Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6396
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6396, 438 aa
1>>>pF1KE6396 438 - 438 aa - 438 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9625+/-0.000454; mu= 19.4432+/- 0.028
mean_var=64.6407+/-12.922, 0's: 0 Z-trim(108.7): 47 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.159522
statistics sampled from 16792 (16817) to 16792 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 6.580
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_062822 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 prec ( 477) 983 235.6 2.2e-61
NP_001135864 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 p ( 477) 983 235.6 2.2e-61
XP_011529503 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein ( 477) 983 235.6 2.2e-61
XP_011529502 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein ( 532) 983 235.6 2.4e-61
XP_005277970 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein ( 532) 983 235.6 2.4e-61
XP_006724910 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein ( 570) 983 235.6 2.5e-61
NP_001135863 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 2 p ( 448) 926 222.4 1.9e-57
XP_006724911 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein ( 541) 926 222.5 2.2e-57
NP_000443 (OMIM: 601295,613291) ileal sodium/bile ( 348) 530 131.2 4.1e-30
NP_932069 (OMIM: 613366) solute carrier family 10 ( 377) 445 111.7 3.4e-24
NP_003040 (OMIM: 182396) sodium/bile acid cotransp ( 349) 410 103.6 8.5e-22
>>NP_062822 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 precurso (477 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1223.1 bits: 235.6 E(85289): 2.2e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:75-465)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
NP_062 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
NP_062 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
NP_062 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
NP_062 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
NP_062 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
NP_062 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
NP_062 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
410 420 430 440 450 460
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
NP_062 IGHFIYSSLFPVP
470
>>NP_001135864 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 1 precu (477 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1223.1 bits: 235.6 E(85289): 2.2e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:75-465)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
NP_001 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
NP_001 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
NP_001 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
NP_001 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
NP_001 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
NP_001 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
NP_001 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
410 420 430 440 450 460
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
NP_001 IGHFIYSSLFPVP
470
>>XP_011529503 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein isof (477 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1223.1 bits: 235.6 E(85289): 2.2e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:75-465)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
XP_011 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
XP_011 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
XP_011 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
XP_011 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
XP_011 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
XP_011 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
XP_011 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
410 420 430 440 450 460
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
XP_011 IGHFIYSSLFPVP
470
>>XP_011529502 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein isof (532 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1222.4 bits: 235.6 E(85289): 2.4e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:130-520)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
XP_011 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
XP_011 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
XP_011 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
XP_011 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
XP_011 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
XP_011 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
XP_011 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
460 470 480 490 500 510
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
XP_011 IGHFIYSSLFPVP
520 530
>>XP_005277970 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein isof (532 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1222.4 bits: 235.6 E(85289): 2.4e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:130-520)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
XP_005 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
XP_005 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
XP_005 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
XP_005 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
XP_005 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
XP_005 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
XP_005 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
460 470 480 490 500 510
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
XP_005 IGHFIYSSLFPVP
520 530
>>XP_006724910 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein isof (570 aa)
initn: 983 init1: 888 opt: 983 Z-score: 1222.0 bits: 235.6 E(85289): 2.5e-61
Smith-Waterman score: 983; 39.9% identity (72.1% similar) in 391 aa overlap (33-416:168-558)
10 20 30 40 50
pF1KE6 RKLFIVLLLLLVTIEEARMSSLSFLNIEKTEILFFTKTEETILVSSSYE---NKRPNSSH
:. : .: :..::.: :. .
XP_006 TASTSLSTAGGHTVPPTGGRYLSIGDGSVMEFEFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPM
140 150 160 170 180 190
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LFVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIK
: : : ..: . ::. . . .:.... . : . . ::: :.. :::: .
XP_006 LRVTSLDTEVLTIKNVSAITWGGGGGFVVSIHSGLAGLAPLHIQLVDAHEAPPTLIEERR
200 210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NVKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPL
. .:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . :
XP_006 DFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQ
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLA
:..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: :::
XP_006 PMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLA
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRI
: :: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..
XP_006 ISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKL
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFA
:. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
XP_006 PKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLA
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 KVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLII
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ..
XP_006 TCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALV
500 510 520 530 540 550
420 430
pF1KE6 LVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
.
XP_006 IGHFIYSSLFPVP
560 570
>>NP_001135863 (OMIM: 312090) P3 protein isoform 2 precu (448 aa)
initn: 968 init1: 888 opt: 926 Z-score: 1152.5 bits: 222.4 E(85289): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 926; 42.7% identity (76.1% similar) in 330 aa overlap (91-416:107-436)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIKN
::. . :. . .: :.. :::: ..
NP_001 EFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPMLRVTSLDTEVLTIKNLVDAHEAPPTLIEERRD
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE6 VKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPLP
.:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . : :
NP_001 FCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQP
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLAI
..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: ::::
NP_001 MLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLAI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRIP
:: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..:
NP_001 SMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKLP
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFAK
. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
NP_001 KFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLAT
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLIIL
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ...
