FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6083, 324 aa
1>>>pF1KE6083 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7411+/-0.00119; mu= 13.5023+/- 0.070
mean_var=164.1064+/-55.189, 0's: 0 Z-trim(103.0): 366 B-trim: 424 in 1/50
Lambda= 0.100118
statistics sampled from 6778 (7211) to 6778 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 2084 314.0 1.1e-85
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 1377 211.8 5.8e-55
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 1100 171.8 6.4e-43
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 1077 168.6 6.9e-42
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 1064 166.6 2.3e-41
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 1038 162.9 3.1e-40
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 805 129.2 4.3e-30
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 805 129.2 4.3e-30
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 795 127.8 1.2e-29
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 784 126.2 3.5e-29
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 774 124.7 9.5e-29
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 773 124.6 1e-28
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 765 123.5 2.4e-28
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 764 123.3 2.6e-28
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 762 123.0 3.2e-28
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 758 122.4 4.7e-28
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 751 121.4 9.4e-28
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 749 121.1 1.2e-27
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 745 120.5 1.7e-27
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 738 119.5 3.5e-27
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 735 119.1 4.7e-27
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 732 118.7 6.5e-27
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 723 117.4 1.6e-26
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 722 117.2 1.7e-26
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 721 117.1 1.9e-26
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 719 116.8 2.3e-26
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 719 116.8 2.3e-26
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 717 116.5 2.8e-26
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 717 116.5 2.8e-26
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 717 116.5 2.9e-26
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 715 116.2 3.5e-26
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 714 116.1 3.9e-26
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 713 115.9 4.3e-26
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 711 115.7 5.5e-26
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 706 114.9 8.9e-26
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 703 114.5 1.2e-25
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 699 113.9 1.7e-25
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 697 113.6 2.1e-25
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 697 113.6 2.1e-25
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 693 113.0 3.1e-25
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 692 112.9 3.5e-25
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 690 112.6 4.2e-25
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 678 110.9 1.4e-24
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 659 108.2 1e-23
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 624 103.1 3.2e-22
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 623 102.9 3.5e-22
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 617 102.0 6.3e-22
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 608 100.7 1.6e-21
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 596 99.0 5.3e-21
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 592 98.4 7.7e-21
>>CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2084 init1: 2084 opt: 2084 Z-score: 1652.1 bits: 314.0 E(32554): 1.1e-85
Smith-Waterman score: 2084; 99.7% identity (99.7% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS31 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPECFAQIYAIHFFVGME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPTVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPTVY
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 ALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
310 320
>>CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1357 init1: 1175 opt: 1377 Z-score: 1100.3 bits: 211.8 E(32554): 5.8e-55
Smith-Waterman score: 1377; 66.0% identity (87.5% similar) in 312 aa overlap (4-315:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
:..: ... .:..:.:.:::.:.:::: :::::::::.:::: ::.:: ::.: : .
CCDS31 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
. :..::: .:::: .::.::::::.::::::::::::.:::: :::::::: : .:
CCDS31 ETVLHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
:::.:::: :::.:::.::.::::::.....::: :..:::::.. :::.::::: :::.
CCDS31 SGIFLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
::::::::::::: :::::: :.. ::.:::. .:::..:.. :: .::.::::::::
CCDS31 NEIEHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPTVY
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CCDS31 EAMSKALSTCSSHLILILF-HTGIIVLSVTHLAEKKIPLIPVFLNVLHNVIPPALNPLAC
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
::. ..:: .::..:
CCDS31 ALRMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
300 310
>>CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1098 init1: 965 opt: 1100 Z-score: 884.1 bits: 171.8 E(32554): 6.4e-43
Smith-Waterman score: 1100; 52.3% identity (82.4% similar) in 306 aa overlap (11-315:9-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
:::: ::::.:. ::...::::::::::.::.: :..::: .:: :
CCDS31 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
. ::.::.: .:..: ..:. : :.:::.:::::.: . ::.: : :.. .. :. ::
CCDS31 EASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
: .. ::.:::::::::::::::.:.... ::..:.:.::.:...:.:.:.. ::..
CCDS31 SCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
: ::.:.:.::.:. :.::. : : :.: .: .:::: ::.::: .:: .:::...
