Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6086, 324 aa
1>>>pF1KE6086 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7402+/-0.000507; mu= 20.0038+/- 0.031
mean_var=93.8584+/-22.772, 0's: 0 Z-trim(108.2): 232 B-trim: 1084 in 1/50
Lambda= 0.132385
statistics sampled from 16009 (16296) to 16009 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 5.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 793 162.3 1.2e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 791 161.9 1.6e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 772 158.3 2e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 766 157.1 4.3e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 745 153.1 7e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 745 153.1 7e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 745 153.1 7e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 741 152.3 1.2e-36
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 732 150.6 3.9e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 732 150.6 4e-36
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 731 150.4 4.5e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 719 148.2 2.2e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 710 146.4 7.2e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 699 144.3 3.1e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 696 143.7 4.5e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 690 142.6 9.9e-34
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 689 142.4 1.1e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 681 140.9 3.3e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 674 139.6 8.4e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 572 120.1 6.2e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 542 114.4 3.3e-25
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 209 50.8 4.6e-06
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 183 46.1 0.00021
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 174 44.2 0.00055
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 174 44.2 0.00055
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 172 43.7 0.00064
NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 173 44.0 0.00065
XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077
XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077
XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 171 43.6 0.00077
NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362) 171 43.6 0.00077
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 163 42.0 0.0021
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 161 41.6 0.0028
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 161 41.7 0.003
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 161 41.7 0.0031
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 160 41.4 0.0031
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 161 41.7 0.0032
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 157 41.0 0.0056
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 157 41.0 0.0057
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 154 40.3 0.0071
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 154 40.3 0.0071
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 154 40.3 0.0075
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 154 40.3 0.0075
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 154 40.4 0.0079
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 154 40.4 0.0079
XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 152 39.9 0.0095
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MESPNRTTIQEFI---FSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHT
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLP-TEIQSLL-FLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS
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pF1KE6 PMYTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTV
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300 310 320
pF1KE6 EIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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NP_835 EVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 791; 43.3% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (5-304:6-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESPNRTTIQEFI---FSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLH
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pF1KE6 VMAFDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEH
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pF1KE6 IFCDFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEI-ITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGG
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pF1KE6 RRTAFSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLR
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NP_001 RSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLR
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300 310 320
pF1KE6 NKEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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NP_001 NKEIKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 772; 39.2% identity (71.2% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-306)
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pF1KE6 MESPNRT-TIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPM
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTD---MSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAA
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NP_003 GRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCL
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pF1KE6 RNKEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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NP_003 RNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 680 init1: 241 opt: 745 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37
Smith-Waterman score: 745; 37.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303)
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pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
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pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSI--VLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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NP_036 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
: .:
NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 680 init1: 241 opt: 745 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37
Smith-Waterman score: 745; 37.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303)
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pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSI--VLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
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XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
: .:
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 680 init1: 241 opt: 745 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37
Smith-Waterman score: 745; 37.7% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSI--VLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
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XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
: .:
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 728 init1: 316 opt: 741 Z-score: 779.0 bits: 152.3 E(85289): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 741; 38.4% identity (69.5% similar) in 305 aa overlap (5-307:8-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVK-SVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLH
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFS-NWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLH
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pF1KE6 TPMYTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLS-ERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLT
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NP_001 TPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
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pF1KE6 VMAFDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE6 IFCDFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGR
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMI--TSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGL
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pF1KE6 RTAFSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRN
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NP_001 QKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRN
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300 310 320
pF1KE6 KEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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NP_001 KVVRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 557 init1: 308 opt: 732 Z-score: 769.7 bits: 150.6 E(85289): 3.9e-36
Smith-Waterman score: 732; 38.0% identity (69.0% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
: . :.....::.. .. . .. . :: .: .: :.:::.:: :.... ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSS-LLSERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE--GALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
190 200 210 220 230
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pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
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XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
:.:: .: .. :::
XP_011 GALKKVVG--RVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 557 init1: 308 opt: 732 Z-score: 769.7 bits: 150.6 E(85289): 3.9e-36
Smith-Waterman score: 732; 38.0% identity (69.0% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
: . :.....::.. .. . .. . :: .: .: :.:::.:: :.... ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSS-LLSERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
:.: :::..: .. .:.::::.. .: ..::: ::: :::: . ::.:::.
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
::..:.: :::: . :: .::. :. . : . .. : . .. : ::..: . :.:::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
:.:.:.:.::. .: . . :. .:: . :. :: :. ..:.. :. :: ::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSE--GALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
::: ::. : ::.... .:. ...: : .. ..:..:..::.::::::. .:
NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
:.:: .: .. :::
NP_036 GALKKVVG--RVVFSV
300 310
324 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:22:43 2016 done: Tue Nov 8 09:22:44 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]