Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6311
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6311, 425 aa
1>>>pF1KE6311 425 - 425 aa - 425 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7405+/-0.000325; mu= 15.5682+/- 0.020
mean_var=77.0544+/-15.298, 0's: 0 Z-trim(116.2): 45 B-trim: 133 in 1/54
Lambda= 0.146108
statistics sampled from 27213 (27260) to 27213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 8.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Hom ( 425) 2875 615.4 8.8e-176
XP_005257833 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 ( 425) 2875 615.4 8.8e-176
NP_001138495 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 2 [ ( 378) 2528 542.2 8.4e-154
XP_016880775 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 ( 403) 2389 512.9 5.8e-145
XP_005246913 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_005246914 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_016860399 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_005246911 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_005246912 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_016860398 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
NP_078859 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 1 [Hom ( 424) 1488 323.0 9.1e-88
XP_005246910 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 444) 1488 323.0 9.4e-88
NP_001138985 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [ ( 414) 1466 318.3 2.2e-86
NP_055581 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform a [Hom ( 414) 1466 318.3 2.2e-86
NP_001138986 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform b [ ( 434) 1466 318.4 2.3e-86
NP_001180457 (OMIM: 614967) secernin-3 isoform 2 [ ( 417) 1399 304.2 4e-82
NP_001138987 (OMIM: 614965) secernin-1 isoform c [ ( 346) 1231 268.8 1.5e-71
XP_011510141 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 ( 344) 1146 250.9 3.8e-66
>>NP_612364 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 1 [Homo sa (425 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 3276.8 bits: 615.4 E(85289): 8.8e-176
Smith-Waterman score: 2875; 99.3% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_612 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_612 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
NP_612 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGSLFQAFVKRE
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SQAYA
:::::
NP_612 SQAYA
>>XP_005257833 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 isof (425 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 3276.8 bits: 615.4 E(85289): 8.8e-176
Smith-Waterman score: 2875; 99.3% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_005 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_005 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGSLFQAFVKRE
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SQAYA
:::::
XP_005 SQAYA
>>NP_001138495 (OMIM: 614966) secernin-2 isoform 2 [Homo (378 aa)
initn: 2528 init1: 2528 opt: 2528 Z-score: 2882.3 bits: 542.2 E(85289): 8.4e-154
Smith-Waterman score: 2528; 99.5% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_001 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKRE
:::::::::::::
NP_001 GHQAALGLMERDQVSPRE
370
>>XP_016880775 (OMIM: 614966) PREDICTED: secernin-2 isof (403 aa)
initn: 2378 init1: 2378 opt: 2389 Z-score: 2723.5 bits: 512.9 E(85289): 5.8e-145
Smith-Waterman score: 2671; 94.1% identity (94.8% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTPGSRLQCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 YIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTKEPVGEGEALLGMDLLRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLYR
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGMGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQ---------
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 GHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKRE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
XP_016 -------------DRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGSLFQAFVKRE
360 370 380 390
pF1KE6 SQAYA
:::::
XP_016 SQAYA
400
>>XP_005246913 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_005 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_005 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_005 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_005 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_005 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_005 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_005 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_005 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
>>XP_005246914 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_005 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_005 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_005 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_005 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_005 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_005 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_005 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_005 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
>>XP_016860399 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_016 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_016 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_016 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_016 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_016 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_016 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_016 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_016 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
>>XP_005246911 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_005 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_005 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_005 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_005 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_005 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_005 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_005 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_005 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
>>XP_005246912 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_005 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_005 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_005 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_005 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_005 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_005 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_005 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_005 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
>>XP_016860398 (OMIM: 614967) PREDICTED: secernin-3 isof (424 aa)
initn: 1345 init1: 867 opt: 1488 Z-score: 1696.7 bits: 323.0 E(85289): 9.1e-88
Smith-Waterman score: 1488; 54.0% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (9-424:3-414)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MASSSPDSPCSCDCFVSVPPASAIPAVIFAKNSDRPRDEVQEVVFVPAGTHTP-GSRLQC
: ::: ::..:::.. .::.::::: :::::::. :: .: : ::.:
XP_016 MEPFSCDTFVALPPATVDNRIIFGKNSDRLYDEVQEVVYFPAVVHDNLGERLKC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 TYIEVEQVSKTHAVILSRPSWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWTREPVGEGEALLGMDLLR
::::..:: .:.::.::::.:::::::::::::::::::::: :: : . ::::::::.:
XP_016 TYIEIDQVPETYAVVLSRPAWLWGAEMGANEHGVCIGNEAVWGREEVCDEEALLGMDLVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALERSSSAQEALHVITGLLEHYGQGGNCLEDAAPFSYHSTFLLADRTEAWVLETAGRLW
:.:::...:..::.::. :::.::::::: : ::::..::.:::.:::.:::::. :
XP_016 LGLERADTAEKALNVIVDLLEKYGQGGNCTEGRMVFSYHNSFLIADRNEAWILETAGKYW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AAQRIQEGARNISNQLSIGTDISAQHPELRTHAQAKGWWDGQGAFDFAQIFSLTQQPVRM
::...:::.::::::::: : :. .::..:..:. ::::::. :::: .: . ..:
XP_016 AAEKVQEGVRNISNQLSITTKIAREHPDMRNYAKRKGWWDGKKEFDFAAAYSYLDT-AKM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAKARFQAGRELLRQRQGGITAEVMMGILRDKESGICMDSGGFRTTASMVSVLPQDPTQ
....:. : .:: ...:.:: :.:: ::::: ::: :. : : :::::::.:::: .
XP_016 MTSSGRYCEGYKLLNKHKGNITFETMMEILRDKPSGINME-GEFLTTASMVSILPQDSSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PCVHFLTATPDPSRSVFKPFIFGVGVAQAPQVLSPTFGAQDPVRTLPRFQTQVDRRHTLY
::.::.:.:::: ::::::::: ..: .. :::: .: :. .:. :::: ::
XP_016 PCIHFFTGTPDPERSVFKPFIFVPHISQLLDTSSPTFELEDLVKKKSHFKP--DRRHPLY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 RGHQAALGLMERDQDRGQQLQQKQQDLEQEGLEATQGLLAGEWAPPLWELGGLFQAFVKR
. :: :: ... ...... . .... ::.: .. ...: .. . .. .:: .:
XP_016 QKHQQALEVVNNNEEKAKIMLDNMRKLEKELFREMESILQNKHLD-VEKIVNLFPQCTKD
360 370 380 390 400
420
pF1KE6 ESQAYA
: : :
XP_016 EIQIYQSNLSVKVSS
410 420
425 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 11:59:08 2016 done: Tue Nov 8 11:59:09 2016
Total Scan time: 8.040 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]