Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6312
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6312, 314 aa
1>>>pF1KE6312 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3379+/-0.000905; mu= 14.9018+/- 0.054
mean_var=59.5591+/-12.358, 0's: 0 Z-trim(104.5): 78 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.166188
statistics sampled from 7873 (7953) to 7873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 1.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11059.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 ( 314) 2034 496.2 1.4e-140
CCDS54069.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 ( 263) 1520 372.9 1.5e-103
CCDS11786.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 287) 663 167.5 1.1e-41
CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 641 162.2 4.4e-40
CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 641 162.2 4.9e-40
CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 641 162.2 4.9e-40
CCDS59301.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 296) 608 154.3 1.1e-37
CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 ( 307) 586 149.0 4.3e-36
CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 577 146.9 1.8e-35
CCDS8229.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 ( 312) 571 145.4 5.3e-35
CCDS162.1 SLC25A34 gene_id:284723|Hs108|chr1 ( 304) 537 137.3 1.5e-32
CCDS8228.1 UCP2 gene_id:7351|Hs108|chr11 ( 309) 537 137.3 1.5e-32
CCDS44677.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 ( 275) 493 126.7 2e-29
CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 487 125.2 4.9e-29
CCDS82067.1 SLC25A35 gene_id:399512|Hs108|chr17 ( 300) 448 115.9 3.9e-26
CCDS43470.1 SLC25A27 gene_id:9481|Hs108|chr6 ( 323) 447 115.7 4.9e-26
CCDS11138.1 SLC25A35 gene_id:399512|Hs108|chr17 ( 295) 412 107.3 1.5e-23
CCDS74176.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 406) 392 102.6 5.6e-22
CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 298) 352 92.9 3.3e-19
CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 299) 352 92.9 3.3e-19
CCDS76020.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 353) 338 89.6 3.9e-18
CCDS6300.1 SLC25A32 gene_id:81034|Hs108|chr8 ( 315) 302 80.9 1.4e-15
CCDS32966.1 SLC25A42 gene_id:284439|Hs108|chr19 ( 318) 299 80.2 2.3e-15
CCDS6890.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 469) 291 78.4 1.2e-14
CCDS48031.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 489) 291 78.4 1.3e-14
CCDS59146.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 501) 291 78.4 1.3e-14
CCDS35151.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 503) 291 78.4 1.3e-14
CCDS83420.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 515) 291 78.4 1.3e-14
CCDS32156.1 SLC25A29 gene_id:123096|Hs108|chr14 ( 303) 288 77.6 1.4e-14
CCDS56431.1 SLC25A27 gene_id:9481|Hs108|chr6 ( 245) 278 75.1 6e-14
CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 ( 370) 273 74.0 2e-13
CCDS74817.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 208) 258 70.3 1.4e-12
CCDS13758.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 311) 258 70.4 2.1e-12
CCDS41671.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 246) 256 69.9 2.3e-12
CCDS60850.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 264) 256 69.9 2.5e-12
CCDS41670.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 288) 256 69.9 2.7e-12
CCDS32882.1 SLC25A23 gene_id:79085|Hs108|chr19 ( 468) 254 69.5 5.8e-12
CCDS76431.1 SLC25A45 gene_id:283130|Hs108|chr11 ( 226) 238 65.5 4.3e-11
>>CCDS11059.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 2637.5 bits: 496.2 E(32554): 1.4e-140
Smith-Waterman score: 2034; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DIAKTRIQNMRMIDGKPEYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DIAKTRIQNMRMIDGKPEYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 EQMNKAYKRLFLSG
::::::::::::::
CCDS11 EQMNKAYKRLFLSG
310
>>CCDS54069.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 (263 aa)
initn: 1520 init1: 1520 opt: 1520 Z-score: 1972.7 bits: 372.9 E(32554): 1.5e-103
Smith-Waterman score: 1601; 83.8% identity (83.8% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-263)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAG----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 -----------------------LSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFL
40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTL
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPV
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DIAKTRIQNMRMIDGKPEYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DIAKTRIQNMRMIDGKPEYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFL
190 200 210 220 230 240
310
pF1KE6 EQMNKAYKRLFLSG
::::::::::::::
CCDS54 EQMNKAYKRLFLSG
250 260
>>CCDS11786.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 (287 aa)
initn: 686 init1: 459 opt: 663 Z-score: 861.6 bits: 167.5 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 663; 39.4% identity (73.2% similar) in 284 aa overlap (24-307:9-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTRE
.. :::::. ::. ..::::.: ..: . : .: :
CCDS11 MAAEARVSRWYFGGLASCGAACCTHPLDLLKVHLQTQQE-VKLR-
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFL
. :: .....:. ..:.::::.: :: ::. ::..:: .. .:.. .. : :
CCDS11 --MTGMALR-VVRTDGILALYSGLSASLCRQMTYSLTRFAIYETVRDRVAKGSQGPLPFH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTL
:...: ..: .:.::::::... .:: : .:: :::.: .....: :..::::. :
CCDS11 EKVLLGSVSGLAGGFVGTPADLVNVRMQNDVKLPQGQRRNYAHALDGLYRVAREEGLRRL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 WRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPV
. : . .:...:...::. :.:.::..:..::.::::. :: ::.:.: .: .:.
