Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6417
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6417, 560 aa
1>>>pF1KE6417 560 - 560 aa - 560 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8327+/-0.000422; mu= 15.6360+/- 0.026
mean_var=70.3681+/-13.816, 0's: 0 Z-trim(111.9): 48 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152893
statistics sampled from 20611 (20657) to 20611 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 7.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006662 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tra ( 560) 3599 803.4 0
NP_001274526 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 472) 2241 503.8 4.8e-142
NP_001274524 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 619) 2218 498.8 2.1e-140
XP_016882641 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106
NP_005062 (OMIM: 600637) excitatory amino acid tra ( 564) 1698 384.1 6.4e-106
XP_006722905 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106
XP_006722907 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1698 384.1 6.4e-106
XP_011540304 (OMIM: 604471) PREDICTED: excitatory ( 337) 1383 314.5 3.3e-85
NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1368 311.3 5.3e-84
XP_016873626 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1368 311.3 5.3e-84
XP_016873627 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1368 311.3 5.3e-84
NP_001239581 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1368 311.3 5.3e-84
XP_011518587 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 570) 1368 311.3 5.3e-84
XP_005253124 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 571) 1368 311.3 5.3e-84
NP_004162 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino a ( 574) 1368 311.3 5.3e-84
XP_016873625 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 579) 1368 311.3 5.4e-84
XP_011512386 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 435) 1220 278.6 2.8e-74
NP_001276868 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 496) 1220 278.6 3.1e-74
XP_005248399 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 542) 1220 278.6 3.4e-74
NP_004163 (OMIM: 600111,612656) excitatory amino a ( 542) 1220 278.6 3.4e-74
XP_011516312 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 477) 1118 256.1 1.8e-67
XP_011516311 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 504) 1118 256.1 1.9e-67
NP_004161 (OMIM: 133550,615232) excitatory amino a ( 524) 1118 256.1 2e-67
XP_011516310 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 527) 1118 256.1 2e-67
XP_011516309 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 547) 1118 256.1 2e-67
NP_001276869 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 430) 1053 241.8 3.4e-63
NP_003029 (OMIM: 600229,616657) neutral amino acid ( 532) 942 217.3 9.6e-56
XP_006712142 (OMIM: 600229,616657) PREDICTED: neut ( 312) 930 214.6 3.8e-55
NP_001274525 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 158) 911 210.3 3.7e-54
NP_001138617 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 339) 915 211.3 4e-54
NP_005619 (OMIM: 109190) neutral amino acid transp ( 541) 915 211.4 6.1e-54
NP_001138616 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 313) 905 209.1 1.7e-53
NP_001160167 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 497) 844 195.7 2.9e-49
XP_016870532 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 488) 839 194.6 6.2e-49
XP_016870531 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 511) 839 194.6 6.4e-49
XP_005259224 (OMIM: 109190) PREDICTED: neutral ami ( 469) 827 191.9 3.7e-48
NP_001259017 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 691 161.9 2.8e-39
NP_001259016 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 691 161.9 2.8e-39
XP_016873628 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 496) 627 147.8 7.5e-35
NP_001180422 (OMIM: 600229,616657) neutral amino a ( 234) 593 140.2 6.9e-33
>>NP_006662 (OMIM: 604471) excitatory amino acid transpo (560 aa)
initn: 3599 init1: 3599 opt: 3599 Z-score: 4288.8 bits: 803.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3599; 99.8% identity (100.0% similar) in 560 aa overlap (1-560:1-560)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_006 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEE
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE6 LPAASLNHCTIQISELETNV
::::::::::::::::::::
NP_006 LPAASLNHCTIQISELETNV
550 560
>>NP_001274526 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tran (472 aa)
initn: 2714 init1: 2233 opt: 2241 Z-score: 2671.1 bits: 503.8 E(85289): 4.8e-142
Smith-Waterman score: 2543; 84.8% identity (85.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
:::::::::::
NP_001 LKMMILPLVVS-------------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -----------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE
:::::::: .:
NP_001 FARDTGTETCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSRGLRAHPGPHLPPPRPRS
410 420 430 440 450 460
>>NP_001274524 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tran (619 aa)
initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2641.8 bits: 498.8 E(85289): 2.1e-140
Smith-Waterman score: 3306; 90.0% identity (90.0% similar) in 592 aa overlap (1-533:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSRKNQVRALQCPRSLPPA
310 320 330 340 350 360
350 360
pF1KE6 ------------------------------------------SSATLPITFKCLLENNHI
::::::::::::::::::
NP_001 GAALQRHKHSWRGGCLGRGELPDRGPSHPGGGCWADTGPSNRSSATLPITFKCLLENNHI
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEEL
550 560 570 580 590 600
550 560
pF1KE6 PAASLNHCTIQISELETNV
NP_001 PAASLNHCTIQISELETNV
610
>>XP_016882641 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory amin (564 aa)
initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106
Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP
:::....:.: .:..: :.: :: .:.
