:::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS61 GAGASGWSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHG
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS61 LLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFH
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGT
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYR
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLS
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEI
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 SGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMA
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDF
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550
pF1KE6 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
570 580 590 600 610
>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (558 aa)
initn: 2424 init1: 1440 opt: 2428 Z-score: 2713.1 bits: 511.8 E(32554): 8.4e-145
Smith-Waterman score: 2428; 66.2% identity (86.2% similar) in 542 aa overlap (7-544:14-548)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQ
: .: : ::.::::.::. ::::: ::: : : : .. :
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPC-----ASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 WVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTEC
::.: ::::.:: ::::.:....:.::: : ..:.:.:.. .. : ..: :::. ::
CCDS10 WVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
::::::.: :::.::::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.:::::::
CCDS10 TLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
:::.:.:..:.::. :::.::::::::::: :: :..:: :::::. :::: ::.::::
CCDS10 DPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
:::::::::..::.:::.. . :: ::::.::::..:...::.::.::::. ..:
CCDS10 RGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
..::::::::::: :::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::
CCDS10 YSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
::::: :.::::::::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::
CCDS10 SDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
::::..::. : :.:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::
CCDS10 APIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
::::.::..:::::: :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::
CCDS10 NADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVE
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE6 YYASQGISP---GAPRPCTLATTPSPSP
::. .:. : :.:
CCDS10 YYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
540 550
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2636.1 bits: 497.6 E(32554): 1.6e-140
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:3-542)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQW
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.:: :::.::. : ::
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTL
::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : .. .. .. :::. ::::
CCDS30 FEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGLKEADFLGGMECTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDP
:::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.: : :::.::.::::::
CCDS30 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSG
:.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: : : :: .:.:.::.:
CCDS30 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHT
::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.::::.: : ..:.:.
CCDS30 KHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSD
:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::.:: ::: ::::::::
CCDS30 FLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAP
: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:. :::..:::::::.::
CCDS30 KMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 IINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNA
::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.::.::::.::::::::
CCDS30 IIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 DFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYY
:::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.:::: :::::: :::.::
CCDS30 DFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYY
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE6 ASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
..::.:
CCDS30 NGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
initn: 1960 init1: 1418 opt: 2359 Z-score: 2635.9 bits: 497.6 E(32554): 1.7e-140
Smith-Waterman score: 2359; 62.8% identity (85.6% similar) in 543 aa overlap (5-541:21-560)
10 20 30
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGA------SRVELRVSCHGLLDRDTLT
.:. . : . ::: ..:::::.:.:. :::.:.
CCDS75 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 KPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGA
:: :::.::. : :: ::.::::.:.: .::.:........::: : ..:.: : ..
CCDS75 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTF
.. .. :::. :::::::::: :..: :: :.:.:::::.::..:::.::..:::.:.:
CCDS75 NGLKEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAF
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCD
: :::.::.:::::::.::.. :.: ..::: ::::: :::.:.:. :..:..:::: :
CCDS75 NARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKS
: :: .:.:.::.:::::::::::::.::. : : :...::.::::::. ::::::.
CCDS75 PDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMR-G-AMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYL
::::.: : ..:.:.:::::::::::.:::::::::::::::.: ::: . : :::.::
CCDS75 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 QALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYR
.:: ::: ::::::::: ::::::::::::.. :::::::::. .:::: :.::. .:.
CCDS75 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 RCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVR
:::..:::::::.::::..::. :..: .: .:..: .::.:::::..:::.:: :::.
