Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6427
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6427, 621 aa
1>>>pF1KE6427 621 - 621 aa - 621 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7136+/-0.00117; mu= 16.2801+/- 0.070
mean_var=63.0747+/-12.488, 0's: 0 Z-trim(100.1): 24 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.161490
statistics sampled from 5977 (5998) to 5977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 2.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 3995 940.2 0
CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 1697 404.9 1.8e-112
CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 1697 404.9 1.8e-112
CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 1696 404.6 2e-112
CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 782 191.6 1.8e-48
CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 770 188.8 1.2e-47
CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 755 185.3 1.4e-46
CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 742 182.3 9e-46
CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 740 181.8 1.5e-45
CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 730 179.5 7.2e-45
CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 726 178.6 1.5e-44
CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 726 178.6 1.5e-44
CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 657 162.5 1.1e-39
CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 623 154.6 2.5e-37
CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 575 143.4 5.9e-34
CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 474 119.9 6.8e-27
CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 451 114.6 5.1e-25
CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 431 110.0 1.7e-23
CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 431 110.0 1.8e-23
CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 385 99.1 1.3e-20
>>CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 (621 aa)
initn: 3995 init1: 3995 opt: 3995 Z-score: 5026.7 bits: 940.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3995; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 NSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 YLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 LGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 YGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEAYLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEAYLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIKK
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE6 VSQQILEKRAYICAHPLDRTC
:::::::::::::::::::::
CCDS30 VSQQILEKRAYICAHPLDRTC
610 620
>>CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (655 aa)
initn: 948 init1: 566 opt: 1697 Z-score: 2132.8 bits: 404.9 E(32554): 1.8e-112
Smith-Waterman score: 1697; 46.6% identity (75.0% similar) in 599 aa overlap (29-617:60-653)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPP---VRAFAKELFLGKIKKKEVFP
: : .: ..:: .: :.. .:::
CCDS11 QPRPGPARRPYAGGAAQLALDKSDSHPSDALTRKKPAKAESKSFAVGMFKGQLTTDQVFP
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FPEVSQDELNE-INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEE
.: : ..: .. ..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: :
CCDS11 YPSVLNEEQTQFLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSE
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YGGLGFSNTMYSRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGE
::.:. ::.:.:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: ::::::::::
CCDS11 LGGVGLCNTQYARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGE
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD
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CCDS11 TVAAFCLTEPSSGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTD
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 -SDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDG
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CCDS11 PATGAVKEKITAFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSG
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQK
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CCDS11 FKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVML
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPY
:: :::.:.... .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. ..
CCDS11 QYVTESMAYMVSANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGV
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 ERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRR
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CCDS11 ERVLRDLRIFRIFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQ
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVL
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CCDS11 LRRRAGLGSGLSLS---GLVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLL
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580
pF1KE6 KRVANILINLYGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDK
.:.:. :.::.:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : :
CCDS11 QRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDP
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620
pF1KE6 YAPENLDEQIKKVSQQILEKRAYICAHPLDRTC
. : : ...:..:. ..:. . . ..::
CCDS11 WQQE-LYRNFKSISKALVERGGVVTSNPLGF
630 640 650
>>CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (678 aa)
initn: 948 init1: 566 opt: 1697 Z-score: 2132.5 bits: 404.9 E(32554): 1.8e-112
Smith-Waterman score: 1697; 46.6% identity (75.0% similar) in 599 aa overlap (29-617:83-676)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPP---VRAFAKELFLGKIKKKEVFP
: : .: ..:: .: :.. .:::
CCDS58 QPRPGPARRPYAGGAAQLALDKSDSHPSDALTRKKPAKAESKSFAVGMFKGQLTTDQVFP
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FPEVSQDELNE-INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEE
.: : ..: .. ..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: :
CCDS58 YPSVLNEEQTQFLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSE
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YGGLGFSNTMYSRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGE
::.:. ::.:.:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: ::::::::::
CCDS58 LGGVGLCNTQYARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGE
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD
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CCDS58 TVAAFCLTEPSSGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTD
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 -SDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDG
. :.::.:::::.::: :::.:.: :: :.::..::: :: :.....: ::.:::::.:
CCDS58 PATGAVKEKITAFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSG
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 FKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQK
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CCDS58 FKVAMHILNNGRFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVML
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPY
:: :::.:.... .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. ..
CCDS58 QYVTESMAYMVSANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGV
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 ERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRR
::.::: ::. ::::::.:::...:: : . :. :. ::. .... .. .:..
CCDS58 ERVLRDLRIFRIFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQ
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 LRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVL
:: : :.:. :.::: :. :.. . :. .::. :.. : :..::..:
CCDS58 LRRRAGLGSGLSLS---GLVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLL
540 550 560 570 580
540 550 560 570 580
pF1KE6 KRVANILINLYGMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDK
.:.:. :.::.:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : :
CCDS58 QRLADGAIDLYAMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDP
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620
pF1KE6 YAPENLDEQIKKVSQQILEKRAYICAHPLDRTC
. : : ...:..:. ..:. . . ..::
CCDS58 WQQE-LYRNFKSISKALVERGGVVTSNPLGF
650 660 670
>>CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 (633 aa)
initn: 948 init1: 566 opt: 1696 Z-score: 2131.8 bits: 404.6 E(32554): 2e-112
Smith-Waterman score: 1696; 46.9% identity (75.7% similar) in 588 aa overlap (37-617:49-631)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 FLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNE
..:: .: :.. .:::.: : ..: ..
CCDS42 GGSSRLTALLGQPRPGPARRPYAGGAAQESKSFAVGMFKGQLTTDQVFPYPSVLNEEQTQ
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 -INQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMY
..... :: .:: : : : : . . : . :: :: :::::: : ::.:. ::.:
CCDS42 FLKELVEPVSRFFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLKELGAFGLQVPSELGGVGLCNTQY
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SRLGEIISM-DGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPA
.:: ::..: : .. .::.:::.::.:::.: ::. :: :::::::::: .::::::::.
CCDS42 ARLVEIVGMHDLGVGITLGAHQSIGFKGILLFGTKAQKEKYLPKLASGETVAAFCLTEPS
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVD-SDGSVKDKIT
:::::::::. :. : :.: :::::.::.:::::.:::::::: :.: . :.::.:::
CCDS42 SGSDAASIRTSAVPSPCGKYYTLNGSKLWISNGGLADIFTVFAKTPVTDPATGAVKEKIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSG
::.::: :::.:.: :: :.::..::: :: :.....: ::.:::::.::::::.:::.:
CCDS42 AFVVERGFGGITHGPPEKKMGIKASNTAEVFFDGVRVPSENVLGEVGSGFKVAMHILNNG
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT
::.:....:: .. .: ....: .: ::.... .:::::::.: :.. :: :::.:..
CCDS42 RFGMAAALAGTMRGIIAKAVDHATNRTQFGEKIHNFGLIQEKLARMVMLQYVTESMAYMV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILL
.. .:: : : .::::. :.:.:::::. ..: .::.::.:. .. ::.::: ::.
CCDS42 SANMDQ-GATDFQIEAAISKIFGSEAAWKVTDECIQIMGGMGFMKEPGVERVLRDLRIFR
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQ--AKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDL
::::::.:::...:: : . :. :. ::. .... .. .:..:: : :
CCDS42 IFEGTNDILRLFVALQGCMDKGKELSGLGSALKNPFGNAGLLLGEAGKQLRRRAGLGSGL
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 GLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRFGKTIMEEQLVLKRVANILINLY
.:.: .::: :. :.. . :. .::. :.. : :..::..:.:.:. :.::
CCDS42 SLSG---LVHPELSRSGELAVRALEQFATVVEAKLIKHKKGIVNEQFLLQRLADGAIDLY
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KE6 GMTAVLSRASRSIRIGLRNHDHEVLLANTFCVEA--YLQNLFSLSQLDKYAPENLDEQIK
.:..::::::::. : . .:: .: .:.:.:: ... .. : : . : : ...:
CCDS42 AMVVVLSRASRSLSEGHPTAQHEKMLCDTWCIEAAARIREGMAALQSDPWQQE-LYRNFK
560 570 580 590 600 610
600 610 620
pF1KE6 KVSQQILEKRAYICAHPLDRTC
..:. ..:. . . ..::
CCDS42 SISKALVERGGVVTSNPLGF
620 630
>>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa)
initn: 647 init1: 335 opt: 782 Z-score: 983.7 bits: 191.6 E(32554): 1.8e-48
Smith-Waterman score: 782; 38.6% identity (69.3% similar) in 368 aa overlap (74-437:68-425)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVDS--RKIDQEGKIPDETLEKL
:.:: :.. .:...:. ... :
CCDS76 SEALLNITNNGIHFAPLQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGL
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150
pF1KE6 KSLGLFGLQVPEEYGGLG--FSNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTE
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CCDS76 FQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLSTVLV-IEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTE
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 EQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGL
:::: :::.:.. :....:::.: ..:::. ....:: : .:.:::::.::...