NP_001 CLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALVI
380 390 400 410 420 430
420 430
pF1KE6 VYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
NP_001 GHFIYSSLFPVP
440
>>XP_006724911 (OMIM: 312090) PREDICTED: P3 protein isof (541 aa)
initn: 922 init1: 888 opt: 926 Z-score: 1151.4 bits: 222.5 E(85289): 2.2e-57
Smith-Waterman score: 926; 42.7% identity (76.1% similar) in 330 aa overlap (91-416:200-529)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FVKIEDPKILQMVNVAKKISSDATNFTINLVTDEEGETNVTIQLWDSEGRQERLIEEIKN
::. . :. . .: :.. :::: ..
XP_006 EFPEDSEGIIVISSQYPGQANRTAPGPMLRVTSLDTEVLTIKNLVDAHEAPPTLIEERRD
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160 170
pF1KE6 VKVKVLKQKDS--LLQAPM-HIDRN-ILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPLP
.:: .:. :.: . :...: ::.:.::::..:::.::::.::.... . . : :
XP_006 FCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQSPQP
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLAI
..:: . ::..::. .::.... ::.: :.:...::. :::::.:::.::: :: ::::
XP_006 MLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVFMLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGDVTLAI
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRIP
:: ::. : ..:..: ::::.:.. :.:.:.:::..::::: .:...:..:: ..:
XP_006 SMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLIKSKLP
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFAK
. ...: ....:.::.:.. :..:.. .:. .: : ..:.:. :: .::: :: .:
XP_006 KFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGVFILAGIRLPIVLVGITVPLVGLLVGYCLAT
410 420 430 440 450 460
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLIIL
::. .::.:: :. ::.::::..:::. . .:. :: ::: ::. . ::: ...
XP_006 CLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTSEMLALVI
470 480 490 500 510 520
420 430
pF1KE6 VYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
XP_006 GHFIYSSLFPVP
530 540
>>NP_000443 (OMIM: 601295,613291) ileal sodium/bile acid (348 aa)
initn: 456 init1: 368 opt: 530 Z-score: 661.6 bits: 131.2 E(85289): 4.1e-30
Smith-Waterman score: 530; 32.6% identity (63.2% similar) in 285 aa overlap (143-424:37-314)
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RLIEEIKNVKVKVLKQKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWK
.: ..: :.... .::..:.. : :
NP_000 CVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFS---MGCNVEIKKFLGHIK
10 20 30 40 50 60
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RPLPVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDF
:: . .: . :: .::. ::.:: . :: :.. :::: .. ..: .:::.
NP_000 RPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDGDM
70 80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TLAILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIK
:.. :: :::::: :::. ::... ::.. :: ..: ..:. ..::::::. ..
NP_000 DLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVALVVPVSIGMFVN
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340
pF1KE6 HRIPEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNL---EVILLGLLVPALGLL
:. :.:: .:: .. : . : : .:: .. .. . .. ..: . :. :
NP_000 HKWPQKA----KIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYS
190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 FGYSFAKVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGC
.:. .:.. :: :.:::.:.:: :. : ...:::: . :.. . :. .. .
NP_000 LGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLA
240 250 260 270 280 290
410 420 430
pF1KE6 EMLLIILVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
... : : :.:
NP_000 FAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK
300 310 320 330 340
>>NP_932069 (OMIM: 613366) solute carrier family 10 memb (377 aa)
initn: 371 init1: 334 opt: 445 Z-score: 555.3 bits: 111.7 E(85289): 3.4e-24
Smith-Waterman score: 445; 27.4% identity (63.7% similar) in 292 aa overlap (137-423:26-313)
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SEGRQERLIEEIKNVKVKVLKQKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAF--GCKIEL
.: . .... .. .... : ::..:.
NP_932 MRANCSSSSACPANSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEI
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QLFQTVWKRPLPVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLF
. . . .:: . .: . :: :::: ..::. .: .::..:.. :::: . .:
NP_932 RKLWSHIRRPWGIAVGLLCQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIF
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ALLLDGDFTLAILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVP
.. .:::. :.: :: ::. :: :::. :.:. .:. .. :: ..: ::. . .:
NP_932 TFWVDGDMDLSISMTTCSTVAALGMMPLCIYLYTWSWSLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIP
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 VSIGIVIKHRIPEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTD-NLEVILL--GL
:..:. ...: :...... .: .. .:..: . ..:.:. : . : .. :: ..
NP_932 VAFGVYVNYRWPKQSKIILKIGAVVGGVLLLV----VAVAGVVLAKGSWNSDITLLTISF
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LVPALGLLFGYSFAKVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPF
. : .: . :. .: :.:...:.: : . ....:::: . :.
NP_932 IFPLIGHVTGFLLALFTHQSWQRCRTISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPL
240 250 260 270 280 290
410 420 430
pF1KE6 TVAMCSGCEMLLIILVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI
. .. . . .::. .:.. ::
NP_932 AYGLFQLIDGFLIVAAYQTYKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEG
300 310 320 330 340 350
438 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:54:19 2016 done: Tue Nov 8 12:54:20 2016
Total Scan time: 6.580 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]