Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6371, 423 aa
1>>>pF1KE6371 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7588+/-0.000936; mu= 14.5914+/- 0.055
mean_var=72.2711+/-15.029, 0's: 0 Z-trim(105.4): 171 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.150866
statistics sampled from 8248 (8429) to 8248 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 2891 638.7 3.1e-183
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 1277 287.4 1.7e-77
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 1266 285.0 9.2e-77
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 1208 272.4 6e-73
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 1153 260.4 2.3e-69
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 1087 246.1 4.9e-65
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 749 172.6 1.2e-42
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 749 172.6 1.2e-42
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 693 160.3 3.4e-39
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 692 160.1 4.6e-39
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 692 160.1 4.8e-39
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 692 160.1 4.8e-39
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 681 157.7 2.1e-38
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 679 157.3 2.6e-38
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 679 157.3 2.8e-38
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 679 157.3 2.8e-38
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 677 156.9 4.1e-38
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 677 156.9 4.4e-38
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 674 156.3 8.9e-38
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 661 153.5 7.4e-37
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 650 151.1 4.5e-36
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 648 150.7 6.3e-36
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 633 147.2 2e-35
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 633 147.2 2.6e-35
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 633 147.3 2.8e-35
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 633 147.3 2.8e-35
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 633 147.3 2.8e-35
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 618 144.1 3.6e-34
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 607 141.5 1.1e-33
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 602 140.6 4.2e-33
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 594 138.8 1.4e-32
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 579 135.6 1.9e-31
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 579 135.7 2.1e-31
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 566 132.8 1.2e-30
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 530 124.8 1.5e-28
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 530 124.8 1.7e-28
CCDS82945.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 576) 524 123.6 5e-28
CCDS34049.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 583) 524 123.6 5e-28
CCDS82946.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 591) 524 123.6 5.1e-28
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 515 121.5 1e-27
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 514 121.3 1.1e-27
CCDS73390.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 344) 509 120.2 3.1e-27
CCDS73393.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 388) 509 120.2 3.4e-27
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 507 119.8 3.9e-27
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 496 117.4 2.2e-26
CCDS9530.1 F10 gene_id:2159|Hs108|chr13 ( 488) 489 115.9 8.5e-26
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 483 114.5 1.2e-25
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 480 113.9 2e-25
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 475 112.9 6.1e-25
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 468 111.3 1.2e-24
>>CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 2891 init1: 2891 opt: 2891 Z-score: 3403.1 bits: 638.7 E(32554): 3.1e-183
Smith-Waterman score: 2891; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 ASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TGI
:::
CCDS33 TGI
>>CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 1093 init1: 974 opt: 1277 Z-score: 1504.6 bits: 287.4 E(32554): 1.7e-77
Smith-Waterman score: 1277; 42.8% identity (75.4% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
:::: .:.: .::.:...: .:: :.:: ::: ::.. ..::: : :......
CCDS47 MMYRTVGFGTRSR-NLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEY-YHGSFKIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
.. .::. . .. .. . :..: . : : .....:.::.... .. :: . ..
CCDS47 DPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKVDVI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
.. .: :::. . .: .: .:..:... . : .. ::... .... . .. ::
CCDS47 MVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALP-INASSVQVNAMSSSTGELTVQASCG-
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTYKNP
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CCDS47 KRVVPLNVN-RIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKYKNP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVCLPD
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CCDS47 HQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQICLPE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 ASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRMLCAG
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CCDS47 ASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMFCAG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
.:: :::.::::::::. : .: ::: :::::::.:.. .::::::.:: :.::.::
CCDS47 YMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWIASK
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 TGI
:::
CCDS47 TGI
>>CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 (421 aa)
initn: 1187 init1: 974 opt: 1266 Z-score: 1491.6 bits: 285.0 E(32554): 9.2e-77
Smith-Waterman score: 1266; 43.0% identity (75.1% similar) in 426 aa overlap (1-423:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
:::: .:.: .::.:...: .:: :.:: ::: ::.. ..::: : :......
CCDS35 MMYRTVGFGTRSR-NLKPWMIAVLIVLSLTVVAVTIGLLVHFLVFDQKKEY-YHGSFKIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 TDKLYAEFGREAS---NNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLA
.. .::. . ... : .. : :.: . : : .....:.::.... .. :: .
CCDS35 DPQINNNFGQSNTYQLKDLRETTENLVSQVDEIFIDSAWKKNYIKNQVVRLTPEEDGVKV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 HMLLICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHC
.... .: :::. . .: .: .:..:... . : .. ::... .... . ..
