Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6077
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6077, 323 aa
1>>>pF1KE6077 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6105+/-0.000946; mu= 14.9675+/- 0.056
mean_var=165.1166+/-53.467, 0's: 0 Z-trim(107.1): 381 B-trim: 513 in 1/49
Lambda= 0.099811
statistics sampled from 8883 (9352) to 8883 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 2143 321.1 7.6e-88
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 940 147.8 1e-35
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 899 141.9 6.3e-34
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 882 139.5 3.4e-33
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 881 139.3 3.8e-33
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 864 136.9 2.1e-32
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 859 136.2 3.4e-32
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 848 134.6 1e-31
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 821 130.7 1.6e-30
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 819 130.4 1.8e-30
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 814 129.7 3.1e-30
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 810 129.1 4.6e-30
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 808 128.8 5.6e-30
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 803 128.1 9.1e-30
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 798 127.4 1.5e-29
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 789 126.1 3.7e-29
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 789 126.1 3.9e-29
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 788 125.9 4.1e-29
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 782 125.1 7.4e-29
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 771 123.5 2.2e-28
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 769 123.2 2.8e-28
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 761 122.1 6.1e-28
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 758 121.6 8.2e-28
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 748 120.2 2.2e-27
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 748 120.2 2.4e-27
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 734 118.2 9e-27
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 730 117.6 1.3e-26
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 724 116.7 2.4e-26
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 721 116.3 3.3e-26
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 711 114.8 8.9e-26
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 707 114.3 1.3e-25
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 706 114.1 1.5e-25
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 703 113.7 2e-25
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 692 112.2 6.3e-25
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 689 111.7 7.9e-25
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 689 111.7 8e-25
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 675 109.7 3.2e-24
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 663 107.9 1.1e-23
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 662 107.8 1.2e-23
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 643 105.1 8.1e-23
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 625 102.5 4.8e-22
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 624 102.3 5.2e-22
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 617 101.4 1.1e-21
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 613 100.7 1.6e-21
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 613 100.8 1.6e-21
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 587 97.0 2.1e-20
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 580 96.0 4.3e-20
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 555 92.4 5.1e-19
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 550 91.7 8.5e-19
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 533 89.2 4.6e-18
>>CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 2143 init1: 2143 opt: 2143 Z-score: 1690.6 bits: 321.1 E(32554): 7.6e-88
Smith-Waterman score: 2143; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLTHSYCLHPDVARLACPEAWGAAYSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLTHSYCLHPDVARLACPEAWGAAYSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 VKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
:::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 931 init1: 629 opt: 940 Z-score: 754.5 bits: 147.8 E(32554): 1e-35
Smith-Waterman score: 940; 47.2% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (11-310:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
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CCDS31 RSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
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CCDS31 SVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLTHSYCLHPDVARLACPEAWGAA-YSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRE
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CCDS31 VLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILY
.:.:: .::..:. :::::: ::: :..:.. . ..........:.::..:::.:
CCDS31 ERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 SVKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
::: :.:: :.
CCDS31 SVKTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 886 init1: 622 opt: 899 Z-score: 722.6 bits: 141.9 E(32554): 6.3e-34
Smith-Waterman score: 899; 42.4% identity (77.0% similar) in 309 aa overlap (11-318:5-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIE
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
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CCDS31 SSLHQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLES
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pF1KE6 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
::::::..:: .:::.:::::..:::.::.::.:: .: ::. :: :.:: .. :: .
CCDS31 SVLLAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGN
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190 200 210 220 230
pF1KE6 VLTHSYCLHPDVARLACPEAW-GAAYSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRE
.:.:..::: :: ::.: .: .. :.: ::....:.: ..:..:: :: ... . :::
CCDS31 ALSHAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASRE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILY
.. :: .::..:. .::.:..:.: ...... .. .: :.. ...::::..:::.:
CCDS31 EQLKALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 SVKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
::. :.:: ::... :.
CCDS31 SVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
300 310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 909 init1: 864 opt: 882 Z-score: 709.4 bits: 139.5 E(32554): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 882; 44.8% identity (73.2% similar) in 310 aa overlap (11-319:5-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
:.: ::.::::::: : : ..:. ..::.. :::::::.:: .
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
:.::.::..:: .:..::.:: . .::.:.: : .: . ..::. : ::: :::.::
CCDS31 PSLHEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
:::: ::.:: ::: ::.: ..::. ...:....::. . : ::.:: : . :: .
CCDS31 SVLLIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLTHSYCLHPDVARLACPEAW-GAAYSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRE
:.:::::: :: .::: . . :..: .: : .: .:: :: :: :.. :. :..
CCDS31 QLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILY
.. :: .::..:. ::..::.:.: ::.... .. ..:.. : .:.::: :::.:
CCDS31 EQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 SVKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
:: :.:: :.. .: ::.
CCDS31 CVKTKQIRVRVVAKLCQRKI
300 310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 870 init1: 582 opt: 881 Z-score: 708.6 bits: 139.3 E(32554): 3.8e-33
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (20-319:12-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
:::.:.::: .. :: . :: ..: .. :: .:: . ..
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PALHRPMHFFLFLLSVSDIGLVTALMPTLLGIALAGAHTVPASACLLQMVFIHVFSVMES
:.::.::..:: .:: ::... : .::.: .:... .:::.:: .:: ::.:::
CCDS31 PSLHEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVLLAMSIDRALAICRPLHYPALLTNGVISKISLAISFRCLGLHLPLPFLLAYMPYCLPQ
..:::::.:: .::: ::.: ..::. ::. ..:. . : . .:::::. .: : .
CCDS31 GILLAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLTHSYCLHPDVARLACPE-AWGAAYSLFVVLSAMGLDPLLIFFSYGLIGKVLQGVESRE
::.::::::::. :::: . . .. :.:::..:..:.: ..::.:: :: . .... :::
CCDS31 VLSHSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASRE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DRWKAGQTCAAHLSAVLLFYIPMILLALINHPELPITQHTHTLLSYVHFLLPPLINPILY
.: :: .::..:. ::: ::.::: .. ... . . :.:.: :....::..::..:
CCDS31 ERLKALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 SVKMKEIRKRILNRLQPRKVGGAQ
:.: ::::. :. .. :.
CCDS31 SAKTKEIRRAIFRMFHHIKI
300 310
>>CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 885 init1: 843 opt: 864 Z-score: 695.4 bits: 136.9 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 864; 44.5% identity (72.9% similar) in 310 aa overlap (11-319:5-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSTLPTQIAPNSSTSMAPTFLLVGMPGLSGAPSWWTLPLIAVYLLSALGNGTILWIIALQ
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CCDS31 CVKTRQIWEKILGKLLNVCGR
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]