Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6353
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6353, 388 aa
1>>>pF1KE6353 388 - 388 aa - 388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5141+/-0.000694; mu= 17.0104+/- 0.042
mean_var=79.5250+/-15.940, 0's: 0 Z-trim(111.3): 18 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.143821
statistics sampled from 12227 (12240) to 12227 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 ( 388) 2599 548.4 4.1e-156
CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 ( 429) 797 174.5 1.6e-43
CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 372) 684 151.0 1.6e-36
CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 323) 594 132.3 6.1e-31
CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 369) 569 127.1 2.5e-29
CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 320) 548 122.7 4.5e-28
>>CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 (388 aa)
initn: 2599 init1: 2599 opt: 2599 Z-score: 2916.1 bits: 548.4 E(32554): 4.1e-156
Smith-Waterman score: 2599; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPL
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CCDS17 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 FSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 LLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 GFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRF
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE6 GFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA
370 380
>>CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 (429 aa)
initn: 772 init1: 423 opt: 797 Z-score: 894.8 bits: 174.5 E(32554): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 797; 37.2% identity (69.6% similar) in 349 aa overlap (39-383:79-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 GLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPE
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CCDS10 VVADDGSEAPERPVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQR
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSLWLSTR
...:: : : .. ..:: ::.::::.:.:::::::: :.:.:..... .:..::::..
CCDS10 KVKAR--LTIAAVLYLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSK
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 PATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLTASIAV
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CCDS10 SPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGV
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLE-EGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDLLQSF
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CCDS10 AVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSV
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFEPVRD
::: :. .: :::.:: :::: :..::. . .: . :.. :..::.: ... . ...
CCDS10 GVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKE
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 TLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAI--DSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSC
.:... : ....:..:.:: .: .:. . :.. : : ..:. : . ::. :
CCDS10 ALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRC
350 360 370 380 390 400
370 380
pF1KE6 TLQVEQYQPEMAQ-CLRCQEPPQA
:.:...:. :. . : ::
CCDS10 TIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP
410 420
>>CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 1312 init1: 678 opt: 684 Z-score: 769.0 bits: 151.0 E(32554): 1.6e-36
Smith-Waterman score: 1244; 53.7% identity (78.1% similar) in 352 aa overlap (40-385:32-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEES---KPVEMPF---HHCHRDPLPPP
:::. . . .:. :::: . :
CCDS30 EAKEKQHLLDARPAIRSYTGSLWQEGAGWIPLPRPGLDLQAIELAAQSNHHCHAQKGPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSL
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CCDS30 HCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVVGGYLAHSLAVMTDAAHLLTDFASMLISLFSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 WLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLT
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CCDS30 WMSSRPATKTMNFGWQRAEILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDL
.. :: .:..:...:::.: ::::. . . ::.: ::::::.::.::.
CCDS30 SGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTTNQQ----EENP---------SVRAAFIHVIGDF
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFE
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CCDS30 MQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFS
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CCDS30 AVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDAQAVLKTASSRLQGKFHFH
290 300 310 320 330 340
370 380
pF1KE6 SCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA
. :.:.:.:. .: .: :: :
CCDS30 TVTIQIEDYSEDMKDCQACQGPSD
350 360 370
>>CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (323 aa)
initn: 967 init1: 588 opt: 594 Z-score: 668.9 bits: 132.3 E(32554): 6.1e-31
Smith-Waterman score: 870; 43.2% identity (64.8% similar) in 352 aa overlap (40-385:32-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 LETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEES---KPVEMPF---HHCHRDPLPPP
:::. . . .:. :::: . :
CCDS27 EAKEKQHLLDARPAIRSYTGSLWQEGAGWIPLPRPGLDLQAIELAAQSNHHCHAQKGPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSL
:.. .:.::::.: :.:..:: ::::
CCDS27 HCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVV-------------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 WLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLT
: ::::.::.:.:.:::.:.::: ::. .::.:.::.::.:
CCDS27 ------------------EILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLIT
100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDL
.. :: .:..:...:::.: ::::. . . ::.: ::::::.::.::.