CCDS11 FSGATMASSRGALVTVGQLSCYDQAKQLVLSTGYLSDNIFTHFVASFIAGGCATFLCQPL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DIAKTRIQNMRMIDGKPEYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFL
:. :::..: .: ::.. . .... : ....::..: :: :::::::.::
CCDS11 DVLKTRLMN-----SKGEYQGVFHCAVETAKL-GPLAFYKGLVPAGIRLIPHTVLTFVFL
230 240 250 260 270
310
pF1KE6 EQMNKAYKRLFLSG
::. : .
CCDS11 EQLRKNFGIKVPS
280
>>CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (290 aa)
initn: 575 init1: 237 opt: 641 Z-score: 833.0 bits: 162.2 E(32554): 4.4e-40
Smith-Waterman score: 641; 38.1% identity (71.3% similar) in 286 aa overlap (25-305:9-287)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTR-
:..::::.. : . :.::.:.:.:..:.. .:
CCDS76 MSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDARF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ---EYKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTP
.:. :::: : : ::. ..:.:.. .:::::.: : ..::: : .::
CCDS76 KEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSL-KRLFVERLED
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 PGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEG
.:.. . :...:. .. ...:..: ::: :.: : .: ......: : ..::
CCDS76 ETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSL----FQG--SMIGSFIDIYQQEG
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VLTLWRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAA
. :::: .:: ::..: ...: :. .:. :. ::...:.:: :: .:. ::. . :
CCDS76 TRGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SMPVDIAKTRIQNMRMIDGKPE-YKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVL
: :::...::..:.: : :. . ::. .: ..:. ..::::.:.::: : . :::: ...
CCDS76 SNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNII
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE6 TFIFLEQMNKAYKRLFLSG
:: ::...
CCDS76 FFITYEQLKRLQI
280 290
>>CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (322 aa)
initn: 575 init1: 237 opt: 641 Z-score: 832.3 bits: 162.2 E(32554): 4.9e-40
Smith-Waterman score: 645; 36.9% identity (69.6% similar) in 309 aa overlap (2-305:26-319)
10 20 30
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGAT
..:.: .:.. :: :..::::.. :
CCDS14 MGIFPGIILIFLRVKFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKP--------FVYGGLASIVAE
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTR----EYKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQA
. :.::.:.:.:..:.. .: .:. :::: : : ::. ..:.:.. .:::::
CCDS14 FGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGR
.: : ..::: : .:: .:.. . :...:. .. ...:..: ::: :.:
CCDS14 SYGTIKIGIYQSL-KRLFVERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTLWRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDS
: .: ......: : ..::. :::: .:: ::..: ...: :. .:. :. :
CCDS14 L----FQG--SMIGSFIDIYQQEGTRGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILS
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 GYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIAKTRIQNMRMIDGKPE-YKNGLDVLFKVVR
:...:.:: :: .:. ::. . :: :::...::..:.: : :. . ::. .: ..:. .
