Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6069
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6069, 321 aa
1>>>pF1KE6069 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3571+/-0.00121; mu= 9.7470+/- 0.070
mean_var=164.6474+/-55.669, 0's: 0 Z-trim(102.5): 381 B-trim: 413 in 1/47
Lambda= 0.099953
statistics sampled from 6528 (6982) to 6528 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 1.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 2147 322.6 2.6e-88
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1636 248.9 3.9e-66
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1621 246.8 1.7e-65
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1541 235.2 5.2e-62
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1184 183.7 1.6e-46
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1157 179.8 2.4e-45
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1141 177.6 1.2e-44
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1139 177.2 1.5e-44
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1138 177.1 1.6e-44
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1133 176.4 2.6e-44
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1126 175.4 5.3e-44
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1113 173.5 2e-43
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1106 172.5 4e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1104 172.2 5e-43
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1095 170.9 1.2e-42
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1094 170.8 1.3e-42
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1090 170.2 2e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1089 170.0 2.1e-42
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1086 169.6 2.9e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1071 167.4 1.3e-41
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1058 165.6 4.7e-41
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1042 163.3 2.3e-40
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1030 161.6 8.1e-40
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1028 161.2 9.6e-40
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1025 160.8 1.3e-39
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 985 155.1 7.2e-38
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 979 154.2 1.3e-37
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 960 151.4 8.5e-37
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 941 148.7 5.7e-36
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 940 148.6 6.4e-36
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 938 148.3 7.8e-36
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 937 148.1 8.6e-36
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 921 145.8 4.2e-35
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 911 144.4 1.1e-34
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 884 140.5 1.7e-33
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 870 138.5 7.4e-33
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 869 138.3 7.6e-33
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 857 136.6 2.6e-32
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 856 136.5 3e-32
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 821 131.5 1e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 815 130.5 1.7e-30
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 797 127.9 1e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 776 124.9 8.3e-29
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 755 121.9 6.7e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 754 121.7 7.6e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 731 118.4 7.6e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 708 115.1 7.5e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 655 107.5 1.5e-23
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 637 104.8 8.8e-23
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 610 101.0 1.3e-21
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 1699.0 bits: 322.6 E(32554): 2.6e-88
Smith-Waterman score: 2147; 99.1% identity (99.1% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFIHTFTGMESGVLMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKRLPYCRGNILPHTY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITISYTMILRAVVSLSSADARQKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
:::::::::::::::::::::
CCDS44 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
310 320
>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1634 init1: 1634 opt: 1636 Z-score: 1300.8 bits: 248.9 E(32554): 3.9e-66
Smith-Waterman score: 1636; 74.0% identity (91.7% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
: :: :.: ::::::::.:::::..::::::.:.:: .:..:: ::.:::. ..:::.:
CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFIHTFTGMESGVLMLM
:: :::.:::::..::.::.:..: :.::.::.: : ::.::::.::::::::::::::
CCDS31 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKRLPYCRGNILPHTY
:::. ::::.::::.::::: ::::.: ::::::.:.:: ::::::::::.::..::::
CCDS31 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKGNVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITISYTMILRAVVSLSSADARQKAF
::::::::.:::::.:::::::.::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS31 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
.:::::.::::..:.::::.::.:.:: : :: :::.::.:::.:::::::::::::.
CCDS31 STCTAHFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
:.:. :::.. .::
CCDS31 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
310 320
>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1620 init1: 1597 opt: 1621 Z-score: 1289.1 bits: 246.8 E(32554): 1.7e-65
Smith-Waterman score: 1621; 73.0% identity (91.4% similar) in 315 aa overlap (5-319:5-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
:...: :. :::::::::: :..:::.::: ::..:.::::::. :: .:.:::.:
CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFIHTFTGMESGVLMLM
::::::.:::::...:.. .:. ::::::.::.: :. ::.::::.: .:::::::::::
CCDS31 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKRLPYCRGNILPHTY
::::::::::::::.::::::::::.: :::::.:.::::::.:::::::::::..::::
CCDS31 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITISYTMILRAVVSLSSADARQKAF
::::::::.:::: :::::::::::::: ::: ::..::::::.::.::::::::.:::
CCDS31 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
.:::.:.:.::..:. :::.::.::: : :: ::::::.::::::::::::::::::
CCDS31 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
::.. ::..: :.: . .:
CCDS31 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
310 320
>>CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1586 init1: 1277 opt: 1541 Z-score: 1226.7 bits: 235.2 E(32554): 5.2e-62
Smith-Waterman score: 1541; 70.5% identity (91.8% similar) in 305 aa overlap (11-314:17-321)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYE
: ::::::.:::: ...:::.:.:.::.. .::: ::.:::.::
CCDS31 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DALHKPMYYFLAM-LSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFIHTFTGME
..::.:::.:.. ::. ::. :..:.:.::::::: ::.:.:. ::.::::.: :::.:
CCDS31 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKRLPYCRG
:::::::::::::::::::::.: ::::.:::. :::::::::.::: ::.::::.:..
CCDS31 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NILPHTYCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITISYTMILRAVVSLSSA
::. :::::::::.::::...:::.:::::::::: ::: ::..:::.::.:..::::.
CCDS31 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARQKAFNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPI
:::::::.:::::: ::...:.::::.::.:::: : :::: ::::::.:::::::.:::
CCDS31 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
:::::::::: ::....:.:
CCDS31 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1175 init1: 803 opt: 1184 Z-score: 948.7 bits: 183.7 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1184; 52.9% identity (80.6% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
: ..: : . : :.: :.:::. ..::::::: .:..:.::: .:..:. : .::.:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFIHTFTGMESGVLMLM
:.:::::::. :: . .::::: : ::::.:..:.: ::.:::::: :::::. .:..:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKRLPYCRGNILPHTY
: ::.:::: ::.:. :::: .:. ..... :...:. ::.:: :::.: ::.::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITISYTMILRAVVSLSSADARQKAF
:.: ..: :.:. .:.: :::::: : :.. :. ::..::::: : : :.: :::
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYII-VDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAF
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
::: .:.:... ::::::::..::::..: : ::..::.:...::..::..:::.::
CCDS31 NTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNI-PHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
:::. ...:.
CCDS31 QIREQIVKIFVQKE
300 310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1118 init1: 1118 opt: 1157 Z-score: 927.5 bits: 179.8 E(32554): 2.4e-45
Smith-Waterman score: 1157; 50.8% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (10-316:11-317)
10 20 30 40 50
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
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CCDS31 KEIRSRLLKLLHLGKTSI
310
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CCDS31 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNV-PRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTK
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:: :: .::
CCDS31 QIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
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CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
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CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
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CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
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CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHI-PPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKT
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::::: .....
CCDS31 KQIRDHIVKVFFFKKVT
300 310
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
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CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
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CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
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CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL--LDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]