Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6404, 454 aa
1>>>pF1KE6404 454 - 454 aa - 454 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0153+/-0.000435; mu= 14.4460+/- 0.027
mean_var=94.5954+/-19.072, 0's: 0 Z-trim(112.1): 84 B-trim: 1124 in 1/53
Lambda= 0.131868
statistics sampled from 20798 (20882) to 20798 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 6.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_477518 (OMIM: 607567) noelin-3 isoform 2 precur ( 458) 1955 382.7 1.1e-105
NP_001275750 (OMIM: 607567) noelin-3 isoform 1 pre ( 478) 1948 381.4 2.9e-105
NP_055094 (OMIM: 605366) noelin isoform 1 precurso ( 467) 1910 374.1 4.3e-103
NP_001269541 (OMIM: 605366) noelin isoform 5 [Homo ( 458) 1897 371.7 2.3e-102
NP_001269540 (OMIM: 605366) noelin isoform 4 precu ( 485) 1896 371.5 2.8e-102
NP_001275752 (OMIM: 607567) noelin-3 isoform 3 [Ho ( 383) 1672 328.8 1.6e-89
XP_016855729 (OMIM: 607567) PREDICTED: noelin-3 is ( 383) 1672 328.8 1.6e-89
NP_000252 (OMIM: 137750,601652) myocilin precursor ( 504) 748 153.1 1.6e-36
XP_016863431 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1235) 693 142.9 4.6e-33
NP_001309175 (OMIM: 616417) adhesion G protein-cou (1240) 693 142.9 4.6e-33
XP_016863430 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1299) 693 142.9 4.8e-33
XP_016863429 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1308) 693 142.9 4.8e-33
NP_056051 (OMIM: 616417) adhesion G protein-couple (1469) 693 143.0 5.3e-33
XP_016863427 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1510) 693 143.0 5.4e-33
XP_011530093 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1515) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863426 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1518) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863425 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1524) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863424 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1528) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863423 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1532) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863422 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1534) 693 143.0 5.4e-33
XP_016863421 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1537) 693 143.0 5.4e-33
NP_001309331 (OMIM: 616417) adhesion G protein-cou (1537) 693 143.0 5.4e-33
XP_011530090 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1543) 693 143.0 5.5e-33
XP_016863420 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1580) 693 143.0 5.6e-33
XP_016863418 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1586) 693 143.0 5.6e-33
XP_016863419 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1586) 693 143.0 5.6e-33
XP_016863428 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G (1442) 683 141.0 1.9e-32
XP_005251817 (OMIM: 615899) PREDICTED: olfactomedi ( 569) 662 136.8 1.5e-31
NP_001269644 (OMIM: 615899) olfactomedin-like prot ( 438) 659 136.1 1.8e-31
XP_006717052 (OMIM: 615899) PREDICTED: olfactomedi ( 616) 659 136.2 2.3e-31
NP_872293 (OMIM: 615899) olfactomedin-like protein ( 652) 659 136.2 2.4e-31
XP_016856274 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1463) 652 135.2 1.2e-30
XP_016856275 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1463) 652 135.2 1.2e-30
XP_016881970 (OMIM: 616416) PREDICTED: adhesion G ( 878) 647 134.1 1.5e-30
XP_016856284 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1181) 647 134.1 1.9e-30
XP_016856283 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1191) 647 134.1 1.9e-30
XP_016856282 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1225) 647 134.2 2e-30
NP_001008701 (OMIM: 616416) adhesion G protein-cou (1474) 648 134.4 2e-30
XP_011526098 (OMIM: 616416) PREDICTED: adhesion G (1505) 648 134.4 2e-30
XP_016856281 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1408) 647 134.2 2.2e-30
XP_016856279 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1421) 647 134.2 2.2e-30
XP_016856277 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1451) 647 134.2 2.2e-30
XP_006710551 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_016856272 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_006710548 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_016856271 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_016856273 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_006710552 (OMIM: 607018) PREDICTED: adhesion G (1464) 647 134.2 2.3e-30
XP_016881968 (OMIM: 616416) PREDICTED: adhesion G (1476) 647 134.2 2.3e-30
XP_016881967 (OMIM: 616416) PREDICTED: adhesion G (1482) 647 134.2 2.3e-30
>>NP_477518 (OMIM: 607567) noelin-3 isoform 2 precursor (458 aa)
initn: 1948 init1: 1550 opt: 1955 Z-score: 2018.3 bits: 382.7 E(85289): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 1955; 62.2% identity (85.2% similar) in 447 aa overlap (10-453:11-457)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSRD
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NP_477 MQATSNLLNLLLLSLFAGLDPSKTQISPKEGWQVYSSAQDPDGRCICTVVAPEQNLCSRD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADG---SLSA
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NP_477 AKSRQLRQLLEKVQNMSQSIEVLNLRTQRDFQYVLKMETQMKGLKAKFRQIEDDRKTLMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQ
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NP_477 KHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNLSAVLTGIQEEIGAYDYEELH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 QRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGY
