Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6417
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6417, 560 aa
1>>>pF1KE6417 560 - 560 aa - 560 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6472+/-0.000954; mu= 16.7788+/- 0.057
mean_var=66.9566+/-13.237, 0's: 0 Z-trim(105.2): 32 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156739
statistics sampled from 8256 (8279) to 8256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 3599 823.0 0
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 2241 515.9 4.3e-146
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 2218 510.8 2e-144
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1698 393.2 4.6e-109
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 1368 318.5 1.3e-86
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 1368 318.5 1.4e-86
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1220 285.0 1.4e-76
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1220 285.1 1.5e-76
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 1118 262.0 1.3e-69
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 1053 247.3 2.9e-65
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 942 222.2 1.3e-57
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 911 215.0 5.5e-56
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 915 216.0 5.8e-56
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 915 216.1 8.8e-56
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 905 213.7 2.6e-55
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 844 200.0 5.5e-51
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 691 165.3 9.6e-41
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 593 143.1 3.5e-34
>>CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (560 aa)
initn: 3599 init1: 3599 opt: 3599 Z-score: 4394.8 bits: 823.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3599; 99.8% identity (100.0% similar) in 560 aa overlap (1-560:1-560)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS57 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEE
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE6 LPAASLNHCTIQISELETNV
::::::::::::::::::::
CCDS57 LPAASLNHCTIQISELETNV
550 560
>>CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (472 aa)
initn: 2714 init1: 2233 opt: 2241 Z-score: 2736.4 bits: 515.9 E(32554): 4.3e-146
Smith-Waterman score: 2543; 84.8% identity (85.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
:::::::::::
CCDS72 LKMMILPLVVS-------------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 -----------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNH
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAA
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKD
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEE
:::::::: .:
CCDS72 FARDTGTETCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSRGLRAHPGPHLPPPRPRS
410 420 430 440 450 460
>>CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (619 aa)
initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2706.4 bits: 510.8 E(32554): 2e-144
Smith-Waterman score: 3306; 90.0% identity (90.0% similar) in 592 aa overlap (1-533:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QKETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE6 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS-----------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSRKNQVRALQCPRSLPPA
310 320 330 340 350 360
350 360
pF1KE6 ------------------------------------------SSATLPITFKCLLENNHI
::::::::::::::::::
CCDS72 GAALQRHKHSWRGGCLGRGELPDRGPSHPGGGCWADTGPSNRSSATLPITFKCLLENNHI
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAG
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDF
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEEL
550 560 570 580 590 600
550 560
pF1KE6 PAASLNHCTIQISELETNV
CCDS72 PAASLNHCTIQISELETNV
610
>>CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 (564 aa)
initn: 1680 init1: 1160 opt: 1698 Z-score: 2071.6 bits: 393.2 E(32554): 4.6e-109
Smith-Waterman score: 1698; 54.4% identity (80.6% similar) in 504 aa overlap (15-510:54-552)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSP
:::....:.: .:..: :.: :: .:.
CCDS12 QRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLTY
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
..:.::.::::::::::.:..:::.::::..:.:::: :...:.:. ...::. ::..::
CCDS12 RQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTIIAV
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTK-
..::.::.:::::... :: .. :. . .:::..:::::::: ::::: :::..:.
CCDS12 FIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTQY
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210
pF1KE6 TTPVVKSPKVAPEE-APPRRILIYGVQEENG-SHVQNFALDLTPPPEVVYKSE----PGT
.: :: : :. . : . . ::: : ..: . : :.. : ::.
CCDS12 STRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVPGS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLI
..:.:.::.: ::...:...: : .: : .: . :::..:..:.. .:: : ::.:::
CCDS12 ANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGILFLI
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 AGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALL
:::::::.: ..: .::.:..::. :: ::. ..:::.::..:..::. :: :.::::.
CCDS12 AGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGMLQALI
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 IALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVN
:..::::::::::::.:: :. .::::.:::::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS12 TAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFIAQVN
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 NYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDR
::::..::: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: :::
CCDS12 NYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDWFLDR
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE6 FRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVA
.::: :::::...:... :. .... . . : :: :: . . ::..:
CCDS12 LRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEA-ELTLPSLGKPY---KSLMAQEKGASRGRG
510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KE6 EASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
CCDS12 GNESAM
560
>>CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 1450 init1: 1051 opt: 1368 Z-score: 1668.3 bits: 318.5 E(32554): 1.3e-86
Smith-Waterman score: 1480; 50.2% identity (78.4% similar) in 468 aa overlap (16-481:34-492)
10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP
.: :: :.:..::.: . : .:: . :
CCDS55 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
. . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:.
CCDS55 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT
..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: :
CCDS55 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
CCDS55 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
CCDS55 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
CCDS55 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG
:..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: :
CCDS55 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV
::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .::
CCDS55 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL
.::...:::. :. ....
CCDS55 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN
480 490 500 510 520 530
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10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSP
.: :: :.:..::.: . : .:: . :
CCDS31 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
. . . :::..:::::::.::::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:.