CCDS35 DVIMVFQFPSTEQRAVREKKIQSILNQKIRNLRALP-INASSVQVNAMSSSTGELTVQAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CGTRRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCFTTY
:: .: :. . ::..:. . .. ::::::::.:. :.::::::. ::::.::::: :
CCDS35 CG-KRVVPLNVN-RIASGVIAPKAAWPWQASLQYDNIHQCGATLISNTWLVTAAHCFQKY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KNPARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAELSSPVPYTNAVHRVC
::: .::.:::. :.: :::..::.:.::::. ...:::.....:: : ... ....:
CCDS35 KNPHQWTVSFGTKINPPLMKRNVRRFIIHEKYRSAAREYDIAVVQVSSRVTFSDDIRQIC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LPDASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCNEPQAYNDAITPRML
::.:: :::. .. .:::::: : ::: ::.:.: .:. .:..::.:.. : : :.
CCDS35 LPEASASFQPNLTVHITGFGALYYGGESQNDLREARVKIISDDVCKQPQVYGNDIKPGMF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 CAGSLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWI
::: .:: :::.::::::::. : .: ::: :::::::.:.. .::::::.:: :.::
CCDS35 CAGYMEGIYDACRGDSGGPLVTRDLKDTWYLIGIVSWGDNCGQKDKPGVYTQVTYYRNWI
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE6 TSKTGI
.:::::
CCDS35 ASKTGI
420
>>CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 (438 aa)
initn: 984 init1: 643 opt: 1208 Z-score: 1423.1 bits: 272.4 E(32554): 6e-73
Smith-Waterman score: 1211; 43.2% identity (70.9% similar) in 440 aa overlap (1-423:1-438)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMYRP------DVVRA---RKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTY
::: : . :: ::. :. ..: . . .... ::...:.: ..:. :
CCDS35 MMYAPVEFSEAEFSRAEYQRKQQFWDSVRLALFTLAIVAIIGIAIGIVTHFVVEDDKSFY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 NYYSTLSFTTDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQ
: .... :. : ..: ..: .: : :...: :.. : .: . .:.::.:::.: .
CCDS35 -YLASFKVTNIKYKENYGIRSSREFIERSHQIERMMSRIFRHSSVGGRFIKSHVIKLSPD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 KHGVLAHMLLICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETD
..:: ..:: :. ::.. : . : .. .:...:. .. : .. :.. .
CCDS35 EQGVDILIVLIFRYPSTDSAEQIKKKIEKALYQSLKTKQLSLTINKPSFRLTPIDSKKMR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 SYLNHCCGTRRSKT------LGQSLRIVGGTEVE-EGEWPWQASLQWDGS-HRCGATLIN
. :: :: : ... ... ::: : :. ::::::::::: :: :.:::.::.
CCDS35 NLLNSRCGIRMTSSNMPLPASSSTQRIVQGRETAMEGEWPWQASLQLIGSGHQCGASLIS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ATWLVSAAHCFTTYKNPARWTASFGVTIKPSKMKRGLRRIIVHEKYKHPSHDYDISLAEL
:::..::::: :.:..: :.::.:: : .::..:.::.::.:.. ... ::.:..:
CCDS35 NTWLLTAAHCFWKNKDPTQWIATFGATITPPAVKRNVRKIILHENYHRETNENDIALVQL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 SSPVPYTNAVHRVCLPDASYEFQPGDVMFVTGFGALKNDGYSQNHLRQAQVTLIDATTCN
:. : ..: :.::::::.: .. : .::::::.. .:: :: ::::.: :.. .::
CCDS35 STGVEFSNIVQRVCLPDSSIKLPPKTSVFVTGFGSIVDDGPIQNTLRQARVETISTDVCN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 EPQAYNDAITPRMLCAGSLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNK
. ..:. ::: ::::: .::: :::.:::::::: : .::::..::::::. :: :.:
CCDS35 RKDVYDGLITPGMLCAGFMEGKIDACKGDSGGPLVY-DNHDIWYIVGIVSWGQSCALPKK
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE6 PGVYTRVTALRDWITSKTGI
:::::::: ::::.::::.