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NP_477 QRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGAWMTDPLASEKNNRVWYMDSY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 YKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSR
... : :.....::..: . . :: ::::.::::::::..::::::...:: :
NP_477 TNNKIVREYKSIADFVSGAESRTYNLPFKWAGTNHVVYNGSLYFNKYQSNIIIKYSFDMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 SVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLE
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NP_477 RVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVYATNQNAGNIVISQLNQDTLE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSH
::.::.::::::::::.:::::.::::::::.:::::..: :.::.:::::.:::::: :
NP_477 VMKSWSTGYPKRSAGESFMICGTLYVTNSHLTGAKVYYSYSTKTSTYEYTDIPFHNQYFH
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE6 ISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
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NP_477 ISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
430 440 450
>>NP_001275750 (OMIM: 607567) noelin-3 isoform 1 precurs (478 aa)
initn: 1920 init1: 1550 opt: 1948 Z-score: 2010.8 bits: 381.4 E(85289): 2.9e-105
Smith-Waterman score: 1948; 61.3% identity (84.5% similar) in 457 aa overlap (2-453:21-477)
10 20 30
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAG-QTLFQ-NPEEGWQLYTSAQA
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NP_001 MSPPLLKLGAVLSTMAMISNWMSQTLPSLVGLNTTRLSTPDTLTQISPKEGWQVYSSAQD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PDGKCICTAVIPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETL
:::.::::.: : :. ::::..::.::::.:::::.:::.:::.::: ::.::: :::
NP_001 PDGRCICTVVAPEQNLCSRDAKSRQLRQLLEKVQNMSQSIEVLNLRTQRDFQYVLKMETQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 MRSLDARLRAADG---SLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNL
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NP_001 MKGLKAKFRQIEDDRKTLMTKHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGS
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NP_001 SAVLTGIQEEIGAYDYEELHQRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 WMTDTMAPSADSRVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNG
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NP_001 WMTDPLASEKNNRVWYMDSYTNNKIVREYKSIADFVSGAESRTYNLPFKWAGTNHVVYNG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVY
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NP_001 SLYFNKYQSNIIIKYSFDMGRVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVY
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 TTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAY
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NP_001 ATNQNAGNIVISQLNQDTLEVMKSWSTGYPKRSAGESFMICGTLYVTNSHLTGAKVYYSY
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 FTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
:.::.:::::.:::::: :::::::: :.::::.::::::::.::::::.:.: :
NP_001 STKTSTYEYTDIPFHNQYFHISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
430 440 450 460 470
>>NP_055094 (OMIM: 605366) noelin isoform 1 precursor [H (467 aa)
initn: 1869 init1: 1509 opt: 1910 Z-score: 1971.9 bits: 374.1 E(85289): 4.3e-103
Smith-Waterman score: 1910; 59.0% identity (86.7% similar) in 444 aa overlap (10-450:21-464)
10 20 30 40
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAV
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NP_055 MPGRWRWQRDMHPARKLLSLLFLILMGTELTQVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 IPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRA
: :. ::::.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:.....
NP_055 APQQTMCSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 ADGSLS---AKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEE
.. : . :..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::
NP_055 VEESHKQHLARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 MGAYGYEDLQQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSA
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NP_055 IGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 DSRVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSN
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NP_055 DNRVWYMDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 VVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIV
..... ......: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.:::::::::
NP_055 IIIRFDLKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 VSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYT
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NP_055 VSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYI
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KE6 DVPFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
:.::.:.:::::::::::..::::.::::::.:::::::::: .
NP_055 DIPFQNKYSHISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
430 440 450 460
>>NP_001269541 (OMIM: 605366) noelin isoform 5 [Homo sap (458 aa)
initn: 1869 init1: 1509 opt: 1897 Z-score: 1958.7 bits: 371.7 E(85289): 2.3e-102
Smith-Waterman score: 1897; 59.6% identity (87.5% similar) in 433 aa overlap (21-450:23-455)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQSTCSR
..: ::::.::.:.::: .:.::::.: : :. :::
NP_001 MGEAPGREGRGPCPQLESPRRRRVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTMCSR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADGSLS---
:.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:..... .. : .
