Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6411, 602 aa
1>>>pF1KE6411 602 - 602 aa - 602 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9354+/-0.000431; mu= 20.6467+/- 0.027
mean_var=64.3717+/-13.678, 0's: 0 Z-trim(110.6): 40 B-trim: 94 in 1/51
Lambda= 0.159855
statistics sampled from 18946 (18984) to 18946 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 8.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_073740 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 ( 602) 3992 930.1 0
NP_001011554 (OMIM: 606411) solute carrier family ( 555) 3695 861.5 0
NP_001180271 (OMIM: 606411) solute carrier family ( 504) 3347 781.3 0
NP_001180268 (OMIM: 606411) solute carrier family ( 552) 2085 490.2 7.5e-138
NP_001180269 (OMIM: 606411) solute carrier family ( 520) 1958 460.9 4.7e-129
NP_003975 (OMIM: 604148) solute carrier family 13 ( 592) 1719 405.9 2e-112
XP_011523754 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 593) 1709 403.6 1e-111
XP_006722228 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 549) 1591 376.3 1.5e-103
NP_001139447 (OMIM: 604148) solute carrier family ( 641) 1452 344.3 7.4e-94
XP_011523753 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 598) 1442 342.0 3.5e-93
XP_011523752 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 642) 1442 342.0 3.7e-93
NP_001271439 (OMIM: 608305,615905) solute carrier ( 525) 1258 299.5 1.9e-80
NP_001271438 (OMIM: 608305,615905) solute carrier ( 551) 1258 299.5 1.9e-80
NP_808218 (OMIM: 608305,615905) solute carrier fam ( 568) 1258 299.5 2e-80
NP_001311329 (OMIM: 606193) solute carrier family ( 471) 1077 257.7 6.3e-68
NP_071889 (OMIM: 606193) solute carrier family 13 ( 595) 1077 257.8 7.6e-68
XP_011514819 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 587) 1076 257.6 8.8e-68
XP_016868043 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 608) 1076 257.6 9.1e-68
XP_011514817 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 651) 1076 257.6 9.6e-68
NP_036582 (OMIM: 604309) solute carrier family 13 ( 626) 1055 252.7 2.7e-66
XP_016867451 (OMIM: 604309) PREDICTED: solute carr ( 575) 1053 252.3 3.4e-66
NP_001305121 (OMIM: 604309) solute carrier family ( 627) 1053 252.3 3.7e-66
XP_011523755 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 569) 717 174.8 7.2e-43
XP_011514818 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 617) 654 160.3 1.8e-38
XP_011522097 (OMIM: 608305,615905) PREDICTED: solu ( 498) 622 152.8 2.6e-36
NP_001137310 (OMIM: 608305,615905) solute carrier ( 522) 622 152.8 2.7e-36
XP_011514821 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 340) 543 134.5 5.8e-31
XP_011514820 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 346) 543 134.5 5.8e-31
XP_016868044 (OMIM: 606193) PREDICTED: solute carr ( 352) 543 134.5 5.9e-31
XP_016867452 (OMIM: 604309) PREDICTED: solute carr ( 374) 501 124.8 5.1e-28
XP_011514326 (OMIM: 604309) PREDICTED: solute carr ( 581) 501 125.0 7.2e-28
XP_011523756 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carr ( 471) 370 94.7 7.6e-19
>>NP_073740 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 memb (602 aa)
initn: 3992 init1: 3992 opt: 3992 Z-score: 4972.2 bits: 930.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3992; 99.8% identity (100.0% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 AAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 SASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 YGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PKFVPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 PKFIPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 AQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 FASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 FASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 VKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 VKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFR
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 TL
::
NP_073 TL
>>NP_001011554 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 m (555 aa)
initn: 3695 init1: 3695 opt: 3695 Z-score: 4602.5 bits: 861.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3695; 99.8% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (48-602:1-555)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPGFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNPGFLS
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600
pF1KE6 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
520 530 540 550
>>NP_001180271 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 m (504 aa)
initn: 3347 init1: 3347 opt: 3347 Z-score: 4169.4 bits: 781.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3347; 99.8% identity (100.0% similar) in 504 aa overlap (99-602:1-504)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLI
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRG
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 WRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_001 WRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWN
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATI
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 IIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 LLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
460 470 480 490 500
>>NP_001180268 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 m (552 aa)
