Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6085
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6085, 324 aa
1>>>pF1KE6085 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9416+/-0.00123; mu= 11.6056+/- 0.072
mean_var=145.7946+/-53.031, 0's: 0 Z-trim(102.4): 373 B-trim: 867 in 2/43
Lambda= 0.106219
statistics sampled from 6453 (6948) to 6453 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 1.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 2129 339.0 3.2e-93
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1229 201.0 1e-51
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1216 199.0 4.1e-51
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1141 187.5 1.2e-47
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1111 182.9 2.8e-46
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1057 174.7 8.8e-44
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1042 172.4 4.3e-43
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1039 171.9 5.9e-43
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1017 168.5 6.1e-42
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1011 167.6 1.2e-41
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 996 165.4 6e-41
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 992 164.7 8.7e-41
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 985 163.6 1.8e-40
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 982 163.2 2.5e-40
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 972 161.6 7.3e-40
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 963 160.2 1.9e-39
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 962 160.1 2.1e-39
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 962 160.1 2.2e-39
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 956 159.2 4e-39
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 939 156.6 2.5e-38
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 938 156.4 2.7e-38
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 937 156.3 3.1e-38
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 934 155.8 4.1e-38
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 931 155.4 5.8e-38
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 928 154.9 7.9e-38
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 925 154.4 1.1e-37
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 919 153.6 2.2e-37
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 913 152.6 4e-37
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 909 152.0 5.9e-37
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 899 150.5 1.7e-36
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 888 148.8 5.5e-36
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 883 148.0 9.3e-36
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 882 147.9 1.1e-35
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 873 146.5 2.7e-35
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 872 146.3 3e-35
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 840 141.4 9e-34
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 808 136.5 2.7e-32
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 789 133.6 2e-31
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 785 133.0 3.2e-31
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 783 132.7 4.1e-31
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 767 130.2 2.1e-30
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 714 122.1 5.9e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 708 121.2 1.1e-27
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 652 112.7 4.6e-25
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 649 112.1 5.9e-25
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 648 112.0 6.5e-25
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 640 110.8 1.5e-24
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 636 110.1 2.3e-24
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 606 105.5 5.6e-23
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 600 104.6 1.1e-22
>>CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2129 init1: 2129 opt: 2129 Z-score: 1787.2 bits: 339.0 E(32554): 3.2e-93
Smith-Waterman score: 2129; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTSLLHVVMANTYLLLPPVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTSLLHVVMANTYLLLPPVVN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 PLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
310 320
>>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1195 init1: 965 opt: 1229 Z-score: 1041.9 bits: 201.0 E(32554): 1e-51
Smith-Waterman score: 1229; 57.9% identity (84.2% similar) in 311 aa overlap (10-319:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
... ::: :.::.:.:.::: .:::::::: .: .:.::::::.
CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGL-EEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
:.:.:. ::::::.:: ::: ::...:. .:::: ..: .. :.:. :: ::: ::.:
CCDS31 IVRTEHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
:..::.:::::::::.::::::::::.::: :.:::..:..:: ... ::: ..: :
CCDS31 SGMESTVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
.:... ..::.:::::.:::.: : ::::::::..:.:..:.:::.:.:::.::: .::
CCDS31 FCRSNILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPT-SLLHVVMANTYLLLPPVV
:. :.: :::.::.::.:::..::::.::::.:::.. : : :..:: :::.:::.
CCDS31 LT-REAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVL
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
::.:::.::::: .:.: .:
CCDS31 NPIVYGVKTKEIRQRILRLFHVATHASEP
290 300 310
>>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1207 init1: 1008 opt: 1216 Z-score: 1031.1 bits: 199.0 E(32554): 4.1e-51
Smith-Waterman score: 1216; 58.6% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (14-319:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
:. :..::. :.:.::::: :::..::: ::..: .:: .:.
CCDS77 MSSCNFTHAT-FVLIGIPGL-EKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVF
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
:.:.:: :: :::::: ::..:::.::. ::::. .:: . .:: :. ::.:::.::::
CCDS77 IVRTERSLHAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHAL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
::.::..::::::::.::::::::::.::.. ..:.::. :..:: .::::::...: :.
CCDS77 SAIESTILLAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
.:......::.:.:::.:::. .:: :::::: :: ::::: .::..::.::. .::.
CCDS77 FCHSNVLSHSYCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE6 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTS-LLHVVMANTYLLLPPVV
: :. :::.::.::. .::.:::::::::::::.:. ...:::.. :::::::.
CCDS77 LPSKSERAKAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
::..::::::.: .::: ::
CCDS77 NPIIYGAKTKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
290 300 310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1055 init1: 965 opt: 1141 Z-score: 969.1 bits: 187.5 E(32554): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 1141; 54.7% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (21-319:14-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
.: ::: ::::: .:.:...:::::: .. :: ::..
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGL-ERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
::..:: :::::::::.::. ::: :: :.: . ..: .: .:: . :.::.:.:: .
CCDS31 IIKTERSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
: .::.:::.:::::::::::::...:.::. ....::: .: :. ...:::::.:: .
CCDS31 SFLESSVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
:: . ...::.::::..:::.:.: ..: .::.:.:.:..:.:::.: ::: ::: .::
CCDS31 YCGSPVLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTS-LLHVVMANTYLLLPPVV
..:: .::.:::.::.::::.::.:.:::::.::.: . :..:::. :::.:::.
CCDS31 IASRAERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVM
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
::.::..:::.: .:: :
CCDS31 NPIVYSVKTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1158 init1: 906 opt: 1111 Z-score: 944.3 bits: 182.9 E(32554): 2.8e-46
Smith-Waterman score: 1111; 52.3% identity (80.3% similar) in 304 aa overlap (17-319:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
:..: :.:::.::::: . : ::. ::: :::.: :: .:.
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGL-ESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
.::: :::::: ::.::: :...: :.: . : .. ..: :. :: :::::: .
CCDS31 AVRVEPSLHEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
: .::..::::.:::.:::: :::.:.::: ..: .::.: .:.:. .:::::..: :
CCDS31 SMMESGILLAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
:......::.::: :.:.:.:.: .: .::::...:..:.: .:: .::.::: .:.
CCDS31 ICRSNVLSHSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE6 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTS-LLHVVMANTYLLLPPVV
.::. :::.:::.::. :::.::::.::.:.:::.: . .::.:.:.::..:::.
CCDS31 TASREERLKALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
:::.:.:::::: .. ::
CCDS31 NPLIYSAKTKEIRRAIFRMFHHIKI
290 300 310
>>CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1044 init1: 872 opt: 1057 Z-score: 899.5 bits: 174.7 E(32554): 8.8e-44
Smith-Waterman score: 1057; 49.8% identity (80.6% similar) in 309 aa overlap (14-321:4-311)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 VIWIESSLHQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTF
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CCDS31 NPIVYSVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
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CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGL-EHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLL
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CCDS31 IIQADAALHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSF
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CCDS31 SIMESAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFH
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CCDS31 YCRGPVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLL
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CCDS31 LASQEARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMV
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CCDS31 NPIIYGVKTKQIRESILGVFPRKDM
290 300 310
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGL-EYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILF
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CCDS31 IIKTEPSLHEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGF
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CCDS31 SVLESSVLLIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLR
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CCDS31 YCKKNQLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLG
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CCDS31 IASKKEQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLT
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CCDS31 NPIVYCVKTKQIRVRVVAKLCQRKI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]