CCDS35 PGVYTRVTKYRDWIASKTGM
420 430
>>CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 (418 aa)
initn: 900 init1: 900 opt: 1153 Z-score: 1358.8 bits: 260.4 E(32554): 2.3e-69
Smith-Waterman score: 1153; 38.9% identity (73.0% similar) in 422 aa overlap (2-423:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
:::: : . .: .:.:. ... ....::: :.: :... ..:: .: : :....
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pF1KE6 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
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CCDS35 NVEYNSQLNSPATQEYRTLSGRIESLITKTFKESNLRNQFIRAHVAKLRQDGSGVRADVV
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pF1KE6 LICRFHSTEDPETVDKIVQLVLHEKLQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHCCGT
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pF1KE6 SLEGKTDACQGDSGGPLVSSDARDIWYLAGIVSWGDECAKPNKPGVYTRVTALRDWITSK
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CCDS35 VPQGGVDACQGDSGGPLVQEDSRRLWFIVGIVSWGDQCGLPDKPGVYTRVTAYLDWIRQQ
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CCDS35 TGI
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pF1KE6 MMYRPDVVRARKRVCWEPWVIGLVIFISLIVLAVCIGLTVHYVRYNQKKTYNYYSTLSFT
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CCDS35 MYRHGISSQRS---WPLWTTIFIFLGVAAILGVTIGLLVHFLAV--EKTYYYQGDFHIS
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pF1KE6 TDKLYAEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHML
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CCDS35 LKFKFPPAEGVSMRTKI-KAKLHQMLKNNMASWNAVPASIKLMEISKAASEMLTNNCCGR
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CCDS35 QVANSIITGNKIVNGKSSLEGAWPWQASMQWKGRHYCGASLISSRWLLSAAHCFAKKNNS
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CCDS35 KDWTVNFGIVVNKPYMTRKVQNIIFHENYSSPGLHD-DIALVQLAEEVSFTEYIRKICLP
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CCDS35 EAKMKLSENDNVVVTGWGTLYMNGSFPVILQEDFLKIIDNKICNASYAYSGFVTDTMLCA
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CCDS35 GFMSGEADACQNDSGGPLAYPDSRNIWHLVGIVSWGDGCGKKNKPGVYTRVTSYRNWITS
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420
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CCDS35 KTGL
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pF1KE6 LQDAVGPPKVDPHSVKIKKINKTETDSYLNHC-CGTRRSKTLGQSLRIVGGTEVEEGEWP
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CCDS13 TFQCEDRSCVKKPNPQCDGRPDCRDGSDEEHCDCGLQ-----GPSSRIVGGAVSSEGEWP
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CCDS13 WQASLQVRGRHICGGALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLGKVWQNSRWPGEVSF
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CCDS58 LRVSSLEGQFREEFVSIDHLLPDDKVTALHHSVYVREGCASGHVVTL-QCTACGHRR---
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CCDS58 QVGLVSLLDNPAPSHLVEKIVYHSKYKPKRLGNDIALMKLAGPLTFNEMIQPVCLPNSEE
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CCDS58 NFPDGKVCWTSGWGATEDGGDASPVLNHAAVPLISNKICNHRDVYGGIISPSMLCAGYLT
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CCDS58 GGVDSCQGDSGGPLVCQE-RRLWKLVGATSFGIGCAEVNKPGVYTRVTSFLDWIHEQMER
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pF1KE6 AEFGREASNNFTEMSQRLESMVKNAFYKSPLREEFVKSQVIKFSQQKHGVLAHMLLICRF
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CCDS55 YKEQRESCPKHAVRCDGVVDCKLKSDELGCVRFDWDKSLLKIYSGSSH----QWLPIC--
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CCDS55 SSNWNDSYSEKTCQQLGFESAHRTTEVAHRDFANSFSILRYNSTIQESLHRSECPSQRYI
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pF1KE6 TL--------GQSLRIVGGTEVEEGEWPWQASLQWDGSHRCGATLINATWLVSAAHCF--
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CCDS55 SLQCSHCGLRAMTGRIVGGALASDSKWPWQVSLHFGTTHICGGTLIDAQWVLTAAHCFFV
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CCDS55 TREKVLEGWKVYAGTSNLHQLPEAASIAEIIINSNYTDEEDDYDIALMRLSKPLTLSAHI
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CCDS55 HPACLPMHGQTFSLNETCWITGFGKTRETDDKTSPFLREVQVNLIDFKKCNDYLVYDSYL
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. :: ::
CCDS55 VLPWIYSKMESEVRFRKS
520 530
423 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:40:29 2016 done: Tue Nov 8 12:40:30 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]