CCDS27 SGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTTNQQ----EENP---------SVRAAFIHVIGDF
140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFE
.::.:::.:. ..::::.:: .::: ::.::: .::.: ::::. .::::::..: :
CCDS27 MQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFT
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFS
::: :::: ::.: : ::.::::.. : :.:.:: ...: .::: ::::: ..: :
CCDS27 AVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDAQAVLKTASSRLQGKFHFH
240 250 260 270 280 290
370 380
pF1KE6 SCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA
. :.:.:.:. .: .: :: :
CCDS27 TVTIQIEDYSEDMKDCQACQGPSD
300 310 320
>>CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (369 aa)
initn: 986 init1: 538 opt: 569 Z-score: 640.1 bits: 127.1 E(32554): 2.5e-29
Smith-Waterman score: 993; 42.3% identity (70.0% similar) in 383 aa overlap (10-385:4-367)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEPSPAAGGLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMP-------FH
:: : ::. :... .. :.:. . ..:. ... : : : ..
CCDS63 MEFLERTYLVN--DKAAKMYAFTLESVELQ-QKPVNKDQCPRERPEELESGGMY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HCHRDPLPPPGLTPERLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADV
::: : . : .:. .: .: :.::.:: .:::::..: :::..::::::: :.
CCDS63 HCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAICFIFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GSMMGSLFSLWLSTRPATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDY
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CCDS63 TSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAEILGALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HIEGGAMLLTASIAVCANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVR
.:.. .:....: :: ::.... :::: :.: : :.:::
CCDS63 QIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRCLGHNHKEVQA----------------NASVR
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AAFVHVLGDLLQSFGVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILM
:::::.::::.::..:: ....:::::.:: :::: ::.::: .:.:: :.: .::
CCDS63 AAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEYKIADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLM
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 EGTPRNVGFEPVRDTLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEAS
::.:..... :.. .:.: :: ..: ::.:.::.. . :::.: .. : ..: : .
CCDS63 EGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLHIWSLTMNQVILSAHVATAASRDSQVVRREIA
280 290 300 310 320 330
360 370 380
pF1KE6 SRLYSRFGFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRCQEPPQA
. : . : . : :.:.:. . .:: :..:
CCDS63 KALSKSFTMHSLTIQMESPVDQDPDCLFCEDPCD
340 350 360
>>CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (320 aa)
initn: 986 init1: 538 opt: 548 Z-score: 617.4 bits: 122.7 E(32554): 4.5e-28
Smith-Waterman score: 972; 45.0% identity (72.1% similar) in 333 aa overlap (53-385:2-318)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 GAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPERLHARRQLYAACAV
.::: : . : .:. .: .: :.
CCDS55 MYHCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAI
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 CFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSLWLSTRPATRTMTFGWHRSE
::.:: .:::::..: :::..::::::: :. :.. ::::::::..: .. .::::::.:
CCDS55 CFIFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDLTSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLTASIAVCANLLMAFVLHQAG
:::: :.. .:.:::.:.::: :::. ::.:.. .:....: :: ::.... ::::
CCDS55 ILGALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDYQIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRC
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 PPHSHGSRGAEYAPLEEGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDLLQSFGVLAASILIYFKPQY
:.: : :.::::::::.::::.::..:: ....:::::.:
CCDS55 LGHNHKEVQA----------------NASVRAAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEY
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 KAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFEPVRDTLLSVPGVRATHELH
: :::: ::.::: .:.:: :.: .::::.:..... :.. .:.: :: ..: ::
CCDS55 KIADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLMEGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLH
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 LWALTLTYHVASAHLAIDSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSCTLQVEQYQPEMAQCLRC
.:.::.. . :::.: .. : ..: : .. : . : . : :.:.:. . .:: :
CCDS55 IWSLTMNQVILSAHVATAASRDSQVVRREIAKALSKSFTMHSLTIQMESPVDQDPDCLFC
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 QEPPQA
..:
CCDS55 EDPCD
320
388 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:23:49 2016 done: Tue Nov 8 12:23:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]