Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6315
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6315, 437 aa
1>>>pF1KE6315 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5993+/-0.000961; mu= 4.4994+/- 0.058
mean_var=214.5243+/-43.813, 0's: 0 Z-trim(113.5): 11 B-trim: 109 in 1/51
Lambda= 0.087566
statistics sampled from 14095 (14106) to 14095 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs108|chr4 ( 437) 2923 381.7 7.9e-106
CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 ( 349) 766 109.1 7.1e-24
CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 ( 348) 744 106.3 4.9e-23
CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 ( 377) 712 102.3 8.6e-22
CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 ( 438) 467 71.4 2e-12
>>CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs108|chr4 (437 aa)
initn: 2923 init1: 2923 opt: 2923 Z-score: 2013.4 bits: 381.7 E(32554): 7.9e-106
Smith-Waterman score: 2923; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGNDNVTLLFAPLLRDNYTLAPNASSLGPGTDLALAPASSAGPGPGLSLGPGPSFGFSP
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CCDS34 MDGNDNVTLLFAPLLRDNYTLAPNASSLGPGTDLALAPASSAGPGPGLSLGPGPSFGFSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 YMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYG
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 TVKAENIIMMETAQTSL
:::::::::::::::::
CCDS34 TVKAENIIMMETAQTSL
430
>>CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 (349 aa)
initn: 800 init1: 734 opt: 766 Z-score: 542.1 bits: 109.1 E(32554): 7.1e-24
Smith-Waterman score: 766; 36.2% identity (65.5% similar) in 351 aa overlap (78-426:3-343)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 LSLGPGPSFGFSPGPTPTPEPTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNV
: .. .:: :. : : . .:.:
CCDS97 MEAHNASAPFNFTLPPN---FGKRPTDLALSV
10 20
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 FVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVA
.. : . ::.::::.. ... ::. .: : .: . :.:..:: ::.:. .:.: ..
CCDS97 ILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAHLWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIE
30 40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 AVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTP
:.:.:.::: :::::::..:: . :::::::.:: ::. :: .::: :.::: . .
CCDS97 ALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKGDMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYDGD
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 IVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTM
. . .: ....: .::: .:. .. : . :..: .. .:. :.. ....
CCDS97 LKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIGIVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAIN
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 LGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAI
.: .. .. . . . .::. :. :: :..:: : :.::: .::: ::::::..:
CCDS97 VGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIGFLLGYVLSALFCLNGRCRRTVSMETGCQNVQLCSTI
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYK
:..::::. :: ...::::: .:: .:. ... :. : : . . : :. : . :
CCDS97 LNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIFQLGEGLLLIAIFWCY--EKF--KTPKDK---TKMIYT
270 280 290 300 310 320
410 420 430
pF1KE6 KLKEEEMADTSYG--TVKAENIIMMETAQTSL
:: . : : :.:.
CCDS97 AATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA
330 340
>>CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 (348 aa)
initn: 655 init1: 426 opt: 744 Z-score: 527.1 bits: 106.3 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 744; 38.7% identity (72.3% similar) in 292 aa overlap (98-385:23-311)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCI----TMLGLGCT
.. .:. :.: ....: : .:...::.
CCDS95 MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCN
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLS
:....: .:..:: : .. :::::..:: .:.:..:: . . ::.::. ::::::. :
CCDS95 VEIKKFLGHIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTAS
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCS
:... :::::.::. :: :::::: .::::: ::. :... . ..: .. .: :
CCDS95 NILAYWVDGDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI-VIPYDNIGTSLVS
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVI
..:...:.:. .:. . : :.:.. . . :.::. ..: .: : ...:
CCDS95 LVVPVSIGMFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAI-LIVLIAVVGGILYQSAWIIAPK-LWII
180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 AIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMF
. ..:.:::. :. :: . :: ::: .::: ::.:::..:..:.: :. .. .. :
CCDS95 GTIFPVAGYSLGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTF
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVK
::.:..:: : :.::. .: :
CCDS95 PLIYSIFQLAFAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK
290 300 310 320 330 340
>>CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 (377 aa)
initn: 689 init1: 447 opt: 712 Z-score: 504.7 bits: 102.3 E(32554): 8.6e-22
Smith-Waterman score: 712; 38.1% identity (70.9% similar) in 278 aa overlap (115-392:44-318)
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 FPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAAL
. :..:::.:.. .. .:.::: : .. :
CCDS36 NSSEEELPVGLEVHGNLELVFTVVSTVMMGLLMFSLGCSVEIRKLWSHIRRPWGIAVGLL
20 30 40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 CQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISS
:::::.:. :.:::..:.: : :.:::. ::::::..::.... :::::.::: :: :
CCDS36 CQFGLMPFTAYLLAISFSLKPVQAIAVLIMGCCPGGTISNIFTFWVDGDMDLSISMTTCS
80 90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 TLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADY
:. :: .::::...:.:.: . .: .. .:: ::...::.. :.. . .
CCDS36 TVAALGMMPLCIYLYTWSW-SLQQNLTIPYQNIGITLVCLTIPVAFGVYVNYRWPKQSKI
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 IVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHL
:.:.. : :.:. . .:..:. : .. .:....:: :...:. :: . :
CCDS36 ILKIGAVVGGVLLLVVAV-AGVVLAKGSWNS-DITLLTISFIFPLIGHVTGFLLALFTHQ
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 PPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKM
. ::. ::::.::.:.: ..:.:.: . . .: ::: :.::: .. ..: :.
CCDS36 SWQRCRTISLETGAQNIQMCITMLQLSFTAEHLVQMLSFPLAYGLFQLIDGFLIVAAYQT
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KE6 YGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVKAENIIMMETAQTSL
: .. .:
CCDS36 YKRRLKNKHGKKNSGCTEVCHTRKSTSSRETNAFLEVNEEGAITPGPPGPMDCHRALEPV
320 330 340 350 360 370
>>CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 (438 aa)
initn: 389 init1: 283 opt: 467 Z-score: 336.6 bits: 71.4 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 467; 31.3% identity (64.9% similar) in 265 aa overlap (120-383:158-419)
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 APHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCITMLGLGCTVDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGL
.:: .... : . .::. ..:.:. :: :
CCDS34 QKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWKRPLPVILGAVTQFFL
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 LPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLSNLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLAL
.:. .:::. : :. : .:.. ::::. . :..::.:::..:.:.:: .::::::
CCDS34 MPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDFTLAILMTCTSTLLAL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 VLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCSTLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVS
..::. .::: .. . .:.. .. :: :.:...:. :... . :... ..
CCDS34 IMMPVNSYIYSRI-LGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIKHRIPEKASFLERI-
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 LWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVIAIFMPLAGYASGYGLATLFHLP-PNC
. : :. . :. .: .: . : ......: : ::..: . :: : :
CCDS34 IRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNLEVILLGLLVPALGLLFGYSFAKVCTLPLPVC
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 KRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMFPLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSE
: :: .:.: : : :...:.:: . . . :. :. .. : ...:.::
CCDS34 K-TVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGCEMLLIILVYKAKKRC
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KE6 MLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVKAENIIMMETAQTSL
CCDS34 IFFLQDKRKRNFLI
430
437 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:01:24 2016 done: Tue Nov 8 12:01:24 2016
Total Scan time: 2.280 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]