Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6076
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6076, 323 aa
1>>>pF1KE6076 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6956+/-0.00116; mu= 13.5240+/- 0.068
mean_var=143.8568+/-49.789, 0's: 0 Z-trim(102.9): 412 B-trim: 827 in 2/47
Lambda= 0.106932
statistics sampled from 6628 (7171) to 6628 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 2104 337.1 1.1e-92
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 1058 175.7 4.2e-44
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1014 168.9 4.6e-42
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1010 168.3 7e-42
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 995 166.0 3.5e-41
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 994 165.8 3.9e-41
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 983 164.2 1.3e-40
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 979 163.5 1.9e-40
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 974 162.8 3.3e-40
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 972 162.5 4.2e-40
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 971 162.3 4.6e-40
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 953 159.5 3.1e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 950 159.1 4.3e-39
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 944 158.1 8.1e-39
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 944 158.1 8.2e-39
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 939 157.4 1.4e-38
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 916 153.8 1.6e-37
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 896 150.7 1.4e-36
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 887 149.3 3.6e-36
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 882 148.6 6.4e-36
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 877 147.8 1.1e-35
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 867 146.3 3.2e-35
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 867 146.3 3.3e-35
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 864 145.8 4.4e-35
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 858 144.9 8.1e-35
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 858 144.9 8.3e-35
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 858 144.9 8.3e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 857 144.7 9e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 857 144.7 9.1e-35
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 852 144.0 1.5e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 845 142.9 3.3e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 841 142.3 5e-34
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 837 141.6 7.6e-34
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 833 141.0 1.2e-33
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 832 140.9 1.3e-33
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 831 140.7 1.5e-33
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 830 140.6 1.7e-33
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 829 140.4 1.8e-33
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 829 140.4 1.9e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 824 139.7 3.2e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 821 139.2 4.4e-33
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 820 139.0 4.8e-33
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 819 138.9 5.3e-33
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 818 138.7 5.8e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 818 138.7 5.8e-33
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 818 138.7 5.8e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 812 137.8 1.1e-32
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 811 137.6 1.2e-32
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 811 137.6 1.2e-32
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 805 136.7 2.3e-32
>>CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 2104 init1: 2104 opt: 2104 Z-score: 1777.3 bits: 337.1 E(32554): 1.1e-92
Smith-Waterman score: 2104; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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CCDS31 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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CCDS31 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
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CCDS31 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
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CCDS31 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
310 320
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1076 init1: 604 opt: 1058 Z-score: 905.3 bits: 175.7 E(32554): 4.2e-44
Smith-Waterman score: 1058; 52.5% identity (83.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
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CCDS31 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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pF1KE6 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
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CCDS31 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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CCDS31 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
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CCDS31 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
:::..
CCDS31 LRETVNRIMTLIQRKT
300 310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1052 init1: 1007 opt: 1014 Z-score: 868.7 bits: 168.9 E(32554): 4.6e-42
Smith-Waterman score: 1014; 49.3% identity (82.6% similar) in 298 aa overlap (5-302:3-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMY
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pF1KE6 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
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CCDS31 FFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSY
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pF1KE6 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
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CCDS31 DRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICD
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pF1KE6 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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CCDS31 SSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFST
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pF1KE6 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
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CCDS31 CSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQA
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310 320
pF1KE6 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
..
CCDS31 FKSMVQKMIFSLNK
300 310
>>CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1010 init1: 1010 opt: 1010 Z-score: 865.3 bits: 168.3 E(32554): 7e-42
Smith-Waterman score: 1010; 47.8% identity (81.3% similar) in 299 aa overlap (5-303:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMY
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pF1KE6 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
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CCDS31 FFLRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSY
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pF1KE6 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
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CCDS31 DRYVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFICD
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pF1KE6 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
: :.: ..: ::..:.:.::.:....:. .:::. .::. :: :.:. :.: .:.:::::
CCDS31 SSPMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFST
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pF1KE6 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
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CCDS31 CSSHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA
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310 320
pF1KE6 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
:::
CCDS31 LREFTKKILSLNKQ
300 310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1048 init1: 986 opt: 995 Z-score: 852.8 bits: 166.0 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 995; 47.5% identity (82.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE6 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
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CCDS31 FFLRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
:::.:::.::.: ..:: ..:. ::: .::.::: .. : .:. .: .:. : :::: :
CCDS31 DRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACD
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pF1KE6 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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CCDS31 YFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFST
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CCDS31 CSSHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA
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310 320
pF1KE6 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
.....
CCDS31 FKNVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1023 init1: 813 opt: 994 Z-score: 852.0 bits: 165.8 E(32554): 3.9e-41
Smith-Waterman score: 994; 48.0% identity (80.1% similar) in 302 aa overlap (4-305:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]