Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6074
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6074, 323 aa
1>>>pF1KE6074 323 - 323 aa - 323 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8729+/-0.000603; mu= 12.9891+/- 0.037
mean_var=111.4577+/-29.060, 0's: 0 Z-trim(105.8): 381 B-trim: 1751 in 2/48
Lambda= 0.121484
statistics sampled from 13431 (13935) to 13431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.476), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 990 185.4 1.3e-46
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 863 163.1 6.7e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 860 162.6 9.7e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 847 160.3 4.7e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 847 160.3 4.7e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 847 160.3 4.8e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 831 157.5 3.3e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 157.5 3.3e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 157.5 3.3e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 819 155.4 1.4e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 809 153.7 4.7e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 766 146.1 8.7e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 763 145.6 1.3e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 756 144.4 3e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 756 144.4 3e-34
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 754 144.0 3.8e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 753 143.9 4.3e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 749 143.2 7.2e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 725 138.9 1.3e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 715 137.2 4.2e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 595 116.2 9.4e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 502 99.9 7.6e-21
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 222 50.8 4.8e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 217 50.0 8.8e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 215 49.6 1.1e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 209 48.5 2.3e-05
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 210 49.0 3.1e-05
NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 205 47.9 3.8e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 204 47.7 4.4e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 203 47.5 4.6e-05
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 198 46.6 9.1e-05
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 198 46.6 9.1e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 197 46.6 0.00012
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 197 46.6 0.00013
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 195 46.1 0.00013
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 194 46.0 0.00015
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 194 46.0 0.00015
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 192 45.6 0.00018
NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 193 45.8 0.00018
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 193 45.9 0.00019
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 193 45.9 0.00019
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 187 44.7 0.00034
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 185 44.5 0.00053
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 180 43.4 0.00074
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 180 43.5 0.00077
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 181 43.8 0.00084
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 173 41.8 0.00084
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 180 43.5 0.0009
NP_036284 (OMIM: 605106) lysophosphatidic acid rec ( 353) 176 42.8 0.0013
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 175 42.5 0.0013
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1013 init1: 983 opt: 990 Z-score: 957.7 bits: 185.4 E(85289): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 990; 48.5% identity (78.5% similar) in 297 aa overlap (5-301:3-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: . ..::::::: . :.: . : : :.: . :.: .::..:.:.. :: ::::
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
. :. :::.: : .: ::..:. : ....: :.::..:.: :.: :.: .::. :::
NP_001 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:.::::::::.:..::.. .:..:. . : ...:. :. : .::::::::.: :.::
NP_001 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTL
: . .::: :....:..:..:::.. : .:.::. ::..:: .. .: : ::.::
NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
.:::.:::::: ::::.:. : . :.:: .:::::..::.:::.::::.: .:: :.::
NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
.
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 840 init1: 636 opt: 863 Z-score: 837.3 bits: 163.1 E(85289): 6.7e-40
Smith-Waterman score: 863; 42.2% identity (74.5% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: ..: . ..::::::: .. .::.. : :: :.::. ::::: .:: . :..::.:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.:.::::::.:... ::::.::.:: ..::::.::. :..:. .. : .:. :::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:::.:::.:: : .:::: . .. ..:..:.. . . : . .: :: ::. ::::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
: . ::.: :. . : . . .:. ..:. ...::: .: ... ..:. . .::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPL--DKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA
:::....:::.. ::. :. : . : :: ..:::: :.:::.::.::....: :
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
. ....
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 864 init1: 623 opt: 860 Z-score: 834.4 bits: 162.6 E(85289): 9.7e-40
Smith-Waterman score: 860; 42.9% identity (73.8% similar) in 301 aa overlap (5-302:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSP
: ..:.::.:::. . .::. : .: .::..:..::. ..: . : :..:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSM
:::.:.::::::.: : .:::...::: ...::. :: :..:. :. : .:..:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFF
:::::::::.:: :.:.::: : :...:. . . .: . ::. : .: ::.. ::
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAF
:::: . ::.: :. : : :. . .. . . : ... ::..::..: ..: .. :.:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STLASHIAVVILFFGPCIFIYVWP-FTISP-LDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMK
:: :::.. : .. : .::: : . :: ::....:::.: :::::.::.:::.:.:
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 AAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
:..:..