initn: 3235 init1: 2085 opt: 2085 Z-score: 2595.9 bits: 490.2 E(85289): 7.5e-138
Smith-Waterman score: 3148; 83.7% identity (86.6% similar) in 606 aa overlap (1-602:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 AAVR--RNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISI
: . :. .: . . ::. : ::
NP_001 AKTTLGRQRFHWI-----------CRLTPGR-----------------RMNI--------
190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 PYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLA--GWLW
.. .: :. .. .:. .:: :. : :: : . ::::
NP_001 ---VGTSGRAS-SSPSPTQPVLGAQ----PHSR----------AQPLTSSCLASSRGWLW
210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 ISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILL
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 FTRDPKFVPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLL
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTRDPKFIPGWASLFNPGFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLL
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 TWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIA
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 FFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFAS
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 GHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLAN
490 500 510 520 530 540
600
pF1KE6 DTFRTL
::::::
NP_001 DTFRTL
550
>>NP_001180269 (OMIM: 606411) solute carrier family 13 m (520 aa)
initn: 1952 init1: 1952 opt: 1958 Z-score: 2437.9 bits: 460.9 E(85289): 4.7e-129
Smith-Waterman score: 3368; 93.7% identity (93.7% similar) in 555 aa overlap (48-602:1-520)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVRKDPSQESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQF
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPGFLS
::::::::::::::::::::::: ::
NP_001 TNAEDRARAVIREEYQNLGPIKF-----------------------------------LS
280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGF
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAE
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KE6 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVL
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600
pF1KE6 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
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>>NP_003975 (OMIM: 604148) solute carrier family 13 memb (592 aa)
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Smith-Waterman score: 1729; 45.1% identity (75.0% similar) in 616 aa overlap (4-598:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
.:. . .:. : :...:.:. :::. . .: ::. : ..:.:::..::::::::.
NP_003 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLA
10 20 30 40 50
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pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
::::.:..:::.:::. ...: .:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:
NP_003 VTALFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIV
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pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS-
::.:: ::::.:..:.:::::.::::..:::.:::.:.: .: ... : ..:.
NP_003 GVRPAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTF
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pF1KE6 --QESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIW
:: . ... .. ...:. ::.:.. : .. .. :
NP_003 ELQEPSPQKEVTKLDNGQALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------
180 190 200 210
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pF1KE6 KGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFL
. . . . ::::::: ::::::::::.: ::..:.::: .::::.::: :::: :...:
NP_003 QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE6 LAGWLWISFLYGGLSFRGWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFIL
: .:::...:. :..: ::: .: . .. : ::. :.. :::. :::.:. ::
NP_003 LLAWLWLQILFLGFNF---RKNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISIL
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pF1KE6 FCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWF
: ....: :::.: : ::..: :. ..::..... : :.:..::. :.:
NP_003 FVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--
340 350 360 370 380 390
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pF1KE6 DFKAPNTETEPL--LTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLEN
: . :. :: : :: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::..
NP_003 DPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQS
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pF1KE6 VP-PALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFA
:: ::.:..: ....: ::: .::.:: ::::.:: .: . .::::.:.: :.. :.:
NP_003 VPAPAIAIIL-SLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLA
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pF1KE6 FMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWA
:::::.::::.:.:. : : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:. .:.: .::.::
NP_003 FMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWA
520 530 540 550 560 570
590 600
pF1KE6 DMYSVNVTALP-PTLANDTFRTL
. :.:: :.::: :
NP_003 ---QSNTTAQCLPSLANTTTPSP
580 590
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Smith-Waterman score: 1720; 45.1% identity (74.9% similar) in 617 aa overlap (4-598:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
.:. . .:. : :...:.:. :::. . .: ::. : ..:.:::..::::::::.
