Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6091, 322 aa
1>>>pF1KE6091 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7114+/-0.00133; mu= 13.4343+/- 0.078
mean_var=146.0285+/-50.080, 0's: 0 Z-trim(100.6): 387 B-trim: 726 in 2/43
Lambda= 0.106134
statistics sampled from 5682 (6165) to 5682 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 2026 323.0 2e-88
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1733 278.1 6.1e-75
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1647 265.0 5.7e-71
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1636 263.3 1.8e-70
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1597 257.3 1.2e-68
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1224 200.2 1.8e-51
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1092 180.0 2.2e-45
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1054 174.2 1.2e-43
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1024 169.6 3e-42
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1017 168.5 6.3e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 996 165.3 5.8e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 985 163.6 2e-40
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 977 162.4 4.3e-40
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 974 162.0 6.5e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 973 161.8 6.8e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 970 161.3 9.1e-40
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 962 160.1 2.1e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 957 159.3 3.6e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 951 158.4 6.8e-39
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 949 158.1 8.4e-39
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 941 156.9 2e-38
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 934 155.8 4.2e-38
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 934 155.8 4.2e-38
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 926 154.6 1e-37
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 919 153.5 2e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 919 153.5 2.1e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 917 153.2 2.6e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 916 153.1 2.9e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 908 151.8 6.6e-37
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 904 151.2 1e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 901 150.7 1.4e-36
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 893 149.5 3.3e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 892 149.4 3.6e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 890 149.0 4.4e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 888 148.7 5.5e-36
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 883 148.0 9.4e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 882 147.8 1e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 881 147.7 1.2e-35
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 881 147.7 1.2e-35
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 879 147.4 1.4e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 878 147.2 1.6e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 876 146.9 2e-35
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 872 146.3 3e-35
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 872 146.3 3e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 868 145.7 4.6e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 859 144.4 1.3e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 858 144.1 1.3e-34
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 854 143.5 2e-34
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 851 143.1 2.8e-34
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 848 142.6 3.9e-34
>>CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 (325 aa)
initn: 1263 init1: 1263 opt: 2026 Z-score: 1701.1 bits: 323.0 E(32554): 2e-88
Smith-Waterman score: 2026; 97.5% identity (98.2% similar) in 325 aa overlap (1-322:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDASLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 VTT---ECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VTTVTTECFLLATMAYDRYVAICKALLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS33 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLTFKYLGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
>>CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 1762 init1: 1169 opt: 1733 Z-score: 1458.8 bits: 278.1 E(32554): 6.1e-75
Smith-Waterman score: 1733; 87.0% identity (95.5% similar) in 308 aa overlap (17-321:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
::..:::::::::::::.::.::::::::::.:: :::::::::::::::::: .:.::.
CCDS33 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ---VTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
::::::::::::::::::::::::::.:::: :::.::.::..::::::::::.: :
CCDS33 AISVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
:::::::::::::: ::::::::: ::::::::::::::::.:::::::.:::: ..:.:
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
::.:::.::.::: ::::::::::::::::::: :.::::::::.:::::::::::::::
CCDS33 ILKKKSVKGMRKAFSTCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::::::::::::::::::::: :
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKRNDV
290 300 310
>>CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1697 init1: 1077 opt: 1647 Z-score: 1387.6 bits: 265.0 E(32554): 5.7e-71
Smith-Waterman score: 1647; 81.2% identity (93.5% similar) in 309 aa overlap (17-322:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
::..:::::::::::::.::.:::::: .::::::::: :::::::::::::: .::::.
CCDS33 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ---VTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
::::::::::::::::::::::::::.:::: :::.::.::..::.:::::::.: :
CCDS33 AISVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
:::::::::..:.: : ::: :::::::::::::::::.::.:::.: :::.:::..::.
CCDS33 RLTFCNSNIVHHIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
::.::: ::.::: :::::::.::::::::: : :.: ::::::.:::.: ::::::.::
CCDS33 ILKKKSDKGVRKAFSTCGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::.::::::::: .:::::.:..:
CCDS33 LNPIIYSLRNKQVTVSFTKMLKKHVKVSY
290 300 310
>>CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1658 init1: 1065 opt: 1636 Z-score: 1378.5 bits: 263.3 E(32554): 1.8e-70
Smith-Waterman score: 1636; 81.2% identity (92.9% similar) in 309 aa overlap (17-322:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
::..:::::::::::::.::.:::::: .::::::::: :::::::::::::: .::::.
CCDS33 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 ---VTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
::::::::::::::::::::::::::.:::: :::.::.::.:.:.:::::::.: :
CCDS33 AIGVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
:::::::::..:.: : ::: :::::::::::::::::.::.:::.: :::::::..:::
CCDS33 RLTFCNSNIVHHIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
.::::: ::.::: :::::::.:: :::::: . :.: ::::::.:.:.: ::::::.::
CCDS33 VLEKKSDKGVRKAFSTCGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::.::::::::::.:: ::.: ::
CCDS33 LNPIIYSLRNKQVIVSFIKMLKRNVKVSY
290 300 310
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1599 init1: 1062 opt: 1597 Z-score: 1346.2 bits: 257.3 E(32554): 1.2e-68
Smith-Waterman score: 1597; 77.2% identity (92.6% similar) in 312 aa overlap (14-322:3-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
.:.::..:.::::::::::. .::. :.::::.:::::::::. :::
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
::.:::.::.::::::.:::::::::: .:::::::::.:::::..::::::::.::::.
CCDS33 LIALIWNDPQLHIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 V---TTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
. ::::::::::::::::::::::::::::.: :::.::..::.::.:::::::.. :
CCDS33 AFGGTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RLTFCNSNIIQHFYRDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
::::::::::.::: :::::. ::::: :::::::::..::.::::: :.: :::. :::
CCDS33 RLTFCNSNIIHHFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLAFKYLGSASPQADNQDMMESLFYTVIVPL
::.:::..:.::: ::::::::::::::::: : :: ::::::.:::..:.:::.:.::
CCDS33 ILKKKSVRGVRKAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
:::.:::::::::: ::::: : ::
CCDS33 LNPIIYSLRNKQVIDSFTKMVKRNV
290 300 310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1241 init1: 787 opt: 1224 Z-score: 1037.7 bits: 200.2 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1224; 60.3% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (16-319:2-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
.. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE6 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDALLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFF--
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