XP_016 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..::
XP_016 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK-
..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:.
XP_016 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT
.: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::.
XP_016 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI
..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.:::
XP_016 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL
:::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::.
XP_016 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN
:..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.:::::::::
XP_016 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR
::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::
XP_016 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA
.::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..:
XP_016 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
XP_016 GNESAM
560
>>NP_005062 (OMIM: 600637) excitatory amino acid transpo (564 aa)
initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106
Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP
:::....:.: .:..: :.: :: .:.
NP_005 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY
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50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..::
NP_005 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK-
..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:.
NP_005 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
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.: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::.
NP_005 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI
..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.:::
NP_005 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI
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280 290 300 310 320 330
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:::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::.
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340 350 360 370 380 390
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:..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.:::::::::
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400 410 420 430 440 450
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::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::
NP_005 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR
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460 470 480 490 500 510
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.::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..:
NP_005 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
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NP_005 GNESAM
560
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initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106
Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP
:::....:.: .:..: :.: :: .:.
XP_006 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY
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50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..::
XP_006 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV
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110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK-
..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:.
XP_006 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY
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170 180 190 200 210
pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT
.: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::.
XP_006 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI
..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.:::
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:::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::.
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pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN
:..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.:::::::::
XP_006 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN
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::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::
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460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA
.::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..:
XP_006 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
XP_006 GNESAM
560
>>XP_006722907 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory amin (564 aa)
initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2022.6 bits: 384.1 E(85289): 6.4e-106
Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP
:::....:.: .:..: :.: :: .:.
XP_006 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..::
XP_006 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK-
..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:.
XP_006 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT
.: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::.
XP_006 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI
..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.:::
XP_006 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL
:::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::.
XP_006 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN
:..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.:::::::::
XP_006 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR
::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::
XP_006 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR
450 460 470 480 490 500
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pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA
.::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..:
XP_006 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
XP_006 GNESAM
560
>>XP_011540304 (OMIM: 604471) PREDICTED: excitatory amin (337 aa)
initn: 1383 init1: 1383 opt: 1383 Z-score: 1650.6 bits: 314.5 E(85289): 3.3e-85
Smith-Waterman score: 1642; 82.2% identity (82.5% similar) in 337 aa overlap (283-560:1-337)
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 LNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFIL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFIL
10 20 30
320 330 340
pF1KE6 PLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS-----------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSRKNQVRALQCPRSLPPAGAALQRHKHSWR
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pF1KE6 ------------------------------SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGCLGRGELPDRGPSHPGGGCWADTGPSNRSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVG
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pF1KE6 ATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIV
160 170 180 190 200 210
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 LTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPC
220 230 240 250 260 270
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 ETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
XP_011 ETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEELPAASLNHCTIQI
280 290 300 310 320 330
560
pF1KE6 SELETNV
:::::::
XP_011 SELETNV
>>NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino ac (565 aa)
initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1629.1 bits: 311.3 E(85289): 5.3e-84
Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:34-492)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP
.: :: :.:..::.: . : .:: . :
NP_001 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
. . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:.
NP_001 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
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pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT
..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: :
NP_001 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
NP_001 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
NP_001 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
NP_001 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG
:..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: :
NP_001 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV
::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .::
NP_001 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL
.::...:::. :. ....
NP_001 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN
480 490 500 510 520 530
>>XP_016873626 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: excitato (565 aa)
initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1629.1 bits: 311.3 E(85289): 5.3e-84
Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:34-492)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP
.: :: :.:..::.: . : .:: . :
XP_016 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
. . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:.
XP_016 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT
..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: :
XP_016 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
XP_016 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
XP_016 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
XP_016 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
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