CCDS31 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT
..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: :
CCDS31 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
CCDS31 KKVLVAP--PPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPE-------ETKMVIKKGLEFKDGMNVL
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
CCDS31 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
CCDS31 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG
:..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: :
CCDS31 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV
::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .::
CCDS31 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL
.::...:::. :. ....
CCDS31 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN
490 500 510 520 530 540
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30 40 50 60 70 80
pF1KE6 GCLLGFFLRTRRLSPQEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLG
... .. :.:.... :.:.::.:.:...:
CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKASGKMG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 VLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFP
. .:.::. ::..::..::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.:::::::::
CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFP
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 ANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEV
::::: :::..:. .: :: : .: . :. :. .: :.... .: :.
CCDS78 PNLVEACFKQFKTNYEK--RSFKV-PIQA--NETLV-GAVINNVSEAMETLTRITE--EL
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 VYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYF
: ::. .:.:.::.: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .::
CCDS78 V--PVPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYA
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 PFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFI
: ::.:::::::.::.: ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: :::
CCDS78 PVGILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFI
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 RGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVA
:.::::. ::.::::::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.:
CCDS78 GGLLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALA
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 AIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLII
:::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AIFIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLII
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 AVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIV
:::: :::.:: :::::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .:
CCDS78 AVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----
430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE6 AAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
::.: : . ...
CCDS78 IAQDNETEKPIDSETKM
480 490
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10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ
::....:.: .:::: .::: :: :.: .
CCDS39 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVI
:..::.::::::::::.:..:::..:::..:.:.::.:.:...:. .:.::. ::..::.
CCDS39 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 VGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTT
.::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.::::::::: ::::: :::..:.
CCDS39 IGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 PVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLG
.: :: : .: . :. .: :.... .: :.: ::. .:.:.::
CCDS39 K--RSFKV-PIQANET---LVGAVINNVSEAMETLTRITE--ELV--PVPGSVNGVNALG
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 IVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMD
.: :: .:...: : ..: : : . :::..:..::: .:: : ::.:::::::.::.
CCDS39 LVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEME
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSS
: ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.::::
CCDS39 DMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQ
::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.:::
CCDS39 SATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQ
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: :::
CCDS39 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 GDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASE
::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: ::.: : . ..
CCDS39 GDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----IAQDNETEKPIDSETK
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560
pF1KE6 LTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
.
CCDS39 M
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSPQEISYFQFPGELLM
. : .:. .: .:..: : ..: . :: : :: ::::.::
CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
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pF1KE6 RMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGS
::::..::::..::...:.:.::...:...:. .:.::. ::..:::.:: .: :.::
CCDS64 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPG-
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pF1KE6 AAQK--ETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEE
..:: : .. .. : .:..::.::::::::: :::.: :.::.:: : .: ::
CCDS64 VTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEV--KPPSDPE-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 APPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIML
... ::. . :.. :.. . : :: :::.::::.. : ..:...
CCDS64 --------MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKE--YKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVI
180 190 200 210 220
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pF1KE6 GRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFY
:.::..: ::.: . :....:::: . . :.:.::.:::::::.:..: . . .:::.:
CCDS64 GKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE-IFRKLGLY
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 SVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLL
.::. ::..:.. ::::.::....:::. : :. :::: :: ::::::::.::.:
CCDS64 MATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAE
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 ENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAAS
:::..:.::.:::::::::::::::::::::::.::::.:. .: .:::::::::::.::
CCDS64 ENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSAS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 IGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHI
:::::.::::::::::::..::::..:.:::::::: :::::::.::::::...::. ..
CCDS64 IGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKL
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pF1KE6 CRKDFAR-DTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQV
.:.. . :...:
CCDS64 SKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
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>>CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (430 aa)
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10 20 30 40
pF1KE6 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRRLSPQ
::....:.: .:::: .::: :: :.: .
CCDS78 RFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYR
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 EISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVI
:..::.::::::::::.:..:::..:::..:.:.::.:.:...:. .:.::. ::..::.
CCDS78 EVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 VGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGKPI-MSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTT
.::..: :::::... ::. .. :: . ...:::.:::::
CCDS78 IGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIR--------------------
140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 PVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLG
CCDS78 ------------------------------------------------------------
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 IVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMD
: : ::.:::::::.::.
CCDS78 ------------------------------------------YAPVGILFLIAGKIVEME
180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSS
: ..: .:..:.:::. ::..:....::::::..:.::: ::: :.::::. ::.::::
CCDS78 DMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSS
200 210 220 230 240 250
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::::::::::: ::: .:.:..::::::::::::::::::::.::::::::::.::.:::
CCDS78 SATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQ
260 270 280 290 300 310
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pF1KE6 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:: :::
CCDS78 IITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVL
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 GDALAAGIMAHICRKDFA-RDT--GTEKLLPCETK-PVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASE
::.:.:::. :. :... ::. :. . : : : .: ::.: : . ..
CCDS78 GDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQL----IAQDNETEKPIDSETK
380 390 400 410 420
530 540 550 560
pF1KE6 LTLGPTCPHHVPVQVERDEELPAASLNHCTIQISELETNV
.
CCDS78 M
430
560 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:05:17 2016 done: Tue Nov 8 13:05:18 2016
Total Scan time: 2.330 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]