FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6095, 326 aa
1>>>pF1KE6095 326 - 326 aa - 326 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1869+/-0.000602; mu= 17.0034+/- 0.037
mean_var=110.0796+/-29.476, 0's: 0 Z-trim(106.1): 251 B-trim: 899 in 1/48
Lambda= 0.122242
statistics sampled from 13918 (14248) to 13918 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.485), E-opt: 0.2 (0.167), width: 16
Scan time: 5.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1108 207.2 3.7e-53
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1019 191.5 2e-48
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 978 184.3 2.9e-46
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 927 175.3 1.5e-43
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XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 859 163.3 6.1e-40
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NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 835 159.0 1.1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 825 157.3 3.9e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 820 156.4 7.1e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 809 154.5 2.7e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 799 152.7 9.1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 791 151.3 2.5e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 791 151.3 2.5e-36
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 791 151.3 2.5e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 776 148.6 1.5e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 763 146.4 7.8e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 509 101.6 2.3e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 450 91.2 3.2e-18
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 197 46.6 8.9e-05
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 182 43.9 0.00054
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 169 41.6 0.0027
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 168 41.4 0.003
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 169 41.8 0.0031
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 166 41.2 0.0043
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 166 41.2 0.0043
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 164 40.9 0.0057
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NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 161 40.3 0.0084
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 161 40.4 0.0089
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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NP_006 IYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1019; 47.7% identity (83.9% similar) in 304 aa overlap (17-319:5-307)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
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NP_003 IRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLA
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NP_003 CDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDT-ILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFS
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NP_003 MHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNP
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NP_003 LIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
290 300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 978; 47.5% identity (78.2% similar) in 303 aa overlap (17-319:6-308)
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NP_001 TSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPL
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310 320
pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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NP_001 IYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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NP_835 NPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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NP_001 SYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALG
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NP_001 CGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRM
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NP_001 QSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPL
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pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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NP_001 IYTLRNKVVRGAVKRLM--GWE
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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NP_003 VHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFG
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pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
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NP_003 RGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKM
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NP_003 KSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--VSVFYAIVTPMLNPL
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pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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NP_003 IYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
. : ::.:::.::. :::.:.:.: ...::::.: . ....::: :: :::... :
XP_011 VSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFV
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
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XP_011 DMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
:..: : : ::.. ::: .::::::. ..... . . :. .: .: :: : ..::.
XP_011 CADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
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pF1KE6 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
::::::. .: :.:... : :
XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 883 init1: 829 opt: 859 Z-score: 838.1 bits: 163.3 E(85289): 6.1e-40
Smith-Waterman score: 859; 41.2% identity (77.1% similar) in 306 aa overlap (17-322:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
: . :. :.:...... . : .::..::..:: :..::: ...
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10 20 30 40
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pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
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NP_036 VSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFV
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pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
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pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
::::::. .: :.:... : :
NP_036 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 883 init1: 829 opt: 859 Z-score: 838.1 bits: 163.3 E(85289): 6.1e-40
Smith-Waterman score: 859; 41.2% identity (77.1% similar) in 306 aa overlap (17-322:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
: . :. :.:...... . : .::..::..:: :..::: ...
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILS
10 20 30 40
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pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
. : ::.:::.::. :::.:.:.: ...::::.: . ....::: :: :::... :
XP_011 VSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFV
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
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XP_011 DMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSF
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pF1KE6 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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XP_011 CADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
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pF1KE6 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPF
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
::::::. .: :.:... : :
XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 904 init1: 832 opt: 837 Z-score: 817.1 bits: 159.4 E(85289): 9e-39
Smith-Waterman score: 837; 40.7% identity (75.8% similar) in 302 aa overlap (17-318:5-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
: . : :::..:... .. .::...: ::.::.:: ...
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILV
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NP_001 SRLDPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLG
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
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NP_001 GVECLLLAVMAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPR
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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NP_001 CGHHEVDHFLREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQI
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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NP_001 RSASGRQKAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]