CCDS14 GMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALASNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310
pF1KE6 YEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTFIFLEQMNKAYKRLFLSG
.::::.:.::: : . :::: ... :: ::...
CCDS14 HEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFITYEQLKRLQI
290 300 310 320
>>CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (325 aa)
initn: 575 init1: 237 opt: 641 Z-score: 832.3 bits: 162.2 E(32554): 4.9e-40
Smith-Waterman score: 645; 36.9% identity (69.6% similar) in 309 aa overlap (2-305:29-322)
10 20 30
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGM
..:.: .:.. :: :..::::..
CCDS14 MGIFPGIILIFLRVKFATAAVIVSGHQKSTTVSHEMSGLNWKP--------FVYGGLASI
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KE6 GATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTR----EYKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLL
: . :.::.:.:.:..:.. .: .:. :::: : : ::. ..:.:.. .::
CCDS14 VAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALL
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 RQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPGFLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTA
:::.: : ..::: : .:: .:.. . :...:. .. ...:..: ::: :
CCDS14 RQASYGTIKIGIYQSL-KRLFVERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQA
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 DGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVLTLWRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFL
.: : .: ......: : ..::. :::: .:: ::..: ...: :. .:. :
CCDS14 QGSL----FQG--SMIGSFIDIYQQEGTRGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHL
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASMPVDIAKTRIQNMRMIDGKPE-YKNGLDVLFK
. ::...:.:: :: .:. ::. . :: :::...::..:.: : :. . ::. .: ..:
CCDS14 ILSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALASNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILK
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310
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. ..::::.:.::: : . :::: ... :: ::...
CCDS14 MWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFITYEQLKRLQI
290 300 310 320
>>CCDS59301.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 (296 aa)
initn: 617 init1: 408 opt: 608 Z-score: 790.1 bits: 154.3 E(32554): 1.1e-37
Smith-Waterman score: 635; 38.2% identity (71.0% similar) in 293 aa overlap (24-307:9-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTRE
.. :::::. ::. ..::::.: ..: . : .: :
CCDS59 MAAEARVSRWYFGGLASCGAACCTHPLDLLKVHLQTQQE-VKLR-
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70 80 90 100 110 120
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CCDS59 --MTGMALR-VVRTDGILALYSGLSASLCRQMTYSLTRFAIYETVRDRVAKGSQGPLPFH
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130 140 150 160 170 180
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CCDS59 EKVLLGSVSGLAGGFVGTPADLVNVRMQNDVKLPQGQRRNYAHALDGLYRVAREEGLRRL
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CCDS59 FSGATMASSRGALVTVGQLSCYDQAKQLVLSTGYLSDNIFTHFVASFIAAAGDEPPPQGG
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300 310
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CCDS59 HTVLTFVFLEQLRKNFGIKVPS
280 290
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CCDS37 LGSKILAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPR-YTGTYNAYRIIATTEGLT
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CCDS37 PVDVVKTRF-----INSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMF
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CCDS37 VCFEQLKRELSKSRQTMDCAT
290 300
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CCDS31 MSALNWKPFVYGGLASITAECGTFPIDLTKTRLQIQGQTNDAKF
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pF1KE6 RE--YKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTP
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CCDS31 KEIRYRGMLHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSL-KRLFIERPED
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. .... :. .:. .. ...:..: ::: :. .. .: .... .. : ..::
CCDS31 ETLPINVICGILSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQ----SNTIQG--GMIGNFMNIYQQEG
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CCDS31 TRGLWKGVSLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYTHFLSSFTCGLAGALA
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CCDS31 SNPVDVVRTRMMNQRVLRDGRCSGYTGTLDCLLQTWKNEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNI
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CCDS31 IFFVTYEQLKKLDL
280 290
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CCDS82 QTARLVQYRGVLGTILTMVRTEGPCSPYNGLVAGLQRQMSFASIRIGLYDSVKQVYTPKG
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CCDS82 ADNS--SLTTRILAGCTTGAMAVTCAQPTDVVKVRFQASIHLGPSRSDRKYSGTMDAYRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]