Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6081
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6081, 324 aa
1>>>pF1KE6081 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7269+/-0.00135; mu= 13.4048+/- 0.079
mean_var=105.6744+/-29.930, 0's: 0 Z-trim(100.6): 377 B-trim: 681 in 2/46
Lambda= 0.124764
statistics sampled from 5756 (6197) to 5756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 2092 388.1 5.1e-108
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1182 224.3 1e-58
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1156 219.6 2.6e-57
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1102 209.9 2.2e-54
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1087 207.2 1.6e-53
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1086 207.0 1.6e-53
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1081 206.1 3e-53
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1081 206.1 3.1e-53
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1074 204.8 7.2e-53
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1074 204.9 7.6e-53
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1068 203.8 1.5e-52
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1067 203.6 1.8e-52
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1065 203.2 2.3e-52
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1058 202.0 5.3e-52
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1051 200.7 1.3e-51
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1050 200.5 1.4e-51
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1049 200.3 1.6e-51
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1041 198.9 4.4e-51
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1039 198.5 5.7e-51
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1036 198.0 8.5e-51
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1033 197.5 1.2e-50
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1032 197.3 1.4e-50
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1032 197.3 1.4e-50
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1028 196.6 2.2e-50
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1028 196.6 2.2e-50
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1020 195.1 6.1e-50
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1019 194.9 6.9e-50
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1016 194.4 1e-49
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1015 194.2 1.1e-49
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1007 192.8 3.1e-49
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1005 192.4 3.9e-49
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1000 191.5 7.5e-49
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 998 191.2 9.4e-49
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 998 191.2 1e-48
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 996 190.8 1.2e-48
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 995 190.6 1.4e-48
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 995 190.6 1.4e-48
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 994 190.4 1.5e-48
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 994 190.4 1.6e-48
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 993 190.2 1.7e-48
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 992 190.1 2e-48
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 985 188.8 4.8e-48
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 983 188.5 6.2e-48
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 980 187.9 9e-48
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 979 187.7 1e-47
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 977 187.4 1.3e-47
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 976 187.2 1.5e-47
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 975 187.0 1.7e-47
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 974 186.9 2e-47
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 973 186.7 2.1e-47
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 2052.7 bits: 388.1 E(32554): 5.1e-108
Smith-Waterman score: 2092; 99.7% identity (99.7% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
310 320
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1203 init1: 1181 opt: 1182 Z-score: 1167.7 bits: 224.3 E(32554): 1e-58
Smith-Waterman score: 1182; 56.1% identity (83.5% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIP
. :::. :::...:: :...:::.:: .:.. ..::: :..:. :. :: :
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAM
::.:::::::.:. . :.::::.:::. :::: ::::::..:: .:::.: .:::::
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFF
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTF
::.:::: :::::: ::. :: . : .. :..:.:::: ::..::.:.: .::.:::
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVK
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CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 NALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
.: .:.:
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1185 init1: 1150 opt: 1156 Z-score: 1142.4 bits: 219.6 E(32554): 2.6e-57
Smith-Waterman score: 1156; 55.1% identity (84.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:11-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSS
: : ::::..:..: :. .:: .:::.: .::::. .:.:..:.
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LQIPMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLI
:. :::.:::.:::.: : :...:::::.:..: :.:: .::: :..::.:: .::..
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LAAMAYDLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIV
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CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NHFFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGR
:::.:: :::: :::.::..: ....:. ::: : ....:::.::.:.::.. : ::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRN
:.::::::.:.:::.:.:..:::::.::.:::.. ::::.:::::..:..::.:::..:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
::::.::::.:
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1090 init1: 1070 opt: 1102 Z-score: 1089.9 bits: 209.9 E(32554): 2.2e-54
Smith-Waterman score: 1102; 55.2% identity (82.6% similar) in 299 aa overlap (10-308:10-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
:.:...:.:. ..:::: ::: :: ... .:. .:.:. .. .:. :::
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
.:::.::: :. ::: ::::...::. ::: ::::::.. : :::.:::.:..::.
CCDS31 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
: : :: ::::::. :: ::: ... .:. : . .:.:. :.::: ::::: .::::::
CCDS31 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
::::: :: .:::.:.:.::.. .::. ::. .:::: :...:: :.:. :: :..::
CCDS31 IPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
:.::: ::..: :.:::::..:..::::: ::....:::.: ::.::.:::.::::::.:
CCDS31 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
:::: ..:
CCDS31 LKKLKNKILF
310
>>CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 (362 aa)
initn: 1098 init1: 1078 opt: 1087 Z-score: 1074.5 bits: 207.2 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1087; 52.1% identity (81.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:52-358)
10 20 30
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLV
: .: .. :: ..:.: :. ::.:
CCDS32 LGRIKPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVV
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 FLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRK
:: .:: :..::.....:......:. ::: .:..:::::. :....:. :.::::.::
CCDS32 FLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAKRK
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAYDLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYF
:: .:: ::::.:.:: .:: ..:::::: ::::::::::.:.:: .::. .:: .:
CCDS32 VISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGSYS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTST
.: .::.:. : :.:::...:.::::: ::.:.:::.::.. ..::: . .: :
CCDS32 AGFLNSLIHTGCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLLSC
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDT
..:.:::: :: :.:...:. :: :.:::::::: :. ::.:. :::::.: .::::
CCDS32 TLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSLTQ
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE6 DKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
:..:::.::::.:..::..::.::::::.:: :. :
CCDS32 DRTVAVIYTVVIPVLNPLMYSLRNKDVKKALIKVWGRKTME
330 340 350 360
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1099 init1: 687 opt: 1086 Z-score: 1074.4 bits: 207.0 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1086; 52.3% identity (82.6% similar) in 304 aa overlap (5-308:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
: : :::...:.:: :.. :.:.::..: .:..:: ...... .: :. :::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVF-VAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
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300
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
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CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVR-----NWFINKL
310 320
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