Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6382, 327 aa
1>>>pF1KE6382 327 - 327 aa - 327 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6400+/-0.000866; mu= 13.6537+/- 0.052
mean_var=61.5190+/-12.160, 0's: 0 Z-trim(105.8): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.163520
statistics sampled from 8614 (8641) to 8614 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 ( 327) 2187 524.5 4.6e-149
CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 ( 354) 1789 430.6 9.1e-121
CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 ( 317) 670 166.6 2.4e-41
CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 ( 342) 623 155.5 5.6e-38
CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 ( 278) 480 121.7 6.6e-28
CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 266 71.3 1.5e-12
CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 255 68.7 8e-12
CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 255 68.7 9e-12
>>CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 (327 aa)
initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187 Z-score: 2789.6 bits: 524.5 E(32554): 4.6e-149
Smith-Waterman score: 2187; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA
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CCDS34 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLI
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CCDS34 RLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
310 320
>>CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 (354 aa)
initn: 1649 init1: 1649 opt: 1789 Z-score: 2281.6 bits: 430.6 E(32554): 9.1e-121
Smith-Waterman score: 1789; 79.8% identity (92.5% similar) in 332 aa overlap (1-327:23-354)
10 20 30
pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMV
::::::::::::.::::::::::::.::::::.::::.
CCDS61 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDMI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 ITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQ
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CCDS61 ITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFKNFKADDPGIKR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 ALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQVNGF
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CCDS61 ALIDGFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEVLIEDPELQINGF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFL
.::::::::.::::::::::.:.::::::::::::::::.::::::::::::::.:.:::
CCDS61 ILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWYIHALYTLIKPFL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 KEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNV
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CCDS61 KDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLLGPDYSDENDYTH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE6 DSYS-MPVKE----VEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
::. : ::. .:.: ::: ::::::::. .::. .:.:.:: ::::.::
CCDS61 TSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQPLLALD
310 320 330 340 350
>>CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 (317 aa)
initn: 660 init1: 526 opt: 670 Z-score: 855.7 bits: 166.6 E(32554): 2.4e-41
Smith-Waterman score: 670; 39.4% identity (71.7% similar) in 269 aa overlap (8-266:40-306)
10 20 30
pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDM
: .::.::. :::: .: .. ..:...:
CCDS32 MVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETREEAVRELQEM
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KE6 VITRPDIG----------FLRTDDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFK
: .. : . :..:.:::.:::::. .:..:: : ..: : ..:
CCDS32 VQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPELFD
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 SFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAM
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CCDS32 SL--SPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEKL
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 IEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYI
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CCDS32 LENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWYF
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 HALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLD
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CCDS32 TTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQLFG
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 HEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
CCDS32 PQAQAENTAF
310
>>CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 (342 aa)
initn: 569 init1: 386 opt: 623 Z-score: 795.3 bits: 155.5 E(32554): 5.6e-38
Smith-Waterman score: 623; 39.1% identity (69.4% similar) in 271 aa overlap (8-276:35-301)
10 20 30
pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDM
:. . . ::: ::.:.:. .:.: .:::
CCDS13 SDSLRTSPSVASLSENELPPPPEPPGYVCSLTEDLVTKAREELQEKPEWRLRDVQALRDM
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VITRPDIGFLRT--DDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPG
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CCDS13 V--RKEYPNLSTSLDDAFLLRFLRARKFDYDRALQLLVNYHSCRRSWPEVFNNLKPS--A
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 IKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQV
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CCDS13 LKDVLASGFLTVLPHTDPRGCHVVCIRPDRWIPSNYPITENIRAIYLTLEKLIQSEETQV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 NGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIR
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CCDS13 NGIVILADYKGVSLSKASHFGPFIAKKVIGILQDGFPIRIKAVHVVNEPRIFKGIFAIIK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 PFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSE
:::::: .:.::::..::::: . :::.:.:: : .:: .:: : : .:
CCDS13 PFLKEKIANRFFLHGSDLNSLHTNLPRSILPKEYGGTAGELDTATWNAVLLASEDDFVKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE6 YNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
.
CCDS13 FCQPVPACDSILGQTLLPEGLTSDAQCDDSLRAVKSQLYSCY
310 320 330 340
>>CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 (278 aa)
initn: 419 init1: 349 opt: 480 Z-score: 614.4 bits: 121.7 E(32554): 6.6e-28
Smith-Waterman score: 480; 39.1% identity (67.3% similar) in 202 aa overlap (51-251:49-247)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 NENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQ
:.:.::::::: : :.::: .:...:
CCDS61 DHSPLLQPGLAALRRRAREAGVPLAPLPLTDSFLLRFLRARDFDLDLAWRLLKNYYKWRA
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 QNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAI
. .. ... . : :: :. : : . : : :.:. :.:: . .: :..:.
