Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6086, 324 aa
1>>>pF1KE6086 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3206+/-0.00122; mu= 16.5860+/- 0.072
mean_var=152.1036+/-48.227, 0's: 0 Z-trim(102.7): 367 B-trim: 429 in 1/48
Lambda= 0.103993
statistics sampled from 6661 (7086) to 6661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 1.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 2153 335.6 3.2e-92
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 1300 207.7 1.1e-53
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 1237 198.2 7.3e-51
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1090 176.1 3.2e-44
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 1072 173.4 2.1e-43
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 860 141.6 7.7e-34
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 842 138.9 5.1e-33
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 833 137.6 1.3e-32
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 833 137.6 1.3e-32
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 833 137.6 1.4e-32
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 828 136.8 2.2e-32
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 827 136.7 2.4e-32
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 826 136.5 2.7e-32
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 826 136.5 2.7e-32
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 826 136.5 2.7e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 824 136.2 3.4e-32
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 821 135.8 4.6e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 820 135.6 5e-32
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 817 135.2 6.8e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 815 134.9 8.4e-32
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 815 134.9 8.7e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 813 134.6 1e-31
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 812 134.4 1.1e-31
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 810 134.1 1.4e-31
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 807 133.7 1.9e-31
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 807 133.7 1.9e-31
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 807 133.7 1.9e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 807 133.7 2e-31
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 804 133.2 2.6e-31
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 803 133.1 2.9e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 803 133.1 2.9e-31
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 802 132.9 3.3e-31
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 799 132.5 4.4e-31
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 793 131.6 8.3e-31
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 791 131.3 1e-30
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 788 130.8 1.4e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 788 130.8 1.4e-30
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 787 130.7 1.5e-30
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 787 130.7 1.6e-30
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 786 130.5 1.7e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 786 130.6 1.8e-30
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 785 130.4 1.9e-30
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 784 130.2 2.1e-30
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 783 130.1 2.3e-30
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 783 130.1 2.4e-30
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 782 129.9 2.6e-30
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 781 129.8 2.8e-30
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 781 129.8 2.8e-30
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 780 129.6 3.2e-30
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 778 129.3 3.9e-30
>>CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 2153 init1: 2153 opt: 2153 Z-score: 1769.2 bits: 335.6 E(32554): 3.2e-92
Smith-Waterman score: 2153; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSERSISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAFD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 HYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIKE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 AIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
310 320
>>CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 (343 aa)
initn: 1008 init1: 574 opt: 1300 Z-score: 1077.3 bits: 207.7 E(32554): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1300; 62.7% identity (85.1% similar) in 303 aa overlap (3-304:31-330)
10 20 30
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLL
: :.: . ::.:: ::.. ... :.:::
CCDS30 MKQYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAHRGGLLFFIPLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 FIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMYTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSE-RSI
.::.::..:::... :.:.. ::::.: :::.:::::: :::.::::::: :.:: .::
CCDS30 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAFDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCG
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CCDS30 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 FITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCDFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITA
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CCDS30 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVV---IVDAIHAAEIVAS
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAFSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFW
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CCDS30 FLVIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE6 DIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIKEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
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CCDS30 DTAIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
300 310 320 330 340
>>CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 826 init1: 460 opt: 1237 Z-score: 1026.6 bits: 198.2 E(32554): 7.3e-51
Smith-Waterman score: 1237; 60.2% identity (81.8% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
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CCDS30 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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CCDS30 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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CCDS30 DRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
..::: :::::: :: . :::::: :: . ..: .:: ::.::::: :. ::. ::
CCDS30 LVPVLSLACTDTS---MILIEDVIHAVTIIITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
:::..:..:: .:::::.::::::: :: : :::: :.::.:::::::::::::...
CCDS30 STCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMN
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
.:::: . :.. .::
CCDS30 NAIKKLFCLQKVL--NKPGG
300 310
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 824 init1: 478 opt: 1090 Z-score: 907.5 bits: 176.1 E(32554): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 1090; 51.8% identity (79.9% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
:.. : . . :::. .::. .. :. ::.:: . :.:::.:. :: :...::::::
CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
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CCDS30 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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CCDS30 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
: ::: :::::: :... ::.. .:... .::. :: :. ..::: ::.:.: :.
CCDS30 FPPVLSLACTDTSINVLVDF--VINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAI
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
:::.::: : .:.::. ::.... .::: .: :.:....::.::.::.::::::::::
CCDS30 STCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
::..... . :.
CCDS30 EAVRRQLKRIGILA
300 310
>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 819 init1: 472 opt: 1072 Z-score: 892.8 bits: 173.4 E(32554): 2.1e-43
Smith-Waterman score: 1072; 51.0% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFP-YSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPM
:.. :.... ::.: .: ..:.. . :: ::. : : . ::..:..:..:.. :::::
CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWL-FVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YTFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMA
: :.:.:::::.:::..:::::::..:::. .::: ::::: ::::: : : :::.::
CCDS30 YHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 FDHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFC
.:.::::: ::::: ::: ::.... .: .:::. :. :. : ::::. :...::::
CCDS30 YDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DFLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTA
:: :.: ::: :: : .... .:.: :. . ..:..:: :....:.:..:.::. :
CCDS30 DFPPLLSLACKDTSANILVDF--AINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEI
::::.::. : .::::. .::.:.. .::: : ..:....::.:. ::::::::::::
CCDS30 FSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 KEAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
.:::. : :
CCDS30 IKAIKRTIFQKGDKASLAHL
300 310
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 859 init1: 361 opt: 860 Z-score: 721.0 bits: 141.6 E(32554): 7.7e-34
Smith-Waterman score: 860; 44.8% identity (72.9% similar) in 310 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
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CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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180 190 200 210 220 230
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CCDS31 IAPWIALACTNTQAVELVAF--VIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAF
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CCDS31 STCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVR
240 250 260 270 280 290
300 310 320
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CCDS31 ETLLKKWKGK
300
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10 20 30 40
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CCDS32 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
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CCDS32 AVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTP
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CCDS32 LFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
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CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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CCDS32 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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CCDS32 GPNIIDHFLCDMDPLMALSCAP--APITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQ
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CCDS32 VPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYV--SPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLF
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CCDS32 NPLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGF-HGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLG
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CCDS32 NGAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQF
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CCDS32 NINLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTGFILLGFPCPREGQILLFVLF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]