XP_011 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLA
10 20 30 40 50
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pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGILPSNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLV
::::.:..:::.:::. ...: .:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:
XP_011 VTALFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIV
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pF1KE6 GVQPARLILGMMVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS-
::.:: ::::.:..:.:::::.::::..:::.:::.:.: .: ... : ..:.
XP_011 GVRPAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 --QESEENTAAVRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIW
:: . ... .. ...:. ::.:.. : .. .. :
XP_011 ELQEPSPQKEVTKLDNGQALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------
180 190 200 210
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pF1KE6 KGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFL
. . . . ::::::: ::::::::::.: ::..:.::: .::::.::: :::: :...:
XP_011 QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE6 LAGWLWISFLYGGLSFRGWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFIL
: .:::...:. :..: ::: .: . .. : ::. :.. :::. :::.:. ::
XP_011 LLAWLWLQILFLGFNF---RKNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISIL
280 290 300 310 320 330
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pF1KE6 FCMFAILLFTRDPKFVPGWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWF
: ....: :::.: : ::..: :. ..::..... : :.:..::. :.:
XP_011 FVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--
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pF1KE6 D-FKAPNTETEPL--LTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLE
: . :. :: : :: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::.
XP_011 DPVENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQ
400 410 420 430 440 450
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pF1KE6 NVP-PALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSF
.:: ::.:..: ....: ::: .::.:: ::::.:: .: . .::::.:.: :.. :.
XP_011 SVPAPAIAIIL-SLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSL
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pF1KE6 AFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDW
::::::.::::.:.:. : : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:. .:.: .::.:
XP_011 AFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSW
520 530 540 550 560 570
580 590 600
pF1KE6 ADMYSVNVTALP-PTLANDTFRTL
: . :.:: :.::: :
XP_011 A---QSNTTAQCLPSLANTTTPSP
580 590
>>XP_006722228 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carrier (549 aa)
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Smith-Waterman score: 1602; 45.9% identity (75.0% similar) in 573 aa overlap (48-598:1-545)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILP
::..::::::::.::::.:..:::.:::.
XP_006 MALFWCTEALPLAVTALFPLILFPMMGIVD
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80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SNKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSF
...: .:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:::.:: ::::.:..:.:
XP_006 ASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGFMLVTAF
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pF1KE6 LSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS---QESEENTAAVRRNGL
::::.::::..:::.:::.:.: .: ... : ..:. :: . ... ..
XP_006 LSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTFELQEPSPQKEVTKLDNG
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pF1KE6 HTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSASIGGTA
...:. ::.:.. : .. .. : . . . . ::::::: :
XP_006 QALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------QCMSLCVCYSASIGGIA
160 170 180 190
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pF1KE6 TLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFR
:::::::::.: ::..:.::: .::::.::: :::: :...:: .:::...:. :..::
XP_006 TLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFR
200 210 220 230 240 250
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pF1KE6 GWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFVP
:: .: . .. : ::. :.. :::. :::.:. ::: ....: :::.: :
XP_006 ---KNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFL
260 270 280 290 300
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pF1KE6 GWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFD-FKAPNTETEPL--LT
::..: :. ..::..... : :.:..::. :.: : . :. :: :
XP_006 GWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--DPVENPGKLKAPLGLLD
310 320 330 340 350 360
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pF1KE6 WKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVP-PALAVLLITVVIA
:: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::..:: ::.:..: ....:
XP_006 WKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIIL-SLLVA
370 380 390 400 410 420
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pF1KE6 FFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNSIAFAS
::: .::.:: ::::.:: .: . .::::.:.: :.. :.::::::.::::.:.:.
