Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6089
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6089, 325 aa
1>>>pF1KE6089 325 - 325 aa - 325 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5624+/-0.000547; mu= 20.7898+/- 0.034
mean_var=98.2460+/-25.732, 0's: 0 Z-trim(106.4): 333 B-trim: 885 in 1/48
Lambda= 0.129395
statistics sampled from 14079 (14501) to 14079 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1177 231.0 2.6e-60
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1172 230.0 4.9e-60
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1172 230.0 4.9e-60
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1086 214.0 3.3e-55
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1071 211.2 2.3e-54
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 930 184.9 2e-46
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 865 172.7 8.7e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 864 172.5 1e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 861 172.0 1.5e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 860 171.8 1.7e-42
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 854 170.7 3.6e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 838 167.7 2.9e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 838 167.7 2.9e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 838 167.7 2.9e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 833 166.8 5.5e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 817 163.8 4.5e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 161.0 3e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 793 159.3 9.7e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 782 157.2 3.9e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 768 154.6 2.5e-37
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 568 117.3 4.4e-26
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 558 115.4 1.6e-25
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 237 55.7 2.1e-07
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 237 55.7 2.2e-07
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 208 50.1 7.6e-06
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 200 48.7 2.3e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 200 48.8 2.5e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 200 48.8 2.5e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 200 48.8 2.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 191 46.9 6.7e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 189 46.8 0.00011
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 188 46.5 0.00011
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 188 46.5 0.00011
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 188 46.5 0.00011
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 188 46.5 0.00011
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 188 46.5 0.00011
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 188 46.5 0.00011
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 188 46.5 0.00011
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 188 46.5 0.00012
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 188 46.5 0.00012
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 188 46.6 0.00012
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 188 46.6 0.00013
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 188 46.6 0.00013
NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo ( 354) 178 44.5 0.00038
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 176 44.1 0.00047
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 176 44.1 0.00047
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 176 44.3 0.00054
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 174 43.8 0.00066
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 173 43.5 0.00067
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 173 43.6 0.00068
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1170 init1: 1170 opt: 1177 Z-score: 1203.7 bits: 231.0 E(85289): 2.6e-60
Smith-Waterman score: 1177; 55.1% identity (81.5% similar) in 314 aa overlap (12-325:9-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
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XP_011 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1170 init1: 1170 opt: 1172 Z-score: 1198.8 bits: 230.0 E(85289): 4.9e-60
Smith-Waterman score: 1172; 55.1% identity (81.7% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
..:.:. ::::::.::.::::.:: ..:::::.: ..:.::. .:.::::: ..:
XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
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XP_011 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1170 init1: 1170 opt: 1172 Z-score: 1198.8 bits: 230.0 E(85289): 4.9e-60
Smith-Waterman score: 1172; 55.1% identity (81.7% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
..:.:. ::::::.::.::::.:: ..:::::.: ..:.::. .:.::::: ..:
NP_036 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_036 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
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NP_036 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
: ::.:.:::::::::::.::::::.::..::: : :.: . : ...::.::::::.::
NP_036 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
:::::::. .::::.:...: . :.
NP_036 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1083 init1: 1059 opt: 1086 Z-score: 1112.1 bits: 214.0 E(85289): 3.3e-55
Smith-Waterman score: 1086; 52.8% identity (82.7% similar) in 307 aa overlap (14-320:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
:. : : ...:.:::. . : : .:: :::.::::::.:: :::.
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
:.: :..::::::.::.::::.:: ::..::::::.::..:..::: .:.::.:: ..:
NP_001 AVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_001 AGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLT
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pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
: . . .:::::. : .::..::.::.:..::... . .:: . .::: :. ...
NP_001 FSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
.:::.::.:::::::::: :: ::::: .:::. . :: .... ..:....::::.::
NP_001 MSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
:::::::::.::::..:..:
NP_001 FIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1071; 50.6% identity (80.8% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
: :::. .::.:::. .. :.: .:: .::.::::::.:: :::.
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIIL
10 20 30 40
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pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
::: :. ::::.:.:::::::.:. ..:..::::::.:.....::: .:.::.:: . .
NP_002 AISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_002 VALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVT
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pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
::. . ..::.. ::...::. ::. ::. .: ....:: . ..::: ::::.::
NP_002 FCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILR
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
. :.. :.::::::.::: .: :::::. ::. : :. :....:...:::::.::
NP_002 IPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVK-DSVATVMYAVVTPMMNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
::::::::::.::: .:...... :
NP_002 FIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 942 init1: 916 opt: 930 Z-score: 954.6 bits: 184.9 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 930; 46.6% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (18-324:7-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
: : .:::::::: . : : .::..:: .: . .::: ...
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLML
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_006 LIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_006 ADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
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NP_006 YCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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NP_006 IRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_006 LIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 886 init1: 863 opt: 865 Z-score: 889.1 bits: 172.7 E(85289): 8.7e-43
Smith-Waterman score: 865; 42.5% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (18-318:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIII
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_001 LSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLAL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_001 GTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
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NP_001 LCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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NP_001 MQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNP
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_001 LIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 855 init1: 809 opt: 864 Z-score: 888.0 bits: 172.5 E(85289): 1e-42
Smith-Waterman score: 864; 45.5% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (14-320:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFK-QDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLII
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLII
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VAISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIV
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NP_835 LVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 FVVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQL
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NP_835 FGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LFCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVL
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NP_835 PFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAIL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RVSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMIN
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NP_835 KIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLN
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300 310 320
pF1KE6 PFIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_835 PIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 861 init1: 716 opt: 861 Z-score: 885.1 bits: 172.0 E(85289): 1.5e-42
Smith-Waterman score: 861; 42.3% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (14-320:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
:.: ::: .:::.:::. . ..:::...::.:::::.:: :.:
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLIS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
. .:. ::::::.:: :::.::. .: ::. ::.. .... :.. : ... : ..:
NP_003 LVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_003 GCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
. . :.. ::::. :: :. .:: .:...:..:. ....: : . :: :: .:..
NP_003 YRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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NP_003 MKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQ--EKSVSVFYAIVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_003 LIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 914 init1: 846 opt: 860 Z-score: 884.1 bits: 171.8 E(85289): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 860; 41.7% identity (76.3% similar) in 300 aa overlap (18-317:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTFSSFLQIGRNMHQGNQTTITEFILLGFFKQDEHQNLLFVLFLGMYLVTVIGNGLIIV
:....::::.::. :. : :...:..:: .:::. .:: :::.
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIII
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDTYLHTPMYLFLANLSFADISSISNSVPKMLVNIQTKSQSISYESCITQMYFSIVF
: .. ::::::.:: .:. .:: .. .:::: .. :. ..::: .:..:...
NP_001 AKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVIDNLLLGTMAYDHFVAICHPLNYTILMRPRFGILLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_001 LGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCNHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTLINELVLFIVGLSVIIFPFTLSFFSYVCIIRAVLR
::. ::. ::::.. ::: :::: . :::...... ... : : :. .:: :: :.::
NP_001 FCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILR
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTVVLLFYGTIVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMINP
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NP_001 IRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNP
230 240 250 260 270 280
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]