CCDS75 SCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 ASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSAL
::.::::.:::::::::::::..:::::: :: :.: :. ::::::::::.:: :.:.::
CCDS75 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KE6 AKCVLAEVPRQVVEYYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:: :::::: :::.:: ..::.:
CCDS75 AKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550 560 570
>>CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (633 aa)
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Smith-Waterman score: 2158; 59.0% identity (76.9% similar) in 571 aa overlap (53-544:55-623)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 ELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFE
:::.: ::::.:: ::::.:....:.::
CCDS10 ELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFE
30 40 50 60 70 80
90 100 110
pF1KE6 EKQPVQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTECTLGQ-------------------------
: : ..:.:.:.. .. : ..: :::. ::::::
CCDS10 EVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQPAQKWLLQVVMRVSVDVLGPAGHCA
90 100 110 120 130 140
120
pF1KE6 --------------------------------------------------IVSQTKVTKP
::.: :::.:
CCDS10 KHFLCCTESSHLARTGPSFLLRYDDLCLPWATAGAVRWWTCRGGHTQGWQIVAQKKVTRP
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQS
:::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.::::::::::.:.:..:.::.
CCDS10 LLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFLELYRVNDDQG
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTF
:::.::::::::::: :: :..:: :::::. :::: ::.:::: :::::::::..::
CCDS10 LQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKHDFIGEFSTTF
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQIS
.:::.. . :: ::::.::::..:...::.::.::::. ..:..:::::::::::
CCDS10 EEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDYIMGGCQIH
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 FTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARI
:::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::::::: :.::::::
CCDS10 FTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFSALGFGARI
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQRE
::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::::::..::. : :
CCDS10 PPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISKVARVAAAE
450 460 470 480 490 500
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 QSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDD
.:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::..:::::
CCDS10 ESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTDMQVLDGDD
510 520 530 540 550 560
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 GPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISP---GA
: :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::::. .:. : :.
CCDS10 GVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRGLPPRSLGV
570 580 590 600 610 620
550
pF1KE6 PRPCTLATTPSPSP
:
CCDS10 PAGEASPGCTP
630
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
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Smith-Waterman score: 1931; 54.2% identity (77.6% similar) in 531 aa overlap (20-548:7-532)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
..: : ::: .:::.: .: : :::. : .:: ::::
CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEVER
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
:: ...: .: ::... ..:.:: : ..: :.: .. . .: ::: :::::::::
CCDS62 TERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKTIELSDDDFLGECECTLGQIVS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
. :.:.::..:.:. :::..::: :::.. : : . ..: ::::::::.::::..:..
CCDS62 SKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIKD-NRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYLEFH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
: . : . .: ::::::::::: :.::..::.::: :. . .: ::::..:.::.:
CCDS62 KQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSHDLI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
: : .:. ...: :. .. ....::: : :.:::.::.::.. . :: . ::::::
CCDS62 GTFQTTMTKLKE--ASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDYI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
:::::..:::..:::.::::::: .::: .:: :.:: :: .:: . ::::.:: :::
CCDS62 MGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFPA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
:::::.:::...:::.: .::.: :: :. :.:.. .:: :::::.:::::: .::::.:
CCDS62 FGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINHV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
:. : . :..: :::..::::..:. ::: ::: ::::::::::::::.:::: :
CCDS62 ARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSAM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
..:::: : :: : : : ::::::::::.:..: :::.:::::.:.::: :. . .
CCDS62 EFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYKL
470 480 490 500 510 520
540 550
pF1KE6 SPGAPR-PCTLATTPSPSP
: :. : :
CCDS62 LP--PKNPATKQQKQ
530
>>CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 (548 aa)
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Smith-Waterman score: 1835; 50.8% identity (76.3% similar) in 545 aa overlap (4-546:10-547)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPE-PQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDE
: : .: :: . .::: :: ..:::::. .: : :::. ..
CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMGPQYCV---CKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFT-ENNG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 QWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTEC
.:.: .:::. . .:.::. ..:.: ::: : ..: .:: . .. . :::. :
CCDS10 RWIEYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFDQDKSSMRLDEHDFLGQFSC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
.:: :::. :.:.:::: : : :::. :::.:.:.: : . :.. . .::.::::.::
CCDS10 SLGTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELSD-NRVITLSLAGRRLDKKDLFGKS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
:::.:.:: ..: . .:: ::::.: .:.: :.:: . : :::. :...:.. . ::::.
CCDS10 DPFLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
.: ::::::: .. ..: : : . ....::::: . ::::::.:: ..: .: ...
