Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6096
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6096, 326 aa
1>>>pF1KE6096 326 - 326 aa - 326 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8365+/-0.000532; mu= 18.9032+/- 0.033
mean_var=90.4144+/-22.427, 0's: 0 Z-trim(107.1): 233 B-trim: 1042 in 1/51
Lambda= 0.134882
statistics sampled from 14843 (15140) to 14843 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 7.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 856 177.4 3.3e-44
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 828 172.0 1.5e-42
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 828 172.0 1.5e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 826 171.6 1.9e-42
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NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 820 170.4 4.3e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 166.9 4.8e-41
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XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 789 164.4 2.8e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 789 164.4 2.8e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 782 163.1 7.2e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 774 161.5 2.2e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 773 161.3 2.4e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 762 159.1 1e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 734 153.7 4.6e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 730 152.9 7.9e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 730 152.9 8e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 697 146.5 6.8e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 484 105.1 2.1e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 470 102.3 1.4e-21
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 178 45.5 0.00018
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 166 43.2 0.00092
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 166 43.2 0.00093
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 157 40.9 0.0015
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 161 42.2 0.0018
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 161 42.3 0.002
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 160 42.1 0.0021
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 160 42.1 0.0022
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 160 42.1 0.0023
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 160 42.2 0.0024
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 160 42.2 0.0024
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 160 42.2 0.0024
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 160 42.2 0.0024
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 160 42.2 0.0024
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 159 41.9 0.0026
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 158 41.7 0.003
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 158 41.7 0.003
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 152 40.5 0.0062
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 153 40.9 0.0066
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 153 40.9 0.0071
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 150 40.1 0.0077
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 151 40.4 0.0082
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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NP_003 VVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLN
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NP_003 PLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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NP_835 MLNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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XP_011 LNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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XP_011 ILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPM
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pF1KE6 LSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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XP_011 LNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 855 init1: 706 opt: 826 Z-score: 883.1 bits: 171.6 E(85289): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 826; 41.8% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (19-319:6-309)
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pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
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pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIST
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NP_003 LNPLIYSLRSKEVKKA----LANVISRKRTSSFL
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 802 init1: 684 opt: 820 Z-score: 876.7 bits: 170.4 E(85289): 4.3e-42
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NP_006 CTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAF
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pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIST
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NP_006 ILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLS
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NP_006 VLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPV
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pF1KE6 LSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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NP_006 LNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 820 init1: 695 opt: 802 Z-score: 857.8 bits: 166.9 E(85289): 4.8e-41
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pF1KE6 IMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCFF
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NP_009 IILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIF
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NP_009 LSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTL
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NP_009 HLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWA
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NP_009 VLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPS
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pF1KE6 LSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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NP_009 LNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 789; 40.3% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (21-322:5-309)
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLL
10 20 30 40
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NP_036 IILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFV
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NP_036 FMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMA
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NP_036 PLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCT
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