FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6068, 321 aa
1>>>pF1KE6068 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4645+/-0.00118; mu= 14.6002+/- 0.069
mean_var=154.3464+/-52.996, 0's: 0 Z-trim(102.3): 376 B-trim: 441 in 1/47
Lambda= 0.103235
statistics sampled from 6434 (6875) to 6434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 2164 335.2 4.3e-92
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1629 255.5 4.2e-68
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1600 251.2 8.3e-67
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1562 245.5 4.2e-65
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1169 186.9 1.7e-47
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1160 185.6 4.5e-47
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1152 184.4 1e-46
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1125 180.4 1.7e-45
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1111 178.3 6.9e-45
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1108 177.9 9.4e-45
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1090 175.2 6e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1084 174.3 1.1e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1078 173.5 2.2e-43
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1076 173.1 2.6e-43
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1061 170.9 1.2e-42
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1033 166.7 2.2e-41
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1031 166.4 2.8e-41
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1025 165.5 4.9e-41
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1018 164.5 1e-40
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1014 163.9 1.6e-40
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 997 161.3 8.9e-40
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 995 161.0 1.1e-39
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 990 160.3 1.8e-39
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 971 157.5 1.3e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 966 156.7 2.2e-38
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 954 154.9 7.6e-38
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 951 154.5 1.1e-37
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CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 943 153.3 2.4e-37
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 928 151.1 1.1e-36
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 921 150.0 2.3e-36
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 917 149.4 3.4e-36
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 904 147.5 1.3e-35
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 890 145.4 5.6e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 868 142.1 5.5e-34
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 862 141.2 1e-33
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 844 138.6 6.9e-33
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 841 138.1 8.9e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 824 135.6 5.4e-32
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 822 135.3 6.3e-32
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 803 132.5 4.8e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 778 128.7 5.9e-30
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 762 126.4 3.1e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 753 125.0 7.8e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 743 123.5 2.2e-28
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 740 123.0 2.9e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 707 118.2 9.1e-27
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 652 110.0 2.6e-24
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 632 107.0 2.1e-23
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 619 105.0 7.9e-23
>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 2164 init1: 2164 opt: 2164 Z-score: 1766.8 bits: 335.2 E(32554): 4.3e-92
Smith-Waterman score: 2164; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
:::::::::::::::::::::
CCDS31 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
310 320
>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1629 init1: 1629 opt: 1629 Z-score: 1336.2 bits: 255.5 E(32554): 4.2e-68
Smith-Waterman score: 1629; 76.1% identity (90.8% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
:: :..::::. :::::.:::: .:.:::.:.: :: ::..:: ::. :: .::::::
CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
:: :::::::::: .::. .:: : :.:::::::::.:::::::::: .:::::::::::
CCDS31 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
:::. ::::.:::::::::: ::::::. ::::.:::.:: :.::::::::.:: :::::
CCDS31 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKGNVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
::::::::.:::: .:::::::.:::::: ::: ::..:::::::::.::::::::.:::
CCDS31 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
::::.:.:.::.::: ::::::::.: ::.:: :::::.::::::.:::::::::::::.
CCDS31 STCTAHFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
:..:.::.:.: :
CCDS31 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
310 320
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1608 init1: 1576 opt: 1600 Z-score: 1312.9 bits: 251.2 E(32554): 8.3e-67
Smith-Waterman score: 1600; 72.7% identity (90.8% similar) in 315 aa overlap (5-319:5-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
:...: :. :::::::::: :..:::.::: ::..:.::::::. :: .:.:::.:
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
::::::.:::::...:.. .:. ::::::.::.: :. ::.::::.: .:::::::::::
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
::::::::::::::.::::::::::.: :::::.:.::::::.::: :::::::..::::
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
::::::::.:::: :::::::::::::: ::: ::. ::::::.::.::::::::.:::
CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
.:::.:.:.::..:. :::.::.::: : :: ::::::.::::::::::::::::::
CCDS44 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
::.. ::..: :.: . .:
CCDS44 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
310 320
>>CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1562 init1: 1304 opt: 1562 Z-score: 1282.2 bits: 245.5 E(32554): 4.2e-65
Smith-Waterman score: 1562; 73.6% identity (91.5% similar) in 307 aa overlap (9-314:15-321)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHE
.:: :::::.:::: .:.:::::.: :::: .::: ::. :: .:
CCDS31 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 EALHRPMYYFLA-LLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGME
:.::.:::.:.. ::. :. ::: .:: ::::::.::::.:::::::::::: .::.:
CCDS31 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRG
::::::::::::::::::::::: ::::.:::: ::::::.:.:.::: .:.::::.:..
CCDS31 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NFIPHTYCDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSA
:.: :::::::::.:.::...:::.:::::::::::::::::::.:::.::.:..::::.
CCDS31 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARHKAFSTCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPI
:::.:::::::.:. .:.:::: ::::::.::: ::.:: .::::::::::::::.:::
CCDS31 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
:::::::::...::::. :::
CCDS31 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 968 init1: 790 opt: 1169 Z-score: 966.1 bits: 186.9 E(32554): 1.7e-47
Smith-Waterman score: 1169; 51.8% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
: . :.. . : ::.: :.:::.. :::::.:::..:.::.::: .. .:. :..::.:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
:.::::.::. :. : :. .:.:: ::::::.::.:..:: ::::.::.::::. .:..:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
: ::.:::: ::.:. :::: .:. . .. ::..:. ::..: :::.: :..::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
:.: ..: ..:. .:.: :::::: : . :. :. ::..::.::. : : :.: :::
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYI-IVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAF
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
.:: ::.: .. :. :::.:.:::: :.:::..:::..::::...::..::..:::.::
CCDS31 NTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRF-GQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
::.: ..:...
CCDS31 QIREQIVKIFVQKE
300 310
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1187 init1: 966 opt: 1160 Z-score: 958.7 bits: 185.6 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1160; 52.6% identity (80.7% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
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CCDS53 MYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAM
70 80 90 100 110 120
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CCDS53 AFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSY
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250 260 270 280 290
310 320
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::.:::
CCDS53 QIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
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CCDS31 LSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGART
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CCDS31 KEIRSRLLKLLHLGKTSI
310
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CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
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CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
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CCDS31 QIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
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CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
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CCDS31 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL--LDVILIILSYVRILYAVFCLPSWE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]