CCDS61 ECPEISADLHPRS--IIGLLKAGYHGVLRSRDPTGSKVLIYRIAHWDPKVFTAYDVFRVS
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 LLSLEAMIEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHF
:.. : .... : : ::. :.: .. :..: ..:::. . : :::: . :::.
CCDS61 LITSELIVQEVETQRNGIKAIFDLEGWQFSHAFQITPSVAKKIAAVLTDSFPLKVRGIHL
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250
pF1KE6 VNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLN-SLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMG
.:.: .::....:.::: :: ..:: .:::: . :: : . :.::: :.::
CCDS61 INEPVIFHAVFSMIKPFLTEKIKERIHMHGNNYKQSLLQHF-PDILPLEYGGEEFSMEDI
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 TWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEEN
CCDS61 CQEWTNFIMKSEDYLSSISESIQ
260 270
>>CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (400 aa)
initn: 267 init1: 95 opt: 266 Z-score: 339.0 bits: 71.3 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 266; 27.3% identity (58.8% similar) in 245 aa overlap (25-257:14-249)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA
.:: . ..:.:.. . :. :: :.::.:::
CCDS13 MSGRVGDLSPKQAETLAKFRENVQDVLPALPN-----PDDYFLLRWLRA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV
:.: .. :: .:.:.:. ..:. . . : . : .:::: . :. : .
CCDS13 RNFDLQKSEALLRKYMEFRK-TMDIDHILDWQPPEVIQKY---MPGGLCGYDRDGCPVWY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KE6 LFAANWDQS----RYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQ-------VNGFVLIIDWSNFTF
. . : . : :.:.. . . : .... .:: .. .:.:.: .. .
CCDS13 DIIGPLDPKGLLFSVTKQDLLKTKMRDCERILHECDLQTERLGKKIETIVMIFDCEGLGL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 KQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLH
:. : . . . :....: . . .:. . . :....:::.: ::..:..
CCDS13 KHFWKPLVEVYQEFFGLLEENYPETLKFMLIVKATKLFPVGYNLMKPFLSEDTRRKIIVL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GNNLN-SLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEV
::: . .: .:: :: ::..::: : :
CCDS13 GNNWKEGLLKLISPEELPAQFGGTLTDPDGNPKCLTKINYGGEIPKSMYVRDQVKTQYEH
230 240 250 260 270 280
>>CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 157 init1: 93 opt: 255 Z-score: 325.7 bits: 68.7 E(32554): 8e-12
Smith-Waterman score: 255; 24.7% identity (59.0% similar) in 239 aa overlap (32-257:21-249)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 THLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRAR
....:.. :. .:: :.::.::::
CCDS54 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPN-----ADDYFLLRWLRAR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KFHHFEAFRLLAQYFEYR-QQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV
.: .. .: ...:.: ::.:: . ... : . : : :. ::: . :. : .
CCDS54 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQ--PPEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KE6 LFAANWDQSRYTLV----DILRAILLSLEAMIEDPELQVNGF-------VLIIDWSNFTF
. .. : . : :..: . : .... :::.. . ....: ....
CCDS54 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 KQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLH
:. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..... :..:.::..: .
CCDS54 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEV
:.: .. : ..: :. :: :::: . :
CCDS54 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEH
230 240 250 260 270 280
>>CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (406 aa)
initn: 157 init1: 93 opt: 255 Z-score: 324.9 bits: 68.7 E(32554): 9e-12
Smith-Waterman score: 255; 24.7% identity (59.0% similar) in 239 aa overlap (32-257:21-249)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 THLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRAR
....:.. :. .:: :.::.::::
CCDS13 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPN-----ADDYFLLRWLRAR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 KFHHFEAFRLLAQYFEYR-QQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV
.: .. .: ...:.: ::.:: . ... : . : : :. ::: . :. : .
CCDS13 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQ--PPEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KE6 LFAANWDQSRYTLV----DILRAILLSLEAMIEDPELQVNGF-------VLIIDWSNFTF
. .. : . : :..: . : .... :::.. . ....: ....
CCDS13 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 KQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLH
:. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..... :..:.::..: .
CCDS13 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEV
:.: .. : ..: :. :: :::: . :
CCDS13 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEH
230 240 250 260 270 280
327 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:46:02 2016 done: Tue Nov 8 12:46:02 2016
Total Scan time: 1.920 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]