CCDS10 DGGHDFIGEFQTSVSQMCE--ARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
..:::::.::::. :::.::::::::.: . .::: ..: :.::.:. ::: : ::::
CCDS10 YSFLDYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
::: :::.::::..::...:::.:::::.: :: : ..:. .: :::.:..:::::
CCDS10 SDKMFPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
.::.:.::. : . . ::.: .::..::::.::: ::: :.:.::.:::::::::::
CCDS10 SPIVNHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
::::. :..::::. :: : ::::::::::::.:..:: .::: ::::.:.:::.
CCDS10 NADFAAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQ
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE6 YYASQGISPGAPRPCTLATTPSPSP
:. ... : .:
CCDS10 YFKHKNLPPTNSEPA
540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
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Smith-Waterman score: 1823; 50.8% identity (76.2% similar) in 537 aa overlap (22-557:8-535)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
:.: .:: :.:.: .: : ::::. . .:.:. :
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGR
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
:: .:.:::: ::..: ::: :: : ..: ..: .. . :.: :::..::.::::::
CCDS13 TERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
. .: ::.:: :: ::..:::. :.:.. : : . .: .::.::...:::::.:..
CCDS13 SQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKD-NRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
. . : . .::.:.::.::::::.:. : . .. .:. . :.. ::::.:.::.:
CCDS13 RQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
: : ... ..: : :.. ..::.:. ..:::.::.:::. . : :: ..::::.
CCDS13 GTFHTSLAQLQ---AVPAE---FECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYV
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
::::::.:::..:::.::::: : .::: ::: :.::.:: .::.. ::::::: :::
CCDS13 MGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
:::::..::...:::.::.::.: :: : :.:.. .::. :::..:::::: :::::.:
CCDS13 FGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHV
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
:. : . : :..: .::.::::.:.:. :: :.:::: ::::.::::::.::: :
CCDS13 ARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAM
400 410 420 430 440 450
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pF1KE6 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
. ::.: :::. : ::::::::::.: :..: :::. :::::: :.: :. .::
CCDS13 EQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGW
460 470 480 490 500 510
540 550
pF1KE6 SPGAPRPCTLATTPSPSP
.: : : . : :. .:
CCDS13 APLKPLPPS-AKDPAQAPQA
520 530
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
initn: 1746 init1: 1139 opt: 1823 Z-score: 2037.6 bits: 386.8 E(32554): 3.6e-107
Smith-Waterman score: 1823; 50.8% identity (76.2% similar) in 537 aa overlap (22-557:13-540)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSDPEMGWVPEPQTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHP-CVLLKLYSDEQWVEVER
:.: .:: :.:.: .: : ::::. . .:.:. :
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAELGR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPVQFHVFDAEDGATSPRNDTFLGSTECTLGQIVS
:: .:.:::: ::..: ::: :: : ..: ..: .. . :.: :::..::.::::::
CCDS46 TERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTPELRDDDFLGGAECSLGQIVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 QTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIY
. .: ::.:: :: ::..:::. :.:.. : : . .: .::.::...:::::.:..
CCDS46 SQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELKD-NRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFLEFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 KTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFI
. . : . .::.:.::.::::::.:. : . .. .:. . :.. ::::.:.::.:
CCDS46 RQG-DGKWHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSHDLI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYI
: : ... ..: : :.. ..::.:. ..:::.::.:::. . : :: ..::::.
CCDS46 GTFHTSLAQLQ---AVPAE---FECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDYV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPA
::::::.:::..:::.::::: : .::: ::: :.::.:: .::.. ::::::: :::
CCDS46 MGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFPA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRV
:::::..::...:::.::.::.: :: : :.:.. .::. :::..:::::: :::::.:
CCDS46 FGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINHV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 AEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDM
:. : . : :..: .::.::::.:.:. :: :.:::: ::::.::::::.::: :
CCDS46 ARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEAM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 RLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGI
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CCDS46 EQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQGW
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CCDS46 APLKPLPPS-AKDPAQAPQA
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