CCDS76 EQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGD--YYVLNGSKMWISSAEH
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 ANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTK
:..: :.:. :: . : ::.:.:.:: :. ::::.:::.:.:.:: . :::.:
CCDS76 AGLFLVMAN---VDPTIGYKG-ITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVK
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 IPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEF
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CCDS76 VPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDF
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 GLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQ
.:.. : .: . . . .:: .: .:. : : . ::.:.: ..:: : : .:. ..
CCDS76 QGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEA-GKPFIK-EASMAKYYASEIAGQTTSKCIE
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 ILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAK
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CCDS76 WMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY
390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 VSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCFGRTVETLLLRF
>>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa)
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Smith-Waterman score: 770; 34.5% identity (66.0% similar) in 429 aa overlap (14-436:5-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGCGLFLRTTAAARACRGLVVSTANRRLLRTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVS
: : : : .:. :: ::. .:... . . ..: ..
CCDS10 MAEMATATRLLGWRVASWRL---RPPLAGFVSQ------RAHSLLPVDDAI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE6 QDELNEINQFLGPVEKFFTEEV--DSRKIDQEGKIPD--ETLEKLKSLGLFGLQVPEEYG
. .: :. . ::. :.. ...::. ... . : ..: .::..:. .: .::
CCDS10 NGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRSNEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GLGFSNTMYSRLGEIIS-MDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHI
: :.. . . : :: .:.. .. .::. . .. .. :.: :: :::::: :::.:
CCDS10 GSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSD
.:. ..:: .:::..:.. .: . .::::::.: ::::: :... :.:::...
CCDS10 GALAMSEPNAGSDVVSMKLKAE--KKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GSVKDKITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKV
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CCDS10 AS--RGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYV
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYV
:. :. :. ... ::.. ... : : .:. :......: :.: :.: : . ..
CCDS10 LMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 MESMTYLTAGMLDQPGFPDCSI-EAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYER
....: .: :. : :. . : : ..:.: : : . ...: .:: :: :.:. :
CCDS10 CRQYVYNVAKACDE-GH--CTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 ILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDS
.:::... : ::.:. :. :
CCDS10 FLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
400 410 420
>>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa)
initn: 700 init1: 283 opt: 755 Z-score: 950.0 bits: 185.3 E(32554): 1.4e-46
Smith-Waterman score: 755; 39.3% identity (67.8% similar) in 382 aa overlap (63-437:33-403)
40 50 60 70 80
pF1KE6 SPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVD---SRKIDQ
:: : .:.: . . :.:. . ..:.
CCDS92 AALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDK
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 EGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMYSRLGEIISMD-GSITVTLAAHQAI
: .: ..:. .:::....:::: :: :.. :. : :: .: : .......
CCDS92 EHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNSL
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 GLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSRATLSEDKKHYILN
: :. :..::: .. ..::..:. : :.::..::::.. . : :. ..::
CCDS92 YLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDS--WVLN
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 GSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDK-ITAFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRG
:.:.::::. :. .:::.: : ....: :.::.: :.: :: ::::::::
CCDS92 GTKAWITNAWEASAAVVFAST-----DRALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRG
190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 SNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYAC
:.: .. ::. .:: ..:::: : :::.::. :. ::....: . :. . .. ...::
CCDS92 SSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAE
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 TRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT--AGMLDQPGFPDCSIEAAMVKVF
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CCDS92 NRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMA---LALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIK-EAAMAKLA
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 SSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAG
.:::: .:.:::::.::. ..: :: ::.:: :.:::.:: :. ::
CCDS92 ASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYR
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 RILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENT
CCDS92 S
>>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa)
initn: 634 init1: 335 opt: 742 Z-score: 935.2 bits: 182.3 E(32554): 9e-46
Smith-Waterman score: 742; 39.8% identity (70.8% similar) in 332 aa overlap (108-437:2-323)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 FTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLG--FSNTMYSRLGEIISMD
:..: :::: : : .:. . :. ..:
CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLV-IEELAKVD
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 GSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPASGSDAASIRSR
.:..: .... : ::::::: :::.:.. :....:::.: ..:::. ....:
CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTR
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 ATLSEDKKHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKITAFIVERDFGGVT
: ... .:.:::::.::... :..: :.:. :: . : ::.:.:.:: :.
