Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6082
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6082, 324 aa
1>>>pF1KE6082 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3577+/-0.0011; mu= 15.5102+/- 0.065
mean_var=145.4508+/-49.414, 0's: 0 Z-trim(103.4): 371 B-trim: 434 in 1/45
Lambda= 0.106345
statistics sampled from 6939 (7389) to 6939 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 1.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 2174 346.1 2.3e-95
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1562 252.2 4.2e-67
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1521 245.9 3.3e-65
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1520 245.7 3.6e-65
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1116 183.7 1.6e-46
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1092 180.0 2.1e-45
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1084 178.8 5e-45
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1081 178.4 6.9e-45
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1067 176.3 3.2e-44
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1064 175.7 4.2e-44
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1063 175.6 4.6e-44
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1051 173.8 1.7e-43
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1051 173.8 1.7e-43
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1050 173.6 1.9e-43
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1045 172.8 3.1e-43
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1040 172.1 5.3e-43
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1031 170.7 1.4e-42
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1030 170.5 1.5e-42
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1020 169.0 4.5e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1015 168.2 7.6e-42
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 999 165.8 4.1e-41
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 996 165.4 5.9e-41
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 991 164.5 9.7e-41
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 988 164.1 1.3e-40
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 976 162.2 4.8e-40
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 962 160.1 2.2e-39
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 936 156.1 3.4e-38
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 933 155.6 4.6e-38
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 929 155.0 7.1e-38
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 922 154.0 1.5e-37
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 918 153.3 2.3e-37
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 917 153.2 2.5e-37
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 867 145.5 5.2e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 860 144.5 1.1e-34
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 852 143.3 2.7e-34
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 833 140.3 2e-33
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 831 140.0 2.4e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 830 139.9 2.8e-33
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 822 138.6 6.2e-33
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 759 129.0 5.5e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 753 128.0 9.6e-30
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 744 126.6 2.5e-29
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 729 124.3 1.2e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 724 123.6 2.1e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 720 123.0 3.2e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 703 120.4 2e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 692 118.7 6.3e-27
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 640 110.7 1.6e-24
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 621 107.8 1.3e-23
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 614 106.7 2.5e-23
>>CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2174 init1: 2174 opt: 2174 Z-score: 1825.6 bits: 346.1 E(32554): 2.3e-95
Smith-Waterman score: 2174; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
310 320
>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1562 init1: 1304 opt: 1562 Z-score: 1318.2 bits: 252.2 E(32554): 4.2e-67
Smith-Waterman score: 1562; 73.6% identity (91.5% similar) in 307 aa overlap (15-321:9-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
.:: :::::.:::: .:.:::::.: :::: .::: ::. :: .:
CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
:.::.:::.:.. ::. :. ::: .:: ::::::.::::.:::::::::::: .::.:
CCDS31 EALHRPMYYFLA-LLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
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CCDS31 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
:.: :::::::::.:.::...:::.:::::::::::::::::::.:::.::.:..::::.
CCDS31 NFIPHTYCDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
:::.:::::::.:. .:.:::: ::::::.::: ::.:: .::::::::::::::.:::
CCDS31 DARHKAFSTCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPI
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
:::::::::...::::. :::
CCDS31 VYGVKTKQIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
300 310 320
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1566 init1: 1257 opt: 1521 Z-score: 1284.2 bits: 245.9 E(32554): 3.3e-65
Smith-Waterman score: 1521; 70.2% identity (91.1% similar) in 305 aa overlap (17-321:11-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
: ::::::.:::: ...:::.:.:.::.. .::: ::.:::.::
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
..::.:::.:.. ::. ::. :..:.:.::::::: ::.:.:. ::.::::.: :::.:
CCDS44 DALHKPMYYFLAM-LSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
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CCDS44 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
::. :::::::::.::::...:::.:::::::::: ::: ::. :::.::.:..::::.
CCDS44 NILPHTYCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
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CCDS44 DARQKAFNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPI
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
:::::::::: ::....:.:
CCDS44 VYGVKTKQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
300 310 320
>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1518 init1: 1247 opt: 1520 Z-score: 1283.4 bits: 245.7 E(32554): 3.6e-65
Smith-Waterman score: 1520; 71.3% identity (90.9% similar) in 307 aa overlap (15-321:9-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
.:: ::::::::::: ::.:::.:::::: : ..::.::.:::: .
CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
:.::.::: :.. ::. :.: ::.::::.: :.::.::::.:.:::::::::: :::.:
CCDS31 EALHRPMYVFLA-LLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
::::::::::. ::::.:::::: ::: .:::: . ::::::.:.:: ::.::::.:..
CCDS31 SGVLMLMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
:.: :::::::::.:.::....::.::::.:::::: ::: ::..:::.::.:..::::.
CCDS31 NVIPHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
:::::::::::::. ::..::::::::::.:.::::::: .:::.::::::.:::.:::
CCDS31 DARQKAFSTCTAHFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPI
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
::::::.:.:.:::.:: :
CCDS31 VYGVKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
300 310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1109 init1: 520 opt: 1116 Z-score: 948.5 bits: 183.7 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1116; 50.6% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (11-317:2-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTI---HVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLI
:.: : :: :.: :::::. .:.:::.:.: .:.: .:::. ....:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYEESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFT
:.:::.::..:.. ::.::: :.:.:. : ::::.:.::.:..:: ::::.: ::
CCDS31 KTEHSLHQPMFYFLAM-LSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GVESGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPF
:.:. .:..:: ::.:::: ::.:. ::: :. .. :...:. :: ::. ::::
CCDS31 GMETVLLVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CQSNIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISL
: ::. ::::.: ... :.:: ::.:.:::::: : . :. :. ::.:::.:.. :
CCDS31 CGHNIVPHTYCEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYI-IVDVILIASSYVLILRAVFRL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SSSDARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTL
:.:.: :::.:: .:. ... :.::::.:..:::: ..:: .::..::::...::.:
CCDS31 PSQDVRLKAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFG-QNIPHYIHILLANLYVVVPPAL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 NPIVYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
::..:::.:::::....:.:
CCDS31 NPVIYGVRTKQIREQIVKIFVQKE
290 300 310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1128 init1: 541 opt: 1092 Z-score: 928.7 bits: 180.0 E(32554): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1092; 50.8% identity (81.1% similar) in 301 aa overlap (17-317:11-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
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70 80 90 100 110 120
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CCDS31 QTLREPMFYFLA-ILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGME
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310 320
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CCDS31 IYGVRTKQIRERVLYVFTKK
300 310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMD
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CCDS31 NALHAPMYLFLC-LLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALE
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CCDS31 SSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGH
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CCDS31 DAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPI
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310 320
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CCDS31 LYGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
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10 20 30 40 50 60
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CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVME
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CCDS53 RNLHVPMYFFLSM-LAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVG-
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CCDS53 ESAILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCL
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CCDS53 TNIVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPS
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CCDS53 QDARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFG-RNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNP
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CCDS53 IVYGVKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
300 310 320
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CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSM-LSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLH
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CCDS31 GFTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKR
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CCDS31 LSFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSV
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CCDS31 LSIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYG-HSAPPFVHIIMANVFLLIP
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTE
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CCDS31 QSLHEPMYYFLAM-LDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAME
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]