XP_006 TFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSF
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pF1KE6 GHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALP-PTLA
: : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:. .:.: .::.::. :.:: :.::
XP_006 GDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWAQ---SNTTAQCLPSLA
490 500 510 520 530 540
600
pF1KE6 NDTFRTL
: :
XP_006 NTTTPSP
>>NP_001139447 (OMIM: 604148) solute carrier family 13 m (641 aa)
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Smith-Waterman score: 1610; 42.7% identity (69.9% similar) in 654 aa overlap (15-598:12-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
: :...:.:. :::. . .: ::. : ..:.:::..::::::::.
NP_001 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLA
10 20 30 40 50
70 80
pF1KE6 VTALLPIVLFPFMGIL----------PSN---------------------------KVCP
::::.:..:::.:::. ::. .: :
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90 100 110 120 130
pF1KE6 ------------QYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGM
.:. :.:.::..::..: :.:.::::.::::..:..:::.:: ::::.
NP_001 PLSHVSTCQVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGF
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180
pF1KE6 MVTTSFLSMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQK------EVRKDPS---QESEENTAA
:..:.:::::.::::..:::.:::.:.: .: ... : ..:. :: . .
NP_001 MLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQASSNVEEGSNNPTFELQEPSPQKEV
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VRRNGLHTVPTEMQFLASTEAKDHPGETEVPLDLPADSRKEDEYRRNIWKGFLISIPYSA
.. .. ...:. ::.:.. : .. .. : . . . . :::
NP_001 TKLDNGQALPVTS---ASSEGRAHLSQKHLHLT----------------QCMSLCVCYSA
240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQC-DVVNFGSWFIFAFPLMLLFLLAGWLWISFLY
:::: ::::::::::.: ::..:.::: .::::.::: :::: :...:: .:::...:.
NP_001 SIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILF
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350
pF1KE6 GGLSFRGWRKN--KSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTR
:..:: :: .: . .. : ::. :.. :::. :::.:. ::: ....: :::
NP_001 LGFNFR---KNFGIGEKMQEQQQAAYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTR
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 DPKFVPGWASLFNPG-----FLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPSLKWWFDFKAPNTETEP
.: : ::..: :. ..::..... : :.:..::. :.: : . :. :
NP_001 EPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIMFIIPSKFPGLTQ--DPENPGKLKAP
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 L--LTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGGQLHPLENVP-PALAVLLI
: : :: ... .::::.::::::.:.::: :.:::: :.:..: ::..:: ::.:..:
NP_001 LGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIIL-
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 TVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGTVGCSFAFMLPVSTPPNS
....: ::: .::.:: ::::.:: .: . .::::.:.: :.. :.::::::.::::.
NP_001 SLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNA
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 IAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLGTFPDWADMYSVNVTALP
:.:. : : : ::.:.:.:.:..:::...::.:.:. .:.: .::.:: . :.::
NP_001 IVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWA---QSNTTAQC
580 590 600 610 620
600
pF1KE6 -PTLANDTFRTL
:.::: :
NP_001 LPSLANTTTPSP
630 640
>>XP_011523753 (OMIM: 604148) PREDICTED: solute carrier (598 aa)
initn: 1365 init1: 637 opt: 1442 Z-score: 1793.9 bits: 342.0 E(85289): 3.5e-93
Smith-Waterman score: 1503; 42.8% identity (69.5% similar) in 622 aa overlap (48-598:1-594)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGIL-
::..::::::::.::::.:..:::.:::.
XP_011 MALFWCTEALPLAVTALFPLILFPMMGIVD
10 20 30
80
pF1KE6 ---------PSN---------------------------KVCP------------QYFLD
::. .: : .:. :
XP_011 ASEIIQRPFPSSFESPGECQSVGMSVTASHNLGGTVGDSRVFPPLSHVSTCQVAVEYLKD
40 50 60 70 80 90
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