NP_001 DARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDL
:..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::.::: :..:
NP_001 ARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIGAYDYDEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 QQRVMALEARLHACAQKLGCGKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDG
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NP_001 QSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWYMDG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 YYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRS
:...: : :.... ::.. .:: .: ::.::.:::.::::::...::.::...... ...
NP_001 YHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTL
...: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.::::::::::::::: .:
NP_001 ETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 EVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYS
.....:.:.::::::::::.:::.:::::.. .:.::..:: ::.:.::: :.::.:.::
NP_001 QTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE6 HISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
:::::::::..::::.::::::.:::::::::: .
NP_001 HISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
430 440 450
>>NP_001269540 (OMIM: 605366) noelin isoform 4 precursor (485 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQST
::::.::.:.::: .:.::::.: : :.
NP_001 TLPSLVGLNTTKLSAAGGGTLDRSTGVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTM
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 CSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLDARLRAADGSLS
::::.:...::::.:::::.:::.:::. :: ::::::. ::. :..:..... .. : .
NP_001 CSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHK
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120 130 140 150 160 170
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:..:. .: .: :: :: :::.::::.. .....:::.::.. : .:::.::: :
NP_001 QHLARQFKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIGAYDY
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180 190 200 210 220 230
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..::.:: :: ::.:: :::.::::::.:.:.::.. :::::::::: .:: .:.::::
NP_001 DELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWY
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240 250 260 270 280 290
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::::...: : :.... ::.. .:: .: ::.::.:::.::::::...::.::......
NP_001 MDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFD
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......: ::: ::::: . :.::: ::.:.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 LKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDP
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360 370 380 390 400 410
pF1KE6 HTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHN
.:.....:.:.::::::::::.:::.:::::.. .:.::..:: ::.:.::: :.::.:
NP_001 VSLQTLQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQN
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420 430 440 450
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.:::::::::::..::::.::::::.:::::::::: .
NP_001 KYSHISMLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
450 460 470 480
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.:::.:::.::: ::.::: ::: :..:
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:..: . .: .: :::::..: ::::: ::::::.:.. :....::.::::. :.
NP_001 AKFRQIEDDRKTLMTKHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNLSAVLT
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.::::.::: ::.:.:::..::.::. : .:: :::: ...:.::.. :.:::.::::
NP_001 GIQEEIGAYDYEELHQRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGAWMTDP
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.: ..::::::.: ... : :.....::..: . . :: ::::.::::::::..:
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:::::...:: : ::.:::: ::..:..::.::::::.:.:.:: ::::::.::::
NP_001 KYQSNIIIKYSFDMGRVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVYATNQN
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NP_001 AGNIVISQLNQDTLEVMKSWSTGYPKRSAGESFMICGTLYVTNSHLTGAKVYYSYSTKTS
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.:::::.:::::: :::::::: :.::::.::::::::.::::::.:.: :
NP_001 TYEYTDIPFHNQYFHISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
340 350 360 370 380
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Smith-Waterman score: 1672; 62.3% identity (85.9% similar) in 382 aa overlap (75-453:1-382)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 ICTAVIPAQSTCSRDGRSRELRQLMEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMETLMRSLD
.:::.:::.::: ::.::: ::: :..:
XP_016 MSQSIEVLNLRTQRDFQYVLKMETQMKGLK
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pF1KE6 ARLRAADG---SLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLA
:..: . .: .: :::::..: ::::: ::::::.:.. :....::.::::. :.
XP_016 AKFRQIEDDRKTLMTKHFQELKEKMDELLPLIPVLEQYKTDAKLITQFKEEIRNLSAVLT
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.::::.::: ::.:.:::..::.::. : .:: :::: ...:.::.. :.:::.::::
XP_016 GIQEEIGAYDYEELHQRVLSLETRLRDCMKKLTCGKLMKITGPVTVKTSGTRFGAWMTDP
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pF1KE6 MAPSADSRVWYMDGYYKGRRVLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYN
.: ..::::::.: ... : :.....::..: . . :: ::::.::::::::..:
XP_016 LASEKNNRVWYMDSYTNNKIVREYKSIADFVSGAESRTYNLPFKWAGTNHVVYNGSLYFN
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pF1KE6 KYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQN
:::::...:: : ::.:::: ::..:..::.::::::.:.:.:: ::::::.::::
XP_016 KYQSNIIIKYSFDMGRVLAQRSLEYAGFHNVYPYTWGGFSDIDLMADEIGLWAVYATNQN
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:::::.:.:. :::::.::.::::::::::.:::::.::::::::.:::::..: :.::
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pF1KE6 SYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
.:::::.:::::: :::::::: :.::::.::::::::.::::::.:.: :
XP_016 TYEYTDIPFHNQYFHISMLDYNARDRALYAWNNGHQVLFNVTLFHIIKTEDDT
340 350 360 370 380
>>NP_000252 (OMIM: 137750,601652) myocilin precursor [Ho (504 aa)
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Smith-Waterman score: 758; 31.5% identity (63.4% similar) in 464 aa overlap (26-444:41-501)
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pF1KE6 MWPLTVPPPLLLLLCSGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCICTAVIPAQST
: . : :: . : .. : :.:.
