Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6071
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6071, 321 aa
1>>>pF1KE6071 321 - 321 aa - 321 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1670+/-0.000546; mu= 17.1768+/- 0.034
mean_var=124.2237+/-34.304, 0's: 0 Z-trim(107.4): 261 B-trim: 993 in 1/51
Lambda= 0.115073
statistics sampled from 15074 (15447) to 15074 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.504), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 5.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 975 174.0 3.6e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 926 165.9 1e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 866 155.9 1e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 866 155.9 1e-37
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 866 155.9 1e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 854 153.9 4e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 849 153.1 7e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 800 144.9 2e-34
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 797 144.4 2.8e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 778 141.3 2.5e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 776 141.0 3.2e-33
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 776 141.0 3.2e-33
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 776 141.0 3.2e-33
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 776 141.0 3.2e-33
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 763 138.8 1.4e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 746 136.0 9.7e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 744 135.7 1.3e-31
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 732 133.7 5.1e-31
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 723 132.2 1.4e-30
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 696 127.7 3.2e-29
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 545 102.6 1.1e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 504 95.8 1.3e-19
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 193 44.4 0.00052
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 190 43.7 0.00065
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 183 42.6 0.0015
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 182 42.5 0.0018
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 177 41.5 0.0027
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 177 41.6 0.0028
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 177 41.6 0.003
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 177 41.6 0.003
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 177 41.7 0.0032
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 177 41.7 0.0033
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 174 41.1 0.004
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 174 41.2 0.0046
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 172 40.9 0.006
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 172 41.0 0.0065
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 167 39.9 0.009
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 959 init1: 845 opt: 975 Z-score: 896.0 bits: 174.0 E(85289): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 975; 46.2% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (5-304:7-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYIFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE6 AYDRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFF
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pF1KE6 CDILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAF
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pF1KE6 STCASHFLSVSIFYICLL-MYIGPSE--EGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVI
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310 320
pF1KE6 NVLKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 875 init1: 768 opt: 926 Z-score: 852.1 bits: 165.9 E(85289): 1e-40
Smith-Waterman score: 926; 44.6% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE6 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
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pF1KE6 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE6 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE6 CASHFLSVSIFYI-CLLMYIGPSEEG--DKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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pF1KE6 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
: ...
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 866; 42.6% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE6 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE6 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE6 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGP--SEEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310 320
pF1KE6 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
:::..
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 866; 42.6% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
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pF1KE6 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE6 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
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pF1KE6 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGP--SEEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE6 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
:::..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 853 init1: 729 opt: 866 Z-score: 798.1 bits: 155.9 E(85289): 1e-37
Smith-Waterman score: 866; 42.6% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (1-302:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIY
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pF1KE6 KEGRGKAFSTCASHFLSVSIFYICLL-MYIGP--SEEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KE6 SLRNKEVINVLKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 838 init1: 715 opt: 854 Z-score: 787.5 bits: 153.9 E(85289): 4e-37
Smith-Waterman score: 854; 42.0% identity (77.3% similar) in 295 aa overlap (12-303:13-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE6 YIFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMA
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pF1KE6 YDRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFC
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pF1KE6 DILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE6 TCASHFLSVSIFYIC-LLMYIGPSEEGDK--DTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVIN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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pF1KE6 VLKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
.::....
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 815 init1: 699 opt: 849 Z-score: 783.1 bits: 153.1 E(85289): 7e-37
Smith-Waterman score: 849; 41.7% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHFLSVSIFY-ICLLMYIGPSEEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINVLK
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KIM-RNYNILKQTCSIANLFLIY
:. ::.
NP_003 KVATRNFP
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 781 init1: 704 opt: 800 Z-score: 739.1 bits: 144.9 E(85289): 2e-34
Smith-Waterman score: 800; 40.2% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (5-301:2-301)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGN-LGLVALIYVERRLLTPM
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIY-NNTLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YIFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMA
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NP_001 YVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFC
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NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFS
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NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCASHFLSVSIFYICLLM-YIGP--SEEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVIN
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NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 VLKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
..:.
NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 792 init1: 670 opt: 797 Z-score: 736.4 bits: 144.4 E(85289): 2.8e-34
Smith-Waterman score: 797; 38.2% identity (72.4% similar) in 301 aa overlap (5-302:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYIFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCDILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCASHFLSVSIFYI-CLLMYIGPSEEGDKDTP--VAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 INVLKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
...:..:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 772 init1: 654 opt: 778 Z-score: 719.3 bits: 141.3 E(85289): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 778; 40.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (5-302:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
:.: ..::.:.:... :: . .:: .: ..::::.:::. .. : . :: ::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
.::.::.. : . :::: :. :... :: :..:.::: . : ..::.:::
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
::::::: ::.: : :: ::: . . . . :...::. :. :.::: : :::..::.
NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
. : :..:.. .::. .. . : .. .. :.:::. :. ..... : . :::::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHFLSVSIFY--ICLLMYIGPSEEGD-KDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMV-YLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
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: ...
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
321 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:14:23 2016 done: Tue Nov 8 09:14:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]