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.2 bits: 160.3 E(85289): 4.7e-39
Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
:. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:. :. ::.:::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:. . ::. :::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::. :.. ::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
. . ::.: :... :..:. ..... .. : ...::. : :: . :. . :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDK--FLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA
.::.:::.::.. : .: :.. .: . ...::: ::.:::.::.:::: .:.:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
..:.:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.2 bits: 160.3 E(85289): 4.7e-39
Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
:. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:. :. ::.:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:. . ::. :::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::. :.. ::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
. . ::.: :... :..:. ..... .. : ...::. : :: . :. . :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDK--FLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA
.::.:::.::.. : .: :.. .: . ...::: ::.:::.::.:::: .:.:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
..:.:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.0 bits: 160.3 E(85289): 4.8e-39
Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVT
:. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:.
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SDTSLHSPMYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGG
:. ::.::::.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:.
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 EMVLLVSMAYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCG
. ::. ::::..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE6 PNVVDSFFCDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKS
:.. ::::. . ::.: :... :..:. ..... .. : ...::. : :: . :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 SAAMAKAFSTLASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDK--FLAIFYTVFTPVLNPIIY
. . ::::: .::.:::.::.. : .: :.. .: . ...::: ::.:::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KE6 TLRNRDMKAAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
.:::: .:.:..:.:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 821 init1: 625 opt: 831 Z-score: 806.9 bits: 157.5 E(85289): 3.3e-38
Smith-Waterman score: 831; 42.5% identity (71.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: .:.. ::::.:::: :. .. : .: :.:.: :::: ::.: . :. ::.:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.: :::.::. :. ..:...: ::. :..: :..: ::.:: . : :.:::. :::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:::::.: : : .:: :. :.. ::. ... . : ..: .::.: . .: . :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
: :..:::.:. :. :.:.: .: .. : :.. ::: :. :. ..: . ::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISP---LDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKA
:::..:: : .: :: :. : . :: .:....::...::.:::.::.:::...:.
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHS-SPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 AVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
: .:..
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 821 init1: 625 opt: 831 Z-score: 806.9 bits: 157.5 E(85289): 3.3e-38
Smith-Waterman score: 831; 42.5% identity (71.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: .:.. ::::.:::: :. .. : .: :.:.: :::: ::.: . :. ::.:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.: :::.::. :. ..:...: ::. :..: :..: ::.:: . : :.:::. :::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:::::.: : : .:: :. :.. ::. ... . : ..: .::.: . .: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
: :..:::.:. :. :.:.: .: .. : :.. ::: :. :. ..: . ::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISP---LDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKA
:::..:: : .: :: :. : . :: .:....::...::.:::.::.:::...:.
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHS-SPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 AVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
: .:..
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 821 init1: 625 opt: 831 Z-score: 806.9 bits: 157.5 E(85289): 3.3e-38
Smith-Waterman score: 831; 42.5% identity (71.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: .:.. ::::.:::: :. .. : .: :.:.: :::: ::.: . :. ::.:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:.: :::.::. :. ..:...: ::. :..: :..: ::.:: . : :.:::. :::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
:::::.: : : .:: :. :.. ::. ... . : ..: .::.: . .: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
: :..:::.:. :. :.:.: .: .. : :.. ::: :. :. ..: . ::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISP---LDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKA
:::..:: : .: :: :. : . :: .:....::...::.:::.::.:::...:.
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHS-SPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 AVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
: .:..
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 827 init1: 606 opt: 819 Z-score: 795.7 bits: 155.4 E(85289): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 819; 40.0% identity (74.3% similar) in 300 aa overlap (5-301:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: :::.::..::: .. .:: . : :: ..: : :::.:::.. ...::.:::
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
.: .:. ::: .. :::.. .:....:::..::..:.:.. :.::::...:::
NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
::::::: ::.: .::... :..:. . :...... . .. . : :::::..: :::.
NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST
.: . :.: : :... : . :... : : :: .:.:.. ... . :::::
NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPL--DKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA
.::..:: :...: :. :. : . . :: .: .::. ::.:::..:...::.:.:.
NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
.::.
NP_001 IRKVFAFLKH
300
323 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:16:08 2016 done: Tue Nov 8 09:16:09 2016
Total Scan time: 5.000 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]