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:. ..: .: .. .:.: : . : : .: .:: :.: : . ::
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.: ... .::. ...:: .::::. : .... ..:::. .
NP_000 DQLETQT-RELETAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARLRRGQCPQ
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160 170 180 190
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.:. . :: . .. . ....:.... . : :.. :::.
NP_000 TRDTARAVPPGSREVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGYLRSGEGDTGCGE
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:. :..:.:.:. . ...: :: : : .. .: .: :.:.:. ...:
NP_000 LVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFEYDLISQF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 IKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNN
..: :.::.: .:: :::.:::... .: .:..:.. ...: ... .:::::..
NP_000 MQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEIPGAGYHG
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 TFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAG
:::::::..:.:. :::.:::..:.:.. : ::.:.:.:..::. ..:.:. :.:..
NP_000 QFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETNIRKQSVA
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380 390 400 410 420 430
pF1KE6 EAFMICGVLYVTNSHL-AGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRERALY
.::.:::.::...:. : : : ::: :.:. . .::.:.:.. ::.:::: :. :.
NP_000 NAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYNPLEKKLF
430 440 450 460 470 480
440 450
pF1KE6 TWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
.:.: ..: :.. :
NP_000 AWDNLNMVTYDIKLSKM
490 500
>>XP_016863431 (OMIM: 616417) PREDICTED: adhesion G prot (1235 aa)
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pF1KE6 QYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMA--LEARLHACAQKLGC
:.: : ..: . . .: .. :
XP_016 DAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCP-----
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pF1KE6 GKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGY-YKGRRVLEFRTLGDFIKG
: : :: . . . :.: : . .:.....:: :. . :. . ::: :
XP_016 GLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPL--QASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAG
140 150 160 170 180 190
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pF1KE6 QNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQRSLPGAGYNNTFP
. . ::. ::: :::.:.::.:: .. .::. .:.: . . .:.:..: :
XP_016 RPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSP
200 210 220 230 240 250
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pF1KE6 YSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAF
: ::: ::.:. :::.:::..:.:.:: :.::.:.:.:.::.. .:::.: ::::..::
XP_016 YRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAF
260 270 280 290 300 310
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pF1KE6 MICGVLYVTNS-------HLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRER
::::.:::..: . .: :. . : :. :. .:::: :.:..:. .:::::.
XP_016 MICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDN
320 330 340 350 360 370
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pF1KE6 ALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::.::: : : :.. . . : ::
XP_016 LLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKGPLGMGSTT
380 390 400 410 420 430
>>NP_001309175 (OMIM: 616417) adhesion G protein-coupled (1240 aa)
initn: 621 init1: 478 opt: 693 Z-score: 714.6 bits: 142.9 E(85289): 4.6e-33
Smith-Waterman score: 693; 38.6% identity (65.8% similar) in 295 aa overlap (168-452:112-399)
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 QYKADTRTIVRLREEVRNLSGSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMA--LEARLHACAQKLGC
:.: : ..: . . .: .. :
NP_001 DAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCP-----
90 100 110 120 130
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pF1KE6 GKLTGVSNPITVRAMGSRFGSWMTDTMAPSADSRVWYMDGY-YKGRRVLEFRTLGDFIKG
: : :: . . . :.: : . .:.....:: :. . :. . ::: :
NP_001 GLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPL--QASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAG
140 150 160 170 180 190
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. . ::. ::: :::.:.::.:: .. .::. .:.: . . .:.:..: :
NP_001 RPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSP
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 YSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSWDTGYPKRSAGEAF
: ::: ::.:. :::.:::..:.:.:: :.::.:.:.:.::.. .:::.: ::::..::
NP_001 YRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAF
260 270 280 290 300 310
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pF1KE6 MICGVLYVTNS-------HLAGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISMLDYNPRER
::::.:::..: . .: :. . : :. :. .:::: :.:..:. .:::::.
NP_001 MICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDN
320 330 340 350 360 370
430 440 450
pF1KE6 ALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
::.::: : : :.. . . : ::
NP_001 LLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLG
380 390 400 410 420 430
454 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:56:43 2016 done: Tue Nov 8 12:56:44 2016
Total Scan time: 6.110 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]