FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6064, 320 aa
1>>>pF1KE6064 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2367+/-0.00102; mu= 9.8345+/- 0.059
mean_var=137.5327+/-46.515, 0's: 0 Z-trim(104.0): 359 B-trim: 456 in 1/47
Lambda= 0.109363
statistics sampled from 7252 (7676) to 7252 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 2082 340.8 8.4e-94
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CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1077 182.3 4.6e-46
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1037 175.9 3.5e-44
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1035 175.6 4.5e-44
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1033 175.3 5.6e-44
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1033 175.4 6e-44
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CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1027 174.4 1.1e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1027 174.4 1.1e-43
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1027 174.4 1.1e-43
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1023 173.7 1.7e-43
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1016 172.6 3.5e-43
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1013 172.1 4.8e-43
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1013 172.2 4.9e-43
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1004 170.7 1.3e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 985 167.7 1.1e-41
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 981 167.1 1.6e-41
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 981 167.2 1.8e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 959 163.6 1.8e-40
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 952 162.5 3.8e-40
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 942 161.0 1.2e-39
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 942 161.0 1.2e-39
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 939 160.5 1.6e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 938 160.3 1.8e-39
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CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 931 159.2 3.8e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 923 158.0 9.5e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 921 157.6 1.1e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 920 157.5 1.3e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 918 157.2 1.6e-38
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 917 157.0 1.8e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 917 157.0 1.8e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 915 156.7 2.3e-38
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 913 156.4 2.8e-38
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 911 156.1 3.4e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 906 155.3 5.9e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 904 155.0 7.3e-38
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 903 154.8 8.2e-38
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 901 154.5 1e-37
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 901 154.5 1e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 899 154.2 1.3e-37
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 894 153.4 2.2e-37
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 894 153.4 2.2e-37
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 893 153.2 2.5e-37
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 892 153.1 2.7e-37
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 892 153.1 2.8e-37
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 891 152.9 3.3e-37
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 890 152.7 3.4e-37
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 890 152.7 3.4e-37
>>CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 (320 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 1797.5 bits: 340.8 E(32554): 8.4e-94
Smith-Waterman score: 2082; 100.0% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
::::::::::::::::::::
CCDS35 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
310 320
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1148 init1: 1125 opt: 1134 Z-score: 989.3 bits: 191.2 E(32554): 8.7e-49
Smith-Waterman score: 1134; 58.4% identity (82.3% similar) in 293 aa overlap (15-307:11-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
.: :::::: ...:.:: . : ::.... .:.:: .::::: .::
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
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CCDS31 TPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
.::.::: :: ::::::. ::.:.: :: . : : ..:..: ::.::: :: : .::
CCDS31 VMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
::::::::: .: :::..:::.::.. :::. .:. .. .:: .: .:....:.:: .
CCDS31 FFCDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
: :: :::.:::.. :::.:::.::::::.:: :::.:.:::::.: :::::::::::.
CCDS31 ALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
:::::..
CCDS31 VKEALKKLKNKILF
300 310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1097 init1: 1067 opt: 1077 Z-score: 940.5 bits: 182.3 E(32554): 4.6e-46
Smith-Waterman score: 1077; 53.2% identity (82.6% similar) in 299 aa overlap (13-311:9-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
:.::...:.:. :::.:::. : :: ....::. . .:. ... :.
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
:::.::.:::.:: :.:: ::::...: : .: .:::::: ::..::.:: .::
CCDS31 IPMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
:::::::.:: ::::::: ::.:.:. .. . ..:.....::. :::::::: : .:
CCDS31 AMAYDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
::::::::::.::.::..:.:::::.:.::::.: ..: .:: : .:. ..: : .
CCDS31 FFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSK
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pF1KE6 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
. :: .::: ::...::.:.::::.:..::.:::::...::::.:.: .::.:::.:::.
CCDS31 TFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKD
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
::.::.. :
CCDS31 VKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
300 310 320
>>CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1059 init1: 1034 opt: 1037 Z-score: 906.6 bits: 175.9 E(32554): 3.5e-44
Smith-Waterman score: 1037; 53.6% identity (81.1% similar) in 302 aa overlap (15-314:11-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
::.:::.:.. .:...::.. : .: ..:: :.:: :::.. ..::
CCDS31 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
:::::.:. ::..::::::::.:::::.::. .::: ..:: .: . :. . :: ::.
CCDS31 TPMYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLS
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
.::::::::: .:::::.:::.: :. :. .: .:: :....:: :::::: ..
CCDS31 VMAYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSH
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
:::::: :: .::::::.:::::... : : :: :.. .:: ::: : ....:. : ..
CCDS31 FFCDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
: :: .::::::...:::::: :..:::.: .. .:..:.:::: :: :: ::.:::::.
CCDS31 AFSTCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKD
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VKEALRQT--WSRFHCPGQGSQ
::::.... ..: :
CCDS31 VKEAVKRAIEMKHFLC
300 310
>>CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1020 init1: 996 opt: 1035 Z-score: 904.7 bits: 175.6 E(32554): 4.5e-44
Smith-Waterman score: 1035; 52.0% identity (80.1% similar) in 296 aa overlap (16-311:24-319)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALL
:.:...:...:..: ::: : .:: .:.::.:...
CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 IRMDARLHTPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLA
: : ::.:::.::. ::.::.:::... :::::..: .: . .:: :::. ..
CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DTECCLLAAMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSF
::: ::::::::::::: :::::...:: :. . :. :: ... . : .::. :: :::
CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CRSRKINSFFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHM
: : .: ::..::::::::::: . .::.: . : :. .:.: . .::::: :...:
CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RSVEGSRRAASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPL
.:.:: :.. :: :.:::.:....::..:::.::::::. :.: ..:.:::.::: :::.
CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 IYSLRNKEVKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
:::::::.::::... :
CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
310 320
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1044 init1: 1019 opt: 1033 Z-score: 903.0 bits: 175.3 E(32554): 5.6e-44
Smith-Waterman score: 1033; 48.7% identity (79.6% similar) in 304 aa overlap (8-311:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
: . ..:.:::.... .... ::. : .::..: :... ::.::..::
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
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CCDS31 MPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
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CCDS31 AMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
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CCDS31 FFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
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CCDS31 AFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKE
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
.:.:.:.. :
CCDS31 IKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
300 310 320
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10 20 30
pF1KE6 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVAL
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CCDS31 NIPLSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTL----FVLKGFTDNLELQTIF
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 FLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLHTPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLL
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CCDS31 FFLFLAIYLFTLMGNLGLILVVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNMLVDFTT
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CCDS31 KNKVISFLGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYMPLINA
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160 170 180 190 200 210
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CCDS31 SYVAGILHATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLLFYFVGSIE
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 TATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRRAASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYA
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CCDS31 LVTILIVLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVRPSSSYA
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280 290 300 310 320
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CCDS31 SDHDMIVSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
310 320 330 340 350
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10 20 30 40 50 60
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CCDS41 TPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLA
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CCDS41 SMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNH
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CCDS41 FYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQK
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CCDS41 AFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE6 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
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CCDS41 VKEALKKIIINKN
300
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLH
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CCDS31 TPMYFFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLA
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CCDS31 SMAYDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINH
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 FFCDIPPLLALSCSDTRISKLVVF-VAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKK
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CCDS31 VFSTCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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CCDS31 VKSALWKILNKLYPQY
300
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLH
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CCDS31 TPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLA
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 SMAYDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEH
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 FFCDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]