CCDS31 NVIENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATL-IPVLLNVLHNIIPPSLNPTV
::.::::::.::. ::::: ::..:. .:.... :. . : .::::::..:::.::: :
CCDS31 GAAVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
:...:::.. ..::.:
CCDS31 YGVRTKEIKQGIQKLLQRGR
300 310
>>CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 (365 aa)
initn: 1088 init1: 942 opt: 1077 Z-score: 865.5 bits: 168.6 E(32554): 6.9e-42
Smith-Waterman score: 1077; 50.7% identity (81.0% similar) in 306 aa overlap (11-315:57-362)
10 20 30 40
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPL
::.: ::::.:. ::...::::::::::
CCDS31 MYFLCFCTSLLRFKVHWVSRLIRKLYMASPSNDSTAPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPL
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 ALLYLSALAANTLILIIIWQNPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKV
.::.: :..::: .:: : . ::.::.: .:..: ..:. : :.:::.::::::: .
CCDS31 SLLFLLAMGANTTLLITIQLEASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWFDLRS
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 ISLPERFAQIYAIHFFVGMESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLR
::.: : :.. .. :. ::: .. ::.:::::::::::::::.:.... .:..:.. :
CCDS31 ISFPACFLQMFIMNSFLTMESCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDQFVARAVVFVIAR
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 NGLFVTPVPVLAAQRDYCSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDL
:.. :::.:.:. ::. : :..:.::::.:..:.::: :.. :.: .: .::::
CCDS31 NAFVSLPVPMLSARLRYCAGNIIKNCICSNLSVSKLSCDDITFNQLYQFVAGWTLLGSDL
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270
pF1KE6 SLIILSYILILYSVLRLNSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATL-
::..:: .:: :::... :.:::::::.::. ::::: :...:. .:.:.. .
CCDS31 ILIVISYSFILKVVLRIKAEGAVAKALSTCGSHFILILFFSTVLLVLVITNLARKRIPPD
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE6 IPVLLNVLHNIIPPSLNPTVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
.:.:::.::..:::.::: ::...:::.. ..:..:
CCDS31 VPILLNILHHLIPPALNPIVYGVRTKEIKQGIQNLLKRL
330 340 350 360
>>CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1067 init1: 922 opt: 1064 Z-score: 856.0 bits: 166.6 E(32554): 2.3e-41
Smith-Waterman score: 1064; 50.7% identity (81.3% similar) in 300 aa overlap (17-315:12-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
..:.:.: : ::::::::::.::.: :..::: .:. ::
CCDS41 MTTHRNDTLSTEASDFLLNCFVRSPSWQHWLSLPLSLLFLLAVGANTTLLMTIWL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
. ::.::.: .:..: ..:. : :.:::.:.::::: . ::.: : :.: .. :..::
CCDS41 EASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLTIFWFDLRPISFPACFLQMYIMNCFLAME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
: .. ::.:::::::::::::::.:. ...::..:.. :: :.. :.:.:.:: ::..
CCDS41 SCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDHFVVKAAMFILTRNVLMTLPIPILSAQLRYCGR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
: ::.:.:.:..:. :.::: : . :.. .: .:::: ::.::: .:: .::::..
CCDS41 NVIENCICANMSVSRLSCDDVTINHLYQFAGGWTLLGSDLILIFLSYTFILRAVLRLKAE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATL-IPVLLNVLHNIIPPSLNPTV
:.:::::::.::. ::::: ::..:. .::... :.. .::::::::..:: .::: .
CCDS41 GAVAKALSTCGSHFMLILFFSTILLVFVLTHVAKKKVSPDVPVLLNVLHHVIPAALNPII
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
:...:.:.. ..:..:
CCDS41 YGVRTQEIKQGMQRLLKKGC
300 310
>>CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1024 init1: 903 opt: 1038 Z-score: 835.7 bits: 162.9 E(32554): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 1038; 48.0% identity (81.4% similar) in 306 aa overlap (11-315:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
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CCDS73 SCTFMIMAYDRYVAICKPLQYSSIITDQFVARAAIFVVARNGLLTMPIPILSSRLRYCAG
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CCDS73 HIIKNCICTNVSVSKLSCDDITLNQSYQFVIGWTLLGSDLILIVLSYFFILKTVLRIKGE
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CCDS73 GDMAKALGTCGSHFILILFFTTVLLVLVITNLARKRIPPDVPILLNILHHLIPPALNPIV
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300 310
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CCDS31 ESSLHQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLE
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CCDS31 YSVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
300 310
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CCDS31 EHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGME
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CCDS31 STVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRS
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300 310
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CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQA
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CCDS31 DAALHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIME
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CCDS31 PVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQ
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CCDS31 EARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPII
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CCDS31 MLPSNITSTHPAVFLLVGIPGLEHLHAWISIPFCFAYTLALLGNCTLLFIIQA
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