Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6065
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6065, 320 aa
1>>>pF1KE6065 320 - 320 aa - 320 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2201+/-0.000516; mu= 22.3621+/- 0.032
mean_var=109.1109+/-29.242, 0's: 0 Z-trim(107.5): 352 B-trim: 1804 in 2/48
Lambda= 0.122784
statistics sampled from 15091 (15605) to 15091 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 4.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1259 234.7 2e-61
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1193 223.0 6.5e-58
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1152 215.7 1e-55
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1140 213.5 4.3e-55
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 937 177.6 2.9e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 900 171.1 2.7e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 898 170.7 3.5e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 893 169.8 6.5e-42
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.8 6.5e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.8 6.5e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 885 168.4 1.7e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 874 166.4 6.6e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 871 165.9 9.6e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 868 165.4 1.4e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 868 165.4 1.4e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 868 165.4 1.4e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 862 164.3 2.9e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 857 163.4 5.4e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 822 157.3 4e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 768 147.7 3e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 507 101.5 2.5e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 463 93.7 5.5e-19
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 231 52.7 1.4e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 231 52.7 1.5e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 51.2 3.6e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 217 50.3 8.5e-06
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 213 49.5 1.3e-05
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 213 49.5 1.3e-05
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 213 49.5 1.3e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 206 48.3 3.1e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 206 48.3 3.1e-05
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 193 46.0 0.00016
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 192 45.7 0.00016
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 193 46.1 0.00017
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 191 45.6 0.0002
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 190 45.3 0.0002
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 190 45.5 0.00023
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1259 init1: 1259 opt: 1259 Z-score: 1223.9 bits: 234.7 E(85289): 2e-61
Smith-Waterman score: 1259; 60.3% identity (85.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
: .:.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1193 Z-score: 1160.8 bits: 223.0 E(85289): 6.5e-58
Smith-Waterman score: 1193; 56.8% identity (82.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MSYDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LCELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MNTCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KDALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 1146 init1: 1146 opt: 1152 Z-score: 1121.5 bits: 215.7 E(85289): 1e-55
Smith-Waterman score: 1152; 54.8% identity (81.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
...:.
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 1134 init1: 1134 opt: 1140 Z-score: 1110.2 bits: 213.5 E(85289): 4.3e-55
Smith-Waterman score: 1140; 55.8% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (5-298:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: :::::::::::: .:::::::::: ::::.. : .:..... ::..::.::.::..
XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
XP_011 GS
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 951 init1: 774 opt: 937 Z-score: 915.7 bits: 177.6 E(85289): 2.9e-44
Smith-Waterman score: 937; 46.7% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
: : : ... :.:::.:. :. :..: :. ::.:..:: .: .:::::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: :::. ::::.:.:.:: ::.: . :.:... : .: .. .: ..: :::::::
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
:::. .: .:: . ::..: .:..:.: :..:::.::: : .:.. :: ... ::..:
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
::::: :: .:::. : :. : ..::.: : ...::...:: ::::::.::::..: :
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
:.:.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 948 init1: 896 opt: 900 Z-score: 880.3 bits: 171.1 E(85289): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 900; 42.1% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (5-306:6-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKD
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 873 init1: 845 opt: 898 Z-score: 878.3 bits: 170.7 E(85289): 3.5e-42
Smith-Waterman score: 898; 43.3% identity (72.7% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHP-KMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKD
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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NP_835 ALS---RTFHKVLAL-RNCIP
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42
Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42
Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42
Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
: .: . . :::::.:. .. : . ..:..:..:: :.: :::.::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: :::..:. ..::..::.:... . :.: . .: ::. . ::..: .:::::.:
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
:.::::::.. ::. :. :.:: . : : :....::...:: :::.::.::::..: :
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS
.::. .: ..:.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
320 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:11:14 2016 done: Tue Nov 8 09:11:15 2016
Total Scan time: 4.460 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]