CCDS81 A--DKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMAN---VDPTIGYKG-ITSFLVDRDTPGLH
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 NGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSGRFSMGSVVAGLL
::::.:::.:.:.:: . :::.:.: ::::..: :.: :.. :: ::..... . ::
CCDS81 IGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLA
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 KRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLTAGMLDQPGFPDC
. ...: : : ::.::: .: .:.. : .: . . . .:: .: .:. : :
CCDS81 QGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEA-GKPFI
210 220 230 240 250 260
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pF1KE6 SIEAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMY
. ::.:.: ..:: : : .:. .. .::.:::.::: :. .::..: :.::...:
CCDS81 K-EASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNT
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 IALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLA
::
CCDS81 IAKHIDAEY
330
>>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa)
initn: 661 init1: 227 opt: 740 Z-score: 931.4 bits: 181.8 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 740; 38.4% identity (69.2% similar) in 344 aa overlap (96-436:52-387)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EINQFLGPVEKFFTEEVDSRKIDQEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMY
: ..: .::..:. .: .::: :.. .
CCDS53 PPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEH
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SRLGEIIS-MDGSITVTLAAHQAIGLKGIILAGTEEQKAKYLPKLASGEHIAAFCLTEPA
. : :: .:.. .. .::. . .. .. :.: :: :::::: :::.:.:. ..::
CCDS53 VLVMEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPN
90 100 110 120 130 140
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pF1KE6 SGSDAASIRSRATLSEDK-KHYILNGSKVWITNGGLANIFTVFAKTEVVDSDGSVKDKIT
.:::..:.. .: : : .::::::.: ::::: :... :.:::... .: ::
CCDS53 AGSDVVSMKLKA---EKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPAS--RGIT
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFIVERDFGGVTNGKPEDKLGIRGSNTCEVHFENTKIPVENILGEVGDGFKVAMNILNSG
:::::. . : ...: ::::.:::::::. ::. :::. ::::. . : : :. :.
CCDS53 AFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLE
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 RFSMGSVVAGLLKRLIEMTAEYACTRKQFNKRLSEFGLIQEKFALMAQKAYVMESMTYLT
:. ... ::.. ... : : .:. :......: :.: :.: : . .. ....: .
CCDS53 RLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNV
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AGMLDQPGFPDCSI-EAAMVKVFSSEAAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRIL
: :. : :. . : : ..:.: : : . ...: .:: :: :.:. :.:::...
CCDS53 AKACDE-G--HCTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLY
320 330 340 350 360 370
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pF1KE6 LIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRILTTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLG
: ::.:. :. :
CCDS53 EIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
380 390
>>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa)
initn: 641 init1: 230 opt: 730 Z-score: 919.0 bits: 179.5 E(32554): 7.2e-45
Smith-Waterman score: 730; 34.3% identity (67.8% similar) in 379 aa overlap (61-437:3-376)
40 50 60 70 80
pF1KE6 RTSPPVRAFAKELFLGKIKKKEVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEKFFTEEVD--SRKID
:. .. ..: . ..:: ::. . . :
CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 QEGKIPDETLEKLKSLGLFGLQVPEEYGGLGFSNTMYSRLGEIISMDGSITVTLAAHQAI
. :. : ... :::.. ..::. ::::... ..: ... . . : ...
CCDS65 KTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSL
40 50 60 70 80 90
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: ::.::...:: ::: ... . :.:.:::..:::.:.:...: . :. ::.:
CCDS65 GQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDE--YIIN
100 110 120 130 140 150
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:.:.:::::: :: . ..:... : . .. .:.:::: : :. :. : ..: : :
CCDS65 GQKMWITNGGKANWYFLLARSDP-DPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCS
160 170 180 190 200
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.: . ::..:.: ::.: : ::::::. ... : ... ..:: .: .. ...::
CCDS65 DTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALE
210 220 230 240 250 260
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:: :.: : : :. .: ::.:. . :.: :. . : . . :...:.:...
CCDS65 RKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVE-LARMSYQRAAWEVDSGRRN-TYYASIAKAFAGD
270 280 290 300 310 320
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pF1KE6 AAWQCVSEALQILGGLGYTRDYPYERILRDTRILLIFEGTNEILRMYIALTGLQHAGRIL
: : ...:.::::: :.. .:: :...::..: :.:::..: :. .:
CCDS65 IANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 TTRIHELKQAKVSTVMDTVGRRLRDSLGRTVDLGLTGNHGVVHPSLADSANKFEENTYCF
621 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:11:16 2016 done: Tue Nov 8 13:11:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]