Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6091, 322 aa
1>>>pF1KE6091 322 - 322 aa - 322 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8129+/-0.000543; mu= 18.7620+/- 0.034
mean_var=95.9986+/-25.728, 0's: 0 Z-trim(106.4): 315 B-trim: 891 in 1/48
Lambda= 0.130901
statistics sampled from 14037 (14464) to 14037 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 4.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 996 199.3 8.5e-51
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 892 179.7 6.9e-45
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 792 160.8 3.3e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 789 160.2 4.9e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 773 157.2 4e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 772 157.0 4.6e-38
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 766 155.9 1e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 764 155.5 1.3e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 764 155.5 1.3e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 762 155.1 1.7e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 752 153.3 6.3e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 752 153.3 6.3e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 752 153.3 6.3e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 750 152.9 8.2e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 750 152.9 8.2e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 746 152.1 1.4e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 729 148.9 1.2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 722 147.6 3.2e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 721 147.4 3.6e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 672 138.2 2.3e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 485 102.8 9.6e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 467 99.5 1e-20
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 221 53.0 9.5e-07
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 221 53.0 1e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 215 52.0 2.6e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 207 50.4 6.8e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 207 50.4 6.8e-06
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 198 48.8 2.4e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 198 48.8 2.5e-05
NP_005279 (OMIM: 600752) G-protein coupled recepto ( 334) 190 47.2 5.8e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 187 46.6 8.7e-05
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 182 45.7 0.00019
NP_005275 (OMIM: 600553) G-protein coupled recepto ( 362) 178 44.9 0.00029
NP_001273028 (OMIM: 600553) G-protein coupled rece ( 377) 178 45.0 0.0003
XP_016856349 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_005245114 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_011507679 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_016856350 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_011507680 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_005245113 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_011507677 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_011507678 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
XP_016856351 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 178 45.1 0.00037
NP_001254539 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 529) 178 45.1 0.00037
NP_722561 (OMIM: 612250) G-protein coupled recepto ( 529) 178 45.1 0.00037
NP_001254540 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 546) 178 45.2 0.00038
XP_005245112 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 549) 178 45.2 0.00038
NP_001254538 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 549) 178 45.2 0.00038
XP_016856348 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 549) 178 45.2 0.00038
XP_011507675 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 552) 178 45.2 0.00038
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 996; 47.4% identity (77.7% similar) in 310 aa overlap (16-322:2-311)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
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NP_006 LNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 892; 46.5% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (17-310:1-297)
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pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQ---F
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NP_003 LNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 792; 42.1% identity (70.9% similar) in 302 aa overlap (21-319:6-307)
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pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::.:::::::.. .. .. :
NP_001 LNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE6 -SLVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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NP_001 WVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRA
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NP_001 ILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPS
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:::.::.:::: : .. ..
NP_001 LNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 773; 38.5% identity (72.1% similar) in 301 aa overlap (21-318:2-302)
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pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
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.:. . :: :::.:: .:: :: . .... :::: ..:.. . :: . :: :.: .
NP_001 IIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLF
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pF1KE6 VTT---ECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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:::::. : :.::. .: ::: .::. :: .::.. .. . . ::: .:. .
NP_001 RLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVA
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::. ....: ::: :::..:: :.:::.:. . :. :: . ..: . . .::...:
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pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
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NP_001 LNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
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>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
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Smith-Waterman score: 772; 41.0% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (17-318:1-305)
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pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
:: :: : :..:.: :. .:. . :: :: .::.:..:::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLL
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pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
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pF1KE6 VT---TECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
:::: ... : ::. . .::..:... .: ..... .. . :: .. ::.::. :. .
NP_001 RLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSS
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pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
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Smith-Waterman score: 766; 39.5% identity (69.8% similar) in 311 aa overlap (10-317:4-314)
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pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
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pF1KE6 FSLVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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XP_011 PLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCT
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pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
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XP_011 LNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 774 init1: 504 opt: 764 Z-score: 796.2 bits: 155.5 E(85289): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 764; 40.1% identity (70.1% similar) in 304 aa overlap (17-317:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
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pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQF---
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XP_011 IILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFV
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pF1KE6 FSLVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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XP_011 FMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMA
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pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
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XP_011 PLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCT
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pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
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XP_011 VLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPM
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pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
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XP_011 LNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 774 init1: 504 opt: 764 Z-score: 796.2 bits: 155.5 E(85289): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 764; 40.1% identity (70.1% similar) in 304 aa overlap (17-317:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
: : . ..::.: :. .::. . ::. :: .:: :..:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLL
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70 80 90 100 110
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQF---
.:. . : :: :::.::..:.::: .: :..:::: : . ... ::. :..:.
NP_036 IILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFV
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pF1KE6 FSLVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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NP_036 FMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMA
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
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NP_036 PLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
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NP_036 VLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPM
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::.::::::. . ... :.
NP_036 LNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 749 init1: 390 opt: 762 Z-score: 794.3 bits: 155.1 E(85289): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 762; 39.6% identity (71.1% similar) in 308 aa overlap (17-321:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
:.. : : .:::.: :. : . ::...: .::.:..:::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQF-FS
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NP_003 LISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFF
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pF1KE6 LV--TTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
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NP_003 LIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFIL
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
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NP_003 RLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
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NP_003 VVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSK--QQEKSVSVFYAIVTPM
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NP_003 LNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
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322 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:25:01 2016 done: Tue Nov 8 09:25:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]