FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6230, 300 aa
1>>>pF1KE6230 300 - 300 aa - 300 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8116+/-0.000356; mu= 18.3051+/- 0.022
mean_var=65.5743+/-12.796, 0's: 0 Z-trim(113.9): 10 B-trim: 18 in 1/49
Lambda= 0.158383
statistics sampled from 23469 (23479) to 23469 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 5.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001766 (OMIM: 107270) ADP-ribosyl cyclase/cycli ( 300) 2100 488.5 6.6e-138
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XP_005248242 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 290) 659 159.3 8.4e-39
XP_011512181 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 295) 659 159.3 8.6e-39
XP_016864055 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 297) 659 159.3 8.6e-39
XP_011512180 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 300) 659 159.3 8.7e-39
XP_016864054 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 305) 659 159.3 8.8e-39
NP_004325 (OMIM: 600387) ADP-ribosyl cyclase/cycli ( 318) 659 159.3 9.1e-39
XP_011512183 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 260) 555 135.5 1.1e-31
XP_016864056 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 192) 416 103.6 3.2e-22
>>NP_001766 (OMIM: 107270) ADP-ribosyl cyclase/cyclic AD (300 aa)
initn: 2100 init1: 2100 opt: 2100 Z-score: 2596.9 bits: 488.5 E(85289): 6.6e-138
Smith-Waterman score: 2100; 100.0% identity (100.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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NP_001 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETVLARCVKYTEIHPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPCN
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130 140 150 160 170 180
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NP_001 KILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKDC
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NP_001 SNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSRSKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTLEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 WVIHGGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSCTSEI
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NP_001 WVIHGGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSCTSEI
250 260 270 280 290 300
>>XP_005248243 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (289 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.6 bits: 159.3 E(85289): 8.4e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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70 80 90 100 110
pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_005 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
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pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_005 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_005 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_005 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_005 ALKSKLWEP
>>XP_005248242 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (290 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.6 bits: 159.3 E(85289): 8.4e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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XP_005 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
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70 80 90 100 110
pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_005 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_005 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_005 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_005 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_005 ALKSDGVSPC
290
>>XP_011512181 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (295 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.5 bits: 159.3 E(85289): 8.6e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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XP_011 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
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70 80 90 100 110
pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_011 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_011 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_011 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_011 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_011 ALKSYQVPYTWLYSL
290
>>XP_016864055 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (297 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.4 bits: 159.3 E(85289): 8.6e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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XP_016 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
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pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_016 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_016 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_016 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_016 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_016 ALKSILGSSSISGTEKD
290
>>XP_011512180 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (300 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.4 bits: 159.3 E(85289): 8.7e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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XP_011 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
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pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_011 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_011 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_011 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_011 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_011 ALKSKIGHRGVHREDHVQTE
290 300
>>XP_016864054 (OMIM: 600387) PREDICTED: ADP-ribosyl cyc (305 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.3 bits: 159.3 E(85289): 8.8e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
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XP_016 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
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pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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XP_016 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
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pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
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XP_016 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
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XP_016 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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XP_016 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE6 TSEI
XP_016 ALKSPKRLCGTLGVRPRAEPYNRRF
290 300
>>NP_004325 (OMIM: 600387) ADP-ribosyl cyclase/cyclic AD (318 aa)
initn: 569 init1: 382 opt: 659 Z-score: 817.0 bits: 159.3 E(85289): 9.1e-39
Smith-Waterman score: 659; 36.8% identity (66.0% similar) in 285 aa overlap (16-296:6-280)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANCEFSPVSGDKPCCRLSRRAQLCLGVSILVLILVVVLAVVVPRWRQQWSGPGTTKRFP
: :: :: : . .:.:.:.. : : .: : ::. ..
NP_004 MAAQGCAASRLLQLLLQLLLLLLLLAAGGA------RARWRGEGTSAHLR
10 20 30 40
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pF1KE6 ETVLARCVKYTEI-HPEMRHVDCQSVWDAFKGAFISKHPCNITEEDYQPLMKLGTQTVPC
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NP_004 DIFLGRCAEYRALLSPEQRNKNCTAIWEAFKVA-LDKDPCSVLPSDYDLFINLSRHSIPR
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pF1KE6 NKILLWSRIKDLAHQFTQVQRDMFTLEDTLLGYLADDLTWCGEFNTSKINYQSCPDWRKD
.: :.: . :...:.. : .. : :.: : .:: :.:: . : : ..::::: .:
NP_004 DKSLFWENSHLLVNSFADNTRRFMPLSDVLYGRVADFLSWCRQKNDSGLDYQSCPT-SED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSNNPVSVFWKTVSRRFAEAACDVVHVMLNGSR-SKIFDKNSTFGSVEVHNLQPEKVQTL
: ::::. ::: .: .... . :.:::::::. . . .. :.. :. ::: ::. .
NP_004 CENNPVDSFWKRASIQYSKDSSGVIHVMLNGSEPTGAYPIKGFFADYEIPNLQKEKITRI
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pF1KE6 EAWVIH--GGREDSRDLCQDPTIKELESIISKRNIQFSCKNIYRPDKFLQCVKNPEDSSC
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NP_004 EIWVMHEIGG--PNVESCGEGSMKVLEKRLKDMGFQYSCINDYRPVKLLQCVDHSTHPDC
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 TSEI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]